MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 3063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008086	A	6	6	216306	216311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008086	TTGGT	2	10	216428	216437	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008086	A	6	6	221288	221293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008086	TAA	2	6	223204	223209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008086	T	6	6	224992	224997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008086	AAT	2	6	225047	225052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008086	TATT	2	8	225074	225081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008086	TGT	2	6	225582	225587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008086	GAG	2	6	225723	225728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008086	T	6	6	227936	227941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008086	ATT	2	6	227991	227996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008086	GAT	3	9	228044	228052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008086	TTTTGC	2	12	228335	228346	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
514	NC_008086	CAAAAC	2	12	228354	228365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008086	TTA	2	6	229795	229800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008086	AAC	2	6	229822	229827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008086	T	8	8	229833	229840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008086	ATTAAA	2	12	229860	229871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008086	A	6	6	231027	231032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008086	AAT	2	6	231050	231055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008086	T	6	6	231059	231064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008086	T	6	6	231090	231095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008086	GTTTT	2	10	231106	231115	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008086	T	7	7	231145	231151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008086	A	6	6	232173	232178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008086	A	6	6	232208	232213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008086	TAG	2	6	232458	232463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008086	TTC	2	6	234491	234496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_008086	A	14	14	234589	234602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008086	T	6	6	234615	234620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008086	A	6	6	234635	234640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008086	AAGA	2	8	234711	234718	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008086	A	6	6	235900	235905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008086	GCC	2	6	235971	235976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_008086	A	6	6	236011	236016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008086	GT	3	6	236032	236037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008086	T	6	6	236037	236042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008086	ATG	2	6	236060	236065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008086	TTTA	2	8	237643	237650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008086	TAA	2	6	237689	237694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008086	T	9	9	237722	237730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008086	T	6	6	237746	237751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008086	T	6	6	237775	237780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008086	TAT	2	6	238562	238567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008086	TGT	2	6	238591	238596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008086	A	6	6	241863	241868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008086	A	6	6	241898	241903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008086	CAA	2	6	241912	241917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_008086	A	6	6	241963	241968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008086	T	6	6	242026	242031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008086	CAA	2	6	242054	242059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_008086	AAC	2	6	242110	242115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008086	TAA	3	9	242229	242237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008086	TTTTA	2	10	242322	242331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008086	CTAAC	2	10	242363	242372	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
556	NC_008086	AACA	2	8	242399	242406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_008086	AAC	2	6	242413	242418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008086	A	6	6	242422	242427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008086	GAT	2	6	242558	242563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008086	GGTT	2	8	242573	242580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008086	CTT	2	6	243663	243668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_008086	CTT	2	6	243691	243696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008086	CAAAA	2	10	243701	243710	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
564	NC_008086	A	6	6	243707	243712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008086	T	7	7	250202	250208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008086	TAA	2	6	250270	250275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008086	A	6	6	250274	250279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008086	T	7	7	250280	250286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008086	ATT	2	6	250331	250336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008086	CTTT	2	8	252890	252897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_008086	ATT	2	6	252913	252918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008086	ATTTTA	2	12	253006	253017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008086	AAATT	2	10	253041	253050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008086	A	6	6	256201	256206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008086	TGA	2	6	258842	258847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008086	TAAT	2	8	258867	258874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008086	AAAG	2	8	258912	258919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008086	ATA	2	6	258923	258928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008086	TGG	2	6	258930	258935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008086	TAT	2	6	259023	259028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008086	T	6	6	259061	259066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008086	T	8	8	262086	262093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008086	CAATC	2	10	262116	262125	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
584	NC_008086	ATA	2	6	262141	262146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008086	ATT	2	6	268446	268451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008086	TAT	2	6	268464	268469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008086	TAT	2	6	268563	268568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008086	TGAT	2	8	268573	268580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008086	ATGA	2	8	269200	269207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008086	AGA	2	6	269276	269281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008086	A	6	6	272713	272718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008086	A	6	6	272740	272745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008086	A	6	6	280621	280626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008086	AAATA	2	10	280629	280638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008086	GTTTT	2	10	286254	286263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008086	GAA	2	6	286294	286299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008086	CAT	2	6	286345	286350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_008086	T	6	6	287504	287509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008086	T	6	6	304222	304227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008086	AG	3	6	305782	305787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008086	A	6	6	308402	308407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008086	AAT	2	6	308424	308429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008086	CATT	2	8	308444	308451	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_008086	ATT	2	6	308469	308474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008086	TCA	2	6	308508	308513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008086	A	8	8	308513	308520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008086	AGG	2	6	309562	309567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008086	G	6	6	309566	309571	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008086	ACC	2	6	309623	309628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_008086	T	6	6	312139	312144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008086	AACA	2	8	312145	312152	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_008086	TAA	2	6	312177	312182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008086	TAA	2	6	312208	312213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008086	A	7	7	312242	312248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008086	TAA	2	6	312306	312311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008086	TTAA	2	8	312965	312972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008086	TGT	2	6	313048	313053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008086	GTTT	2	8	320476	320483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008086	ATT	2	6	320492	320497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008086	GTC	2	6	320538	320543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_008086	ATA	2	6	320608	320613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008086	ACTG	2	8	325095	325102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_008086	TAA	2	6	326927	326932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008086	T	7	7	326962	326968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008086	TAA	2	6	329522	329527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008086	A	7	7	329540	329546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008086	TTATA	2	10	329554	329563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008086	ATA	2	6	329588	329593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008086	TAT	2	6	329645	329650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008086	TGAA	2	8	329668	329675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008086	TTA	2	6	329686	329691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008086	CTT	2	6	329751	329756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_008086	GGT	2	6	329760	329765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008086	TAA	2	6	329787	329792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008086	T	6	6	329854	329859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_008086	TTG	2	6	329884	329889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008086	AAC	2	6	329922	329927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_008086	A	6	6	329950	329955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_008086	GA	3	6	330097	330102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008086	AAT	2	6	330148	330153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_008086	ATC	2	6	330212	330217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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643	NC_008086	T	7	7	330249	330255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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