MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008212	ACCG	2	8	1822162	1822169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10002	NC_008212	GAT	2	6	1822187	1822192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_008212	GCC	2	6	1822217	1822222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10004	NC_008212	CAA	2	6	1822260	1822265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_008212	GA	3	6	1822299	1822304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_008212	ACT	2	6	1822305	1822310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_008212	TTC	2	6	1822342	1822347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_008212	ACT	2	6	1822353	1822358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_008212	TTC	2	6	1822368	1822373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_008212	TG	3	6	1822380	1822385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_008212	TG	3	6	1822403	1822408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_008212	CGA	2	6	1822430	1822435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_008212	GCT	2	6	1822524	1822529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_008212	ATT	2	6	1822561	1822566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_008212	CCCT	2	8	1822598	1822605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10016	NC_008212	CG	3	6	1822623	1822628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10017	NC_008212	GTA	2	6	1822643	1822648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_008212	GGGAG	2	10	1822649	1822658	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_008212	TCA	2	6	1822673	1822678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_008212	TCG	2	6	1822732	1822737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_008212	GA	3	6	1822748	1822753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_008212	TCG	2	6	1822791	1822796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_008212	AAG	2	6	1822859	1822864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_008212	GAA	2	6	1822918	1822923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_008212	CGAA	2	8	1822955	1822962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10026	NC_008212	C	6	6	1822966	1822971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10027	NC_008212	TGG	2	6	1823049	1823054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_008212	CGT	2	6	1823077	1823082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_008212	GCA	2	6	1823161	1823166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_008212	CA	3	6	1823171	1823176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10031	NC_008212	TA	3	6	1823622	1823627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_008212	TA	3	6	1823639	1823644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_008212	TAT	2	6	1823658	1823663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_008212	TTA	2	6	1823896	1823901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_008212	GGT	2	6	1823906	1823911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_008212	ATA	3	9	1823925	1823933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_008212	ACT	2	6	1823938	1823943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_008212	ATC	2	6	1823968	1823973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_008212	TACA	2	8	1823991	1823998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10040	NC_008212	CTG	2	6	1824029	1824034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_008212	CTA	2	6	1824064	1824069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_008212	ATT	2	6	1824073	1824078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_008212	GCT	2	6	1824088	1824093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_008212	TAT	2	6	1826418	1826423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_008212	GAA	2	6	1826450	1826455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_008212	ATC	3	9	1826483	1826491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_008212	ACA	2	6	1826506	1826511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_008212	CATA	2	8	1826524	1826531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10049	NC_008212	AT	3	6	1826537	1826542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_008212	CGA	2	6	1826550	1826555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_008212	TA	3	6	1826556	1826561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_008212	AC	3	6	1826620	1826625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_008212	CAT	2	6	1828067	1828072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_008212	TTCAA	2	10	1828100	1828109	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10055	NC_008212	AAT	2	6	1828149	1828154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_008212	ATA	2	6	1828155	1828160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_008212	ATG	2	6	1828711	1828716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_008212	AATC	2	8	1828778	1828785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10059	NC_008212	GAAGT	2	10	1828858	1828867	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_008212	CCGC	2	8	1828947	1828954	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10061	NC_008212	GTC	2	6	1829025	1829030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_008212	TGC	2	6	1829034	1829039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_008212	GGCG	2	8	1829043	1829050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_008212	GTA	2	6	1829163	1829168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_008212	A	7	7	1829185	1829191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_008212	GCT	2	6	1829250	1829255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_008212	AG	3	6	1829273	1829278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_008212	GGC	2	6	1829301	1829306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_008212	CTG	2	6	1829396	1829401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_008212	CAC	2	6	1829406	1829411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_008212	CTC	2	6	1829447	1829452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_008212	AAC	2	6	1829461	1829466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_008212	CAG	2	6	1829525	1829530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_008212	ACTCG	2	10	1829535	1829544	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10075	NC_008212	CCGCTC	3	18	1829617	1829634	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10076	NC_008212	TCC	2	6	1829646	1829651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10077	NC_008212	AGG	2	6	1829664	1829669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_008212	ACG	2	6	1829679	1829684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_008212	TCC	2	6	1829689	1829694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10080	NC_008212	T	6	6	1831454	1831459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_008212	GTTA	2	8	1831576	1831583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_008212	TGTCGT	2	12	1831603	1831614	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10083	NC_008212	GCGAG	2	10	1831632	1831641	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10084	NC_008212	TC	3	6	1831733	1831738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10085	NC_008212	CGA	2	6	1831861	1831866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_008212	CACC	2	8	1831883	1831890	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10087	NC_008212	AAC	2	6	1831964	1831969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_008212	GTG	2	6	1831971	1831976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_008212	T	6	6	1831981	1831986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_008212	GA	3	6	1832005	1832010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_008212	GAT	2	6	1832380	1832385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_008212	CTGC	2	8	1832466	1832473	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10093	NC_008212	TAA	2	6	1832488	1832493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_008212	TCCT	2	8	1832509	1832516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10095	NC_008212	ACGA	2	8	1832530	1832537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10096	NC_008212	AGGGA	2	10	1832540	1832549	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_008212	ATG	2	6	1832606	1832611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_008212	TCA	2	6	1832620	1832625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_008212	GACT	2	8	1832626	1832633	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10100	NC_008212	GAC	2	6	1833544	1833549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_008212	GAGTT	2	10	1834773	1834782	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_008212	AAT	2	6	1834964	1834969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_008212	TTCCC	2	10	1836506	1836515	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10104	NC_008212	G	6	6	1836545	1836550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_008212	TCAC	2	8	1836551	1836558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10106	NC_008212	GCGA	2	8	1836580	1836587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10107	NC_008212	TAT	2	6	1836595	1836600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_008212	CAT	2	6	1836647	1836652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_008212	CAT	2	6	1836657	1836662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_008212	CATA	2	8	1836684	1836691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10111	NC_008212	AAT	2	6	1836736	1836741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_008212	TAT	2	6	1836747	1836752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_008212	ACC	2	6	1836762	1836767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10114	NC_008212	TG	4	8	1836771	1836778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_008212	GTG	2	6	1836833	1836838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_008212	TGA	2	6	1837400	1837405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_008212	CTT	2	6	1837629	1837634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_008212	GATT	2	8	1837707	1837714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_008212	GGTT	2	8	1837755	1837762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_008212	CGG	2	6	1837829	1837834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_008212	CAAA	2	8	1837871	1837878	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10122	NC_008212	TCC	2	6	1837897	1837902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10123	NC_008212	TCC	2	6	1837923	1837928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10124	NC_008212	GCCAGA	2	12	1837956	1837967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_008212	TGT	2	6	1838011	1838016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_008212	GTG	2	6	1838036	1838041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_008212	CCAA	2	8	1838045	1838052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_008212	AATA	2	8	1838173	1838180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_008212	GT	3	6	1838198	1838203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_008212	ATAG	2	8	1838255	1838262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_008212	CGT	2	6	1838284	1838289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_008212	GA	3	6	1838292	1838297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_008212	TC	3	6	1838303	1838308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10134	NC_008212	CT	3	6	1838369	1838374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10135	NC_008212	TA	3	6	1838466	1838471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10169	NC_008212	TG	3	6	1841697	1841702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10170	NC_008212	AGTT	2	8	1841738	1841745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10178	NC_008212	CAAACC	2	12	1842322	1842333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10247	NC_008212	TTG	2	6	1853923	1853928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10249	NC_008212	TTC	2	6	1855274	1855279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10251	NC_008212	TATT	2	8	1856017	1856024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_008212	AAG	2	6	1856078	1856083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_008212	ATA	2	6	1856165	1856170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_008212	GCT	2	6	1857319	1857324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_008212	CTT	2	6	1857474	1857479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10256	NC_008212	CTG	2	6	1857494	1857499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10257	NC_008212	AC	3	6	1857533	1857538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10259	NC_008212	ACTC	2	8	1857607	1857614	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10381	NC_008212	CGC	2	6	1883990	1883995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10389	NC_008212	CG	3	6	1884268	1884273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10500	NC_008212	CGA	2	6	1897321	1897326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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