MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008212	AT	3	6	2118166	2118171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_008212	AGT	2	6	2118207	2118212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_008212	ATATT	2	10	2119594	2119603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_008212	GAT	2	6	2119647	2119652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_008212	CA	3	6	2119668	2119673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11506	NC_008212	ATA	2	6	2119744	2119749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_008212	GTACA	3	15	2119798	2119812	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11508	NC_008212	ATG	2	6	2119871	2119876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_008212	ATA	2	6	2121253	2121258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_008212	GAG	2	6	2121303	2121308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_008212	TCAT	2	8	2121331	2121338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11512	NC_008212	TAT	2	6	2122101	2122106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_008212	ATAA	2	8	2122250	2122257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_008212	ACTC	2	8	2123770	2123777	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11515	NC_008212	ATA	2	6	2123837	2123842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_008212	ATA	2	6	2123853	2123858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_008212	AGA	2	6	2123876	2123881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_008212	A	6	6	2123886	2123891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_008212	AT	3	6	2123895	2123900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_008212	AG	3	6	2123941	2123946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_008212	ATT	2	6	2123977	2123982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_008212	ATCA	2	8	2123994	2124001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11523	NC_008212	CA	3	6	2124000	2124005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_008212	ATTAA	2	10	2124060	2124069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_008212	CGT	2	6	2124098	2124103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_008212	CT	3	6	2124111	2124116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11527	NC_008212	ACTG	2	8	2124172	2124179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11528	NC_008212	TA	3	6	2124215	2124220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_008212	TGA	2	6	2124224	2124229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_008212	CGT	3	9	2124593	2124601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_008212	ATTT	2	8	2124674	2124681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_008212	AGT	2	6	2124700	2124705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_008212	ATA	2	6	2124839	2124844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_008212	GA	3	6	2124853	2124858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_008212	GGACA	2	10	2124885	2124894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11536	NC_008212	TA	3	6	2124918	2124923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_008212	TAAAT	2	10	2124969	2124978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_008212	CTG	2	6	2125010	2125015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_008212	CA	3	6	2125084	2125089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11540	NC_008212	ACT	2	6	2125100	2125105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_008212	TCA	2	6	2125151	2125156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_008212	CTTGAA	2	12	2125159	2125170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11543	NC_008212	GATA	2	8	2125220	2125227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_008212	TGTT	2	8	2125242	2125249	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_008212	CTC	2	6	2125289	2125294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11546	NC_008212	ATT	2	6	2125301	2125306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_008212	GAGTT	2	10	2125581	2125590	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_008212	CA	4	8	2125591	2125598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_008212	GTA	2	6	2125646	2125651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_008212	CGTGG	2	10	2125660	2125669	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11551	NC_008212	CGA	2	6	2126045	2126050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_008212	ATAA	2	8	2126060	2126067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_008212	AGT	2	6	2126136	2126141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_008212	TTCAG	2	10	2126155	2126164	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11555	NC_008212	CAT	2	6	2126217	2126222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_008212	AGA	2	6	2126223	2126228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_008212	TTG	2	6	2126311	2126316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_008212	CT	3	6	2126351	2126356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11559	NC_008212	CTC	2	6	2126412	2126417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11560	NC_008212	TGGG	2	8	2126424	2126431	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_008212	TACT	2	8	2126752	2126759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11562	NC_008212	ATT	2	6	2126761	2126766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_008212	GTTGA	2	10	2126849	2126858	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_008212	TCG	2	6	2126872	2126877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_008212	CAG	2	6	2126892	2126897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_008212	A	6	6	2126966	2126971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_008212	GTA	2	6	2138078	2138083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_008212	TATGA	2	10	2138525	2138534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_008212	TTG	2	6	2138535	2138540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_008212	CTG	2	6	2138556	2138561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_008212	GTCT	2	8	2142423	2142430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11572	NC_008212	TAC	2	6	2142467	2142472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_008212	TATG	2	8	2142557	2142564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_008212	TC	3	6	2142567	2142572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11575	NC_008212	GC	3	6	2142600	2142605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11576	NC_008212	GTAGT	2	10	2142608	2142617	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_008212	TGA	2	6	2142689	2142694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_008212	AAT	2	6	2142704	2142709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_008212	CA	3	6	2142740	2142745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11580	NC_008212	ATC	2	6	2142769	2142774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_008212	AGT	2	6	2142788	2142793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_008212	TGC	2	6	2142861	2142866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11583	NC_008212	TA	3	6	2142947	2142952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_008212	AGT	2	6	2143002	2143007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_008212	GT	3	6	2143006	2143011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_008212	TA	3	6	2143789	2143794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_008212	AAC	2	6	2143796	2143801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11588	NC_008212	TAAT	2	8	2143805	2143812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_008212	CTC	2	6	2144933	2144938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11590	NC_008212	ATT	2	6	2144977	2144982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_008212	TCC	2	6	2144987	2144992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11592	NC_008212	CA	3	6	2145079	2145084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11593	NC_008212	ATAAC	2	10	2145099	2145108	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11594	NC_008212	GTT	2	6	2145131	2145136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_008212	TTG	2	6	2145144	2145149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_008212	CGC	2	6	2145157	2145162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11597	NC_008212	TTTA	2	8	2145190	2145197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_008212	AT	3	6	2145214	2145219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_008212	ATA	2	6	2145262	2145267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_008212	TG	4	8	2146661	2146668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_008212	ATG	2	6	2146674	2146679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_008212	TA	3	6	2146700	2146705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_008212	AATGCA	2	12	2146713	2146724	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11604	NC_008212	AG	3	6	2146743	2146748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_008212	CGA	2	6	2146837	2146842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_008212	TTCG	2	8	2146891	2146898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11607	NC_008212	ATT	2	6	2146931	2146936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_008212	TC	3	6	2146950	2146955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11609	NC_008212	TTCA	2	8	2146984	2146991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11610	NC_008212	TCGT	2	8	2147085	2147092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11611	NC_008212	TTC	2	6	2147122	2147127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_008212	TCC	2	6	2147147	2147152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11613	NC_008212	TCT	2	6	2147183	2147188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_008212	ATT	2	6	2147351	2147356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_008212	GCAG	2	8	2147385	2147392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11616	NC_008212	CAA	2	6	2147550	2147555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_008212	T	6	6	2147566	2147571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_008212	TCA	2	6	2147587	2147592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_008212	CGA	2	6	2149784	2149789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_008212	ACA	2	6	2149837	2149842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_008212	GAC	2	6	2149865	2149870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_008212	ACT	2	6	2149923	2149928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_008212	CT	3	6	2149943	2149948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11624	NC_008212	CTT	2	6	2149986	2149991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_008212	TCA	2	6	2150037	2150042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_008212	GATG	2	8	2150045	2150052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_008212	ATC	2	6	2150073	2150078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11628	NC_008212	TCA	2	6	2150080	2150085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11629	NC_008212	ATTAT	2	10	2150090	2150099	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11630	NC_008212	TCA	2	6	2150100	2150105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11631	NC_008212	AT	3	6	2150192	2150197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11632	NC_008212	GC	3	6	2150828	2150833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11761	NC_008212	AT	3	6	2178826	2178831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11882	NC_008212	AT	3	6	2199757	2199762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11883	NC_008212	TATAT	2	10	2201854	2201863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11888	NC_008212	AAGA	2	8	2203949	2203956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11889	NC_008212	TGC	2	6	2204028	2204033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11890	NC_008212	GC	3	6	2204032	2204037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11891	NC_008212	CAT	2	6	2204039	2204044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11892	NC_008212	CCAG	2	8	2204511	2204518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11893	NC_008212	TCA	2	6	2204539	2204544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11998	NC_008212	TGA	2	6	2231263	2231268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11999	NC_008212	TAGC	2	8	2231292	2231299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12000	NC_008212	AAT	2	6	2231364	2231369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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