MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008212	ACAA	2	8	2636465	2636472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14002	NC_008212	CCGT	2	8	2636989	2636996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14003	NC_008212	AAT	2	6	2637601	2637606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_008212	AGGTCA	2	12	2637622	2637633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14005	NC_008212	CCAA	2	8	2637665	2637672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14006	NC_008212	CTC	2	6	2637753	2637758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14007	NC_008212	GAA	2	6	2637771	2637776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_008212	TTCC	2	8	2637780	2637787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14009	NC_008212	ACC	2	6	2637804	2637809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14010	NC_008212	ACC	2	6	2637836	2637841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14011	NC_008212	A	7	7	2638112	2638118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_008212	CCTC	2	8	2638119	2638126	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14013	NC_008212	ATC	2	6	2644271	2644276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_008212	AT	3	6	2644277	2644282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_008212	TGC	2	6	2644325	2644330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_008212	ATG	2	6	2644400	2644405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_008212	GGC	2	6	2644421	2644426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_008212	GAA	2	6	2644448	2644453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_008212	CGT	2	6	2646551	2646556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_008212	CAG	2	6	2646573	2646578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_008212	TCT	2	6	2646583	2646588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_008212	CA	3	6	2646771	2646776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14023	NC_008212	CTG	2	6	2646793	2646798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_008212	CGA	2	6	2646812	2646817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_008212	TAGA	2	8	2646819	2646826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_008212	TCAG	2	8	2646883	2646890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14027	NC_008212	CGT	2	6	2646941	2646946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_008212	CGT	2	6	2646986	2646991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_008212	TCC	2	6	2647015	2647020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14030	NC_008212	GACA	2	8	2647061	2647068	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14031	NC_008212	TTC	2	6	2647113	2647118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_008212	AAG	2	6	2647164	2647169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_008212	GAC	2	6	2648494	2648499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_008212	TGT	2	6	2648506	2648511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_008212	ATA	2	6	2648515	2648520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_008212	ATA	2	6	2648590	2648595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_008212	GTC	2	6	2648741	2648746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_008212	TC	3	6	2648764	2648769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14039	NC_008212	GCTCC	2	10	2648798	2648807	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14040	NC_008212	GAG	2	6	2648890	2648895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_008212	CTC	2	6	2648932	2648937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14042	NC_008212	CCG	2	6	2649003	2649008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14043	NC_008212	CGC	2	6	2649049	2649054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14044	NC_008212	CCT	2	6	2649057	2649062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14045	NC_008212	ACA	2	6	2649103	2649108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_008212	CA	3	6	2649118	2649123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14047	NC_008212	CA	3	6	2649126	2649131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14048	NC_008212	ACA	3	9	2649129	2649137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_008212	CA	3	6	2649144	2649149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14050	NC_008212	CAAA	2	8	2649154	2649161	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14051	NC_008212	ACA	2	6	2649167	2649172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_008212	GAA	3	9	2649286	2649294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_008212	TCGCAG	2	12	2649299	2649310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_008212	CAA	2	6	2649313	2649318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_008212	CCA	2	6	2649365	2649370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14056	NC_008212	CAG	3	9	2649373	2649381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14057	NC_008212	CAA	2	6	2649390	2649395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_008212	GACT	2	8	2649400	2649407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14059	NC_008212	CTC	2	6	2649547	2649552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14060	NC_008212	CAG	2	6	2649681	2649686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14061	NC_008212	TC	3	6	2649723	2649728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14062	NC_008212	ACA	3	9	2649786	2649794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_008212	ACA	2	6	2649855	2649860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_008212	GCA	2	6	2649875	2649880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_008212	AGCTAA	2	12	2649958	2649969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14066	NC_008212	TCA	2	6	2650005	2650010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14067	NC_008212	CTC	2	6	2650126	2650131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14068	NC_008212	CAC	2	6	2650140	2650145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14069	NC_008212	ACA	2	6	2650172	2650177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_008212	TTCC	2	8	2650215	2650222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14071	NC_008212	AAC	2	6	2650415	2650420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_008212	CAA	2	6	2650447	2650452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14073	NC_008212	ACC	2	6	2650460	2650465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14074	NC_008212	GTA	2	6	2653161	2653166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_008212	CCA	2	6	2653184	2653189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14076	NC_008212	ATAG	2	8	2653211	2653218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_008212	CTA	2	6	2653236	2653241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_008212	GTG	2	6	2653258	2653263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_008212	GAT	2	6	2653354	2653359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_008212	A	7	7	2653372	2653378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_008212	TTA	2	6	2653403	2653408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_008212	T	6	6	2653571	2653576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_008212	A	6	6	2653592	2653597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_008212	TAT	2	6	2653638	2653643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_008212	CT	3	6	2653673	2653678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14086	NC_008212	GCC	2	6	2653807	2653812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14087	NC_008212	TTC	2	6	2653861	2653866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_008212	T	6	6	2653884	2653889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_008212	T	6	6	2653981	2653986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_008212	CGT	3	9	2653990	2653998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_008212	TCA	2	6	2654056	2654061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14092	NC_008212	GTT	2	6	2654109	2654114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_008212	CTAGG	2	10	2654151	2654160	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14094	NC_008212	TTC	2	6	2654185	2654190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_008212	TAG	2	6	2654279	2654284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_008212	GT	3	6	2654433	2654438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_008212	CGA	2	6	2654526	2654531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_008212	ATT	2	6	2654558	2654563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_008212	TCT	2	6	2654608	2654613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_008212	CGC	2	6	2654625	2654630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14101	NC_008212	AAT	2	6	2654708	2654713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_008212	GAC	2	6	2654816	2654821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_008212	AAACT	2	10	2654916	2654925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14104	NC_008212	CTA	2	6	2654927	2654932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_008212	ACA	2	6	2654964	2654969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_008212	ACA	2	6	2654988	2654993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_008212	TCT	3	9	2655018	2655026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14108	NC_008212	CGG	2	6	2655106	2655111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_008212	TTTA	2	8	2655113	2655120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_008212	CAC	2	6	2655142	2655147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14111	NC_008212	CAA	2	6	2655186	2655191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_008212	AT	3	6	2655265	2655270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_008212	CTC	2	6	2655286	2655291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14114	NC_008212	TAA	3	9	2655292	2655300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_008212	TCA	2	6	2658764	2658769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_008212	GGT	2	6	2658804	2658809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_008212	GGGGA	2	10	2660303	2660312	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_008212	CAC	2	6	2660390	2660395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14119	NC_008212	TAACGG	2	12	2660401	2660412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14120	NC_008212	AAG	2	6	2660427	2660432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_008212	CATCT	2	10	2660461	2660470	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14122	NC_008212	GAG	2	6	2660592	2660597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_008212	T	7	7	2660643	2660649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_008212	TTAG	2	8	2660750	2660757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_008212	ATCG	2	8	2660763	2660770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14126	NC_008212	AGGA	2	8	2660771	2660778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_008212	ACTC	2	8	2660843	2660850	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14128	NC_008212	AT	3	6	2660855	2660860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_008212	CAA	2	6	2660951	2660956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14130	NC_008212	TC	3	6	2660969	2660974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14131	NC_008212	ACG	2	6	2661085	2661090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14132	NC_008212	CAG	2	6	2661166	2661171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14133	NC_008212	CGC	2	6	2661197	2661202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14136	NC_008212	GGC	2	6	2661305	2661310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14137	NC_008212	AAG	2	6	2661312	2661317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14138	NC_008212	TTTC	2	8	2661358	2661365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14139	NC_008212	CAAG	2	8	2661400	2661407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14140	NC_008212	CGACAA	2	12	2661453	2661464	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14143	NC_008212	CGT	2	6	2661567	2661572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14148	NC_008212	ATT	2	6	2662300	2662305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14153	NC_008212	ATT	2	6	2662520	2662525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14160	NC_008212	TAA	2	6	2662871	2662876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14161	NC_008212	GATA	2	8	2662895	2662902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14162	NC_008212	AT	3	6	2662907	2662912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14163	NC_008212	CTA	2	6	2663597	2663602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14165	NC_008212	TA	3	6	2663635	2663640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14166	NC_008212	AT	3	6	2663653	2663658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14170	NC_008212	TA	3	6	2663719	2663724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14171	NC_008212	TG	3	6	2663732	2663737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14175	NC_008212	AT	4	8	2663846	2663853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14185	NC_008212	TGTA	2	8	2665715	2665722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14247	NC_008212	TG	3	6	2680536	2680541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14248	NC_008212	TA	3	6	2680559	2680564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14249	NC_008212	ACATG	2	10	2680590	2680599	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14250	NC_008212	GGA	2	6	2680606	2680611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14252	NC_008212	TTC	2	6	2680664	2680669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14253	NC_008212	TTCG	2	8	2681708	2681715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14254	NC_008212	AT	3	6	2681798	2681803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14255	NC_008212	AAAT	2	8	2681858	2681865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14256	NC_008212	AC	3	6	2682913	2682918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14258	NC_008212	TGG	2	6	2683048	2683053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14259	NC_008212	AAT	2	6	2683924	2683929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14260	NC_008212	GAG	2	6	2683944	2683949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14261	NC_008212	AT	3	6	2683951	2683956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14262	NC_008212	TTA	2	6	2684001	2684006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14267	NC_008212	AT	3	6	2685134	2685139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14268	NC_008212	TTA	2	6	2685152	2685157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14273	NC_008212	GTT	2	6	2687095	2687100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14289	NC_008212	AT	3	6	2693160	2693165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14369	NC_008212	CT	3	6	2713052	2713057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14370	NC_008212	TGGT	2	8	2713505	2713512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14372	NC_008212	A	6	6	2713534	2713539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14373	NC_008212	AAC	2	6	2713558	2713563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14382	NC_008212	TGCA	2	8	2718136	2718143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14383	NC_008212	TGA	2	6	2718149	2718154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14384	NC_008212	AT	3	6	2718211	2718216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14385	NC_008212	TCG	2	6	2718231	2718236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14386	NC_008212	TGAT	2	8	2719630	2719637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14387	NC_008212	ATG	2	6	2719653	2719658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14388	NC_008212	TCC	2	6	2719698	2719703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14389	NC_008212	TTC	2	6	2719753	2719758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14390	NC_008212	TCC	2	6	2719857	2719862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14391	NC_008212	TG	3	6	2719984	2719989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14392	NC_008212	CCGATC	2	12	2720077	2720088	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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14394	NC_008212	TTA	2	6	2720257	2720262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14395	NC_008212	TCC	3	9	2720269	2720277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14407	NC_008212	GCC	2	6	2720631	2720636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14490	NC_008212	TGAGA	2	10	2734278	2734287	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14491	NC_008212	CTG	2	6	2734317	2734322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14498	NC_008212	TCAA	2	8	2735394	2735401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14499	NC_008212	GAA	2	6	2735514	2735519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14500	NC_008212	ACT	2	6	2735581	2735586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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