MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 5764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008309	ATG	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008309	AAT	2	6	57	62	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008309	A	7	7	155	161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008309	CTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008309	ATT	2	6	200	205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008309	T	6	6	204	209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008309	AAT	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008309	A	6	6	266	271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008309	TTA	3	9	289	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008309	CAA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008309	T	8	8	304	311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008309	GAA	2	6	335	340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008309	T	8	8	1317	1324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008309	GGT	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008309	CTC	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008309	CAG	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008309	GAG	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008309	GTTA	2	8	1480	1487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008309	TGT	2	6	1488	1493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008309	ATT	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008309	AATTTA	2	12	1577	1588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008309	CAA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008309	A	6	6	1765	1770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008309	ATG	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008309	T	6	6	1791	1796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008309	A	7	7	1808	1814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008309	AAT	2	6	1825	1830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008309	TAA	3	9	1834	1842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008309	CTTTT	2	10	1853	1862	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008309	TA	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008309	ATTA	2	8	1897	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008309	GAT	2	6	3349	3354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008309	ATC	2	6	3367	3372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008309	TAT	2	6	3949	3954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008309	TAA	2	6	3971	3976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008309	A	6	6	3982	3987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008309	ACAAG	2	10	5461	5470	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008309	AGCA	2	8	5503	5510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008309	T	6	6	5561	5566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008309	AAC	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008309	TAA	2	6	8183	8188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008309	T	6	6	8240	8245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008309	T	6	6	10230	10235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008309	A	6	6	10249	10254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008309	CAA	2	6	10255	10260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008309	AAT	2	6	10275	10280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008309	T	6	6	12120	12125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008309	ATT	2	6	12175	12180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008309	AAT	2	6	12186	12191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008309	AAT	2	6	12196	12201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008309	T	8	8	12217	12224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008309	A	8	8	12227	12234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008309	T	6	6	18438	18443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008309	GAG	2	6	18453	18458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008309	A	6	6	18467	18472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008309	TATTT	2	10	18473	18482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008309	TGT	2	6	18498	18503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008309	TGA	2	6	18526	18531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008309	TTC	2	6	18718	18723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008309	TCA	2	6	18743	18748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008309	ATA	2	6	18771	18776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008309	A	6	6	18799	18804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008309	ATT	3	9	18828	18836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008309	A	6	6	18889	18894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008309	AGG	2	6	18899	18904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008309	ACTAA	2	10	18924	18933	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008309	A	6	6	18940	18945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008309	TA	3	6	18986	18991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008309	A	6	6	21213	21218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008309	T	6	6	21265	21270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008309	GAG	2	6	21280	21285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008309	A	6	6	21294	21299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008309	ATT	2	6	21320	21325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008309	ACA	2	6	21326	21331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008309	GT	3	6	21352	21357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008309	AATTA	2	10	21385	21394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008309	AAAT	2	8	22285	22292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008309	A	6	6	22333	22338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008309	CTGT	2	8	22354	22361	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008309	GAC	2	6	22377	22382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008309	TAAC	2	8	23451	23458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008309	TAA	2	6	23467	23472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008309	TGTT	2	8	24473	24480	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008309	TTA	2	6	26280	26285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008309	TAA	2	6	26355	26360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008309	T	6	6	26426	26431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008309	CTTT	2	8	28811	28818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008309	AAAAC	2	10	28865	28874	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008309	GAT	2	6	30089	30094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008309	AT	3	6	30177	30182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008309	ATCT	2	8	30198	30205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008309	TTACTT	2	12	30206	30217	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008309	GAT	2	6	30218	30223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008309	TAGA	2	8	30291	30298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008309	CAA	2	6	30299	30304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008309	ACTTT	2	10	31059	31068	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008309	A	8	8	31094	31101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008309	CAAA	2	8	31119	31126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008309	AG	3	6	31167	31172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008309	CTT	2	6	31211	31216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008309	GAA	2	6	31228	31233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008309	TTCT	2	8	32228	32235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008309	TC	3	6	32247	32252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008309	AGG	2	6	32253	32258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008309	ATTT	2	8	32268	32275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008309	TGT	2	6	37281	37286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008309	TAA	2	6	37328	37333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008309	GATT	2	8	37355	37362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008309	T	6	6	38101	38106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008309	TA	3	6	38111	38116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008309	A	6	6	38130	38135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008309	A	7	7	38177	38183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008309	TA	3	6	39147	39152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008309	ATT	2	6	39236	39241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008309	ATT	2	6	39734	39739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008309	ATAAAA	2	12	43574	43585	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008309	T	6	6	44192	44197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008309	AAATA	2	10	44201	44210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008309	A	6	6	44244	44249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008309	T	6	6	44299	44304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008309	TCTA	2	8	47478	47485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008309	A	7	7	47532	47538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008309	A	6	6	47545	47550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008309	GAG	2	6	48636	48641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008309	TTG	2	6	48648	48653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008309	TAA	2	6	48661	48666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008309	GAA	2	6	49386	49391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008309	ATA	2	6	49421	49426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008309	TCC	2	6	49440	49445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008309	AT	3	6	52038	52043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008309	TACAA	2	10	53219	53228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008309	AATG	2	8	53231	53238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008309	TGA	2	6	53256	53261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008309	GTT	2	6	53262	53267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008309	TTG	2	6	53269	53274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008309	AAT	2	6	53334	53339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008309	GAA	2	6	53384	53389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008309	TCC	2	6	55073	55078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008309	TAT	2	6	56074	56079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008309	ATTTTA	2	12	56087	56098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008309	A	7	7	56153	56159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008309	A	8	8	56194	56201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008309	ATG	2	6	59786	59791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008309	TTG	2	6	59831	59836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008309	T	6	6	59847	59852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008309	GAG	2	6	59869	59874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008309	TA	3	6	60903	60908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008309	ATT	2	6	62890	62895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008309	T	7	7	62921	62927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008309	CAC	2	6	62947	62952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_008309	GGA	2	6	63033	63038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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