MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 5803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002940	ATTT	2	8	246083	246090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_002940	ATAA	2	8	246096	246103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_002940	ATTTT	2	10	246233	246242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_002940	TATG	2	8	246250	246257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_002940	T	6	6	247293	247298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_002940	TAA	2	6	250204	250209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_002940	CTT	2	6	250228	250233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_002940	TAT	2	6	250240	250245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_002940	AATA	2	8	252585	252592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_002940	A	6	6	252610	252615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_002940	TCA	2	6	253199	253204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_002940	CATT	2	8	254448	254455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_002940	ATAAAA	2	12	254462	254473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_002940	ATA	2	6	254605	254610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_002940	TGG	2	6	254662	254667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_002940	CCT	2	6	254695	254700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_002940	TGAG	2	8	254724	254731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_002940	TCA	2	6	254751	254756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_002940	CTTT	2	8	254777	254784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_002940	GTG	2	6	254797	254802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_002940	CCT	2	6	254831	254836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_002940	ACA	2	6	254892	254897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_002940	GTG	2	6	254914	254919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_002940	CCT	2	6	254948	254953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_002940	T	7	7	255038	255044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_002940	T	6	6	255046	255051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_002940	TGT	2	6	255060	255065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_002940	T	7	7	255065	255071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_002940	CTTT	2	8	255082	255089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_002940	T	6	6	255087	255092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_002940	ATT	2	6	255137	255142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_002940	T	6	6	255141	255146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_002940	ACTG	2	8	256624	256631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_002940	GTC	2	6	256699	256704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_002940	CCA	2	6	256724	256729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_002940	AAT	2	6	256730	256735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_002940	GTA	2	6	256736	256741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002940	T	6	6	256774	256779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_002940	GAT	2	6	256790	256795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_002940	TAAA	2	8	256802	256809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_002940	A	6	6	256807	256812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_002940	T	6	6	257515	257520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_002940	ATT	2	6	257576	257581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_002940	T	6	6	257580	257585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_002940	A	6	6	257596	257601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_002940	TAT	2	6	258015	258020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_002940	TTAA	2	8	258474	258481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_002940	ATA	2	6	259141	259146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_002940	CAA	2	6	259173	259178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_002940	TTA	2	6	259182	259187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_002940	CTAA	2	8	259620	259627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_002940	TAA	2	6	261443	261448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_002940	A	6	6	261452	261457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_002940	TAA	3	9	261458	261466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_002940	TTG	2	6	261474	261479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_002940	AAT	2	6	261532	261537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_002940	T	6	6	261582	261587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_002940	TGG	2	6	261595	261600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_002940	A	6	6	265862	265867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_002940	AT	3	6	265902	265907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_002940	TAAAC	2	10	265911	265920	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1062	NC_002940	AAT	2	6	265996	266001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_002940	A	7	7	266009	266015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_002940	A	6	6	266281	266286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_002940	TTC	2	6	266334	266339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_002940	GTT	2	6	267482	267487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_002940	AT	3	6	267940	267945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_002940	CTTAA	2	10	267962	267971	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1069	NC_002940	CAT	2	6	267987	267992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_002940	GAT	2	6	268029	268034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_002940	TAAA	2	8	268088	268095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_002940	TTATTT	2	12	268098	268109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_002940	GTT	2	6	268137	268142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_002940	T	6	6	268148	268153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_002940	ATTT	2	8	268158	268165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_002940	GTA	2	6	268186	268191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_002940	TTTTA	2	10	268203	268212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_002940	TAT	2	6	268230	268235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_002940	TAA	2	6	268251	268256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_002940	ATA	2	6	272131	272136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_002940	TTAC	2	8	272167	272174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_002940	GCAA	2	8	272203	272210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_002940	A	6	6	272209	272214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_002940	GTT	2	6	272245	272250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_002940	TGG	2	6	272289	272294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_002940	T	6	6	272305	272310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_002940	GTT	2	6	273998	274003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_002940	ATT	2	6	274109	274114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_002940	T	6	6	275043	275048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_002940	ACT	2	6	275075	275080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_002940	TAT	2	6	275088	275093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_002940	AAT	2	6	275094	275099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_002940	AT	3	6	275144	275149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_002940	A	7	7	275160	275166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_002940	T	6	6	276540	276545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_002940	AATTA	2	10	277404	277413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_002940	TCA	2	6	277453	277458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_002940	ATCA	3	12	277455	277466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_002940	A	7	7	279070	279076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_002940	AAAT	2	8	279080	279087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_002940	TATT	2	8	279179	279186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002940	TTTTGC	2	12	279211	279222	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1103	NC_002940	GAA	2	6	279281	279286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_002940	ATT	3	9	279326	279334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_002940	A	6	6	279350	279355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_002940	CTG	2	6	279362	279367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_002940	GAT	2	6	279380	279385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_002940	TAGA	2	8	280125	280132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_002940	TAT	2	6	280159	280164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_002940	TTC	2	6	280168	280173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_002940	T	7	7	280898	280904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_002940	TTA	2	6	281191	281196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_002940	T	6	6	281205	281210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_002940	TGC	2	6	281221	281226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_002940	TA	3	6	282433	282438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_002940	ATGC	2	8	283454	283461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_002940	AG	3	6	283467	283472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_002940	A	7	7	283507	283513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_002940	TTATG	2	10	284007	284016	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_002940	AGT	2	6	284145	284150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_002940	TTCTCA	2	12	284154	284165	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_002940	CAT	2	6	284200	284205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_002940	ATTT	2	8	285554	285561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_002940	TAT	2	6	285654	285659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_002940	T	7	7	285659	285665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_002940	TTA	2	6	285695	285700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_002940	TATTT	2	10	288963	288972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_002940	CTG	2	6	288973	288978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_002940	ATT	2	6	288993	288998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_002940	TAA	2	6	290636	290641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_002940	CAT	2	6	290673	290678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_002940	ATG	2	6	290684	290689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_002940	AT	3	6	291819	291824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_002940	TTG	2	6	291864	291869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_002940	A	6	6	291931	291936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_002940	ATTC	2	8	291986	291993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_002940	TATT	2	8	292007	292014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_002940	ATC	2	6	292016	292021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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