MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 3609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000921	TAA	2	6	199641	199646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_000921	ATT	2	6	199667	199672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_000921	TAA	2	6	199674	199679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_000921	CAA	2	6	200891	200896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_000921	TTAA	2	8	201342	201349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_000921	CAA	2	6	201924	201929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_000921	ATT	2	6	204331	204336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_000921	ATT	2	6	204350	204355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_000921	AAT	2	6	204372	204377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_000921	T	7	7	204395	204401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_000921	CTA	2	6	204446	204451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_000921	T	6	6	204480	204485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_000921	TAA	2	6	204537	204542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_000921	T	6	6	204545	204550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_000921	TA	3	6	204554	204559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_000921	ATA	2	6	204578	204583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_000921	TA	3	6	204606	204611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_000921	CTT	2	6	204614	204619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_000921	TAT	2	6	204645	204650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_000921	T	6	6	204650	204655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_000921	TAG	2	6	204687	204692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_000921	CAAC	2	8	204718	204725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_000921	T	6	6	204758	204763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_000921	T	7	7	204770	204776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_000921	C	6	6	204860	204865	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
526	NC_000921	C	6	6	204874	204879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
527	NC_000921	ATA	2	6	204887	204892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_000921	AAG	2	6	204902	204907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_000921	AAAC	2	8	204920	204927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_000921	A	6	6	204939	204944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_000921	AAT	2	6	205398	205403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_000921	TAT	2	6	205417	205422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_000921	T	6	6	205442	205447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_000921	TTG	2	6	205454	205459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_000921	ATTTA	2	10	208530	208539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_000921	AAACA	2	10	208552	208561	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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538	NC_000921	T	15	15	211018	211032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_000921	GTTT	2	8	211050	211057	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_000921	T	6	6	212480	212485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_000921	GC	3	6	212509	212514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_000921	TTA	2	6	212539	212544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_000921	A	6	6	214426	214431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_000921	CTT	2	6	214516	214521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_000921	AT	3	6	215375	215380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_000921	TTA	2	6	215384	215389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_000921	A	7	7	215389	215395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_000921	TTATAA	2	12	215405	215416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_000921	GTTT	2	8	215568	215575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_000921	TTGA	2	8	215583	215590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_000921	GAA	2	6	215655	215660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_000921	CAA	2	6	215718	215723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_000921	A	6	6	215765	215770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_000921	AAAAAC	2	12	215782	215793	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
555	NC_000921	ATTTT	2	10	218879	218888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_000921	A	6	6	218906	218911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_000921	A	6	6	220611	220616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_000921	TAA	2	6	222527	222532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_000921	TTTG	2	8	222536	222543	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_000921	ATCA	2	8	223734	223741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_000921	ACAA	2	8	223789	223796	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_000921	AAT	2	6	224437	224442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_000921	TATT	2	8	224464	224471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_000921	GAGC	2	8	227328	227335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_000921	TAA	2	6	227338	227343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_000921	GAT	3	9	227434	227442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_000921	TG	3	6	227767	227772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_000921	A	6	6	227778	227783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_000921	GA	3	6	227784	227789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_000921	AAC	2	6	229165	229170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_000921	T	6	6	229214	229219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_000921	ATTAAA	2	12	229239	229250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_000921	TGA	2	6	230348	230353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_000921	G	6	6	230371	230376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
575	NC_000921	G	6	6	230384	230389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
576	NC_000921	ATTT	2	8	230447	230454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_000921	CT	3	6	230478	230483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_000921	T	6	6	230536	230541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_000921	A	6	6	230542	230547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_000921	G	6	6	230611	230616	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
581	NC_000921	TC	3	6	230631	230636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_000921	A	7	7	230717	230723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_000921	ATTT	2	8	230732	230739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_000921	ATT	2	6	231603	231608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_000921	A	6	6	231617	231622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_000921	A	6	6	231637	231642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_000921	AAAC	2	8	231770	231777	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_000921	T	6	6	231782	231787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_000921	TTA	2	6	233901	233906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_000921	TTG	2	6	233912	233917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_000921	CTTAA	2	10	233981	233990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
592	NC_000921	A	13	13	234004	234016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_000921	T	6	6	234029	234034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_000921	AAGA	2	8	234130	234137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
595	NC_000921	TTTTA	2	10	235303	235312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_000921	A	6	6	235312	235317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_000921	GCC	2	6	235379	235384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_000921	CAAAAA	2	12	235418	235429	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
599	NC_000921	GT	3	6	235439	235444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_000921	T	6	6	235444	235449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_000921	TAT	2	6	235472	235477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_000921	TTTA	2	8	237046	237053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_000921	ATT	2	6	237080	237085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_000921	TAA	2	6	237093	237098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_000921	T	8	8	237126	237133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_000921	A	7	7	237140	237146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_000921	TAT	2	6	237957	237962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_000921	A	6	6	241257	241262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_000921	TGA	2	6	241278	241283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_000921	A	6	6	241291	241296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_000921	AGG	2	6	241341	241346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_000921	T	6	6	241414	241419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_000921	A	6	6	241420	241425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_000921	A	6	6	241449	241454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_000921	ACA	2	6	241505	241510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_000921	TTTTA	2	10	241717	241726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_000921	CTAAC	2	10	241758	241767	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
618	NC_000921	TAT	2	6	241777	241782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_000921	AACA	2	8	241794	241801	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_000921	A	6	6	241827	241832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_000921	A	6	6	241877	241882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_000921	G	6	6	241889	241894	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
623	NC_000921	GAT	3	9	241955	241963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_000921	GATT	2	8	241972	241979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_000921	CTT	2	6	243061	243066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_000921	T	6	6	243102	243107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_000921	A	7	7	243115	243121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_000921	TCCC	2	8	244457	244464	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
629	NC_000921	CTT	2	6	249161	249166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_000921	TTG	2	6	249168	249173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_000921	T	7	7	249620	249626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_000921	A	7	7	249693	249699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_000921	T	7	7	249700	249706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_000921	T	6	6	249792	249797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_000921	ATTT	2	8	252315	252322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_000921	CAT	2	6	252327	252332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_000921	ATTTTA	2	12	252421	252432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_000921	AAATTA	2	12	252456	252467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_000921	TGA	2	6	258291	258296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_000921	TAAT	2	8	258316	258323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_000921	TAA	2	6	258379	258384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_000921	TGG	2	6	258389	258394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_000921	AG	3	6	258567	258572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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