MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 1119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001869	GTG	2	6	37	42	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001869	GTTAC	2	10	59	68	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_001869	ACC	2	6	71	76	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_001869	GCGA	2	8	102	109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_001869	CGA	2	6	208	213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_001869	AAC	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_001869	G	7	7	324	330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001869	TTC	2	6	1238	1243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_001869	TC	3	6	1278	1283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_001869	AT	3	6	1760	1765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001869	GAAA	2	8	1770	1777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001869	CG	3	6	3732	3737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_001869	CGT	2	6	3749	3754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_001869	TTC	2	6	3820	3825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_001869	GCGG	2	8	3856	3863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_001869	ACT	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_001869	TCC	2	6	4047	4052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_001869	AAG	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001869	TCG	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_001869	CTGACG	2	12	5447	5458	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_001869	ACTA	2	8	8693	8700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_001869	AGTAA	2	10	8723	8732	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001869	CAT	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_001869	TGG	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001869	GAA	2	6	8973	8978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001869	CTT	2	6	9026	9031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_001869	CGCTG	2	10	9064	9073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_001869	AAATG	2	10	9076	9085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001869	TCA	2	6	9089	9094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_001869	AC	3	6	9121	9126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_001869	TCC	2	6	12464	12469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_001869	GAC	2	6	12528	12533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_001869	CGT	2	6	12563	12568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_001869	GAT	2	6	12585	12590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001869	CCGTGA	2	12	12608	12619	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_001869	CGG	2	6	12714	12719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_001869	TGT	2	6	12723	12728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001869	TGG	2	6	12731	12736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001869	CGA	2	6	12755	12760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_001869	GCTGTC	2	12	12772	12783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_001869	GGC	3	9	12784	12792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_001869	GCC	2	6	12794	12799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_001869	GTC	2	6	12862	12867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_001869	CGGT	2	8	12871	12878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_001869	TGA	2	6	12936	12941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001869	C	6	6	12973	12978	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_001869	CGG	2	6	12980	12985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_001869	AAC	2	6	13031	13036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_001869	CAC	2	6	13042	13047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_001869	CAG	2	6	13054	13059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_001869	GTC	2	6	13085	13090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_001869	AG	3	6	13105	13110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001869	GCG	2	6	13190	13195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_001869	TCG	2	6	13220	13225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_001869	CCGT	2	8	13228	13235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_001869	GTAC	2	8	13240	13247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_001869	CTTG	2	8	13344	13351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_001869	TG	3	6	13395	13400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001869	AGC	2	6	13406	13411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_001869	AAGA	2	8	13444	13451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001869	CTG	2	6	13508	13513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_001869	TTC	2	6	13562	13567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_001869	CG	3	6	13571	13576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_001869	GTT	2	6	13604	13609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001869	CGCTT	2	10	13613	13622	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_001869	GTGA	2	8	13623	13630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001869	GTA	2	6	13660	13665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001869	CTG	2	6	13699	13704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_001869	G	6	6	13809	13814	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001869	CGA	2	6	13869	13874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_001869	AAG	2	6	13963	13968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001869	TGCT	2	8	13993	14000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_001869	AC	3	6	14010	14015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_001869	AGCA	2	8	14020	14027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_001869	CA	4	8	14075	14082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_001869	CGT	2	6	14093	14098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_001869	TCG	2	6	14176	14181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_001869	GCG	2	6	14229	14234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_001869	GGAA	2	8	14254	14261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001869	CTC	2	6	14292	14297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_001869	GAGC	2	8	15609	15616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_001869	CCT	2	6	15655	15660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_001869	CGA	2	6	15710	15715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_001869	TC	3	6	22288	22293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_001869	TAG	2	6	22322	22327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001869	TTC	2	6	22336	22341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_001869	AAG	2	6	22357	22362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001869	AC	3	6	22791	22796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_001869	ACG	2	6	26182	26187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_001869	CCT	2	6	26521	26526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_001869	ATC	2	6	26534	26539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_001869	AGT	2	6	29442	29447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001869	CGAG	2	8	29448	29455	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_001869	CCA	2	6	29550	29555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_001869	TACA	2	8	29570	29577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_001869	CTG	2	6	29582	29587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_001869	GGAC	2	8	29598	29605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_001869	CGT	2	6	29771	29776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_001869	CTC	2	6	29823	29828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_001869	CAT	2	6	29896	29901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_001869	ATG	2	6	30013	30018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001869	TCAC	2	8	30505	30512	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_001869	GC	3	6	30514	30519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_001869	GAG	2	6	31907	31912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001869	TTCC	2	8	31943	31950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_001869	GCC	2	6	31968	31973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_001869	TTAG	2	8	32062	32069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001869	TGCT	2	8	32076	32083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_001869	GT	3	6	32088	32093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001869	AGCA	2	8	32103	32110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_001869	TC	3	6	32174	32179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_001869	CAA	2	6	32188	32193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_001869	TCG	2	6	32229	32234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_001869	CCG	2	6	32241	32246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_001869	ATC	2	6	32313	32318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_001869	CTT	2	6	32366	32371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_001869	TCG	2	6	32382	32387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_001869	CTA	2	6	32437	32442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_001869	TGA	2	6	32446	32451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001869	GAC	2	6	32453	32458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_001869	ACC	2	6	32495	32500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_001869	CG	3	6	32527	32532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_001869	GAA	2	6	32536	32541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001869	CAG	2	6	32590	32595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_001869	ATC	2	6	32729	32734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_001869	CAG	2	6	32753	32758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_001869	GTAC	2	8	32856	32863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_001869	ACGG	2	8	32868	32875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_001869	ACG	2	6	32877	32882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_001869	CGC	2	6	32908	32913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_001869	ACT	2	6	32955	32960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_001869	TCGAG	2	10	32976	32985	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_001869	CGA	2	6	33012	33017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_001869	ACG	2	6	33020	33025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_001869	CTG	2	6	33044	33049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_001869	CGT	2	6	33052	33057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_001869	CTG	2	6	33065	33070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_001869	CGC	2	6	33114	33119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_001869	GGCG	2	8	33125	33132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_001869	TGG	3	9	33140	33148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001869	CCA	2	6	33230	33235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_001869	GAC	2	6	33236	33241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_001869	CACC	2	8	33258	33265	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_001869	CGG	2	6	33303	33308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_001869	GCC	2	6	33315	33320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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148	NC_001869	CAC	2	6	33373	33378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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150	NC_001869	GTCCG	2	10	34335	34344	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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153	NC_001869	CCG	2	6	34521	34526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_001869	GCG	2	6	35520	35525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_001869	TGG	2	6	35709	35714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_001869	TCG	2	6	35766	35771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_001869	GT	3	6	35802	35807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_001869	GTT	2	6	35828	35833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_001869	TGG	2	6	38237	38242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_001869	TG	3	6	38535	38540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NC_001869	TGC	2	6	38567	38572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_001869	AT	3	6	38611	38616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_001869	TTAG	2	8	58511	58518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
284	NC_001869	GGC	2	6	58539	58544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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428	NC_001869	CGT	2	6	82990	82995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_001869	TTG	2	6	83003	83008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_001869	G	6	6	83063	83068	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
431	NC_001869	TCA	2	6	83100	83105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_001869	GAC	2	6	83174	83179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_001869	GGT	2	6	83487	83492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_001869	ATT	2	6	89593	89598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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