MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_008212	TTG	2	6	2735609	2735614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_008212	AGGG	2	8	2735615	2735622	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_008212	GGA	2	6	2735658	2735663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_008212	ACCG	2	8	2735682	2735689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14505	NC_008212	CCG	2	6	2735746	2735751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14506	NC_008212	CGA	2	6	2735759	2735764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14507	NC_008212	ACA	2	6	2735779	2735784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_008212	A	6	6	2735794	2735799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_008212	TCC	2	6	2735826	2735831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14510	NC_008212	TTCCG	2	10	2735838	2735847	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14511	NC_008212	CTG	2	6	2735889	2735894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14512	NC_008212	ATTG	2	8	2736385	2736392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_008212	AT	3	6	2737479	2737484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_008212	TC	3	6	2737593	2737598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14515	NC_008212	TGC	2	6	2737994	2737999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_008212	CTG	2	6	2738021	2738026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14517	NC_008212	TGATT	2	10	2738074	2738083	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_008212	T	6	6	2738099	2738104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_008212	TAT	2	6	2738116	2738121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_008212	AT	3	6	2738123	2738128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_008212	TAT	2	6	2738325	2738330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_008212	GT	3	6	2738333	2738338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_008212	TGGC	2	8	2738353	2738360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14524	NC_008212	GAC	2	6	2738366	2738371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_008212	TCA	2	6	2738468	2738473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_008212	TGG	2	6	2738483	2738488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_008212	GT	3	6	2738575	2738580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_008212	CG	3	6	2738601	2738606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14529	NC_008212	CAT	2	6	2738912	2738917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_008212	AC	3	6	2738926	2738931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14531	NC_008212	TGC	2	6	2738962	2738967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_008212	GTC	2	6	2738981	2738986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_008212	CCA	2	6	2738996	2739001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14534	NC_008212	GAG	2	6	2739005	2739010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_008212	TGG	2	6	2739015	2739020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_008212	GGA	2	6	2739034	2739039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_008212	TTA	2	6	2739060	2739065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_008212	TGGTT	2	10	2739139	2739148	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_008212	CTT	2	6	2739233	2739238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14540	NC_008212	AAG	2	6	2739293	2739298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_008212	TCAT	2	8	2739307	2739314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14542	NC_008212	AGTAT	2	10	2739333	2739342	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_008212	ATGTGA	2	12	2739398	2739409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_008212	GTT	2	6	2739414	2739419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_008212	ACC	2	6	2739434	2739439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14546	NC_008212	AGACGA	2	12	2739471	2739482	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14547	NC_008212	T	6	6	2739757	2739762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_008212	AT	3	6	2739771	2739776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_008212	ATTG	2	8	2740646	2740653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_008212	ATT	2	6	2740711	2740716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_008212	GCT	2	6	2740718	2740723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14552	NC_008212	AT	3	6	2744072	2744077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_008212	ATT	2	6	2744095	2744100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_008212	TA	4	8	2744106	2744113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_008212	GAAT	2	8	2744114	2744121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_008212	AT	3	6	2744177	2744182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_008212	CT	3	6	2744218	2744223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14558	NC_008212	TGA	2	6	2744231	2744236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_008212	CTTG	2	8	2744247	2744254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14560	NC_008212	TCA	2	6	2744297	2744302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_008212	CAATT	2	10	2744328	2744337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14562	NC_008212	GCA	2	6	2744421	2744426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_008212	TTC	2	6	2744461	2744466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14564	NC_008212	TTG	2	6	2744497	2744502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_008212	CAC	2	6	2744541	2744546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14566	NC_008212	AGC	2	6	2744692	2744697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14567	NC_008212	GAAG	2	8	2744751	2744758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_008212	TCA	2	6	2744835	2744840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14569	NC_008212	TCA	2	6	2745067	2745072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14570	NC_008212	GC	3	6	2746753	2746758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14571	NC_008212	T	6	6	2746772	2746777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_008212	AT	4	8	2746867	2746874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_008212	CGC	2	6	2746879	2746884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14574	NC_008212	GA	3	6	2746901	2746906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_008212	GGT	2	6	2746923	2746928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_008212	GGT	2	6	2748792	2748797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_008212	TCG	2	6	2748806	2748811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14578	NC_008212	GCA	2	6	2748869	2748874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14579	NC_008212	GGAT	2	8	2748916	2748923	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_008212	TAA	2	6	2749000	2749005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_008212	GAGT	3	12	2749018	2749029	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_008212	ATAGA	2	10	2749032	2749041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_008212	AGG	2	6	2751269	2751274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_008212	TGA	2	6	2751293	2751298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_008212	TATG	2	8	2751311	2751318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_008212	CA	3	6	2751422	2751427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14587	NC_008212	CTT	2	6	2751470	2751475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14588	NC_008212	AAG	2	6	2751497	2751502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_008212	GAT	2	6	2751544	2751549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_008212	AT	3	6	2751566	2751571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_008212	ATA	3	9	2751643	2751651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_008212	ATA	2	6	2752546	2752551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_008212	ATC	2	6	2752554	2752559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_008212	CCA	2	6	2752563	2752568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14595	NC_008212	TG	3	6	2752587	2752592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_008212	GAT	2	6	2753823	2753828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_008212	CA	3	6	2753987	2753992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14598	NC_008212	TAT	2	6	2754460	2754465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_008212	GATTTA	2	12	2754473	2754484	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_008212	TA	3	6	2754492	2754497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_008212	AT	3	6	2759457	2759462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_008212	TGTTCG	3	18	2759471	2759488	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14603	NC_008212	TAT	2	6	2759515	2759520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_008212	TCGT	2	8	2759533	2759540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14605	NC_008212	TTG	2	6	2761421	2761426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_008212	AT	3	6	2761599	2761604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_008212	TCACG	2	10	2761625	2761634	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14608	NC_008212	GAAA	2	8	2763473	2763480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_008212	TAC	2	6	2763492	2763497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14610	NC_008212	GGCA	2	8	2763508	2763515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14611	NC_008212	TCA	2	6	2763556	2763561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14612	NC_008212	TAC	2	6	2763588	2763593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14613	NC_008212	AT	3	6	2763614	2763619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_008212	TAT	2	6	2763625	2763630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_008212	ATG	2	6	2765008	2765013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_008212	TG	3	6	2765085	2765090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_008212	TAT	2	6	2765148	2765153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_008212	AGTG	2	8	2765180	2765187	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_008212	ACGA	2	8	2765190	2765197	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14620	NC_008212	AGG	2	6	2765201	2765206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_008212	ATA	2	6	2765224	2765229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_008212	CA	3	6	2765331	2765336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14623	NC_008212	TC	3	6	2765357	2765362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14624	NC_008212	AAAT	2	8	2765363	2765370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_008212	CT	3	6	2765421	2765426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14626	NC_008212	GGA	2	6	2765452	2765457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14627	NC_008212	TGT	2	6	2765490	2765495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14628	NC_008212	GA	3	6	2765497	2765502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_008212	AT	3	6	2766530	2766535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14630	NC_008212	TAT	2	6	2767032	2767037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14636	NC_008212	TTG	2	6	2767399	2767404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14653	NC_008212	TGC	2	6	2771202	2771207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14759	NC_008212	GT	3	6	2795690	2795695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14760	NC_008212	GAA	2	6	2795804	2795809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14762	NC_008212	AAT	2	6	2796986	2796991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14767	NC_008212	TCA	2	6	2797176	2797181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14887	NC_008212	TA	3	6	2813049	2813054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14888	NC_008212	TTG	2	6	2813096	2813101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14900	NC_008212	TAT	2	6	2815521	2815526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15000	NC_008212	CGA	2	6	2840335	2840340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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