MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009972	CCA	2	6	4585533	4585538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11002	NC_009972	CAG	2	6	4585546	4585551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_009972	CAA	2	6	4585593	4585598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_009972	GTT	2	6	4585604	4585609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_009972	TGA	2	6	4585662	4585667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_009972	CAT	2	6	4585678	4585683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_009972	TTG	2	6	4585820	4585825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_009972	GTT	2	6	4585830	4585835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_009972	ATT	2	6	4585881	4585886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_009972	CAC	2	6	4585898	4585903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_009972	A	6	6	4585953	4585958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_009972	ATT	2	6	4585964	4585969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_009972	GAG	2	6	4585970	4585975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_009972	AG	3	6	4587476	4587481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_009972	AAC	2	6	4587517	4587522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_009972	CAAA	2	8	4587541	4587548	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11017	NC_009972	ACC	2	6	4587637	4587642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_009972	GCA	2	6	4587707	4587712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_009972	ATCG	2	8	4587717	4587724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_009972	CA	3	6	4590498	4590503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11021	NC_009972	ACA	2	6	4590541	4590546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_009972	AGC	2	6	4590551	4590556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_009972	GCT	2	6	4590565	4590570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_009972	AACG	2	8	4590880	4590887	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11025	NC_009972	T	6	6	4592817	4592822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_009972	A	6	6	4592850	4592855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_009972	ATC	2	6	4592871	4592876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_009972	A	6	6	4592912	4592917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_009972	GTT	2	6	4593820	4593825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_009972	CAG	2	6	4593907	4593912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_009972	A	6	6	4593917	4593922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_009972	TC	3	6	4595530	4595535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11033	NC_009972	GTG	2	6	4595584	4595589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11035	NC_009972	TCAC	2	8	4595640	4595647	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_009972	GCC	2	6	4596336	4596341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11037	NC_009972	AAT	2	6	4597439	4597444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_009972	AAT	2	6	4597455	4597460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_009972	CTG	2	6	4598829	4598834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_009972	TCC	2	6	4599549	4599554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11041	NC_009972	ATC	2	6	4599575	4599580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_009972	CAG	2	6	4599596	4599601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_009972	C	6	6	4599616	4599621	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11044	NC_009972	GCTT	2	8	4599660	4599667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11045	NC_009972	ACC	2	6	4599746	4599751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11046	NC_009972	CCCT	2	8	4599759	4599766	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11047	NC_009972	TCA	2	6	4599834	4599839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11051	NC_009972	TCT	2	6	4601108	4601113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_009972	GCTAG	2	10	4603913	4603922	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11053	NC_009972	GTT	2	6	4606318	4606323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_009972	CAG	2	6	4606380	4606385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_009972	TGATCA	2	12	4606402	4606413	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11056	NC_009972	CGC	2	6	4606431	4606436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11057	NC_009972	GCAA	2	8	4608021	4608028	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11058	NC_009972	TGG	2	6	4608073	4608078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11060	NC_009972	TAC	2	6	4608147	4608152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_009972	ACA	2	6	4609295	4609300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_009972	TAA	2	6	4609301	4609306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_009972	TGG	2	6	4609978	4609983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_009972	TGG	2	6	4610132	4610137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_009972	GAG	2	6	4610140	4610145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11067	NC_009972	T	6	6	4612057	4612062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_009972	GATC	2	8	4612063	4612070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11069	NC_009972	GTTA	2	8	4613133	4613140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11071	NC_009972	GCAA	2	8	4613162	4613169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11072	NC_009972	ATATA	2	10	4613179	4613188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_009972	TAG	2	6	4613712	4613717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11075	NC_009972	TTC	2	6	4613889	4613894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11077	NC_009972	GCT	3	9	4613993	4614001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_009972	TGA	2	6	4614006	4614011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_009972	GAG	2	6	4614073	4614078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_009972	GCA	2	6	4616049	4616054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_009972	CGCTA	2	10	4616071	4616080	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11082	NC_009972	CCT	2	6	4620864	4620869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11083	NC_009972	GCCCAA	2	12	4620914	4620925	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11084	NC_009972	AGC	2	6	4621009	4621014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_009972	AAGC	2	8	4621075	4621082	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11089	NC_009972	AGG	2	6	4621502	4621507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_009972	ATT	2	6	4621508	4621513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_009972	TGT	2	6	4623191	4623196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_009972	GAT	2	6	4623230	4623235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_009972	GATT	2	8	4623260	4623267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_009972	ACA	2	6	4624072	4624077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_009972	TGC	2	6	4624148	4624153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_009972	GT	4	8	4624164	4624171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_009972	AGC	2	6	4624198	4624203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_009972	ACC	2	6	4624214	4624219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11099	NC_009972	ACC	2	6	4624253	4624258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11100	NC_009972	TCC	2	6	4624261	4624266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11101	NC_009972	TCA	2	6	4624276	4624281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_009972	CAT	2	6	4624296	4624301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_009972	CG	3	6	4624353	4624358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11104	NC_009972	GAT	2	6	4624365	4624370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_009972	CTGT	2	8	4624378	4624385	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11106	NC_009972	TGT	3	9	4624383	4624391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_009972	CGTCT	2	10	4624433	4624442	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11108	NC_009972	GTC	2	6	4624555	4624560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_009972	CCA	2	6	4624572	4624577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11110	NC_009972	ATC	2	6	4624625	4624630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_009972	ACG	2	6	4624665	4624670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_009972	CGA	2	6	4624745	4624750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_009972	CCG	2	6	4624773	4624778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_009972	ACCT	2	8	4624966	4624973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11115	NC_009972	GC	3	6	4624976	4624981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11116	NC_009972	CCA	2	6	4625023	4625028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11117	NC_009972	CCA	2	6	4625105	4625110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11118	NC_009972	CA	3	6	4625158	4625163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11119	NC_009972	CTG	2	6	4625210	4625215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_009972	GCC	2	6	4625354	4625359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11121	NC_009972	TGC	2	6	4625497	4625502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_009972	TCC	2	6	4625666	4625671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11123	NC_009972	AACG	2	8	4625753	4625760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11124	NC_009972	CAT	2	6	4625774	4625779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_009972	ACG	2	6	4625797	4625802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11127	NC_009972	CGC	2	6	4625930	4625935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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