MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 3063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008086	AGATA	2	10	1574958	1574967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_008086	GAA	2	6	1574978	1574983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008086	A	6	6	1575032	1575037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008086	GTGTGA	2	12	1576065	1576076	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_008086	AGC	2	6	1576113	1576118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_008086	T	6	6	1576166	1576171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008086	CCA	2	6	1576195	1576200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3008	NC_008086	ATA	2	6	1576226	1576231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008086	CAA	2	6	1576264	1576269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_008086	CTTTT	2	10	1576946	1576955	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3011	NC_008086	AATT	2	8	1577011	1577018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008086	T	9	9	1577017	1577025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008086	G	6	6	1577890	1577895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008086	TAAAA	2	10	1577959	1577968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008086	G	6	6	1578023	1578028	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008086	CT	3	6	1578047	1578052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_008086	ACC	2	6	1578063	1578068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_008086	ATT	2	6	1578150	1578155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008086	ATT	2	6	1578205	1578210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_008086	ATA	2	6	1578229	1578234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008086	TTCA	2	8	1578268	1578275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_008086	AAC	2	6	1578283	1578288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_008086	ATCA	2	8	1578372	1578379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_008086	TAA	2	6	1578448	1578453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008086	ACC	2	6	1578467	1578472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_008086	AG	3	6	1578527	1578532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_008086	TAA	2	6	1585070	1585075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008086	TTTA	2	8	1585932	1585939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_008086	AAT	2	6	1585976	1585981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008086	TCA	2	6	1588549	1588554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_008086	TTAA	2	8	1588695	1588702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_008086	CAA	2	6	1588712	1588717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_008086	TAT	2	6	1590794	1590799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008086	TGA	2	6	1590814	1590819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_008086	ATT	2	6	1590871	1590876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008086	ATAAA	2	10	1590877	1590886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008086	CAA	2	6	1592627	1592632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_008086	ACC	2	6	1592653	1592658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_008086	AAAGAT	2	12	1592660	1592671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_008086	AAAG	2	8	1593706	1593713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_008086	GA	3	6	1593760	1593765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_008086	TAT	2	6	1593844	1593849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_008086	ATT	2	6	1593856	1593861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_008086	ATT	2	6	1593927	1593932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_008086	TAT	2	6	1593934	1593939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_008086	A	6	6	1593953	1593958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008086	TAGTG	2	10	1594007	1594016	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_008086	ATGATT	2	12	1594042	1594053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008086	GT	3	6	1594089	1594094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_008086	GCAT	2	8	1594101	1594108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3051	NC_008086	TTC	2	6	1594111	1594116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_008086	AGTT	2	8	1594126	1594133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008086	ATA	2	6	1594180	1594185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008086	ATAAA	2	10	1594224	1594233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_008086	A	6	6	1594231	1594236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008086	ACT	2	6	1594246	1594251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_008086	TACT	2	8	1594274	1594281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_008086	ATA	2	6	1594292	1594297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008086	CATT	2	8	1594368	1594375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_008086	CTTG	2	8	1594402	1594409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3061	NC_008086	T	6	6	1594422	1594427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008086	TTA	2	6	1594481	1594486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_008086	CGCT	2	8	1596335	1596342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.