MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 3063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008086	AAG	2	6	534420	534425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008086	GTT	2	6	534449	534454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008086	ATA	2	6	534511	534516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008086	ACC	2	6	534530	534535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_008086	TTTG	2	8	534608	534615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008086	CAAA	2	8	534623	534630	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_008086	A	6	6	534673	534678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008086	TATAT	2	10	534685	534694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008086	AAT	2	6	534698	534703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008086	A	6	6	534718	534723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008086	CAA	2	6	534727	534732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008086	CAAG	2	8	534741	534748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_008086	TTAC	2	8	534777	534784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_008086	T	6	6	534848	534853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008086	ATT	2	6	536956	536961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008086	AAC	2	6	536971	536976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_008086	ATT	2	6	540483	540488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008086	ATT	2	6	542650	542655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008086	CT	3	6	544268	544273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_008086	AATC	2	8	545266	545273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_008086	TTTG	2	8	545354	545361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008086	CAT	2	6	545370	545375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_008086	AT	3	6	545645	545650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008086	AC	4	8	545668	545675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_008086	GCATT	2	10	545745	545754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1030	NC_008086	ACC	2	6	549680	549685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_008086	T	6	6	549705	549710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008086	CT	3	6	550038	550043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_008086	TTA	2	6	550126	550131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008086	T	6	6	550908	550913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008086	ATTA	2	8	550925	550932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1041	NC_008086	TAT	2	6	552465	552470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008086	TTTAAA	2	12	552492	552503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1044	NC_008086	A	8	8	556155	556162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1046	NC_008086	T	6	6	556616	556621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008086	TTGTA	2	10	556644	556653	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1051	NC_008086	T	6	6	556749	556754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008086	ATT	2	6	556757	556762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008086	T	6	6	556787	556792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1055	NC_008086	A	7	7	556829	556835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008086	ATA	2	6	556856	556861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1063	NC_008086	CATT	2	8	559832	559839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_008086	ACA	2	6	559879	559884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_008086	AAT	2	6	559916	559921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008086	ATA	2	6	559931	559936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008086	AAT	2	6	560774	560779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008086	AT	3	6	561087	561092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_008086	ATG	2	6	562506	562511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008086	ACA	2	6	562514	562519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_008086	ACTA	2	8	562521	562528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_008086	A	6	6	562528	562533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_008086	CTTAT	2	10	588798	588807	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_008086	A	11	11	588850	588860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1108	NC_008086	T	7	7	590757	590763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008086	TTA	2	6	590766	590771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_008086	AT	3	6	592489	592494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_008086	CCAT	2	8	592777	592784	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_008086	T	6	6	592826	592831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008086	ATTTT	2	10	592848	592857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008086	T	8	8	592854	592861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008086	T	6	6	592863	592868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_008086	CTT	2	6	601556	601561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_008086	T	6	6	601560	601565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008086	TTA	2	6	601592	601597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008086	AAT	2	6	602919	602924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008086	TGAT	2	8	609812	609819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_008086	AGAT	2	8	609840	609847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008086	GTT	2	6	609853	609858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_008086	TTG	2	6	609877	609882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_008086	TAA	2	6	609885	609890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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