MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_009972	ATAA	2	8	2849980	2849987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_009972	ATAA	2	8	2850054	2850061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_009972	TAT	2	6	2850093	2850098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_009972	CGC	2	6	2850113	2850118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_009972	ATAA	2	8	2850127	2850134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_009972	ATAA	2	8	2850202	2850209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_009972	ATAA	2	8	2850277	2850284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_009972	ATCG	2	8	2850311	2850318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7009	NC_009972	ATAA	2	8	2850350	2850357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_009972	ATAA	2	8	2850421	2850428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_009972	GCC	2	6	2850469	2850474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_009972	ATAA	2	8	2850491	2850498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_009972	ATG	2	6	2850552	2850557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_009972	ATAA	2	8	2850563	2850570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_009972	ATAA	2	8	2850635	2850642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_009972	CTGATA	2	12	2850667	2850678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7017	NC_009972	TCA	2	6	2850691	2850696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_009972	ATAA	2	8	2850710	2850717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_009972	ATAA	2	8	2850782	2850789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_009972	ATAA	2	8	2850856	2850863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_009972	ATAA	2	8	2850926	2850933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_009972	ATAA	2	8	2850997	2851004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_009972	AGC	2	6	2851033	2851038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_009972	ATA	2	6	2851056	2851061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_009972	ATAA	2	8	2851068	2851075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_009972	CATT	2	8	2851099	2851106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7027	NC_009972	TG	3	6	2851122	2851127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_009972	ATAA	2	8	2851141	2851148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_009972	CATA	2	8	2851214	2851221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7030	NC_009972	CATA	2	8	2851285	2851292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7031	NC_009972	CATA	2	8	2851356	2851363	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7032	NC_009972	AAC	2	6	2851386	2851391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_009972	CATA	2	8	2851428	2851435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7034	NC_009972	TGGC	2	8	2851469	2851476	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7035	NC_009972	ATAA	2	8	2851502	2851509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_009972	CGT	2	6	2851538	2851543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_009972	ATAA	2	8	2851574	2851581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_009972	A	7	7	2851598	2851604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_009972	TGA	2	6	2851607	2851612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_009972	GGA	2	6	2851641	2851646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_009972	GCC	2	6	2851657	2851662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7042	NC_009972	CCG	3	9	2851675	2851683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7043	NC_009972	GCC	2	6	2851686	2851691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7044	NC_009972	GCT	2	6	2851730	2851735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7048	NC_009972	TGA	2	6	2851887	2851892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_009972	CTG	2	6	2851901	2851906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_009972	CGG	2	6	2851920	2851925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_009972	TCC	2	6	2851948	2851953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7052	NC_009972	AGG	2	6	2852001	2852006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_009972	TGC	2	6	2852041	2852046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_009972	CGC	2	6	2852089	2852094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7056	NC_009972	CGC	2	6	2855397	2855402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7057	NC_009972	CTCG	2	8	2855438	2855445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_009972	GCT	2	6	2857841	2857846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_009972	AT	3	6	2857876	2857881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_009972	GCT	2	6	2857905	2857910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_009972	AGC	2	6	2857929	2857934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_009972	TGA	2	6	2858344	2858349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_009972	CTA	2	6	2858366	2858371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_009972	TAC	2	6	2858373	2858378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_009972	AGGA	2	8	2858486	2858493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_009972	TCC	2	6	2859647	2859652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7067	NC_009972	TGA	2	6	2859733	2859738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_009972	GGA	2	6	2859787	2859792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_009972	TAT	2	6	2865940	2865945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_009972	GAA	2	6	2865964	2865969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_009972	ATT	2	6	2865983	2865988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_009972	TTG	2	6	2866020	2866025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_009972	CGG	2	6	2866069	2866074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_009972	GGTT	2	8	2866103	2866110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_009972	CAC	2	6	2866167	2866172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7079	NC_009972	ATC	2	6	2867907	2867912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7081	NC_009972	AG	3	6	2868027	2868032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_009972	GAA	2	6	2868039	2868044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7084	NC_009972	GTA	2	6	2869161	2869166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7088	NC_009972	GTTT	2	8	2871961	2871968	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_009972	CAGC	2	8	2871989	2871996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7093	NC_009972	ACA	2	6	2873857	2873862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_009972	AGTCAA	2	12	2875772	2875783	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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7096	NC_009972	TAGT	2	8	2875880	2875887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_009972	AAAT	2	8	2875924	2875931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_009972	A	6	6	2875949	2875954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_009972	GAA	2	6	2880449	2880454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_009972	GAA	2	6	2880458	2880463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_009972	GCT	2	6	2880471	2880476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_009972	GTT	2	6	2880541	2880546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_009972	CAG	2	6	2880566	2880571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_009972	AAT	2	6	2880572	2880577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_009972	AAAT	2	8	2880579	2880586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_009972	A	6	6	2880594	2880599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7108	NC_009972	TAG	2	6	2885708	2885713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_009972	ATC	2	6	2885718	2885723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_009972	CAA	2	6	2885770	2885775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_009972	ACT	2	6	2888402	2888407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_009972	T	7	7	2888465	2888471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_009972	CTA	2	6	2890178	2890183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_009972	AAC	3	9	2892497	2892505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_009972	AGCT	2	8	2892529	2892536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7116	NC_009972	CAC	2	6	2892611	2892616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7117	NC_009972	ACC	2	6	2892624	2892629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_009972	GAT	2	6	2895338	2895343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_009972	TGA	2	6	2895348	2895353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_009972	ATATTT	2	12	2897301	2897312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_009972	TAAT	2	8	2897327	2897334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_009972	CGT	2	6	2897340	2897345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_009972	CTA	2	6	2897366	2897371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7125	NC_009972	CCT	2	6	2897398	2897403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7126	NC_009972	ACTTA	2	10	2898578	2898587	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7127	NC_009972	TGTGG	2	10	2902776	2902785	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_009972	AGC	2	6	2902812	2902817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_009972	GGT	2	6	2903289	2903294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7131	NC_009972	GGT	2	6	2903436	2903441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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