MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_009972	CCT	2	6	5236116	5236121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_009972	CTTG	2	8	5236151	5236158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12503	NC_009972	GAA	2	6	5237259	5237264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_009972	TA	3	6	5237291	5237296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_009972	TTC	2	6	5237306	5237311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_009972	CA	3	6	5239836	5239841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12507	NC_009972	TCA	2	6	5239855	5239860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_009972	AG	3	6	5239961	5239966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_009972	AAT	4	12	5240036	5240047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_009972	AAT	4	12	5240196	5240207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_009972	GTG	2	6	5240279	5240284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_009972	TCGGG	2	10	5240322	5240331	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12513	NC_009972	ATGAA	2	10	5240387	5240396	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_009972	TGA	2	6	5240462	5240467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_009972	ACA	2	6	5240493	5240498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_009972	TC	3	6	5240537	5240542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12517	NC_009972	GGC	2	6	5240560	5240565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_009972	CTAGAA	2	12	5240580	5240591	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12519	NC_009972	AG	3	6	5240650	5240655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_009972	CAA	2	6	5243390	5243395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_009972	GCA	2	6	5243414	5243419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_009972	GAA	2	6	5243444	5243449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_009972	T	6	6	5243460	5243465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_009972	GCTA	2	8	5243500	5243507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12525	NC_009972	TCC	2	6	5246617	5246622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12526	NC_009972	GT	3	6	5246631	5246636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_009972	ACA	2	6	5246642	5246647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12529	NC_009972	CT	3	6	5248176	5248181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12530	NC_009972	ACC	2	6	5248306	5248311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12531	NC_009972	GGT	2	6	5248324	5248329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12533	NC_009972	GTA	2	6	5248936	5248941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_009972	TCC	2	6	5248944	5248949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12535	NC_009972	AT	3	6	5248971	5248976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_009972	TGGG	2	8	5249660	5249667	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_009972	CAA	2	6	5249747	5249752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_009972	AT	3	6	5249873	5249878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_009972	ATAA	2	8	5250087	5250094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_009972	A	7	7	5250093	5250099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_009972	GTG	2	6	5250115	5250120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12545	NC_009972	ATC	2	6	5262822	5262827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_009972	CGC	2	6	5262831	5262836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12547	NC_009972	ACC	2	6	5264178	5264183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12548	NC_009972	ACC	2	6	5264187	5264192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12549	NC_009972	TCG	2	6	5264276	5264281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12553	NC_009972	TAT	2	6	5270365	5270370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12555	NC_009972	ATT	2	6	5270494	5270499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_009972	CGC	2	6	5270535	5270540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_009972	TTC	2	6	5271075	5271080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_009972	TTC	2	6	5271084	5271089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_009972	T	7	7	5271187	5271193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_009972	TAG	2	6	5271208	5271213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12563	NC_009972	A	6	6	5277021	5277026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_009972	TC	3	6	5277084	5277089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12565	NC_009972	TCG	2	6	5277095	5277100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12572	NC_009972	AT	3	6	5280759	5280764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_009972	GAT	2	6	5280765	5280770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12577	NC_009972	T	6	6	5282789	5282794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12586	NC_009972	TGG	2	6	5284173	5284178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12588	NC_009972	GAT	2	6	5284211	5284216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12594	NC_009972	CTCGC	2	10	5286904	5286913	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12595	NC_009972	GGGC	2	8	5286914	5286921	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12596	NC_009972	GTT	2	6	5286952	5286957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12598	NC_009972	ATG	2	6	5290136	5290141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_009972	GCG	2	6	5290175	5290180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_009972	CTG	2	6	5290216	5290221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12601	NC_009972	T	6	6	5292606	5292611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_009972	TTGCC	2	10	5292631	5292640	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12603	NC_009972	A	6	6	5292653	5292658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_009972	C	6	6	5292663	5292668	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12605	NC_009972	G	6	6	5292688	5292693	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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12608	NC_009972	A	6	6	5292801	5292806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_009972	TTC	2	6	5292824	5292829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12612	NC_009972	GCA	2	6	5292923	5292928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12615	NC_009972	AGC	2	6	5294192	5294197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12617	NC_009972	CTG	2	6	5295461	5295466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_009972	GGCG	2	8	5295467	5295474	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12619	NC_009972	ATC	2	6	5295487	5295492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12621	NC_009972	ATC	2	6	5296673	5296678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12622	NC_009972	A	7	7	5297650	5297656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_009972	ATT	2	6	5297664	5297669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_009972	AACCC	2	10	5297711	5297720	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
12625	NC_009972	TCA	2	6	5298611	5298616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12627	NC_009972	TGA	2	6	5298695	5298700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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