MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008212	CG	3	6	2909788	2909793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15502	NC_008212	TTA	2	6	2909835	2909840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_008212	GCT	2	6	2909846	2909851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15504	NC_008212	AAAT	2	8	2909892	2909899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_008212	TGA	2	6	2909981	2909986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_008212	GTC	2	6	2909994	2909999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15507	NC_008212	GAC	2	6	2910015	2910020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_008212	AG	3	6	2910035	2910040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_008212	CCT	2	6	2910071	2910076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15510	NC_008212	TCAA	2	8	2910114	2910121	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15511	NC_008212	AAT	2	6	2910128	2910133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_008212	GAT	2	6	2910149	2910154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_008212	TAA	2	6	2910168	2910173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_008212	AT	3	6	2910181	2910186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_008212	A	7	7	2910212	2910218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_008212	GTA	2	6	2911275	2911280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_008212	ATTA	2	8	2911360	2911367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_008212	TTC	2	6	2911383	2911388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15519	NC_008212	GCT	2	6	2911389	2911394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_008212	TAG	2	6	2911439	2911444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_008212	CATAT	2	10	2911457	2911466	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15522	NC_008212	AT	3	6	2912709	2912714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_008212	TA	3	6	2912721	2912726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_008212	TAT	2	6	2912769	2912774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_008212	GAT	2	6	2912776	2912781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_008212	TA	3	6	2912869	2912874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_008212	TAT	2	6	2912932	2912937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_008212	TAG	2	6	2912967	2912972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_008212	ATA	2	6	2912988	2912993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_008212	AT	3	6	2913001	2913006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_008212	ATC	2	6	2914937	2914942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_008212	CAA	2	6	2914970	2914975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_008212	TC	3	6	2915026	2915031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15534	NC_008212	ATAG	2	8	2915184	2915191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_008212	CA	3	6	2915289	2915294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15536	NC_008212	TCG	2	6	2915333	2915338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_008212	ACT	2	6	2915370	2915375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_008212	GAC	2	6	2915408	2915413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15539	NC_008212	CGA	2	6	2915528	2915533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15540	NC_008212	GAC	2	6	2915557	2915562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15541	NC_008212	GAG	2	6	2915628	2915633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_008212	GGT	2	6	2915741	2915746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_008212	GT	3	6	2915790	2915795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_008212	AT	3	6	2915831	2915836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_008212	ATG	2	6	2915858	2915863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_008212	CGT	2	6	2916215	2916220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_008212	CGA	2	6	2916227	2916232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15548	NC_008212	TCG	2	6	2916235	2916240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15549	NC_008212	CGT	2	6	2916299	2916304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15550	NC_008212	GGA	2	6	2916314	2916319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_008212	CG	3	6	2916379	2916384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15552	NC_008212	GCG	2	6	2916394	2916399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15553	NC_008212	GATG	2	8	2916414	2916421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_008212	CTAATT	2	12	2916435	2916446	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15555	NC_008212	ATT	2	6	2916458	2916463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_008212	TTC	2	6	2916489	2916494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_008212	TCT	2	6	2916514	2916519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_008212	GCA	2	6	2916526	2916531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15559	NC_008212	AGTT	2	8	2916537	2916544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_008212	T	9	9	2916583	2916591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_008212	GTC	3	9	2916631	2916639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_008212	ATG	2	6	2916640	2916645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_008212	ATTTG	2	10	2916713	2916722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_008212	CAAAG	2	10	2916744	2916753	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15565	NC_008212	GGA	2	6	2916766	2916771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_008212	AT	3	6	2916772	2916777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_008212	AAG	2	6	2916785	2916790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_008212	ACCA	2	8	2916798	2916805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15569	NC_008212	CCA	2	6	2916817	2916822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15570	NC_008212	TGA	2	6	2916837	2916842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_008212	CAA	2	6	2916854	2916859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15572	NC_008212	CAC	2	6	2916884	2916889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15573	NC_008212	CT	3	6	2916924	2916929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15574	NC_008212	ATTC	2	8	2919609	2919616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15575	NC_008212	ATA	2	6	2919644	2919649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_008212	ACA	2	6	2919664	2919669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15577	NC_008212	AGTG	2	8	2919788	2919795	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_008212	TTTTC	2	10	2920962	2920971	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15579	NC_008212	TGG	2	6	2921021	2921026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_008212	GGTG	2	8	2923995	2924002	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_008212	ACC	2	6	2924032	2924037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15582	NC_008212	GTCT	2	8	2924053	2924060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15583	NC_008212	ATA	2	6	2925241	2925246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_008212	AT	3	6	2926453	2926458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_008212	ATTA	2	8	2930301	2930308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_008212	TGA	2	6	2932275	2932280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_008212	T	8	8	2932304	2932311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_008212	CAG	2	6	2932342	2932347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15589	NC_008212	CTG	2	6	2932441	2932446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15590	NC_008212	TCA	2	6	2932504	2932509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15591	NC_008212	T	6	6	2932545	2932550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_008212	GTC	2	6	2932554	2932559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15593	NC_008212	CAT	2	6	2932585	2932590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15594	NC_008212	CAA	2	6	2932792	2932797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15595	NC_008212	CA	3	6	2933001	2933006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15596	NC_008212	CTTT	2	8	2933020	2933027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15597	NC_008212	TGA	3	9	2933839	2933847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_008212	CAC	2	6	2934390	2934395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15599	NC_008212	CAG	2	6	2934400	2934405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15600	NC_008212	GA	3	6	2934490	2934495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_008212	ACG	2	6	2934527	2934532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15602	NC_008212	GA	3	6	2935007	2935012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_008212	CGCTAC	2	12	2935015	2935026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15604	NC_008212	ATA	2	6	2935027	2935032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_008212	ACC	2	6	2935105	2935110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15606	NC_008212	AGTC	2	8	2935115	2935122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15607	NC_008212	GCA	2	6	2935244	2935249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15608	NC_008212	ACGT	2	8	2935259	2935266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15609	NC_008212	TGG	2	6	2935283	2935288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_008212	GCA	2	6	2935347	2935352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15611	NC_008212	CTTA	2	8	2935381	2935388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15612	NC_008212	TAC	2	6	2935406	2935411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15613	NC_008212	TA	3	6	2935458	2935463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_008212	CACC	2	8	2936766	2936773	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15615	NC_008212	TTTCT	2	10	2936810	2936819	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15616	NC_008212	CAG	2	6	2936898	2936903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15617	NC_008212	GA	3	6	2936912	2936917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_008212	GT	4	8	2938317	2938324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_008212	CTA	2	6	2938377	2938382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15620	NC_008212	TCG	2	6	2938572	2938577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15621	NC_008212	CTG	2	6	2938629	2938634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15622	NC_008212	GAA	2	6	2939544	2939549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15623	NC_008212	GGA	2	6	2939600	2939605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15624	NC_008212	CAC	2	6	2939715	2939720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15625	NC_008212	GGT	2	6	2939726	2939731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15626	NC_008212	TCG	2	6	2939796	2939801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15627	NC_008212	GA	4	8	2939875	2939882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_008212	GGA	2	6	2939885	2939890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15631	NC_008212	CAG	2	6	2940028	2940033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15633	NC_008212	GAGG	2	8	2940184	2940191	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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15637	NC_008212	CTT	2	6	2941556	2941561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15754	NC_008212	GTC	2	6	2952453	2952458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15755	NC_008212	TCC	2	6	2952470	2952475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15756	NC_008212	ACG	2	6	2952540	2952545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15757	NC_008212	CGGG	2	8	2952550	2952557	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15758	NC_008212	CGA	2	6	2952565	2952570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15759	NC_008212	TCG	2	6	2952598	2952603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15760	NC_008212	CGC	2	6	2952650	2952655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15761	NC_008212	GAA	2	6	2952753	2952758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15762	NC_008212	TCG	2	6	2952798	2952803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15763	NC_008212	TTG	2	6	2953550	2953555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15764	NC_008212	CGC	2	6	2953574	2953579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15766	NC_008212	TGGTG	2	10	2954935	2954944	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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15769	NC_008212	AGTC	2	8	2955046	2955053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15770	NC_008212	CCA	2	6	2955074	2955079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15772	NC_008212	ATC	2	6	2955214	2955219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15775	NC_008212	CGA	2	6	2955306	2955311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15776	NC_008212	CCG	2	6	2955321	2955326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15777	NC_008212	TCG	2	6	2955341	2955346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15778	NC_008212	TGGC	2	8	2955443	2955450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15779	NC_008212	GCC	2	6	2955453	2955458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15782	NC_008212	CCG	2	6	2955896	2955901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15785	NC_008212	AT	3	6	2956814	2956819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15786	NC_008212	CGG	2	6	2956829	2956834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15787	NC_008212	TAC	2	6	2957207	2957212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15791	NC_008212	CGC	2	6	2957734	2957739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15793	NC_008212	GCGA	2	8	2957769	2957776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15794	NC_008212	GC	3	6	2957779	2957784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15795	NC_008212	CTT	2	6	2958761	2958766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15798	NC_008212	CCAGA	2	10	2958779	2958788	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15799	NC_008212	CTCCG	2	10	2958810	2958819	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15800	NC_008212	GCTC	2	8	2958821	2958828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15801	NC_008212	GC	4	8	2958841	2958848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15879	NC_008212	AACG	2	8	2969719	2969726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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