MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG700

Total Repeats: 1226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006395	GACT	2	8	143	150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006395	AGG	2	6	212	217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006395	ACC	2	6	223	228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_006395	TTAAG	2	10	245	254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006395	TAAA	2	8	283	290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006395	ACTT	2	8	300	307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006395	CCA	2	6	338	343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_006395	G	6	6	4520	4525	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006395	TCGAA	2	10	4537	4546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006395	TCC	2	6	4570	4575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_006395	AAC	2	6	4611	4616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006395	AAT	2	6	4626	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006395	ATA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006395	CTC	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_006395	TCG	2	6	6591	6596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006395	GAT	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006395	GCC	2	6	6716	6721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_006395	GAA	2	6	6723	6728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006395	TGA	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006395	GTCT	2	8	6824	6831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006395	AGG	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006395	CCG	2	6	6856	6861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_006395	AATC	2	8	6911	6918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006395	CGA	2	6	7003	7008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006395	GAC	2	6	7031	7036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006395	TCC	2	6	7064	7069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_006395	ACTG	2	8	7129	7136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006395	TC	3	6	7157	7162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006395	TGAAA	2	10	7169	7178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006395	AGC	2	6	7184	7189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006395	GT	3	6	7231	7236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006395	GGT	2	6	8258	8263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006395	CTA	2	6	8293	8298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006395	CTG	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006395	CGATAC	2	12	8427	8438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006395	TGA	2	6	8472	8477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006395	CAT	2	6	8491	8496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006395	AAG	2	6	8515	8520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006395	ACA	2	6	10179	10184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006395	T	6	6	10517	10522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006395	TCT	2	6	10599	10604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006395	GAA	2	6	10617	10622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006395	A	7	7	13179	13185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006395	CCG	2	6	13221	13226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_006395	GCC	2	6	13237	13242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_006395	CTC	2	6	13254	13259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_006395	AT	3	6	13359	13364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006395	AGCG	2	8	13377	13384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006395	TAA	2	6	14428	14433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006395	TAC	2	6	14445	14450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006395	GTC	2	6	14482	14487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006395	GTC	2	6	14532	14537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006395	TCAAT	2	10	14648	14657	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_006395	TGTC	2	8	15950	15957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006395	TCG	2	6	17000	17005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006395	CA	3	6	17017	17022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006395	GGC	2	6	17052	17057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006395	GTT	2	6	17188	17193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006395	GAT	2	6	17281	17286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006395	CGG	2	6	17389	17394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006395	GACA	2	8	17421	17428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006395	CGTCG	2	10	17457	17466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_006395	GTC	2	6	18837	18842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006395	CAT	2	6	18867	18872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006395	AACA	2	8	18981	18988	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_006395	GTA	2	6	18989	18994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006395	AGA	2	6	19082	19087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006395	CGA	2	6	20080	20085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006395	CCT	2	6	20131	20136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_006395	TTAC	2	8	20161	20168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_006395	GAG	2	6	20180	20185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006395	AC	3	6	20280	20285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006395	CTG	2	6	20391	20396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006395	TATT	2	8	20504	20511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006395	GTG	2	6	20584	20589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006395	CTGGT	2	10	20628	20637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_006395	GGT	2	6	22003	22008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006395	CTG	2	6	22032	22037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006395	CCTG	2	8	23650	23657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006395	CAT	3	9	26413	26421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006395	TCA	2	6	26447	26452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006395	TGA	2	6	26477	26482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006395	GCT	2	6	26503	26508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006395	TA	3	6	26527	26532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006395	ATG	2	6	26582	26587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006395	GAT	2	6	26600	26605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006395	AGC	2	6	26622	26627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006395	GTT	2	6	26642	26647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006395	GA	3	6	27227	27232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006395	ACTC	2	8	27249	27256	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_006395	TCG	2	6	27312	27317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006395	CTCGT	2	10	27365	27374	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_006395	TTGC	2	8	27428	27435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_006395	TTG	2	6	27501	27506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006395	GA	3	6	27580	27585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006395	CGCA	2	8	27593	27600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_006395	AAG	2	6	27633	27638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006395	GAT	2	6	27641	27646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006395	CGGT	2	8	27727	27734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_006395	TGC	2	6	27806	27811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006395	GTC	2	6	27812	27817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006395	AT	4	8	27899	27906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006395	TGA	2	6	27971	27976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006395	CTG	2	6	28052	28057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_006395	TG	3	6	28056	28061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006395	CAG	2	6	28091	28096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006395	CAGT	2	8	28126	28133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_006395	GGA	2	6	28139	28144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006395	GT	3	6	28242	28247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006395	GGC	2	6	28276	28281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006395	ATT	2	6	29173	29178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006395	ACAGA	2	10	29248	29257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_006395	GGC	2	6	29308	29313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006395	CGA	2	6	29441	29446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006395	ACG	2	6	29479	29484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006395	AAGG	2	8	29508	29515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006395	GTC	2	6	30562	30567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006395	GTC	2	6	30587	30592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006395	GCA	2	6	30596	30601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006395	GGGTC	2	10	30625	30634	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_006395	GGT	2	6	30638	30643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006395	AC	3	6	30683	30688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_006395	GAT	2	6	30849	30854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006395	TAT	2	6	30861	30866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006395	TCGC	2	8	34227	34234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_006395	ACG	2	6	34237	34242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006395	GCG	3	9	34248	34256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006395	GA	3	6	34281	34286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006395	CGT	2	6	35463	35468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006395	CGC	2	6	35478	35483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_006395	AC	3	6	35499	35504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_006395	ACCC	2	8	39745	39752	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_006395	CCA	2	6	39780	39785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_006395	GTT	2	6	40840	40845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006395	AAG	2	6	40850	40855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006395	ATA	2	6	40862	40867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006395	GGAA	2	8	40892	40899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006395	CAG	2	6	40903	40908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_006395	CGCGA	2	10	40929	40938	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_006395	TAT	2	6	40964	40969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006395	GA	3	6	41039	41044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006395	GA	3	6	41107	41112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006395	GTG	2	6	41176	41181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006395	ATC	2	6	42320	42325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_006395	GTTA	2	8	42387	42394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006395	GGT	2	6	42434	42439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006395	TAT	2	6	42477	42482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006395	CCGA	2	8	42546	42553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_006395	CA	3	6	46685	46690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_006395	GTC	2	6	46834	46839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_006395	CAG	3	9	46857	46865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_006395	GT	3	6	47356	47361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006395	TGT	2	6	47382	47387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_006395	TGT	2	6	47406	47411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_006395	GAG	2	6	47428	47433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_006395	GCA	2	6	47536	47541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_006395	CAG	2	6	47548	47553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_006395	GC	3	6	47597	47602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_006395	CGC	2	6	48908	48913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_006395	GCGG	2	8	48961	48968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
161	NC_006395	CCG	2	6	51320	51325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_006395	CGGC	2	8	52776	52783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_006395	TGTCTC	2	12	53717	53728	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_006395	GGGT	2	8	54164	54171	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
165	NC_006395	GCA	2	6	54261	54266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_006395	CGC	2	6	54807	54812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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168	NC_006395	CTG	2	6	54910	54915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_006395	CCGGT	2	10	54980	54989	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
170	NC_006395	AC	3	6	55408	55413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
171	NC_006395	GA	3	6	55439	55444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_006395	CTG	2	6	55467	55472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_006395	TCG	2	6	55499	55504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_006395	GCT	2	6	56458	56463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_006395	TAT	2	6	58784	58789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_006395	CGA	3	9	58882	58890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_006395	CGA	2	6	58986	58991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_006395	AGC	2	6	58992	58997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_006395	CCG	2	6	59033	59038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_006395	GT	3	6	60638	60643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_006395	GT	3	6	61387	61392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_006395	GTGCT	2	10	61511	61520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
188	NC_006395	AGTG	2	8	61521	61528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
189	NC_006395	GGC	2	6	61602	61607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_006395	GTG	2	6	61996	62001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_006395	GCG	2	6	62854	62859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_006395	AGT	2	6	63902	63907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_006395	GTTG	2	8	91854	91861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_006395	GA	3	6	92249	92254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
281	NC_006395	TCG	2	6	92264	92269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_006395	T	6	6	92286	92291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_006395	GAC	2	6	94190	94195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_006395	GTG	2	6	95501	95506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_006395	GAAC	2	8	95523	95530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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416	NC_006395	TGTGG	2	10	142931	142940	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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