MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 8735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006396	GC	3	6	575053	575058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_006396	ACG	2	6	575826	575831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_006396	CCG	2	6	577686	577691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_006396	CCG	2	6	577701	577706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_006396	CGT	2	6	577722	577727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_006396	CCG	2	6	577745	577750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_006396	TGCT	2	8	577760	577767	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_006396	TAG	2	6	581165	581170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_006396	TCCG	2	8	581172	581179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_006396	GAT	2	6	581335	581340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_006396	CTC	2	6	581353	581358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_006396	TTGC	2	8	581395	581402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_006396	CGC	2	6	581417	581422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_006396	CGCGCT	2	12	581445	581456	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_006396	ACGA	2	8	581495	581502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_006396	AGC	2	6	581618	581623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_006396	CTGA	2	8	581753	581760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_006396	TAT	2	6	581839	581844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_006396	GAA	2	6	583948	583953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_006396	TGGG	2	8	584141	584148	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_006396	ATTT	2	8	584159	584166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_006396	TGT	2	6	584188	584193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_006396	AAC	2	6	584226	584231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_006396	C	6	6	584313	584318	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1525	NC_006396	TAG	2	6	584331	584336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_006396	TGA	2	6	584392	584397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_006396	GGT	2	6	584448	584453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_006396	TGA	2	6	584490	584495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_006396	TGG	2	6	584500	584505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_006396	GCA	2	6	584514	584519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_006396	G	6	6	584522	584527	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_006396	CTG	2	6	585489	585494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_006396	TG	3	6	585493	585498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_006396	ATCG	2	8	585549	585556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_006396	CTG	2	6	585574	585579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_006396	CT	3	6	585607	585612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_006396	GTA	2	6	585687	585692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_006396	GT	3	6	587486	587491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_006396	CGTA	2	8	589601	589608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_006396	GTC	2	6	592176	592181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_006396	CGT	2	6	592210	592215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_006396	GCGTC	2	10	592229	592238	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1543	NC_006396	GCC	3	9	592274	592282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_006396	TTC	2	6	592926	592931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_006396	CGG	2	6	593030	593035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_006396	CGA	2	6	593056	593061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_006396	GATA	2	8	593527	593534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_006396	CTT	2	6	594800	594805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_006396	CCG	2	6	594869	594874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_006396	AT	3	6	601503	601508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_006396	ACGG	2	8	602085	602092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_006396	GA	3	6	603514	603519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_006396	GAG	2	6	603535	603540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_006396	ATC	2	6	603544	603549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_006396	GTCG	2	8	603555	603562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_006396	CGT	2	6	603597	603602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_006396	CGA	2	6	603636	603641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_006396	CG	3	6	603649	603654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_006396	ACG	2	6	603671	603676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_006396	GCC	2	6	603682	603687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_006396	CCG	2	6	603693	603698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_006396	GCC	3	9	603727	603735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_006396	CGAC	2	8	603753	603760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_006396	GGC	2	6	603766	603771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_006396	ACG	2	6	603797	603802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_006396	CAC	2	6	603942	603947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_006396	CCT	2	6	603975	603980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_006396	TCG	2	6	603999	604004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_006396	CAC	2	6	604026	604031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_006396	ACC	2	6	604084	604089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_006396	CCG	2	6	604094	604099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_006396	TGG	2	6	604750	604755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_006396	GCG	2	6	604775	604780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_006396	AAAG	2	8	608572	608579	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_006396	GGC	2	6	608646	608651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_006396	TTA	2	6	609889	609894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_006396	GGC	2	6	609944	609949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_006396	GC	3	6	612798	612803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_006396	CGC	2	6	614297	614302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_006396	TTCG	2	8	614309	614316	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_006396	TGG	2	6	617392	617397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_006396	CGG	2	6	617430	617435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_006396	CCT	2	6	617917	617922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_006396	TGTTC	2	10	618247	618256	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1585	NC_006396	CGG	2	6	618321	618326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_006396	AGCC	2	8	619244	619251	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_006396	GAC	2	6	619257	619262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_006396	AGT	2	6	620061	620066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_006396	GC	4	8	620067	620074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_006396	CAC	2	6	622777	622782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_006396	CGG	2	6	622845	622850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_006396	GCC	2	6	622857	622862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_006396	CTG	2	6	622872	622877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_006396	TGG	2	6	623800	623805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_006396	TCC	2	6	623828	623833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_006396	CA	4	8	623839	623846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_006396	TTAG	2	8	625508	625515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_006396	GGCA	2	8	625566	625573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_006396	GCGG	2	8	626631	626638	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_006396	CG	3	6	629210	629215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_006396	T	7	7	629228	629234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_006396	CCG	2	6	629235	629240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_006396	CAG	2	6	630552	630557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_006396	AAAC	2	8	630626	630633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_006396	CA	3	6	630712	630717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_006396	GCG	2	6	630774	630779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_006396	CGAT	2	8	630862	630869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_006396	CTA	3	9	631512	631520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_006396	GCG	2	6	631541	631546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_006396	TGGAA	2	10	631570	631579	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_006396	CGG	2	6	631580	631585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_006396	ACC	2	6	635185	635190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_006396	ACA	2	6	638074	638079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_006396	ATC	2	6	638087	638092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_006396	GCA	2	6	638157	638162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_006396	CAG	2	6	638185	638190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_006396	AGCC	2	8	638246	638253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_006396	GTG	2	6	638273	638278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_006396	TCG	2	6	638291	638296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_006396	TG	3	6	638299	638304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_006396	GAT	2	6	638308	638313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_006396	CTCA	2	8	638631	638638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_006396	CA	3	6	638637	638642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_006396	CTT	2	6	638653	638658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_006396	TCG	2	6	638670	638675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_006396	GAC	2	6	639725	639730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_006396	TGC	2	6	639795	639800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_006396	CGC	2	6	639818	639823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_006396	AAG	2	6	639840	639845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_006396	ACCA	2	8	639862	639869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_006396	CGT	2	6	639871	639876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_006396	CAA	2	6	641696	641701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_006396	GAT	2	6	641785	641790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1635	NC_006396	GT	3	6	641814	641819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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