MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 5670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002607	GCG	2	6	227022	227027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_002607	GGAC	2	8	228869	228876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_002607	GTC	2	6	228884	228889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_002607	TA	3	6	229040	229045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_002607	GGA	2	6	230603	230608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_002607	GT	3	6	231097	231102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_002607	GCGACG	2	12	231132	231143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_002607	GGC	2	6	232659	232664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_002607	AC	3	6	232964	232969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_002607	C	6	6	232989	232994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1011	NC_002607	TTATA	2	10	233010	233019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_002607	GGCC	2	8	233024	233031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_002607	CGC	2	6	233032	233037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_002607	ACG	2	6	233118	233123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_002607	ACG	2	6	233183	233188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_002607	TC	3	6	233198	233203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_002607	GGC	2	6	233206	233211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_002607	CCG	2	6	233223	233228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_002607	CGGT	2	8	233301	233308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_002607	CCG	2	6	233870	233875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_002607	GGCT	2	8	235642	235649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_002607	GC	3	6	235666	235671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_002607	CGCC	2	8	235675	235682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1024	NC_002607	GTC	2	6	237092	237097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_002607	CGGG	2	8	237125	237132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_002607	GTA	2	6	237738	237743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_002607	T	6	6	237819	237824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_002607	GCC	2	6	239995	240000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_002607	ACA	2	6	240535	240540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_002607	AGAT	2	8	246149	246156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_002607	CCAG	2	8	246191	246198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_002607	TGTC	2	8	246226	246233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_002607	CGA	2	6	246863	246868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_002607	GGCGC	2	10	246892	246901	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1035	NC_002607	C	6	6	247979	247984	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1036	NC_002607	ACA	2	6	248068	248073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_002607	GACA	2	8	248087	248094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_002607	GCG	2	6	248110	248115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_002607	TAT	3	9	248169	248177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_002607	CGC	2	6	248201	248206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_002607	CCA	2	6	248218	248223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_002607	CCGC	2	8	248234	248241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1043	NC_002607	AC	3	6	251002	251007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_002607	CG	3	6	251267	251272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_002607	CCG	2	6	255667	255672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_002607	GCC	2	6	255732	255737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_002607	TGCCG	2	10	257822	257831	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1048	NC_002607	ACC	2	6	257858	257863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_002607	CAG	2	6	258955	258960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_002607	CGG	2	6	260285	260290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_002607	TCC	2	6	264013	264018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_002607	CGC	2	6	264035	264040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_002607	CCAG	2	8	264055	264062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_002607	CGA	2	6	264076	264081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_002607	CCG	3	9	264082	264090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_002607	GC	3	6	264173	264178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_002607	CGGC	2	8	264202	264209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_002607	CGAG	2	8	264233	264240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_002607	CGCC	2	8	264946	264953	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1060	NC_002607	GCC	2	6	264955	264960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_002607	GGC	2	6	272482	272487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_002607	GTC	2	6	272839	272844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_002607	CGC	2	6	274399	274404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_002607	TCGC	2	8	274414	274421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_002607	CGC	3	9	274425	274433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_002607	GTG	2	6	274615	274620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_002607	CCCGCG	2	12	274624	274635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_002607	TCG	2	6	274645	274650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_002607	TC	3	6	274665	274670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_002607	GCCG	2	8	274698	274705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_002607	CGA	2	6	274706	274711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_002607	AGC	2	6	274768	274773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_002607	AC	3	6	274785	274790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_002607	TCGCT	2	10	274814	274823	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1075	NC_002607	CGA	2	6	274838	274843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_002607	CTG	2	6	274864	274869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_002607	CGAC	2	8	274882	274889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_002607	GC	3	6	275387	275392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_002607	GCC	2	6	277986	277991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1081	NC_002607	CGC	2	6	278046	278051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_002607	GT	3	6	278071	278076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_002607	GCG	2	6	278084	278089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_002607	GCC	2	6	278096	278101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1089	NC_002607	GGT	2	6	283740	283745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_002607	GT	3	6	284264	284269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_002607	GGCC	2	8	286081	286088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_002607	ACT	2	6	286090	286095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1095	NC_002607	TGG	2	6	288092	288097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_002607	GGGTCG	2	12	289275	289286	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1101	NC_002607	TCA	2	6	289419	289424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_002607	CTA	2	6	289504	289509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_002607	CA	3	6	291548	291553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_002607	CCA	2	6	291564	291569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_002607	GTG	2	6	291571	291576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1108	NC_002607	T	6	6	292630	292635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_002607	TGC	2	6	292645	292650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_002607	CCG	2	6	295066	295071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_002607	CGG	2	6	295084	295089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_002607	CGT	2	6	295090	295095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_002607	TGG	2	6	295099	295104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_002607	CTC	2	6	295112	295117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_002607	TG	4	8	295204	295211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_002607	GCC	2	6	295299	295304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_002607	A	6	6	296291	296296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_002607	TGC	2	6	296319	296324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_002607	CGA	2	6	296330	296335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_002607	CCG	2	6	297147	297152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_002607	CCA	2	6	300429	300434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_002607	AGC	2	6	300444	300449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_002607	CCA	2	6	303014	303019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_002607	GC	3	6	305198	305203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_002607	GTC	2	6	305227	305232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_002607	TC	3	6	305264	305269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_002607	AGT	2	6	305306	305311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_002607	GT	3	6	305338	305343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_002607	C	6	6	305347	305352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1130	NC_002607	TGCC	2	8	305354	305361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_002607	C	6	6	305363	305368	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1132	NC_002607	GCT	2	6	305415	305420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_002607	GCC	2	6	305852	305857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_002607	CG	3	6	307175	307180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1136	NC_002607	GGT	2	6	307212	307217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_002607	CCG	2	6	420961	420966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1409	NC_002607	ACC	2	6	421002	421007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1410	NC_002607	CGC	2	6	421062	421067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1411	NC_002607	GCCCC	2	10	421082	421091	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1412	NC_002607	GCC	2	6	421122	421127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1413	NC_002607	ACC	2	6	421155	421160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1414	NC_002607	AC	3	6	421177	421182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1415	NC_002607	CCA	2	6	421635	421640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1416	NC_002607	GCG	2	6	421696	421701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1418	NC_002607	CGC	2	6	421797	421802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1420	NC_002607	TCA	2	6	421846	421851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1429	NC_002607	CGG	2	6	428374	428379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1431	NC_002607	CGG	2	6	430192	430197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1432	NC_002607	ATCCC	2	10	430210	430219	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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1435	NC_002607	CCG	2	6	431018	431023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1438	NC_002607	CG	3	6	436232	436237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1439	NC_002607	ACC	2	6	436266	436271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1441	NC_002607	GCC	2	6	436340	436345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1442	NC_002607	GAC	2	6	436346	436351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_002607	CGC	2	6	436385	436390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1445	NC_002607	CGGCGA	2	12	436402	436413	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1448	NC_002607	CGG	2	6	439574	439579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1449	NC_002607	GGC	2	6	439599	439604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1450	NC_002607	GTC	2	6	439614	439619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_002607	GACCG	2	10	439711	439720	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1453	NC_002607	CG	3	6	439727	439732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1454	NC_002607	CCG	2	6	440961	440966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1455	NC_002607	CGC	2	6	440977	440982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1457	NC_002607	CAC	3	9	441035	441043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1460	NC_002607	ACGGCG	2	12	441136	441147	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1462	NC_002607	CACCGA	2	12	441215	441226	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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1464	NC_002607	GC	3	6	441234	441239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1487	NC_002607	GTC	2	6	444231	444236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1489	NC_002607	ACC	2	6	444267	444272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1498	NC_002607	CCG	2	6	450451	450456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1499	NC_002607	CGG	2	6	451615	451620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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