MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_009972	A	6	6	3273843	3273848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_009972	TGCTA	2	10	3274480	3274489	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8003	NC_009972	AAT	2	6	3274506	3274511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_009972	GTT	2	6	3274553	3274558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_009972	A	6	6	3274563	3274568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_009972	CTC	2	6	3275792	3275797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_009972	TCTA	2	8	3275824	3275831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8008	NC_009972	CGC	2	6	3275846	3275851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_009972	C	6	6	3275851	3275856	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8010	NC_009972	GCG	2	6	3275874	3275879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_009972	AAC	2	6	3275969	3275974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_009972	GAA	2	6	3276081	3276086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_009972	CAA	2	6	3277774	3277779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_009972	GAA	2	6	3277844	3277849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_009972	T	6	6	3277941	3277946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_009972	TGC	2	6	3277957	3277962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_009972	CAA	2	6	3278056	3278061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_009972	CGC	2	6	3278076	3278081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8019	NC_009972	GGA	2	6	3280644	3280649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_009972	GGA	2	6	3281615	3281620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_009972	GTT	2	6	3282035	3282040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_009972	AG	3	6	3282737	3282742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_009972	AGCA	2	8	3283710	3283717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8024	NC_009972	CAG	2	6	3284046	3284051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_009972	TGA	2	6	3284761	3284766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_009972	TCCGCT	2	12	3284770	3284781	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8027	NC_009972	AAC	2	6	3284823	3284828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_009972	GCG	2	6	3285179	3285184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_009972	TTTCG	2	10	3285196	3285205	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8030	NC_009972	CTCGC	2	10	3285214	3285223	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8031	NC_009972	GCG	2	6	3285224	3285229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_009972	GCA	2	6	3286146	3286151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_009972	ATG	2	6	3286218	3286223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_009972	TGGT	2	8	3286231	3286238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_009972	TCG	2	6	3286270	3286275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_009972	CGG	2	6	3286295	3286300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_009972	AAT	2	6	3286304	3286309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_009972	TAG	2	6	3286326	3286331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_009972	CT	3	6	3286658	3286663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_009972	CTTTA	2	10	3286685	3286694	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8041	NC_009972	AGC	2	6	3286701	3286706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_009972	CAA	2	6	3287347	3287352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_009972	GCTG	2	8	3287359	3287366	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_009972	ATC	2	6	3287371	3287376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_009972	CAAAC	2	10	3287382	3287391	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8046	NC_009972	AGG	2	6	3287409	3287414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_009972	TGA	2	6	3288039	3288044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_009972	TAA	2	6	3288068	3288073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_009972	TTG	2	6	3292124	3292129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_009972	TGT	2	6	3292191	3292196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_009972	AAT	2	6	3292254	3292259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_009972	CAA	2	6	3292280	3292285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_009972	TCC	2	6	3293573	3293578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8054	NC_009972	A	6	6	3294975	3294980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_009972	TCC	2	6	3295579	3295584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_009972	GGTT	2	8	3295669	3295676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_009972	GCA	2	6	3295702	3295707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_009972	TGAT	2	8	3297393	3297400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_009972	ATTA	2	8	3297409	3297416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_009972	ATT	2	6	3297455	3297460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_009972	TTCG	2	8	3297511	3297518	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8062	NC_009972	TAAA	2	8	3303290	3303297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_009972	A	7	7	3303295	3303301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_009972	GCA	2	6	3303348	3303353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_009972	A	7	7	3303537	3303543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_009972	CTGTA	2	10	3303552	3303561	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8067	NC_009972	GCAG	2	8	3303592	3303599	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8070	NC_009972	CAGCA	2	10	3303766	3303775	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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8074	NC_009972	GA	3	6	3304036	3304041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_009972	TGAT	2	8	3304122	3304129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8083	NC_009972	AGG	2	6	3304429	3304434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8087	NC_009972	AGG	2	6	3305476	3305481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_009972	TAG	2	6	3305912	3305917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8094	NC_009972	GT	3	6	3307327	3307332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_009972	TGAT	2	8	3307353	3307360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_009972	TCT	2	6	3317552	3317557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_009972	GAA	2	6	3319421	3319426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_009972	ATC	2	6	3319622	3319627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8103	NC_009972	AGGC	2	8	3321458	3321465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8104	NC_009972	ACTA	2	8	3321466	3321473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8105	NC_009972	AGCC	2	8	3321905	3321912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8108	NC_009972	ATGG	2	8	3322791	3322798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_009972	AGC	2	6	3325244	3325249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8112	NC_009972	CTTG	2	8	3325368	3325375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8113	NC_009972	TTAAC	2	10	3325405	3325414	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8114	NC_009972	GACG	2	8	3325422	3325429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8115	NC_009972	GAG	2	6	3325450	3325455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_009972	GCAG	2	8	3326447	3326454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8117	NC_009972	TA	3	6	3328973	3328978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_009972	AGCTT	2	10	3330248	3330257	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8119	NC_009972	TAT	2	6	3330287	3330292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8127	NC_009972	TTA	2	6	3333675	3333680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8130	NC_009972	CCG	2	6	3333752	3333757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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