MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 8735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006396	CCGG	2	8	972	979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006396	GCG	2	6	1001	1006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006396	AT	3	6	2928	2933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006396	A	6	6	2993	2998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006396	TCG	2	6	4681	4686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006396	CGA	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006396	CGT	2	6	4726	4731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006396	CG	3	6	4755	4760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006396	CCA	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_006396	CCGGA	2	10	4883	4892	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_006396	ATT	2	6	4944	4949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006396	CGG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006396	CG	3	6	5004	5009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006396	GAA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006396	ACC	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_006396	CGC	2	6	5232	5237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_006396	ACCT	2	8	5252	5259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006396	CGA	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006396	GTCC	2	8	6487	6494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006396	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006396	AAT	2	6	6516	6521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006396	GAT	2	6	6620	6625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006396	TC	3	6	6633	6638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006396	CT	4	8	6643	6650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006396	CCG	2	6	7739	7744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_006396	GCC	2	6	8020	8025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_006396	GCT	2	6	8043	8048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006396	A	6	6	8057	8062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006396	CGA	2	6	8070	8075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006396	GAA	2	6	8110	8115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006396	ACC	2	6	9516	9521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_006396	CCG	2	6	9543	9548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_006396	ACA	2	6	9584	9589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006396	GCC	2	6	9618	9623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_006396	GAC	2	6	9647	9652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006396	GGCA	2	8	9678	9685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006396	CCA	2	6	9698	9703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_006396	TAG	2	6	10433	10438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006396	CGA	2	6	10486	10491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006396	ATC	2	6	11689	11694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006396	AAC	2	6	11709	11714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006396	TTA	2	6	11718	11723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006396	AAGCG	2	10	14790	14799	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_006396	CGA	2	6	14822	14827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006396	ACG	2	6	14899	14904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006396	CAGA	2	8	15270	15277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006396	ACCG	2	8	15310	15317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006396	GCTAT	2	10	15323	15332	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006396	CGG	2	6	15355	15360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006396	GC	3	6	15387	15392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006396	GGC	2	6	20357	20362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006396	TGA	2	6	20423	20428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006396	ACCA	2	8	20494	20501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_006396	AT	3	6	20541	20546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006396	AG	4	8	20588	20595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006396	A	6	6	23512	23517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006396	CGC	3	9	23535	23543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_006396	CGCA	2	8	24389	24396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006396	ACA	2	6	24704	24709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006396	A	6	6	24727	24732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006396	TAT	2	6	24733	24738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006396	CGGT	2	8	24779	24786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_006396	CTA	2	6	24797	24802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006396	AT	3	6	24846	24851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006396	GGC	2	6	25402	25407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006396	CAG	2	6	25445	25450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006396	GGGACC	2	12	25496	25507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006396	CGCT	2	8	25551	25558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006396	CGT	2	6	25581	25586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006396	GCG	2	6	25590	25595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006396	CGCTC	2	10	25629	25638	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_006396	CG	3	6	25726	25731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006396	G	6	6	27152	27157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006396	CCA	2	6	27244	27249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_006396	TAT	2	6	27311	27316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006396	TC	4	8	27339	27346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_006396	CGG	2	6	27410	27415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006396	TGC	2	6	27421	27426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006396	CGT	2	6	27427	27432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006396	GACG	2	8	27459	27466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_006396	CGC	2	6	27500	27505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_006396	TCGC	2	8	27513	27520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_006396	ACG	3	9	27526	27534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006396	CGC	2	6	27565	27570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_006396	CGTG	2	8	27617	27624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_006396	CTGG	2	8	27625	27632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_006396	TGAC	2	8	27643	27650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_006396	GGTC	2	8	30891	30898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_006396	TC	3	6	31924	31929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006396	GAC	2	6	31933	31938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006396	CA	3	6	31956	31961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006396	GCG	2	6	31966	31971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006396	GCC	2	6	32546	32551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_006396	GTC	2	6	32595	32600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006396	GAGG	2	8	32607	32614	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006396	CT	3	6	32634	32639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_006396	GTA	2	6	33495	33500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006396	CA	3	6	33505	33510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006396	GTC	2	6	33543	33548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006396	TAT	2	6	33675	33680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006396	CCG	2	6	34043	34048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_006396	GTCG	2	8	34061	34068	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_006396	ACG	2	6	34074	34079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006396	CA	3	6	36143	36148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_006396	CGG	2	6	36199	36204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006396	GAA	2	6	36799	36804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006396	CGT	2	6	36833	36838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006396	CGT	2	6	37624	37629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006396	CGT	3	9	37653	37661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006396	GC	3	6	37693	37698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_006396	TCC	2	6	37821	37826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_006396	CTG	2	6	37832	37837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_006396	CGT	2	6	37871	37876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006396	TCG	2	6	37942	37947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006396	ATACG	2	10	37993	38002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_006396	CAGC	2	8	38014	38021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_006396	A	6	6	38026	38031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006396	ATAA	2	8	38836	38843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006396	CTG	2	6	38844	38849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006396	CAG	2	6	38885	38890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006396	ACA	2	6	38949	38954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006396	CAA	2	6	41385	41390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006396	TATT	2	8	41393	41400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006396	CG	3	6	41541	41546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_006396	ACCC	2	8	43867	43874	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_006396	TGC	2	6	45761	45766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006396	ACG	2	6	45818	45823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006396	AC	3	6	47217	47222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_006396	CGG	2	6	47267	47272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006396	GTC	2	6	47293	47298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006396	CGTG	2	8	47322	47329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_006396	CAAG	2	8	47359	47366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_006396	GC	3	6	47369	47374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_006396	TTCT	2	8	47572	47579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_006396	CT	3	6	47578	47583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_006396	TTC	2	6	47611	47616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006396	GCA	2	6	48744	48749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_006396	ATCG	2	8	48750	48757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_006396	GAC	2	6	48758	48763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006396	TG	3	6	49196	49201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006396	TGA	2	6	49209	49214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006396	CGGC	2	8	49290	49297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_006396	TGC	2	6	49376	49381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_006396	ACG	2	6	49485	49490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_006396	CAC	2	6	51753	51758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_006396	CCGC	2	8	51768	51775	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_006396	CG	3	6	51829	51834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_006396	GGA	2	6	51932	51937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006396	CGTT	2	8	55522	55529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_006396	CGG	2	6	56008	56013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_006396	ACT	2	6	56036	56041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_006396	CCGC	2	8	56444	56451	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_006396	AGT	2	6	56495	56500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_006396	GGT	2	6	73287	73292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_006396	GTT	2	6	73321	73326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_006396	GTA	2	6	110797	110802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_006396	GCCGC	2	10	114489	114498	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
276	NC_006396	ACTA	2	8	115170	115177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
277	NC_006396	ACA	2	6	116357	116362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_006396	ACA	2	6	116383	116388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_006396	AGT	2	6	116422	116427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_006396	CG	3	6	118322	118327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
281	NC_006396	CACACG	3	18	118328	118345	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
282	NC_006396	CG	3	6	118344	118349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
283	NC_006396	AGA	2	6	118361	118366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_006396	GTG	2	6	119949	119954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_006396	G	6	6	120991	120996	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
286	NC_006396	CGC	2	6	121013	121018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_006396	CGT	3	9	121071	121079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_006396	GAA	2	6	121110	121115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_006396	CGG	2	6	121151	121156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_006396	GCA	2	6	121222	121227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_006396	G	6	6	121236	121241	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
292	NC_006396	CGC	2	6	123078	123083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_006396	CCGA	2	8	125932	125939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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298	NC_006396	GCG	2	6	126161	126166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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403	NC_006396	TGGC	3	12	161407	161418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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411	NC_006396	GTC	2	6	166439	166444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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419	NC_006396	CGAC	2	8	166711	166718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
420	NC_006396	CAA	2	6	166742	166747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_006396	CGC	2	6	166786	166791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_006396	GTC	2	6	166854	166859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_006396	ACC	2	6	168031	168036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_006396	GACC	2	8	169678	169685	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
426	NC_006396	GTT	2	6	169698	169703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_006396	TGT	2	6	169723	169728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
428	NC_006396	CGC	2	6	169797	169802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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446	NC_006396	TGG	2	6	180470	180475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_006396	TCG	2	6	180747	180752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_006396	TCC	2	6	180767	180772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_006396	CGA	2	6	180778	180783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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