MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_009972	AAT	2	6	3056903	3056908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_009972	TCCG	2	8	3056988	3056995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7503	NC_009972	CAA	2	6	3060913	3060918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_009972	CTG	2	6	3061003	3061008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_009972	TTG	2	6	3061022	3061027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_009972	TCT	2	6	3061758	3061763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_009972	CAAT	2	8	3061777	3061784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7508	NC_009972	T	6	6	3063776	3063781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_009972	GCA	2	6	3063799	3063804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_009972	A	6	6	3063871	3063876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_009972	AAC	2	6	3063940	3063945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7512	NC_009972	AGC	2	6	3063952	3063957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_009972	CGG	2	6	3064599	3064604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_009972	TGG	2	6	3066487	3066492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_009972	T	6	6	3066520	3066525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_009972	CTG	2	6	3069857	3069862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_009972	CAAAG	2	10	3069923	3069932	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7518	NC_009972	CAAA	2	8	3069999	3070006	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7519	NC_009972	GGC	2	6	3070040	3070045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_009972	CGG	2	6	3071463	3071468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_009972	GTT	2	6	3071478	3071483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_009972	GTTTG	2	10	3071529	3071538	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_009972	CTCGC	2	10	3071549	3071558	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7524	NC_009972	GCT	2	6	3073337	3073342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7525	NC_009972	TG	3	6	3073356	3073361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_009972	ATG	2	6	3073396	3073401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_009972	GGC	2	6	3073414	3073419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_009972	GCA	2	6	3073500	3073505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_009972	ATT	2	6	3073589	3073594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_009972	TGT	2	6	3074352	3074357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_009972	CTC	2	6	3074363	3074368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7532	NC_009972	GCTA	2	8	3074378	3074385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7533	NC_009972	TCA	2	6	3074398	3074403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_009972	TGT	2	6	3074473	3074478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_009972	AATC	2	8	3074535	3074542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7536	NC_009972	ACT	2	6	3074587	3074592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_009972	CAA	2	6	3074688	3074693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_009972	CA	3	6	3074721	3074726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7539	NC_009972	ATA	2	6	3074733	3074738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_009972	AAAT	2	8	3074747	3074754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_009972	TCAA	2	8	3074790	3074797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7542	NC_009972	AT	3	6	3074815	3074820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_009972	AAATA	2	10	3074949	3074958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_009972	TTTA	2	8	3075075	3075082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_009972	TA	3	6	3075095	3075100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_009972	T	6	6	3075145	3075150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_009972	ATT	2	6	3075199	3075204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_009972	ATTA	2	8	3075268	3075275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_009972	CAT	2	6	3075323	3075328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_009972	TATT	2	8	3075334	3075341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_009972	TA	3	6	3075499	3075504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_009972	GCG	2	6	3091688	3091693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_009972	GAG	2	6	3091697	3091702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_009972	CTCGC	2	10	3091734	3091743	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7555	NC_009972	GAG	2	6	3091752	3091757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_009972	TG	3	6	3091789	3091794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_009972	AG	3	6	3095196	3095201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_009972	AT	3	6	3095204	3095209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_009972	ATTAA	2	10	3099886	3099895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_009972	GAT	2	6	3099971	3099976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_009972	CCA	2	6	3099981	3099986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7562	NC_009972	GTG	2	6	3100058	3100063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_009972	CAA	2	6	3100126	3100131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7564	NC_009972	GAT	2	6	3101471	3101476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_009972	CCA	2	6	3101481	3101486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7566	NC_009972	GTG	2	6	3101558	3101563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_009972	AG	3	6	3101600	3101605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_009972	GAG	2	6	3101616	3101621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_009972	TCAA	2	8	3102520	3102527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7571	NC_009972	CCAA	2	8	3102850	3102857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7572	NC_009972	CCAA	2	8	3102863	3102870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7573	NC_009972	AGCCC	2	10	3102939	3102948	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7574	NC_009972	TAC	2	6	3102984	3102989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_009972	TCCT	2	8	3102997	3103004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7576	NC_009972	CA	4	8	3103008	3103015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7577	NC_009972	TCT	2	6	3103023	3103028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7579	NC_009972	T	6	6	3104743	3104748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_009972	GAA	2	6	3104749	3104754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_009972	ATT	2	6	3104781	3104786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_009972	AGC	2	6	3104794	3104799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_009972	GCTA	2	8	3104806	3104813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7584	NC_009972	ACCA	2	8	3104848	3104855	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7585	NC_009972	GCG	2	6	3104931	3104936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7586	NC_009972	TAT	2	6	3106524	3106529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_009972	GTT	2	6	3112199	3112204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_009972	AT	3	6	3112248	3112253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_009972	TGC	2	6	3112264	3112269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7593	NC_009972	GCTT	2	8	3112411	3112418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7594	NC_009972	ATGAT	2	10	3112439	3112448	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_009972	AAGC	2	8	3112450	3112457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7596	NC_009972	CAG	2	6	3112475	3112480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7597	NC_009972	GCGG	2	8	3112505	3112512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7598	NC_009972	TAA	2	6	3113650	3113655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_009972	TGA	2	6	3113656	3113661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7601	NC_009972	AGC	2	6	3113733	3113738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_009972	ATT	2	6	3114461	3114466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_009972	CATC	2	8	3114475	3114482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7604	NC_009972	AAAT	2	8	3114515	3114522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_009972	TAA	2	6	3114542	3114547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_009972	GGA	2	6	3114620	3114625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7608	NC_009972	CTCGC	2	10	3116358	3116367	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7609	NC_009972	CGG	2	6	3116369	3116374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_009972	CTG	2	6	3117412	3117417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_009972	GCA	2	6	3117424	3117429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_009972	TGA	2	6	3117477	3117482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_009972	CCT	2	6	3118228	3118233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7614	NC_009972	GCCT	2	8	3118271	3118278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7615	NC_009972	TC	3	6	3118322	3118327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7616	NC_009972	T	7	7	3118925	3118931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_009972	TTGA	2	8	3120401	3120408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_009972	CTT	2	6	3120462	3120467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7619	NC_009972	TTGA	2	8	3120475	3120482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_009972	CGC	2	6	3120500	3120505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7621	NC_009972	TTGA	2	8	3120551	3120558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_009972	TTG	2	6	3120567	3120572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_009972	GTTT	2	8	3120592	3120599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_009972	TTGA	2	8	3120622	3120629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_009972	CGC	2	6	3120654	3120659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7626	NC_009972	TTC	2	6	3120663	3120668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7627	NC_009972	TTGA	2	8	3120697	3120704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_009972	CAG	3	9	3120742	3120750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_009972	GATT	2	8	3120826	3120833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_009972	AGA	2	6	3122692	3122697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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