MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008212	ACA	2	6	2503715	2503720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_008212	CGA	2	6	2503752	2503757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_008212	AAGC	2	8	2503758	2503765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13504	NC_008212	TC	3	6	2505348	2505353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13505	NC_008212	TGA	2	6	2505396	2505401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_008212	GAC	2	6	2505484	2505489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_008212	AAG	2	6	2505523	2505528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_008212	TAC	2	6	2505531	2505536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_008212	TAA	2	6	2507926	2507931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_008212	CA	3	6	2507992	2507997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13511	NC_008212	TGA	2	6	2508010	2508015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_008212	TCC	2	6	2508049	2508054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13513	NC_008212	ATA	2	6	2508090	2508095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_008212	CTG	2	6	2508109	2508114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_008212	CAT	2	6	2508121	2508126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13516	NC_008212	ATA	2	6	2508214	2508219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_008212	AT	3	6	2508224	2508229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_008212	GTA	2	6	2508233	2508238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_008212	TGT	2	6	2508246	2508251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_008212	GAA	2	6	2509267	2509272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_008212	TAT	2	6	2509278	2509283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_008212	AT	3	6	2509289	2509294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_008212	TCT	2	6	2509309	2509314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_008212	ATA	2	6	2509356	2509361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_008212	ATC	2	6	2509369	2509374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_008212	ATTT	2	8	2510785	2510792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_008212	TAA	2	6	2510834	2510839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_008212	AT	3	6	2510865	2510870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_008212	CAT	2	6	2511168	2511173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_008212	CCT	2	6	2511181	2511186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13531	NC_008212	ATC	2	6	2511247	2511252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_008212	TTAG	2	8	2516158	2516165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_008212	CTG	2	6	2516175	2516180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_008212	TC	3	6	2516258	2516263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13535	NC_008212	GAA	2	6	2516323	2516328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_008212	CAA	2	6	2516340	2516345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_008212	CAT	2	6	2516412	2516417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_008212	TATAA	2	10	2516468	2516477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_008212	ATA	2	6	2516538	2516543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_008212	TAA	2	6	2516544	2516549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_008212	GGA	2	6	2516588	2516593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_008212	AGT	2	6	2517787	2517792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_008212	TTCG	2	8	2517877	2517884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13544	NC_008212	AAG	2	6	2517904	2517909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_008212	AAC	2	6	2517967	2517972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_008212	TTA	2	6	2517973	2517978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_008212	ATT	2	6	2518221	2518226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_008212	TCA	2	6	2519735	2519740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_008212	CGAC	2	8	2519759	2519766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13550	NC_008212	AC	3	6	2519765	2519770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13551	NC_008212	ATC	2	6	2520176	2520181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_008212	TTTCA	2	10	2520209	2520218	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13553	NC_008212	ATA	2	6	2520245	2520250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_008212	TAT	2	6	2520285	2520290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_008212	TTG	2	6	2521339	2521344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_008212	AAT	2	6	2521369	2521374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_008212	GA	3	6	2521382	2521387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_008212	AC	3	6	2521471	2521476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13559	NC_008212	TC	3	6	2522362	2522367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13560	NC_008212	AATATT	2	12	2522390	2522401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_008212	TGATT	2	10	2522425	2522434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_008212	TA	4	8	2522480	2522487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_008212	GTC	2	6	2522596	2522601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13564	NC_008212	TGA	2	6	2522649	2522654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_008212	GT	3	6	2525303	2525308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_008212	TAA	2	6	2525377	2525382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_008212	GAT	2	6	2525408	2525413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_008212	GAA	2	6	2525418	2525423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_008212	TCA	2	6	2525736	2525741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_008212	TATTT	2	10	2528475	2528484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_008212	ATT	2	6	2528506	2528511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_008212	GTT	2	6	2528542	2528547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_008212	TCA	2	6	2529458	2529463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13574	NC_008212	ATA	2	6	2529524	2529529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_008212	TG	3	6	2529532	2529537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_008212	AGT	2	6	2530015	2530020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_008212	TTG	2	6	2532541	2532546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_008212	AT	4	8	2532554	2532561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_008212	CAG	2	6	2532646	2532651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13580	NC_008212	TGAAT	2	10	2532671	2532680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13581	NC_008212	ACCGC	2	10	2532726	2532735	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13582	NC_008212	GCCAA	2	10	2532770	2532779	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13583	NC_008212	GGT	2	6	2532902	2532907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_008212	TGA	2	6	2532952	2532957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_008212	TCG	2	6	2532962	2532967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_008212	ACACTC	2	12	2533016	2533027	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13587	NC_008212	GCA	2	6	2533246	2533251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_008212	CGATCC	2	12	2533383	2533394	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13589	NC_008212	ATA	2	6	2533473	2533478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_008212	ATG	2	6	2534817	2534822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_008212	AGA	2	6	2534826	2534831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_008212	AAT	2	6	2534848	2534853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_008212	AT	3	6	2534861	2534866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_008212	TAAA	2	8	2534894	2534901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_008212	CTAT	2	8	2537289	2537296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13596	NC_008212	TTA	2	6	2537316	2537321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_008212	CGGT	2	8	2537372	2537379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13598	NC_008212	T	6	6	2537379	2537384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_008212	TCATC	2	10	2539184	2539193	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13600	NC_008212	TGA	2	6	2539210	2539215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_008212	AAG	2	6	2539231	2539236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_008212	G	6	6	2539257	2539262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_008212	ATA	2	6	2539275	2539280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_008212	CAT	2	6	2539352	2539357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_008212	CAAA	2	8	2539403	2539410	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13606	NC_008212	GA	4	8	2539417	2539424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_008212	TC	3	6	2539464	2539469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13608	NC_008212	TGT	2	6	2539554	2539559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_008212	GAG	2	6	2539560	2539565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_008212	CAT	2	6	2539571	2539576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13611	NC_008212	TAT	2	6	2541232	2541237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_008212	TGAG	2	8	2541238	2541245	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_008212	ATC	2	6	2541269	2541274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_008212	TA	3	6	2541290	2541295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_008212	CA	3	6	2541299	2541304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13616	NC_008212	AACA	2	8	2541325	2541332	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13617	NC_008212	CAGCA	2	10	2542065	2542074	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13618	NC_008212	AGC	2	6	2542101	2542106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_008212	T	6	6	2542773	2542778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_008212	GT	3	6	2542852	2542857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_008212	CGA	2	6	2542913	2542918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13622	NC_008212	ATC	2	6	2542922	2542927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13623	NC_008212	ATA	2	6	2543683	2543688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_008212	TACA	2	8	2543722	2543729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13625	NC_008212	TAT	2	6	2543753	2543758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_008212	A	7	7	2543857	2543863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_008212	TAA	2	6	2545169	2545174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_008212	TCA	2	6	2546589	2546594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13629	NC_008212	TAC	2	6	2546595	2546600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13630	NC_008212	TAA	2	6	2546676	2546681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13631	NC_008212	GAA	2	6	2546766	2546771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13632	NC_008212	GATAGA	2	12	2547363	2547374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13633	NC_008212	GA	3	6	2548781	2548786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13634	NC_008212	ATTA	2	8	2548816	2548823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13635	NC_008212	TCC	2	6	2548827	2548832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13638	NC_008212	TTTC	2	8	2548879	2548886	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13639	NC_008212	AT	3	6	2548930	2548935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13640	NC_008212	GAA	2	6	2548986	2548991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13644	NC_008212	GA	3	6	2551815	2551820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13647	NC_008212	TTG	2	6	2552016	2552021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13751	NC_008212	A	8	8	2569205	2569212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13752	NC_008212	CACT	2	8	2569279	2569286	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13756	NC_008212	TCG	2	6	2570158	2570163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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