MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorhodospira halophila SL1 chromosome

Total Repeats: 5010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008789	GGT	2	6	335420	335425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008789	GCG	2	6	336243	336248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_008789	TCC	2	6	336251	336256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_008789	AGG	2	6	336370	336375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008789	GCC	2	6	336575	336580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_008789	T	6	6	340264	340269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008789	GCTTA	2	10	340295	340304	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
508	NC_008789	GCT	2	6	343364	343369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008789	CTC	2	6	347534	347539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_008789	TC	3	6	347538	347543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_008789	GGT	2	6	348883	348888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008789	AG	3	6	348936	348941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008789	TA	3	6	348956	348961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008789	GC	3	6	348983	348988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_008789	CG	3	6	349001	349006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_008789	CCCCG	2	10	349022	349031	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
517	NC_008789	ATG	2	6	350596	350601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008789	CTC	2	6	352573	352578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_008789	GCG	2	6	352582	352587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_008789	GCA	2	6	352603	352608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_008789	TGG	2	6	352614	352619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008789	GCG	2	6	352681	352686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008789	GGC	2	6	352705	352710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_008789	C	6	6	352769	352774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
525	NC_008789	CG	3	6	352776	352781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_008789	CGG	3	9	355324	355332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_008789	CCG	2	6	355402	355407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_008789	CCG	2	6	358105	358110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_008789	TGCT	2	8	358146	358153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_008789	TC	3	6	359250	359255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_008789	TCA	2	6	359390	359395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_008789	TGA	2	6	359408	359413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008789	C	6	6	359455	359460	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
534	NC_008789	ATT	2	6	359500	359505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008789	C	7	7	359586	359592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
536	NC_008789	ACC	3	9	359608	359616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_008789	T	6	6	359659	359664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008789	CCCA	2	8	359667	359674	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
539	NC_008789	TCC	2	6	359693	359698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_008789	ACTC	2	8	359721	359728	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_008789	ACCC	2	8	359789	359796	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
542	NC_008789	T	8	8	359846	359853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008789	C	6	6	359886	359891	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
544	NC_008789	CAA	2	6	359946	359951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008789	TTC	2	6	359976	359981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008789	GAC	2	6	360019	360024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_008789	T	7	7	360054	360060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008789	GGT	2	6	361774	361779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008789	CGC	2	6	361792	361797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_008789	CGG	2	6	361986	361991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_008789	GCCC	2	8	361997	362004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
552	NC_008789	TCA	2	6	362293	362298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008789	AG	3	6	362373	362378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008789	A	6	6	362383	362388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008789	TCA	2	6	363068	363073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_008789	AAT	2	6	363193	363198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008789	TAAA	2	8	363273	363280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008789	AT	3	6	363404	363409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008789	TCT	2	6	363415	363420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_008789	CGA	2	6	363473	363478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_008789	AAT	2	6	363564	363569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008789	GAA	2	6	363577	363582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008789	AC	3	6	364742	364747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_008789	GA	3	6	364757	364762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008789	GAT	2	6	364824	364829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008789	TAT	2	6	365014	365019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008789	CTT	2	6	365104	365109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_008789	AAG	2	6	365136	365141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008789	ATT	2	6	365366	365371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008789	T	6	6	365375	365380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008789	GTT	2	6	365403	365408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008789	TCAT	2	8	365418	365425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_008789	TGA	2	6	365446	365451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008789	GTT	2	6	365468	365473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008789	GTA	2	6	365535	365540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008789	GTT	2	6	365588	365593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008789	ATCTC	2	10	365596	365605	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
578	NC_008789	TCTTT	2	10	365627	365636	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
579	NC_008789	CAG	2	6	365660	365665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_008789	GTT	2	6	365690	365695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008789	AAG	2	6	365709	365714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008789	ATC	2	6	365768	365773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_008789	CAAA	2	8	365776	365783	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_008789	GAT	2	6	365856	365861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008789	CCT	2	6	366218	366223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_008789	AGG	2	6	366232	366237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008789	TCA	2	6	366240	366245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_008789	GAT	2	6	366297	366302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008789	G	6	6	366313	366318	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008789	GAA	2	6	366320	366325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008789	A	6	6	366332	366337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008789	TAA	2	6	366358	366363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008789	GGTT	2	8	366989	366996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008789	CG	3	6	367038	367043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_008789	GGCA	2	8	367069	367076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
596	NC_008789	GGC	2	6	368307	368312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008789	CTG	2	6	370171	370176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_008789	TCT	2	6	376662	376667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_008789	CAA	2	6	376684	376689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_008789	A	8	8	376688	376695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008789	GGT	2	6	376825	376830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008789	CGCT	2	8	376834	376841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
603	NC_008789	TGG	2	6	376870	376875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008789	TGC	2	6	376993	376998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_008789	ACG	2	6	377256	377261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008789	TGA	2	6	377336	377341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008789	CTC	2	6	377362	377367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_008789	GGA	2	6	377386	377391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008789	ACC	2	6	377451	377456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_008789	CTC	2	6	377570	377575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_008789	GAG	2	6	377589	377594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008789	CTAC	2	8	377610	377617	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_008789	CACG	2	8	377618	377625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_008789	GGT	2	6	377674	377679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008789	GC	3	6	377707	377712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_008789	GTA	2	6	377771	377776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008789	ATTTCA	2	12	377830	377841	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
618	NC_008789	GCC	2	6	377944	377949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_008789	C	6	6	378106	378111	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
620	NC_008789	TC	3	6	378201	378206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_008789	CGT	2	6	378325	378330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_008789	CTT	2	6	378421	378426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_008789	GCA	2	6	378439	378444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_008789	TCC	2	6	378637	378642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_008789	GCG	2	6	378647	378652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008789	CTTT	2	8	378760	378767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_008789	GCT	2	6	378776	378781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008789	CCT	2	6	378792	378797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_008789	GAC	2	6	378880	378885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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631	NC_008789	C	6	6	378968	378973	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
632	NC_008789	CAG	2	6	379126	379131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_008789	GCTC	2	8	379164	379171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
634	NC_008789	AAGT	2	8	379258	379265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008789	TCGG	2	8	379405	379412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
636	NC_008789	GGA	2	6	379431	379436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008789	C	6	6	379441	379446	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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639	NC_008789	TCC	2	6	379627	379632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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