MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 5670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002607	GT	3	6	452434	452439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_002607	CGA	2	6	453517	453522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_002607	ACC	2	6	453539	453544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_002607	CAC	2	6	453573	453578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_002607	GA	3	6	453579	453584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_002607	GAG	2	6	453649	453654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_002607	C	6	6	453675	453680	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1508	NC_002607	GAT	2	6	453719	453724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_002607	AAC	2	6	453729	453734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_002607	ACG	3	9	453804	453812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_002607	AGC	2	6	453900	453905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_002607	CTAC	2	8	453910	453917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_002607	GCG	2	6	453985	453990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_002607	AC	3	6	454064	454069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_002607	GCC	2	6	454117	454122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_002607	CGC	2	6	454466	454471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_002607	CCG	2	6	455207	455212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_002607	GTGC	2	8	455269	455276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_002607	CGC	2	6	455314	455319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_002607	CAC	2	6	455368	455373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_002607	CGA	2	6	455425	455430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_002607	CCA	2	6	455434	455439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_002607	GC	4	8	455496	455503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_002607	GAG	2	6	455540	455545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_002607	CGC	2	6	455650	455655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_002607	GCG	2	6	455680	455685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_002607	CGCC	2	8	455686	455693	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1528	NC_002607	ACCG	2	8	455723	455730	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_002607	CCA	2	6	455742	455747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_002607	GACCG	2	10	455774	455783	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1531	NC_002607	CGA	2	6	455818	455823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_002607	TTCGAC	2	12	455825	455836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_002607	GCC	2	6	455856	455861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_002607	T	6	6	456051	456056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_002607	GCGG	2	8	456061	456068	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1539	NC_002607	CGC	3	9	458689	458697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1542	NC_002607	GCAC	2	8	459063	459070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_002607	GCCAC	2	10	459805	459814	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1544	NC_002607	CCGC	2	8	459826	459833	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1545	NC_002607	ATGA	2	8	459880	459887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_002607	CCGG	2	8	459915	459922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1551	NC_002607	CCG	2	6	460057	460062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_002607	GACG	2	8	460068	460075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_002607	CGG	2	6	460108	460113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_002607	TGA	2	6	460142	460147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_002607	CGT	2	6	460285	460290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_002607	GAC	2	6	460758	460763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_002607	CGC	2	6	460808	460813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_002607	CGC	2	6	461738	461743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_002607	ATC	2	6	462844	462849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1561	NC_002607	CGT	2	6	463799	463804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_002607	C	7	7	463890	463896	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1563	NC_002607	TTCC	2	8	463994	464001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1567	NC_002607	GGT	2	6	464163	464168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_002607	GTC	2	6	464185	464190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1570	NC_002607	C	6	6	464322	464327	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1571	NC_002607	TACA	2	8	464330	464337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_002607	GCA	2	6	464439	464444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_002607	GAC	2	6	464480	464485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_002607	TAGAT	2	10	465536	465545	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_002607	GGC	2	6	469355	469360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_002607	CGGT	2	8	469383	469390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1611	NC_002607	GAC	2	6	469652	469657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_002607	GAC	2	6	469664	469669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_002607	CCG	2	6	469721	469726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_002607	CG	3	6	469759	469764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_002607	CTGT	2	8	469790	469797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_002607	GCG	2	6	469821	469826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_002607	GC	3	6	469850	469855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_002607	TCG	2	6	469891	469896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1627	NC_002607	GGTGCG	2	12	476952	476963	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1628	NC_002607	GCT	2	6	476975	476980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_002607	CG	3	6	476981	476986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_002607	GCC	2	6	476987	476992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_002607	CGG	2	6	478428	478433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_002607	GAT	2	6	478435	478440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1634	NC_002607	ACG	2	6	478597	478602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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