MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi DSM 16790

Total Repeats: 16658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008212	CG	3	6	1123079	1123084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_008212	AGGG	2	8	1123104	1123111	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_008212	TCA	2	6	1123124	1123129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_008212	TCG	2	6	1123242	1123247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_008212	AAG	2	6	1123310	1123315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_008212	GAA	2	6	1123369	1123374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_008212	CGAA	2	8	1123406	1123413	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_008212	TGG	2	6	1123500	1123505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_008212	CGT	2	6	1123528	1123533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_008212	TCGG	2	8	1123626	1123633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_008212	GTC	2	6	1123652	1123657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_008212	TCC	2	6	1123669	1123674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_008212	CTCG	2	8	1123683	1123690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_008212	CGCT	2	8	1123694	1123701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_008212	GTA	2	6	1123768	1123773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_008212	ATA	2	6	1123814	1123819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_008212	ATC	2	6	1124354	1124359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_008212	ACAA	2	8	1124389	1124396	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5519	NC_008212	TCAC	2	8	1124448	1124455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_008212	GA	3	6	1124463	1124468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_008212	C	6	6	1124526	1124531	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5522	NC_008212	GGA	2	6	1124687	1124692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_008212	TGC	2	6	1124707	1124712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_008212	CAC	2	6	1124804	1124809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_008212	CGA	2	6	1124849	1124854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_008212	TAC	2	6	1124877	1124882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_008212	CATC	2	8	1124890	1124897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_008212	TGA	2	6	1126660	1126665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_008212	GATTCT	2	12	1126671	1126682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5530	NC_008212	AT	3	6	1126709	1126714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_008212	TCA	2	6	1126716	1126721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_008212	GA	3	6	1126770	1126775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_008212	CTT	2	6	1126798	1126803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_008212	TC	3	6	1126813	1126818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_008212	CAG	2	6	1126833	1126838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_008212	ACG	2	6	1126895	1126900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_008212	GGA	2	6	1126919	1126924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_008212	ACC	2	6	1126959	1126964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_008212	TAA	2	6	1126979	1126984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_008212	GTT	2	6	1126987	1126992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_008212	GTG	2	6	1127716	1127721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_008212	GCA	2	6	1127726	1127731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_008212	AAG	3	9	1127779	1127787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_008212	TCG	2	6	1127933	1127938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_008212	GAG	2	6	1128075	1128080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_008212	CGG	2	6	1128092	1128097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_008212	TAG	2	6	1128135	1128140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_008212	TGA	2	6	1128216	1128221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_008212	GTT	2	6	1128222	1128227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_008212	CGAAC	2	10	1128379	1128388	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5551	NC_008212	CA	3	6	1128427	1128432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_008212	TGT	2	6	1128460	1128465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_008212	TGG	2	6	1128606	1128611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_008212	CCGGGA	2	12	1128658	1128669	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_008212	GTAGG	5	25	1128722	1128746	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_008212	TGAA	2	8	1129398	1129405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_008212	GAT	2	6	1129884	1129889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_008212	GATTTC	2	12	1130209	1130220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5559	NC_008212	TTAA	2	8	1130224	1130231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_008212	TGG	2	6	1130236	1130241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_008212	TGA	2	6	1130385	1130390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_008212	T	6	6	1130393	1130398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_008212	CTG	2	6	1130401	1130406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_008212	ATA	2	6	1130855	1130860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_008212	TAC	2	6	1130867	1130872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_008212	CTT	2	6	1130908	1130913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_008212	GT	3	6	1130939	1130944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_008212	TTA	2	6	1130975	1130980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_008212	TA	3	6	1130979	1130984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_008212	ATT	2	6	1130990	1130995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_008212	ATA	2	6	1130996	1131001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_008212	AAT	2	6	1131016	1131021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_008212	AT	3	6	1131041	1131046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_008212	TA	4	8	1131096	1131103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_008212	AAT	2	6	1131113	1131118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_008212	TAA	2	6	1131218	1131223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_008212	CAT	2	6	1131245	1131250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_008212	TGA	2	6	1131320	1131325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_008212	AGT	2	6	1133274	1133279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_008212	TG	3	6	1133346	1133351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_008212	CGA	2	6	1133358	1133363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_008212	GAT	2	6	1133419	1133424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_008212	AT	3	6	1133443	1133448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_008212	TCAA	2	8	1133566	1133573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5585	NC_008212	GAT	2	6	1133596	1133601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_008212	TAA	2	6	1133611	1133616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_008212	TAA	2	6	1133627	1133632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_008212	TA	3	6	1133634	1133639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_008212	CCA	2	6	1133672	1133677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_008212	TTC	2	6	1133686	1133691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_008212	GAA	2	6	1135177	1135182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_008212	G	6	6	1135199	1135204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_008212	TGAGGA	2	12	1135212	1135223	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_008212	CAT	2	6	1135235	1135240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_008212	TGA	2	6	1135287	1135292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_008212	AAT	2	6	1135325	1135330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_008212	TGT	2	6	1135340	1135345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_008212	AAC	2	6	1135360	1135365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_008212	AGA	2	6	1135377	1135382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_008212	TGA	2	6	1135413	1135418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_008212	GTA	2	6	1135817	1135822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_008212	ATTG	2	8	1137331	1137338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_008212	AAG	2	6	1138189	1138194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008212	ATT	2	6	1138309	1138314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_008212	TAT	2	6	1138387	1138392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_008212	AAATCA	2	12	1138421	1138432	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5607	NC_008212	TAT	3	9	1138433	1138441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_008212	GAGTA	2	10	1138487	1138496	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_008212	TTAAA	2	10	1139335	1139344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_008212	CATT	2	8	1139401	1139408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_008212	AGTGTA	2	12	1139463	1139474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_008212	T	6	6	1139487	1139492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_008212	ACT	2	6	1139509	1139514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_008212	GTAT	2	8	1139572	1139579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_008212	TAT	3	9	1139577	1139585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_008212	GCA	2	6	1139595	1139600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_008212	AT	3	6	1139625	1139630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_008212	ATTG	2	8	1139643	1139650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_008212	GCGG	2	8	1140713	1140720	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_008212	AC	3	6	1140760	1140765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_008212	GTTAGT	2	12	1142025	1142036	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_008212	TTGGTG	3	18	1142038	1142055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_008212	TGGTAC	2	12	1142057	1142068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5624	NC_008212	TCA	2	6	1142075	1142080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_008212	CTG	2	6	1142096	1142101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_008212	GT	3	6	1142112	1142117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_008212	TCA	2	6	1142132	1142137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_008212	CAA	2	6	1143391	1143396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_008212	TATCA	2	10	1144341	1144350	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5631	NC_008212	GTA	2	6	1144391	1144396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5633	NC_008212	CACATC	2	12	1147431	1147442	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5634	NC_008212	ACCATC	2	12	1147443	1147454	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5637	NC_008212	GAGT	2	8	1148190	1148197	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5643	NC_008212	AT	3	6	1148410	1148415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5647	NC_008212	T	6	6	1148465	1148470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5650	NC_008212	ATA	2	6	1148567	1148572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5653	NC_008212	AT	3	6	1148751	1148756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5660	NC_008212	TAAA	2	8	1148984	1148991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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