MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008212	CTG	2	6	421150	421155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_008212	AAG	2	6	421234	421239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_008212	TCA	2	6	421273	421278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_008212	GTT	2	6	421299	421304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_008212	CGC	2	6	421330	421335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2006	NC_008212	CATG	2	8	421373	421380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2007	NC_008212	TCG	2	6	421392	421397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_008212	AAAAC	2	10	421451	421460	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2009	NC_008212	CTC	2	6	421481	421486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2010	NC_008212	CTC	2	6	421546	421551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_008212	TCC	2	6	421583	421588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_008212	GGT	2	6	421626	421631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_008212	AAAGTC	2	12	421677	421688	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2014	NC_008212	GCAA	2	8	421737	421744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2015	NC_008212	ACT	3	9	421807	421815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_008212	CAA	2	6	421831	421836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_008212	GA	3	6	421870	421875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_008212	CTGA	2	8	421882	421889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2019	NC_008212	CTT	2	6	421912	421917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_008212	CTA	2	6	421925	421930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_008212	AC	3	6	422070	422075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2022	NC_008212	AGT	2	6	422144	422149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_008212	GA	3	6	422195	422200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_008212	GTA	2	6	422291	422296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_008212	CA	3	6	422315	422320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2026	NC_008212	TATG	2	8	422325	422332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_008212	AC	3	6	422341	422346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2028	NC_008212	ATT	2	6	422384	422389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_008212	CTG	2	6	429089	429094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_008212	TTA	2	6	429096	429101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_008212	ATA	2	6	429136	429141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_008212	TGA	2	6	429143	429148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_008212	ATT	2	6	429251	429256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_008212	GCA	2	6	429333	429338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_008212	AC	3	6	429340	429345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2036	NC_008212	TCC	2	6	429369	429374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2037	NC_008212	GTCAAT	2	12	429416	429427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2038	NC_008212	ACC	2	6	429470	429475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2039	NC_008212	ACTGT	2	10	429571	429580	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2040	NC_008212	GTAT	2	8	429596	429603	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_008212	TAT	2	6	430208	430213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_008212	AT	3	6	430295	430300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_008212	TGT	2	6	430397	430402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_008212	AC	3	6	430454	430459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_008212	TCA	2	6	430484	430489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_008212	GATC	2	8	430537	430544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2047	NC_008212	TCCA	2	8	430580	430587	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2048	NC_008212	AGG	2	6	430669	430674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_008212	CACG	2	8	431976	431983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2050	NC_008212	ACATG	2	10	432020	432029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2051	NC_008212	AATA	2	8	432055	432062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_008212	GCA	3	9	433503	433511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_008212	AAT	2	6	434085	434090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_008212	AATT	2	8	434093	434100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_008212	TGTT	2	8	434101	434108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_008212	ATG	2	6	434190	434195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_008212	AATCG	2	10	434207	434216	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2058	NC_008212	TC	3	6	434218	434223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2059	NC_008212	GCA	2	6	434241	434246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2060	NC_008212	T	7	7	434260	434266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_008212	CT	3	6	434277	434282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2062	NC_008212	ATA	2	6	434327	434332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_008212	TC	3	6	434342	434347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2064	NC_008212	GGA	2	6	434393	434398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_008212	AACG	2	8	434426	434433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2066	NC_008212	GAAT	2	8	434480	434487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_008212	TAAC	2	8	434494	434501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2068	NC_008212	TGA	2	6	434844	434849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_008212	ATT	2	6	434860	434865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_008212	TAG	2	6	434880	434885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_008212	GT	4	8	434919	434926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_008212	TG	3	6	434993	434998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_008212	CATC	2	8	435002	435009	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2074	NC_008212	TCC	3	9	436636	436644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2078	NC_008212	GTT	2	6	436734	436739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2079	NC_008212	CTG	2	6	436773	436778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2081	NC_008212	CAAGCG	2	12	436826	436837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2082	NC_008212	ACCG	2	8	436943	436950	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2083	NC_008212	GAT	2	6	436968	436973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2084	NC_008212	GCC	2	6	436998	437003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2085	NC_008212	TCG	2	6	437005	437010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2086	NC_008212	TGG	2	6	437014	437019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2087	NC_008212	TAT	3	9	437048	437056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2090	NC_008212	TGC	2	6	437231	437236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2092	NC_008212	GATTG	2	10	437272	437281	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_008212	CG	3	6	437603	437608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2094	NC_008212	CT	3	6	438345	438350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2095	NC_008212	ATC	2	6	438362	438367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2096	NC_008212	TTA	2	6	438369	438374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_008212	ACC	2	6	439265	439270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2098	NC_008212	GCACC	2	10	439330	439339	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2099	NC_008212	CGG	2	6	439459	439464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_008212	GT	3	6	439476	439481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_008212	ATA	2	6	440257	440262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_008212	TCAG	2	8	440279	440286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2103	NC_008212	TACTC	2	10	440981	440990	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2104	NC_008212	TC	3	6	440989	440994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2105	NC_008212	TGT	2	6	441007	441012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_008212	TAC	2	6	441013	441018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2107	NC_008212	ATA	2	6	441069	441074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_008212	AAT	2	6	441121	441126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_008212	A	7	7	441127	441133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_008212	CAG	2	6	441455	441460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_008212	TGAT	2	8	441511	441518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_008212	AT	3	6	441567	441572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_008212	TGCA	2	8	441587	441594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2114	NC_008212	ATG	3	9	441595	441603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_008212	AT	3	6	442849	442854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_008212	TAA	2	6	442889	442894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_008212	GAT	2	6	442906	442911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_008212	AT	3	6	442960	442965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_008212	ATT	2	6	443078	443083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_008212	TA	3	6	443084	443089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_008212	GT	3	6	443114	443119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_008212	GAC	2	6	444379	444384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_008212	AATGT	2	10	444456	444465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_008212	TCC	2	6	444500	444505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2125	NC_008212	CCG	2	6	444506	444511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2126	NC_008212	A	6	6	444590	444595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2127	NC_008212	GTT	2	6	444670	444675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_008212	ATAG	2	8	444818	444825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_008212	TA	3	6	444903	444908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_008212	GGTAA	2	10	445012	445021	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_008212	GTGA	2	8	445063	445070	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_008212	ATTC	2	8	445087	445094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2133	NC_008212	AT	3	6	445106	445111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_008212	AAC	2	6	445145	445150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2135	NC_008212	TCA	2	6	445151	445156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_008212	ATC	2	6	445166	445171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2138	NC_008212	ATC	2	6	446759	446764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2265	NC_008212	TATC	2	8	472032	472039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2395	NC_008212	TGA	2	6	495472	495477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2402	NC_008212	TA	3	6	498424	498429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2403	NC_008212	TCA	2	6	498501	498506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2407	NC_008212	TTCG	2	8	498813	498820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2408	NC_008212	TTC	2	6	498852	498857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2409	NC_008212	ACGC	2	8	498904	498911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2410	NC_008212	ACG	2	6	498978	498983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2411	NC_008212	TCC	2	6	499026	499031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2412	NC_008212	GAT	2	6	499100	499105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2414	NC_008212	CG	3	6	499152	499157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2442	NC_008212	TC	3	6	502728	502733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2443	NC_008212	GA	3	6	502743	502748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2447	NC_008212	AAG	2	6	505491	505496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2452	NC_008212	CCG	2	6	505763	505768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2481	NC_008212	A	6	6	518790	518795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2482	NC_008212	CATG	2	8	518893	518900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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