MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 chromosome

Total Repeats: 15226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009972	CCA	2	6	2135897	2135902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_009972	ATTGT	2	10	2135952	2135961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_009972	CAG	3	9	2136101	2136109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_009972	TTG	2	6	2136166	2136171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_009972	ATG	2	6	2136188	2136193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_009972	GCT	2	6	2136278	2136283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_009972	AACCCC	2	12	2136285	2136296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_009972	AGC	2	6	2136323	2136328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_009972	TTA	2	6	2137386	2137391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_009972	ATG	2	6	2137394	2137399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_009972	ACGTTT	2	12	2137412	2137423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5512	NC_009972	TGC	2	6	2140096	2140101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_009972	GCC	2	6	2140126	2140131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_009972	TTGC	2	8	2140139	2140146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_009972	TGCTA	2	10	2140168	2140177	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5516	NC_009972	GTT	2	6	2140228	2140233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_009972	GAA	2	6	2140259	2140264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_009972	AAC	2	6	2140302	2140307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_009972	AAC	2	6	2140384	2140389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_009972	TGG	2	6	2143413	2143418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_009972	GGT	2	6	2143428	2143433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_009972	ACAA	2	8	2146544	2146551	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5523	NC_009972	CTTT	2	8	2147520	2147527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5524	NC_009972	CAA	2	6	2147531	2147536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_009972	TC	3	6	2150250	2150255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_009972	ATT	2	6	2150312	2150317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_009972	TGC	2	6	2150409	2150414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_009972	TCC	2	6	2151492	2151497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_009972	TTA	2	6	2151538	2151543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_009972	ATA	2	6	2151560	2151565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_009972	ATCT	2	8	2151577	2151584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_009972	TGTT	2	8	2151637	2151644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_009972	TTG	2	6	2151715	2151720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_009972	GTTT	2	8	2151780	2151787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_009972	AGA	2	6	2152296	2152301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_009972	TAT	2	6	2152308	2152313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_009972	TCA	2	6	2152341	2152346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_009972	GAC	2	6	2152429	2152434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_009972	AACC	2	8	2152487	2152494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_009972	TAA	2	6	2153265	2153270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_009972	TAAA	2	8	2153273	2153280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_009972	TAG	2	6	2153325	2153330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_009972	TTA	2	6	2153357	2153362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_009972	ACT	2	6	2154866	2154871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_009972	TCC	2	6	2155197	2155202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_009972	CCT	2	6	2158868	2158873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_009972	GAA	2	6	2158913	2158918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_009972	TGG	2	6	2158936	2158941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_009972	AC	4	8	2158986	2158993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_009972	TAC	2	6	2159017	2159022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_009972	ATC	2	6	2159031	2159036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_009972	TGT	2	6	2159133	2159138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_009972	GTG	2	6	2159152	2159157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_009972	GTT	2	6	2159185	2159190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_009972	CCA	2	6	2199031	2199036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_009972	CGCTA	2	10	2199040	2199049	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5557	NC_009972	TTG	2	6	2199104	2199109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_009972	TCGA	2	8	2199223	2199230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_009972	GAT	2	6	2199246	2199251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_009972	GTGTT	2	10	2199267	2199276	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_009972	GGA	2	6	2199298	2199303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_009972	TGC	2	6	2201083	2201088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_009972	GCA	2	6	2201116	2201121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_009972	GCTA	2	8	2203643	2203650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5565	NC_009972	ACA	2	6	2203672	2203677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_009972	CCA	2	6	2203733	2203738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_009972	TCG	2	6	2203754	2203759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_009972	CGG	2	6	2203770	2203775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_009972	GAG	2	6	2203807	2203812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_009972	GCTA	2	8	2203875	2203882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_009972	GTG	2	6	2203892	2203897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_009972	CAA	2	6	2208141	2208146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_009972	GCA	2	6	2208156	2208161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_009972	GTT	2	6	2208180	2208185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_009972	GTT	2	6	2208239	2208244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_009972	GA	3	6	2208328	2208333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_009972	TGGT	2	8	2208351	2208358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_009972	GTG	2	6	2208375	2208380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_009972	TTC	2	6	2208466	2208471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_009972	AAT	2	6	2208493	2208498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_009972	TAAT	2	8	2208506	2208513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_009972	CAT	2	6	2208520	2208525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_009972	ACT	2	6	2208540	2208545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_009972	CTT	2	6	2208603	2208608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_009972	TGC	2	6	2208614	2208619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_009972	TTC	2	6	2208639	2208644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_009972	TCCT	2	8	2208702	2208709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_009972	CGC	2	6	2208766	2208771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_009972	CTT	2	6	2208794	2208799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_009972	TGC	2	6	2208805	2208810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_009972	TTC	2	6	2208830	2208835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_009972	CAA	2	6	2208856	2208861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_009972	TGG	2	6	2208942	2208947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_009972	CGC	2	6	2208986	2208991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_009972	CTTTT	2	10	2209012	2209021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5596	NC_009972	TTC	2	6	2209047	2209052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_009972	CAA	2	6	2209073	2209078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_009972	TACAGG	2	12	2209176	2209187	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5599	NC_009972	CTT	2	6	2209228	2209233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_009972	TTC	2	6	2209261	2209266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_009972	CAA	2	6	2209287	2209292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_009972	CCA	2	6	2209406	2209411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_009972	CGC	2	6	2209413	2209418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5604	NC_009972	CTT	2	6	2209441	2209446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_009972	TTC	2	6	2209474	2209479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_009972	GGT	2	6	2209526	2209531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_009972	ATCT	2	8	2209550	2209557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5608	NC_009972	ACA	2	6	2212265	2212270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_009972	AGC	2	6	2212279	2212284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_009972	CTG	2	6	2212317	2212322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_009972	AGCGT	2	10	2212326	2212335	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5612	NC_009972	ACT	2	6	2212350	2212355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_009972	CCCG	2	8	2212379	2212386	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5614	NC_009972	TAAA	2	8	2212392	2212399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_009972	GCG	2	6	2212403	2212408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_009972	GATT	2	8	2212443	2212450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_009972	GGA	2	6	2212458	2212463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_009972	GTT	2	6	2213617	2213622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_009972	AAATTG	2	12	2213734	2213745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_009972	CCATT	2	10	2213823	2213832	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5621	NC_009972	ATT	2	6	2213840	2213845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_009972	CTG	2	6	2213977	2213982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_009972	TCAA	2	8	2213994	2214001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5624	NC_009972	GT	4	8	2214032	2214039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_009972	CA	3	6	2214595	2214600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5626	NC_009972	ACA	2	6	2214627	2214632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_009972	AGA	2	6	2214641	2214646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_009972	CTTT	2	8	2246737	2246744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5630	NC_009972	CTTC	2	8	2248154	2248161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5884	NC_009972	CATT	2	8	2417462	2417469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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