MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 3609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000921	CAT	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_000921	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000921	T	6	6	2452	2457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000921	GGT	2	6	4123	4128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000921	TAT	2	6	4171	4176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000921	TGG	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000921	TGG	2	6	4341	4346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000921	GTG	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000921	ACC	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_000921	GGT	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000921	T	8	8	4639	4646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000921	AAC	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_000921	TAA	2	6	4845	4850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000921	TTA	2	6	4854	4859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000921	T	6	6	4871	4876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000921	A	6	6	4881	4886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000921	A	6	6	4897	4902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000921	TGT	2	6	4936	4941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000921	ATT	2	6	4946	4951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000921	TTTA	2	8	4962	4969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000921	T	6	6	5005	5010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000921	AAG	2	6	5050	5055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000921	T	6	6	5059	5064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000921	C	8	8	5143	5150	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_000921	A	7	7	5151	5157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000921	CAAAA	2	10	5286	5295	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_000921	C	7	7	5296	5302	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_000921	A	9	9	5303	5311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000921	AAAG	2	8	5321	5328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000921	CAAAA	2	10	5348	5357	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_000921	A	8	8	5364	5371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000921	A	6	6	5378	5383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000921	A	8	8	5386	5393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000921	AAATT	2	10	7456	7465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000921	TAAG	2	8	7488	7495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000921	T	14	14	7527	7540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000921	T	6	6	7571	7576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000921	TTTG	2	8	7582	7589	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000921	GGT	2	6	7590	7595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000921	TTTG	2	8	7660	7667	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000921	GAT	2	6	7741	7746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000921	TAA	3	9	9409	9417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000921	ATAA	2	8	9800	9807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000921	TTA	2	6	9830	9835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000921	ATTATA	2	12	9894	9905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000921	ATT	2	6	9909	9914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000921	CAA	2	6	9978	9983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_000921	TATT	2	8	10000	10007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000921	GAA	2	6	10051	10056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000921	AGG	2	6	12874	12879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000921	T	6	6	13719	13724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000921	GCTTT	2	10	13732	13741	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_000921	T	6	6	13739	13744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000921	ACC	2	6	13764	13769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_000921	T	7	7	13802	13808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000921	TTAA	2	8	13831	13838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000921	CA	3	6	16823	16828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_000921	CTG	2	6	16844	16849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_000921	A	7	7	16987	16993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000921	C	6	6	18426	18431	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_000921	AAACAC	2	12	18467	18478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_000921	T	6	6	20732	20737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000921	T	6	6	20746	20751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000921	ATCA	2	8	22936	22943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_000921	T	6	6	23003	23008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000921	GGT	2	6	23011	23016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000921	TGT	2	6	23043	23048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000921	TCA	2	6	23055	23060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_000921	AAAG	2	8	23114	23121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000921	TAT	2	6	23144	23149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000921	TTA	2	6	23205	23210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000921	GGT	2	6	23255	23260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000921	TTTA	2	8	23324	23331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000921	A	6	6	23338	23343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000921	T	6	6	23356	23361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000921	A	6	6	23381	23386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000921	TGG	2	6	23394	23399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000921	A	6	6	23400	23405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000921	A	6	6	23408	23413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000921	A	6	6	23468	23473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000921	A	6	6	23486	23491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000921	A	6	6	23502	23507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000921	CTTTA	2	10	25619	25628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_000921	GT	3	6	25667	25672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000921	TAAG	2	8	25676	25683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000921	A	14	14	25759	25772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000921	GTT	2	6	25833	25838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000921	A	6	6	25856	25861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000921	T	7	7	25867	25873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000921	GTTTG	2	10	25884	25893	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000921	TTTG	2	8	25905	25912	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000921	TAA	2	6	25913	25918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000921	GTT	2	6	25940	25945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000921	A	6	6	25964	25969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000921	T	6	6	25974	25979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000921	GTTTG	2	10	25990	25999	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000921	T	6	6	26012	26017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000921	TGT	2	6	26027	26032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000921	TGT	2	6	26039	26044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000921	T	7	7	26106	26112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000921	A	7	7	26113	26119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000921	ATT	2	6	26157	26162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000921	A	6	6	26163	26168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000921	ATC	2	6	26277	26282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_000921	TTA	2	6	26289	26294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000921	AGCCT	2	10	26301	26310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_000921	A	6	6	27643	27648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000921	T	7	7	27677	27683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000921	A	7	7	27721	27727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000921	TA	3	6	27741	27746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000921	GGTT	2	8	32100	32107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000921	T	8	8	37764	37771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000921	TTA	2	6	37773	37778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000921	TGT	2	6	37788	37793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000921	A	7	7	37823	37829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000921	TAA	2	6	40747	40752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000921	A	6	6	40757	40762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000921	AG	3	6	40767	40772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000921	TAA	2	6	42212	42217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000921	CAAA	2	8	44406	44413	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_000921	ACC	2	6	44553	44558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_000921	GCTT	2	8	44559	44566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_000921	CTGT	2	8	44675	44682	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_000921	GAT	2	6	44690	44695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000921	TA	3	6	44778	44783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000921	TTA	2	6	44815	44820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000921	GATT	2	8	44861	44868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000921	AAT	2	6	44878	44883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000921	ATG	2	6	44908	44913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000921	CACTAC	2	12	44978	44989	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_000921	A	6	6	44997	45002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000921	T	7	7	45042	45048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000921	CT	3	6	45070	45075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_000921	TC	3	6	45088	45093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_000921	TAG	2	6	45108	45113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000921	ACTTAG	2	12	45114	45125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_000921	A	7	7	45140	45146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000921	T	8	8	50732	50739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000921	CTA	2	6	50792	50797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_000921	TCA	2	6	50833	50838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_000921	CAT	2	6	50879	50884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_000921	CAT	2	6	51004	51009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_000921	T	6	6	51061	51066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000921	A	6	6	51077	51082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000921	AAG	2	6	53058	53063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000921	TTGA	2	8	53069	53076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000921	GTT	2	6	53084	53089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000921	GAC	2	6	53115	53120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_000921	CAA	2	6	53143	53148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_000921	AAT	2	6	53198	53203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000921	T	6	6	53213	53218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000921	TTTA	2	8	58488	58495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_000921	C	13	13	106944	106956	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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299	NC_000921	ATA	2	6	107076	107081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_000921	TAA	2	6	111573	111578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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