MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008212	AATG	2	8	2231377	2231384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_008212	AGAC	2	8	2231387	2231394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12003	NC_008212	TAT	3	9	2234276	2234284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_008212	AT	3	6	2234357	2234362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_008212	AT	3	6	2234366	2234371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_008212	ATT	2	6	2234961	2234966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_008212	ATT	2	6	2235043	2235048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_008212	ATG	2	6	2235055	2235060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_008212	AAT	2	6	2236460	2236465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_008212	TC	3	6	2236519	2236524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12011	NC_008212	TAT	2	6	2236576	2236581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_008212	AT	3	6	2236627	2236632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_008212	TGA	2	6	2238920	2238925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_008212	ATG	2	6	2238999	2239004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_008212	AT	3	6	2239043	2239048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_008212	GAA	2	6	2239275	2239280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_008212	CTT	2	6	2239306	2239311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12018	NC_008212	CTG	2	6	2239323	2239328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_008212	AG	3	6	2240798	2240803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_008212	AC	3	6	2240928	2240933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12021	NC_008212	ACCG	2	8	2240936	2240943	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12022	NC_008212	AT	3	6	2240991	2240996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_008212	ATC	2	6	2241038	2241043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12024	NC_008212	AAT	2	6	2241057	2241062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_008212	GTCA	2	8	2241136	2241143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12026	NC_008212	GATTT	2	10	2241147	2241156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_008212	GT	3	6	2241162	2241167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_008212	GT	3	6	2241171	2241176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12029	NC_008212	ATT	2	6	2243489	2243494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_008212	GCG	2	6	2243530	2243535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12031	NC_008212	AC	3	6	2243609	2243614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12032	NC_008212	CAT	2	6	2243660	2243665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12035	NC_008212	TA	3	6	2243945	2243950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_008212	CGT	2	6	2243958	2243963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12038	NC_008212	TAT	3	9	2246153	2246161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_008212	ACT	2	6	2246249	2246254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12042	NC_008212	TGT	2	6	2246285	2246290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_008212	ATC	2	6	2246537	2246542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12044	NC_008212	TGAG	2	8	2247343	2247350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_008212	TCT	2	6	2247388	2247393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12046	NC_008212	TGA	2	6	2247396	2247401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_008212	GTT	2	6	2248513	2248518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12049	NC_008212	TAATC	2	10	2249741	2249750	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12050	NC_008212	AAG	2	6	2249790	2249795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_008212	T	6	6	2249799	2249804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12054	NC_008212	CGG	2	6	2250106	2250111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12055	NC_008212	GTC	2	6	2250127	2250132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12056	NC_008212	GGAT	2	8	2250155	2250162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_008212	AGT	2	6	2250195	2250200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_008212	GTC	2	6	2250221	2250226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12059	NC_008212	ATC	2	6	2250307	2250312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12060	NC_008212	AGA	2	6	2250322	2250327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12061	NC_008212	CTC	2	6	2250387	2250392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12062	NC_008212	TCG	2	6	2251394	2251399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12063	NC_008212	CCG	2	6	2251432	2251437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12064	NC_008212	ATC	2	6	2251476	2251481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12065	NC_008212	TGA	2	6	2251503	2251508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12066	NC_008212	TAA	2	6	2251518	2251523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12067	NC_008212	TA	3	6	2251536	2251541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12068	NC_008212	AAT	2	6	2251568	2251573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12069	NC_008212	GCG	2	6	2251627	2251632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12070	NC_008212	ATG	2	6	2251639	2251644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12071	NC_008212	AGATA	2	10	2251660	2251669	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12072	NC_008212	GGA	2	6	2251678	2251683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12073	NC_008212	CATT	2	8	2251738	2251745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12074	NC_008212	TCGTCT	2	12	2251813	2251824	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12075	NC_008212	AAC	2	6	2251848	2251853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12076	NC_008212	GTT	2	6	2251872	2251877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12077	NC_008212	TTGG	2	8	2251894	2251901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12078	NC_008212	ATT	2	6	2251923	2251928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12079	NC_008212	GAG	2	6	2251961	2251966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12080	NC_008212	TAT	2	6	2252060	2252065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12081	NC_008212	A	6	6	2252067	2252072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12082	NC_008212	CACT	2	8	2252098	2252105	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12083	NC_008212	CA	3	6	2252114	2252119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12084	NC_008212	AC	3	6	2252139	2252144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12085	NC_008212	GAAAT	2	10	2252154	2252163	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12086	NC_008212	CAT	2	6	2252179	2252184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12087	NC_008212	CA	3	6	2252197	2252202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12088	NC_008212	GAAAT	2	10	2252211	2252220	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12089	NC_008212	CA	3	6	2252254	2252259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12090	NC_008212	GAAAT	2	10	2252268	2252277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12091	NC_008212	TC	3	6	2252282	2252287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12092	NC_008212	ACT	2	6	2252335	2252340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12094	NC_008212	A	6	6	2252364	2252369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12095	NC_008212	TC	3	6	2252380	2252385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12096	NC_008212	TCAAC	2	10	2252402	2252411	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12097	NC_008212	AC	3	6	2252410	2252415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12098	NC_008212	TGT	2	6	2252421	2252426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12099	NC_008212	GTT	2	6	2252459	2252464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12100	NC_008212	ATTTC	2	10	2252479	2252488	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12101	NC_008212	TTCAT	2	10	2252501	2252510	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12102	NC_008212	TGA	2	6	2252536	2252541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12103	NC_008212	GAA	2	6	2253639	2253644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_008212	TTG	2	6	2253659	2253664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_008212	ACA	2	6	2253735	2253740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12106	NC_008212	CA	3	6	2253739	2253744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12107	NC_008212	AGA	2	6	2253814	2253819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_008212	GGA	2	6	2253841	2253846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12109	NC_008212	TCG	2	6	2255158	2255163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12110	NC_008212	CAAG	2	8	2255521	2255528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12111	NC_008212	GCG	2	6	2255567	2255572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12112	NC_008212	T	6	6	2255596	2255601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12113	NC_008212	AACAG	2	10	2255746	2255755	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12114	NC_008212	TTTAG	2	10	2255760	2255769	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12115	NC_008212	ATC	2	6	2255775	2255780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12116	NC_008212	TCA	2	6	2255839	2255844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12117	NC_008212	GT	3	6	2255914	2255919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12118	NC_008212	AAC	2	6	2255927	2255932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12119	NC_008212	TCG	2	6	2255961	2255966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12120	NC_008212	GT	3	6	2256074	2256079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12121	NC_008212	GTAT	2	8	2256133	2256140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12122	NC_008212	AAC	2	6	2256156	2256161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12123	NC_008212	ACTC	2	8	2256181	2256188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12124	NC_008212	GGTG	2	8	2256213	2256220	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12125	NC_008212	AC	4	8	2256221	2256228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12126	NC_008212	GAAAT	2	10	2256236	2256245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12127	NC_008212	TC	3	6	2256250	2256255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12128	NC_008212	TAC	2	6	2256302	2256307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12129	NC_008212	TCA	2	6	2256312	2256317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12130	NC_008212	AATT	2	8	2257068	2257075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12131	NC_008212	CTC	2	6	2257109	2257114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12132	NC_008212	GAG	2	6	2257226	2257231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12133	NC_008212	TTG	2	6	2257302	2257307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12134	NC_008212	GAC	2	6	2257342	2257347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12135	NC_008212	CTC	2	6	2257637	2257642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12136	NC_008212	AAC	2	6	2258105	2258110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12137	NC_008212	C	6	6	2258110	2258115	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12138	NC_008212	ATAG	2	8	2258165	2258172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12139	NC_008212	CCACAC	2	12	2258186	2258197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12140	NC_008212	ACC	2	6	2258217	2258222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12141	NC_008212	TC	3	6	2258240	2258245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12142	NC_008212	ACTTC	2	10	2258282	2258291	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12143	NC_008212	GCG	2	6	2258307	2258312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12144	NC_008212	GCCTT	2	10	2258318	2258327	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12145	NC_008212	GTT	2	6	2258350	2258355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12146	NC_008212	TAA	2	6	2258368	2258373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12147	NC_008212	CTAC	2	8	2258376	2258383	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12148	NC_008212	GACA	2	8	2258427	2258434	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12149	NC_008212	CAA	2	6	2258441	2258446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12151	NC_008212	TG	3	6	2258513	2258518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12152	NC_008212	TC	3	6	2258520	2258525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12153	NC_008212	ATT	2	6	2258560	2258565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12156	NC_008212	G	7	7	2260018	2260024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12157	NC_008212	TTTAG	2	10	2260085	2260094	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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12162	NC_008212	GAG	2	6	2260304	2260309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12163	NC_008212	CGG	2	6	2260318	2260323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12164	NC_008212	TTCG	2	8	2260352	2260359	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12165	NC_008212	ATA	2	6	2260362	2260367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12166	NC_008212	CCCAC	2	10	2260406	2260415	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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12173	NC_008212	TCGGT	2	10	2260701	2260710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12174	NC_008212	CTTT	2	8	2261031	2261038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12181	NC_008212	TG	3	6	2261390	2261395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12189	NC_008212	TGCA	2	8	2261781	2261788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12200	NC_008212	TCC	3	9	2267016	2267024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12214	NC_008212	TGAG	2	8	2269535	2269542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12217	NC_008212	TA	3	6	2271104	2271109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12218	NC_008212	TG	4	8	2271130	2271137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12219	NC_008212	AC	3	6	2271169	2271174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12220	NC_008212	ACTC	2	8	2271262	2271269	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12221	NC_008212	TCACT	2	10	2271696	2271705	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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12230	NC_008212	GAGC	2	8	2272033	2272040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12241	NC_008212	GTG	2	6	2272605	2272610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12242	NC_008212	CT	3	6	2272621	2272626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12243	NC_008212	TC	3	6	2272628	2272633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12244	NC_008212	CA	3	6	2272712	2272717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12245	NC_008212	ATT	2	6	2272827	2272832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12246	NC_008212	ACG	2	6	2272841	2272846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12248	NC_008212	AGAT	2	8	2272914	2272921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12249	NC_008212	ATG	2	6	2273302	2273307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12250	NC_008212	TA	3	6	2273312	2273317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12251	NC_008212	AGTC	2	8	2273379	2273386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12252	NC_008212	AGT	2	6	2273391	2273396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12253	NC_008212	TGG	2	6	2273403	2273408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12254	NC_008212	GATC	2	8	2273430	2273437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12255	NC_008212	AAG	2	6	2273565	2273570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12256	NC_008212	TA	3	6	2273577	2273582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12257	NC_008212	TTA	3	9	2273609	2273617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12258	NC_008212	T	6	6	2273620	2273625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12259	NC_008212	A	6	6	2273648	2273653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12260	NC_008212	ATT	2	6	2273661	2273666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12261	NC_008212	CGT	2	6	2275598	2275603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12262	NC_008212	TGA	2	6	2275608	2275613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12263	NC_008212	TAT	2	6	2275627	2275632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12264	NC_008212	TGA	2	6	2275676	2275681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12265	NC_008212	GCA	2	6	2275682	2275687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12281	NC_008212	CGA	2	6	2276421	2276426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12339	NC_008212	CGAG	2	8	2280188	2280195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12379	NC_008212	GTCT	2	8	2282324	2282331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12497	NC_008212	ATGA	2	8	2309015	2309022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12499	NC_008212	TGAG	2	8	2309054	2309061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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