MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008212	ATC	2	6	2309595	2309600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_008212	TGT	2	6	2309620	2309625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_008212	TAAT	2	8	2309636	2309643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_008212	CAC	2	6	2309647	2309652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12505	NC_008212	TGATT	2	10	2309654	2309663	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_008212	GAT	2	6	2309677	2309682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_008212	TAA	2	6	2310571	2310576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_008212	TA	3	6	2310578	2310583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_008212	ATA	3	9	2310607	2310615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_008212	AGTG	3	12	2310707	2310718	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_008212	GTA	2	6	2310743	2310748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_008212	GAA	2	6	2310823	2310828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_008212	ATGT	2	8	2311352	2311359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_008212	CTC	2	6	2311375	2311380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_008212	GA	3	6	2311414	2311419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_008212	TA	3	6	2313026	2313031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_008212	GAT	2	6	2313723	2313728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_008212	ATA	2	6	2313729	2313734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_008212	TCA	2	6	2313756	2313761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_008212	GCT	2	6	2313789	2313794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_008212	GGT	2	6	2313817	2313822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_008212	GGGT	2	8	2313854	2313861	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_008212	AAT	2	6	2313898	2313903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_008212	GGC	2	6	2313970	2313975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_008212	TCCC	2	8	2314016	2314023	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12526	NC_008212	CAT	2	6	2314028	2314033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_008212	ATT	2	6	2314036	2314041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_008212	CG	3	6	2314062	2314067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12529	NC_008212	GA	3	6	2314088	2314093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_008212	ATC	2	6	2314166	2314171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_008212	CTAT	2	8	2315194	2315201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12532	NC_008212	ATT	2	6	2315207	2315212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_008212	GA	3	6	2316627	2316632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_008212	CAT	2	6	2316675	2316680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_008212	TTAG	2	8	2316685	2316692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_008212	AAT	2	6	2316703	2316708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_008212	GAC	2	6	2316717	2316722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_008212	AGC	2	6	2316736	2316741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_008212	GTA	2	6	2316766	2316771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_008212	GA	3	6	2316810	2316815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_008212	TAC	2	6	2320621	2320626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_008212	ATA	3	9	2320629	2320637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_008212	TAGCAA	3	18	2320639	2320656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12544	NC_008212	GTA	2	6	2320695	2320700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_008212	CAA	2	6	2320852	2320857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_008212	CAG	2	6	2320876	2320881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_008212	ACC	2	6	2322779	2322784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12548	NC_008212	GAA	2	6	2322812	2322817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_008212	AT	3	6	2322863	2322868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_008212	TCA	2	6	2322874	2322879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_008212	TCGACA	2	12	2322908	2322919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_008212	GT	3	6	2322926	2322931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_008212	AT	3	6	2322951	2322956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_008212	ATT	2	6	2322978	2322983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_008212	TA	3	6	2322988	2322993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_008212	GAA	2	6	2323230	2323235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_008212	T	6	6	2323292	2323297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_008212	ATT	2	6	2323317	2323322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_008212	ATA	2	6	2323406	2323411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_008212	TCA	2	6	2324029	2324034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_008212	T	6	6	2324063	2324068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_008212	GAC	2	6	2324087	2324092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_008212	AT	3	6	2324112	2324117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_008212	ATC	2	6	2324126	2324131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_008212	TCTGTT	2	12	2324132	2324143	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12566	NC_008212	TCT	2	6	2324144	2324149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_008212	AAGC	2	8	2324185	2324192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12568	NC_008212	TCA	2	6	2324225	2324230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_008212	AGA	2	6	2324241	2324246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_008212	AGCGT	2	10	2324260	2324269	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12571	NC_008212	CGG	2	6	2326115	2326120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_008212	GAT	2	6	2326121	2326126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_008212	ATTT	2	8	2326828	2326835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_008212	TAAT	2	8	2327990	2327997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_008212	GCAG	2	8	2328012	2328019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12576	NC_008212	TCC	2	6	2329316	2329321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12577	NC_008212	CGG	2	6	2329405	2329410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_008212	TTA	2	6	2329502	2329507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_008212	TCAT	2	8	2329508	2329515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12580	NC_008212	TA	3	6	2329895	2329900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_008212	AT	3	6	2329905	2329910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_008212	CTC	2	6	2329948	2329953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12583	NC_008212	AAGC	2	8	2330023	2330030	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12584	NC_008212	TGA	2	6	2330060	2330065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_008212	AAAT	2	8	2330067	2330074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_008212	GTCA	2	8	2331096	2331103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12587	NC_008212	CA	3	6	2331102	2331107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12588	NC_008212	CT	3	6	2331115	2331120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12589	NC_008212	GAT	2	6	2331183	2331188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_008212	ATT	2	6	2331220	2331225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_008212	GCG	2	6	2332898	2332903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_008212	TTTA	2	8	2332921	2332928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_008212	TC	3	6	2333913	2333918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12594	NC_008212	TAAC	2	8	2333926	2333933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12595	NC_008212	ATTG	2	8	2334655	2334662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_008212	TAA	2	6	2334679	2334684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_008212	AATC	2	8	2334699	2334706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12598	NC_008212	ATT	2	6	2334709	2334714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_008212	TAA	2	6	2335160	2335165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_008212	ATTG	2	8	2337320	2337327	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_008212	TAT	2	6	2338428	2338433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_008212	TAT	2	6	2338444	2338449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_008212	GTT	2	6	2338452	2338457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_008212	CCG	2	6	2340295	2340300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12605	NC_008212	TAC	2	6	2340307	2340312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_008212	TGCA	2	8	2340327	2340334	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12607	NC_008212	GGA	2	6	2340361	2340366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_008212	ATG	2	6	2340421	2340426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_008212	AAT	2	6	2341294	2341299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_008212	TTC	2	6	2341322	2341327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_008212	TGATT	2	10	2343151	2343160	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_008212	A	6	6	2343186	2343191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_008212	AG	3	6	2343309	2343314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_008212	ACA	2	6	2343315	2343320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_008212	TGT	2	6	2343693	2343698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_008212	TAA	2	6	2343706	2343711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_008212	AT	3	6	2343748	2343753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_008212	TCAT	2	8	2343779	2343786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12619	NC_008212	ATG	2	6	2344236	2344241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_008212	ATT	2	6	2345429	2345434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_008212	TC	3	6	2345464	2345469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12622	NC_008212	ATG	2	6	2345470	2345475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_008212	TGAT	2	8	2345482	2345489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_008212	TCC	2	6	2345491	2345496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12625	NC_008212	CAG	2	6	2345546	2345551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12626	NC_008212	ATT	2	6	2345559	2345564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_008212	TAA	2	6	2345937	2345942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_008212	GAA	2	6	2345963	2345968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12629	NC_008212	AATAT	2	10	2345997	2346006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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