MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009972	GCT	2	6	5445801	5445806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_009972	C	6	6	5445844	5445849	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13003	NC_009972	CAG	2	6	5445873	5445878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_009972	TGC	2	6	5446115	5446120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_009972	CA	3	6	5446131	5446136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_009972	TCG	2	6	5446144	5446149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_009972	CGT	2	6	5446343	5446348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_009972	TCGC	2	8	5446549	5446556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13009	NC_009972	CTA	2	6	5446559	5446564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_009972	CAC	2	6	5446650	5446655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13011	NC_009972	GGT	2	6	5446663	5446668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_009972	CGG	2	6	5446729	5446734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_009972	CTT	2	6	5446746	5446751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_009972	CATC	2	8	5446770	5446777	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13015	NC_009972	CTG	2	6	5446788	5446793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_009972	ATC	2	6	5446794	5446799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_009972	GTC	2	6	5446801	5446806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_009972	TGT	2	6	5446877	5446882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_009972	TGG	2	6	5446891	5446896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_009972	TGG	2	6	5447001	5447006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_009972	TGC	2	6	5447113	5447118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_009972	CGC	2	6	5447119	5447124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13023	NC_009972	GGC	2	6	5447125	5447130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_009972	TTG	2	6	5447145	5447150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_009972	AGG	2	6	5447188	5447193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_009972	CCT	2	6	5447270	5447275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_009972	TGACG	2	10	5447315	5447324	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13028	NC_009972	GT	3	6	5447329	5447334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_009972	CCG	2	6	5447357	5447362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13030	NC_009972	GT	4	8	5447496	5447503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_009972	TCC	2	6	5447549	5447554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13032	NC_009972	GTT	2	6	5447555	5447560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_009972	CACGA	2	10	5447636	5447645	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13034	NC_009972	GAC	2	6	5447649	5447654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_009972	GCA	2	6	5447661	5447666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_009972	TTC	2	6	5447735	5447740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_009972	GCT	2	6	5447770	5447775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_009972	GGC	2	6	5447830	5447835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_009972	ACG	2	6	5447864	5447869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_009972	CGT	2	6	5447948	5447953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_009972	CGC	2	6	5447980	5447985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13042	NC_009972	TCC	2	6	5448001	5448006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_009972	CAC	2	6	5448023	5448028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_009972	CAT	2	6	5448119	5448124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_009972	ACC	2	6	5448127	5448132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13046	NC_009972	GCT	2	6	5448191	5448196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_009972	C	7	7	5448244	5448250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13048	NC_009972	TCC	2	6	5448280	5448285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13049	NC_009972	TGC	3	9	5448332	5448340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_009972	C	6	6	5448340	5448345	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13051	NC_009972	TCTG	2	8	5448376	5448383	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13052	NC_009972	GTC	2	6	5448384	5448389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_009972	CAT	2	6	5448407	5448412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_009972	ACCA	2	8	5448435	5448442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_009972	TCC	2	6	5448484	5448489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13056	NC_009972	GAA	2	6	5448592	5448597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_009972	TGCA	2	8	5448609	5448616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13058	NC_009972	CGC	2	6	5448624	5448629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13059	NC_009972	TAC	2	6	5448688	5448693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_009972	CAA	2	6	5448736	5448741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_009972	ATG	2	6	5448781	5448786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_009972	TGC	2	6	5448796	5448801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_009972	GCA	2	6	5448806	5448811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_009972	A	6	6	5448844	5448849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_009972	TTG	2	6	5448883	5448888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_009972	TTTG	2	8	5448973	5448980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_009972	TTCG	2	8	5448989	5448996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13068	NC_009972	TCGTG	2	10	5449002	5449011	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13069	NC_009972	TTTG	2	8	5449077	5449084	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_009972	TTCG	2	8	5449093	5449100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13071	NC_009972	TCGTG	2	10	5449106	5449115	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13072	NC_009972	CTTG	2	8	5449166	5449173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13073	NC_009972	CGA	2	6	5453262	5453267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_009972	AAT	2	6	5453365	5453370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_009972	AAC	2	6	5453466	5453471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_009972	TAAA	2	8	5454960	5454967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_009972	GTTT	2	8	5454973	5454980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_009972	ACA	2	6	5455051	5455056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_009972	AAT	2	6	5455063	5455068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_009972	CTA	2	6	5464854	5464859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_009972	TGT	2	6	5464926	5464931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_009972	ATTC	2	8	5464932	5464939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13083	NC_009972	AGG	2	6	5464959	5464964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_009972	TCA	2	6	5468110	5468115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_009972	CATG	2	8	5468136	5468143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13086	NC_009972	TTA	2	6	5468176	5468181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_009972	ACT	2	6	5468199	5468204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_009972	CGAG	2	8	5469479	5469486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13089	NC_009972	AT	3	6	5469537	5469542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_009972	CGAG	2	8	5470418	5470425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13091	NC_009972	ATCC	2	8	5470431	5470438	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13092	NC_009972	CAT	2	6	5470439	5470444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_009972	CGC	2	6	5470467	5470472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13094	NC_009972	CGATG	2	10	5472079	5472088	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13095	NC_009972	CGA	2	6	5472094	5472099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_009972	CAG	2	6	5473222	5473227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_009972	ACCAA	2	10	5473241	5473250	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13098	NC_009972	CTCG	2	8	5473257	5473264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_009972	TAA	2	6	5474059	5474064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_009972	TA	3	6	5474075	5474080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_009972	TA	3	6	5474104	5474109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_009972	TA	3	6	5474124	5474129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_009972	TAC	2	6	5474158	5474163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_009972	TA	3	6	5474171	5474176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_009972	TA	3	6	5474200	5474205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_009972	TGC	2	6	5474224	5474229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_009972	TTGC	2	8	5474230	5474237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13108	NC_009972	CGT	2	6	5474274	5474279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_009972	ACA	2	6	5474324	5474329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_009972	ATTA	2	8	5474330	5474337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_009972	TCC	2	6	5475165	5475170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_009972	TCAC	2	8	5475188	5475195	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13113	NC_009972	ATCT	2	8	5475221	5475228	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13114	NC_009972	ATCT	2	8	5475239	5475246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13115	NC_009972	CGAGG	2	10	5475310	5475319	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13116	NC_009972	A	6	6	5476132	5476137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_009972	CAC	2	6	5476138	5476143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13118	NC_009972	GCT	2	6	5478899	5478904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_009972	TTA	2	6	5478915	5478920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_009972	GAA	2	6	5479063	5479068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_009972	AAT	2	6	5479095	5479100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_009972	AGC	2	6	5479431	5479436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_009972	CTT	2	6	5479447	5479452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_009972	CTTG	2	8	5479455	5479462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13125	NC_009972	AGG	2	6	5479495	5479500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_009972	CCT	2	6	5480069	5480074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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