MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 1789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002608	CCG	2	6	121392	121397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_002608	TCG	2	6	121420	121425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_002608	GCC	2	6	121495	121500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_002608	GTC	2	6	121501	121506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_002608	GCG	2	6	121537	121542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_002608	CCG	2	6	121546	121551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_002608	CCG	2	6	121576	121581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_002608	ACT	2	6	121683	121688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_002608	GAAGA	2	10	121781	121790	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
510	NC_002608	AAG	2	6	121855	121860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_002608	TTAG	2	8	122268	122275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_002608	GGC	2	6	122296	122301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_002608	GGAA	2	8	122320	122327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_002608	GAG	2	6	122329	122334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_002608	CCT	2	6	122357	122362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_002608	GGC	2	6	123668	123673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_002608	GTC	2	6	123738	123743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_002608	CGA	2	6	124876	124881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_002608	CAG	2	6	124918	124923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_002608	CGA	2	6	124981	124986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_002608	GC	3	6	125001	125006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_002608	CAA	2	6	125047	125052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_002608	GAC	2	6	125129	125134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_002608	GA	3	6	125198	125203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_002608	TCTGT	2	10	127849	127858	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_002608	GTC	2	6	127867	127872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_002608	GCTGTC	2	12	127906	127917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_002608	GGC	2	6	127918	127923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_002608	GCC	2	6	127929	127934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_002608	GGTG	2	8	127973	127980	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
531	NC_002608	GTC	2	6	127997	128002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_002608	TGG	2	6	128003	128008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_002608	CGG	2	6	128014	128019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_002608	CCA	3	9	128090	128098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_002608	CGCC	2	8	128106	128113	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
536	NC_002608	CGGCG	2	10	128115	128124	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
537	NC_002608	CAG	2	6	128168	128173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_002608	CAC	2	6	128177	128182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_002608	CAG	2	6	128189	128194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_002608	CGT	2	6	128213	128218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_002608	GTC	2	6	128220	128225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_002608	CTCGA	2	10	128253	128262	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
543	NC_002608	AGT	2	6	128278	128283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_002608	GCG	2	6	128325	128330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_002608	TCG	2	6	128355	128360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_002608	CCGT	2	8	128363	128370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
547	NC_002608	GTAC	2	8	128375	128382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
548	NC_002608	CTG	2	6	128480	128485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_002608	GAT	2	6	128504	128509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_002608	CTG	2	6	128643	128648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_002608	TTC	2	6	128697	128702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_002608	CG	3	6	128706	128711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_002608	GGT	2	6	128738	128743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_002608	GTC	2	6	128780	128785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_002608	TCA	2	6	128787	128792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_002608	GTA	2	6	128795	128800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_002608	CGA	2	6	128851	128856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_002608	GAA	2	6	128866	128871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_002608	GAT	2	6	128920	128925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_002608	CGG	2	6	128992	128997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_002608	CGA	2	6	129004	129009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_002608	GTT	2	6	129044	129049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_002608	GA	3	6	129059	129064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_002608	TGCT	2	8	129128	129135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_002608	AC	3	6	129145	129150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_002608	AGCA	2	8	129155	129162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_002608	CTAA	2	8	129169	129176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_002608	AAG	2	6	129230	129235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_002608	TGGG	2	8	129318	129325	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
570	NC_002608	AGA	2	6	129341	129346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_002608	TGT	2	6	130825	130830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_002608	ATCT	2	8	130831	130838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_002608	CTG	2	6	130842	130847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_002608	CGA	2	6	131936	131941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_002608	GAG	2	6	131973	131978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_002608	CGTCGA	2	12	132007	132018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_002608	CGA	2	6	132022	132027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_002608	ACG	2	6	132036	132041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_002608	TGA	3	9	132044	132052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_002608	CGA	2	6	132411	132416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_002608	GTGC	2	8	132457	132464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
582	NC_002608	CGT	2	6	132568	132573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_002608	GGA	2	6	132678	132683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_002608	GA	3	6	133242	133247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_002608	T	6	6	133260	133265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_002608	ACG	2	6	133311	133316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_002608	GTC	2	6	133323	133328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_002608	CCA	2	6	133414	133419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_002608	C	6	6	133428	133433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
590	NC_002608	TCTGT	2	10	133528	133537	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
591	NC_002608	GTC	2	6	133546	133551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_002608	GCTGTC	2	12	133585	133596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_002608	GGC	2	6	133597	133602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_002608	GCC	2	6	133608	133613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_002608	GGTG	2	8	133652	133659	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
596	NC_002608	GTC	2	6	133676	133681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_002608	TGG	2	6	133682	133687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_002608	CCA	3	9	133769	133777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_002608	CGCC	2	8	133785	133792	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
600	NC_002608	CGGCG	2	10	133794	133803	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
601	NC_002608	CAG	2	6	133847	133852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_002608	CAC	2	6	133856	133861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_002608	CAG	2	6	133868	133873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_002608	CGT	2	6	133892	133897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_002608	GTC	2	6	133899	133904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_002608	CTCGA	2	10	133932	133941	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
607	NC_002608	AGT	2	6	133957	133962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_002608	GCG	2	6	134004	134009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_002608	TCG	2	6	134034	134039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_002608	CCGT	2	8	134042	134049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
611	NC_002608	GTAC	2	8	134054	134061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_002608	CTG	2	6	134159	134164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_002608	GAT	2	6	134183	134188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_002608	CTG	2	6	134322	134327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_002608	TTC	2	6	134376	134381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_002608	CG	3	6	134385	134390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_002608	GGT	2	6	134417	134422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_002608	GTC	2	6	134459	134464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_002608	TCA	2	6	134466	134471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_002608	GTA	2	6	134474	134479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_002608	CGA	2	6	134530	134535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_002608	GAA	2	6	134545	134550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_002608	GAT	2	6	134599	134604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_002608	CGG	2	6	134671	134676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_002608	CGA	2	6	134683	134688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_002608	GTT	2	6	134723	134728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_002608	GA	3	6	134738	134743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_002608	TGCT	2	8	134807	134814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_002608	AC	3	6	134824	134829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_002608	AGCA	2	8	134834	134841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_002608	CTAA	2	8	134848	134855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_002608	TG	3	6	134890	134895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_002608	TCT	2	6	134960	134965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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635	NC_002608	CT	3	6	135090	135095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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902	NC_002608	TG	4	8	208775	208782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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907	NC_002608	CGG	2	6	210056	210061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
908	NC_002608	AGGG	2	8	210067	210074	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
909	NC_002608	G	6	6	210072	210077	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
910	NC_002608	CTCC	2	8	210079	210086	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
911	NC_002608	C	6	6	210085	210090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
912	NC_002608	G	6	6	210124	210129	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
913	NC_002608	AACC	2	8	210138	210145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
914	NC_002608	GCG	2	6	210369	210374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
915	NC_002608	GGT	2	6	210431	210436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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922	NC_002608	CGCT	2	8	212163	212170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
923	NC_002608	C	6	6	212173	212178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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930	NC_002608	CCAC	2	8	213059	213066	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
931	NC_002608	TGC	2	6	213122	213127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
932	NC_002608	GC	3	6	213126	213131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
933	NC_002608	ACC	2	6	214625	214630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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941	NC_002608	TCG	2	6	219434	219439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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944	NC_002608	GCC	2	6	219488	219493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
945	NC_002608	GCC	2	6	219503	219508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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