MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008212	CT	3	6	1500112	1500117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8002	NC_008212	TCA	3	9	1500127	1500135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_008212	ATC	2	6	1501166	1501171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_008212	TC	3	6	1501170	1501175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8005	NC_008212	CGCA	2	8	1501178	1501185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8006	NC_008212	CAT	2	6	1501206	1501211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_008212	ATG	2	6	1501328	1501333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_008212	CGT	2	6	1501457	1501462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_008212	CGT	2	6	1501498	1501503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_008212	CAA	2	6	1501653	1501658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_008212	ATA	2	6	1502046	1502051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_008212	AAT	2	6	1502102	1502107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_008212	ATTG	2	8	1502123	1502130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_008212	ACCA	2	8	1502166	1502173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8015	NC_008212	CTCG	2	8	1502180	1502187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8016	NC_008212	ATTTT	2	10	1502204	1502213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_008212	GTCAA	2	10	1503863	1503872	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8018	NC_008212	A	6	6	1503871	1503876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_008212	AAATA	2	10	1503951	1503960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_008212	CT	3	6	1504109	1504114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8021	NC_008212	GA	3	6	1504133	1504138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_008212	AATG	2	8	1504235	1504242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_008212	TCT	2	6	1504280	1504285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_008212	ACT	2	6	1504287	1504292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_008212	CTT	2	6	1504309	1504314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_008212	ATA	2	6	1504825	1504830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_008212	GTT	2	6	1504924	1504929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_008212	CT	3	6	1505482	1505487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_008212	TGT	2	6	1505520	1505525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_008212	TGAC	2	8	1505922	1505929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8031	NC_008212	TGC	2	6	1505956	1505961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_008212	GGT	2	6	1505972	1505977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_008212	CTG	2	6	1506016	1506021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_008212	GA	3	6	1506039	1506044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_008212	CCG	2	6	1506048	1506053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8036	NC_008212	CGA	2	6	1506122	1506127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_008212	CAT	2	6	1506149	1506154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_008212	ATC	2	6	1506190	1506195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_008212	CTC	2	6	1506209	1506214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_008212	GCG	2	6	1506215	1506220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_008212	AAAT	2	8	1506255	1506262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_008212	ACAT	2	8	1506265	1506272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8043	NC_008212	GC	3	6	1506273	1506278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8044	NC_008212	ATTA	2	8	1506869	1506876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_008212	TTGA	2	8	1507081	1507088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_008212	TGAT	2	8	1507100	1507107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_008212	ATC	2	6	1507123	1507128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_008212	TC	3	6	1507155	1507160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_008212	TGC	2	6	1507162	1507167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_008212	TTA	2	6	1507223	1507228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_008212	GATT	2	8	1507256	1507263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_008212	TGT	2	6	1507368	1507373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_008212	TAC	2	6	1507406	1507411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_008212	ATCA	2	8	1507442	1507449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8055	NC_008212	AT	3	6	1507470	1507475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_008212	TAT	2	6	1507516	1507521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_008212	TAG	2	6	1507646	1507651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_008212	AGA	2	6	1507657	1507662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_008212	TC	3	6	1507701	1507706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8060	NC_008212	TTG	2	6	1507740	1507745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_008212	GGA	2	6	1508072	1508077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_008212	TGA	2	6	1508085	1508090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_008212	GA	3	6	1508152	1508157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_008212	GTC	2	6	1508211	1508216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_008212	TAG	2	6	1509312	1509317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_008212	TAAA	2	8	1509337	1509344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_008212	GATAA	2	10	1509346	1509355	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_008212	ATG	2	6	1509370	1509375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_008212	TTA	2	6	1510247	1510252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_008212	TAT	2	6	1510336	1510341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_008212	GCTG	2	8	1510354	1510361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8072	NC_008212	ATC	2	6	1510441	1510446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_008212	A	6	6	1510447	1510452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_008212	ATCA	2	8	1510458	1510465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8075	NC_008212	CAT	2	6	1510468	1510473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_008212	GAT	2	6	1510506	1510511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_008212	TC	3	6	1510524	1510529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8078	NC_008212	ATTT	2	8	1510580	1510587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_008212	CG	3	6	1512390	1512395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8080	NC_008212	AT	3	6	1512430	1512435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_008212	CA	3	6	1512436	1512441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8082	NC_008212	TCT	2	6	1512443	1512448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8084	NC_008212	GTCA	2	8	1512501	1512508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_008212	ATG	2	6	1512576	1512581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_008212	TA	3	6	1512586	1512591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_008212	CAGCGA	2	12	1512666	1512677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_008212	CAGCAA	2	12	1512678	1512689	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_008212	TTC	2	6	1512807	1512812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_008212	CGT	2	6	1512847	1512852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_008212	TCA	2	6	1512886	1512891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_008212	TTG	2	6	1513005	1513010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_008212	TCA	2	6	1513012	1513017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_008212	CACCGA	2	12	1513021	1513032	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8095	NC_008212	CGA	2	6	1513054	1513059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_008212	ACG	2	6	1513106	1513111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_008212	TGC	2	6	1513194	1513199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_008212	ACA	2	6	1513202	1513207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_008212	GTC	2	6	1513370	1513375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_008212	TGC	2	6	1513381	1513386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_008212	TCA	2	6	1513426	1513431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_008212	TGA	2	6	1513433	1513438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_008212	AAG	2	6	1513475	1513480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_008212	ATA	2	6	1514383	1514388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_008212	AT	3	6	1514482	1514487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_008212	GGGT	2	8	1515569	1515576	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_008212	ATG	2	6	1515625	1515630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_008212	AGA	2	6	1515795	1515800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_008212	GAT	2	6	1515803	1515808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_008212	TC	3	6	1515898	1515903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_008212	GAT	2	6	1515920	1515925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_008212	ATA	2	6	1515995	1516000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_008212	GTC	2	6	1516036	1516041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_008212	CGA	2	6	1516120	1516125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_008212	TCA	2	6	1516148	1516153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_008212	AG	3	6	1516186	1516191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_008212	TA	3	6	1516215	1516220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_008212	TTG	2	6	1518121	1518126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_008212	TAG	2	6	1518220	1518225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_008212	AGA	2	6	1518231	1518236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_008212	TCAG	2	8	1518261	1518268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8122	NC_008212	TC	3	6	1518275	1518280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_008212	TTG	2	6	1518314	1518319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_008212	CCG	2	6	1518470	1518475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8125	NC_008212	GGC	2	6	1518478	1518483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_008212	AAT	2	6	1518507	1518512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_008212	CGGT	2	8	1518531	1518538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8128	NC_008212	GATGCA	2	12	1518553	1518564	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8129	NC_008212	CAG	2	6	1518707	1518712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_008212	CTC	2	6	1518720	1518725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8131	NC_008212	CCA	2	6	1518796	1518801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8132	NC_008212	TCC	2	6	1518822	1518827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8133	NC_008212	GAG	2	6	1518839	1518844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_008212	CCT	2	6	1518863	1518868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8135	NC_008212	AGG	2	6	1518880	1518885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8136	NC_008212	CGCT	2	8	1518894	1518901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8137	NC_008212	TG	3	6	1518916	1518921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8138	NC_008212	ATA	2	6	1519062	1519067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8139	NC_008212	GAT	2	6	1519213	1519218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8140	NC_008212	TA	3	6	1519543	1519548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8141	NC_008212	CCT	2	6	1519590	1519595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8142	NC_008212	CGT	2	6	1519845	1519850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8143	NC_008212	CAC	2	6	1519947	1519952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8144	NC_008212	ATTG	2	8	1520034	1520041	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8145	NC_008212	TGC	2	6	1520055	1520060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8146	NC_008212	AATC	2	8	1520079	1520086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8148	NC_008212	TTGT	2	8	1520173	1520180	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8149	NC_008212	AT	3	6	1520210	1520215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8150	NC_008212	AAC	2	6	1520218	1520223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8151	NC_008212	GATG	2	8	1520288	1520295	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8152	NC_008212	TA	3	6	1520342	1520347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8153	NC_008212	AT	4	8	1520370	1520377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8154	NC_008212	A	6	6	1521879	1521884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8155	NC_008212	CCGATC	3	18	1522013	1522030	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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8158	NC_008212	TCC	2	6	1522255	1522260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8159	NC_008212	TCG	2	6	1522365	1522370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8162	NC_008212	TCA	2	6	1523113	1523118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8164	NC_008212	TAT	2	6	1523232	1523237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8165	NC_008212	GAG	2	6	1523250	1523255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8166	NC_008212	CTG	2	6	1523264	1523269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8173	NC_008212	AT	3	6	1524908	1524913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8174	NC_008212	GAC	2	6	1524925	1524930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8243	NC_008212	TGA	2	6	1533313	1533318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8246	NC_008212	GTG	2	6	1533465	1533470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8247	NC_008212	AAACGC	2	12	1533539	1533550	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8248	NC_008212	TCAC	2	8	1533630	1533637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8250	NC_008212	T	6	6	1533656	1533661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8251	NC_008212	AAT	2	6	1533720	1533725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8252	NC_008212	A	6	6	1533745	1533750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8253	NC_008212	AGA	2	6	1533858	1533863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8254	NC_008212	TA	3	6	1533887	1533892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8255	NC_008212	TAAT	2	8	1533959	1533966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8256	NC_008212	A	6	6	1533972	1533977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8257	NC_008212	AAT	2	6	1534217	1534222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8258	NC_008212	AGT	2	6	1534250	1534255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8260	NC_008212	GAAG	2	8	1534320	1534327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8262	NC_008212	CA	3	6	1534691	1534696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8282	NC_008212	TCCA	2	8	1536673	1536680	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8391	NC_008212	GAT	2	6	1564365	1564370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8392	NC_008212	GCC	2	6	1564395	1564400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8393	NC_008212	TG	3	6	1564451	1564456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8394	NC_008212	ATGT	2	8	1564473	1564480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8395	NC_008212	CGA	2	6	1564501	1564506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8422	NC_008212	TTAAT	2	10	1565675	1565684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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