MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae PittEE chromosome

Total Repeats: 8294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009566	GGC	2	6	32	37	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009566	GAA	3	9	53	61	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009566	ATG	2	6	111	116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009566	TGC	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009566	GTT	2	6	191	196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009566	A	7	7	305	311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009566	TTTC	2	8	330	337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009566	GAA	2	6	353	358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009566	GAA	2	6	376	381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009566	TGCAT	2	10	443	452	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009566	TAT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009566	TGG	2	6	488	493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009566	CTTTC	2	10	513	522	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009566	ATC	2	6	530	535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009566	TAG	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009566	TAGT	2	8	702	709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009566	TATT	2	8	750	757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009566	TCT	2	6	779	784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009566	TTAGTG	2	12	914	925	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009566	GTA	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009566	TA	3	6	1035	1040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009566	CAA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009566	TAAAA	2	10	1158	1167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009566	ATG	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009566	CCA	2	6	1216	1221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009566	TGG	2	6	1243	1248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009566	CAA	2	6	1278	1283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009566	ATA	2	6	1329	1334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009566	AATC	2	8	1367	1374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009566	TTG	2	6	1379	1384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009566	ATT	4	12	1419	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009566	T	8	8	1429	1436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009566	TGT	2	6	4416	4421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009566	AAAAT	2	10	4423	4432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009566	T	6	6	4491	4496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009566	TGTA	2	8	4527	4534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009566	ATT	2	6	4622	4627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009566	CGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009566	C	7	7	4684	4690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_009566	AAT	2	6	4770	4775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009566	ATA	2	6	4832	4837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009566	AC	3	6	4929	4934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009566	GTA	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009566	TGA	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009566	A	6	6	5030	5035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009566	TCA	2	6	5083	5088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009566	ATT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009566	GGC	2	6	5138	5143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009566	TGTT	2	8	5156	5163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009566	TGAT	2	8	5187	5194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009566	TTGG	2	8	5232	5239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009566	TAT	2	6	5269	5274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009566	TCC	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_009566	TCA	2	6	5335	5340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009566	GAA	2	6	5396	5401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009566	AAATG	2	10	5479	5488	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009566	TTA	2	6	5572	5577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009566	ATT	2	6	5601	5606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009566	ATT	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009566	ATTT	2	8	5644	5651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009566	A	6	6	5659	5664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009566	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009566	ATTA	2	8	5772	5779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009566	TTAC	2	8	5851	5858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009566	TTC	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009566	TCA	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009566	TCA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009566	CTG	3	9	5939	5947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009566	TGC	3	9	5952	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009566	CTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009566	ATG	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009566	TTC	2	6	6066	6071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009566	GTT	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009566	AAC	2	6	6212	6217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009566	AAAG	2	8	6245	6252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009566	GTT	2	6	6263	6268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009566	TGG	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009566	CAT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009566	ACA	2	6	6343	6348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009566	GAA	2	6	6452	6457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009566	TAT	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009566	TGC	2	6	6556	6561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009566	TTTC	2	8	6564	6571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009566	CAA	2	6	6606	6611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009566	GCA	2	6	6653	6658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009566	GCA	2	6	6731	6736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009566	TTGT	2	8	6789	6796	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009566	ATT	2	6	6877	6882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009566	TGT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009566	A	6	6	6900	6905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009566	TTTA	2	8	6916	6923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009566	GAA	2	6	6954	6959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009566	CTTT	2	8	8258	8265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009566	TAA	2	6	8313	8318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009566	AAAAT	2	10	10311	10320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009566	T	6	6	10350	10355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009566	TAG	2	6	10380	10385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009566	T	7	7	10386	10392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009566	T	6	6	10423	10428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009566	GATA	2	8	10440	10447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009566	CTTT	2	8	10471	10478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009566	GATA	2	8	10479	10486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009566	ATAA	2	8	10557	10564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009566	TCAA	2	8	11057	11064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009566	ATT	2	6	11075	11080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009566	TA	3	6	11106	11111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009566	T	7	7	11113	11119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009566	TAA	2	6	11131	11136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009566	ATAA	2	8	11153	11160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009566	TAA	2	6	11216	11221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009566	AC	3	6	11233	11238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009566	A	7	7	11331	11337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009566	TAA	2	6	11341	11346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009566	AAT	2	6	11348	11353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009566	TA	3	6	11362	11367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009566	T	7	7	11428	11434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009566	T	6	6	11470	11475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009566	AATA	2	8	11482	11489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009566	T	6	6	13391	13396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009566	A	6	6	13400	13405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009566	ATT	2	6	13457	13462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009566	TA	3	6	13504	13509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009566	T	6	6	13518	13523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009566	AAC	2	6	13525	13530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009566	ATTCT	2	10	13531	13540	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009566	T	6	6	13563	13568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009566	TAAG	2	8	13956	13963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009566	TGA	2	6	14603	14608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009566	TA	3	6	14620	14625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009566	TAAA	2	8	14635	14642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009566	CTT	2	6	16803	16808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009566	AGA	2	6	18043	18048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009566	AAAAG	2	10	18053	18062	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009566	T	6	6	18083	18088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009566	ATT	2	6	18125	18130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009566	T	6	6	19871	19876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009566	ATA	2	6	19877	19882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009566	CG	3	6	19902	19907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009566	AATG	2	8	20667	20674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009566	AAT	2	6	20676	20681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009566	TCTA	2	8	20705	20712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009566	T	8	8	20721	20728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009566	ATA	2	6	21033	21038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009566	T	7	7	21788	21794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009566	GTT	2	6	21804	21809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009566	TAT	2	6	21830	21835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009566	AATT	2	8	21863	21870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009566	TTC	2	6	23491	23496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_009566	T	6	6	23996	24001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009566	AGCC	2	8	24014	24021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009566	T	7	7	24047	24053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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