MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 6878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	A	6	6	1033	1038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000907	T	6	6	1058	1063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000907	AATTT	2	10	1073	1082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000907	AAT	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000907	CAAT	2	8	1126	1133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_000907	TTC	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_000907	CTTT	2	8	3037	3044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_000907	AAT	2	6	4435	4440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000907	TC	3	6	4559	4564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_000907	TTA	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000907	ATT	2	6	5432	5437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000907	TTG	2	6	5466	5471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000907	A	6	6	5505	5510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000907	GAT	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000907	TA	3	6	5555	5560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000907	AG	3	6	5563	5568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000907	TAT	2	6	5569	5574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000907	CTA	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_000907	CTAT	2	8	5619	5626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_000907	CAA	2	6	5634	5639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_000907	TTG	3	9	5641	5649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000907	AAG	2	6	5673	5678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000907	TTC	2	6	5683	5688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_000907	AGG	2	6	5700	5705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000907	ATT	2	6	5778	5783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000907	CG	3	6	5785	5790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_000907	TGT	2	6	5837	5842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000907	TA	3	6	5843	5848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000907	AGC	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_000907	ATC	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000907	CAGT	2	8	5939	5946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_000907	GTG	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000907	TTG	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000907	TTA	2	6	6208	6213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000907	CAT	2	6	6302	6307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_000907	ATC	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_000907	GAA	2	6	6426	6431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000907	ATC	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_000907	GTTCTG	2	12	6509	6520	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_000907	AAAC	2	8	6560	6567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_000907	CAT	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_000907	TGA	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000907	GAA	2	6	6664	6669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000907	TGA	2	6	6708	6713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000907	ACA	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_000907	CTT	2	6	6840	6845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_000907	GAA	2	6	6856	6861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000907	TAT	2	6	7171	7176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000907	ATG	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000907	TGA	2	6	7310	7315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000907	AAATAA	2	12	7374	7385	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000907	ATC	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_000907	AAT	2	6	7480	7485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000907	ACT	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_000907	AGA	3	9	7542	7550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000907	TTCT	2	8	7637	7644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_000907	GAA	2	6	7654	7659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000907	A	6	6	7675	7680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000907	TGA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000907	ACA	3	9	7873	7881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_000907	CCG	2	6	8004	8009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_000907	CAT	2	6	8027	8032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_000907	AACTGG	2	12	8092	8103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_000907	ACC	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_000907	GTA	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000907	AGA	2	6	8310	8315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000907	CAA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_000907	ATC	2	6	8416	8421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_000907	CACAAC	2	12	8423	8434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_000907	TCG	2	6	8508	8513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_000907	GAAAAA	2	12	10409	10420	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000907	TAT	2	6	10447	10452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000907	GA	3	6	10459	10464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000907	ATT	2	6	11403	11408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000907	TTA	2	6	12308	12313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000907	A	7	7	13364	13370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000907	AAT	2	6	13381	13386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000907	TAT	2	6	13396	13401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000907	AAAAC	2	10	17984	17993	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_000907	T	6	6	18015	18020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000907	CCT	2	6	18424	18429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_000907	ATA	3	9	18443	18451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000907	ATT	2	6	18491	18496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000907	TATT	2	8	18500	18507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000907	T	7	7	18525	18531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000907	AATT	2	8	18532	18539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000907	TAAA	2	8	18577	18584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000907	AAT	2	6	18594	18599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000907	TGAA	2	8	18623	18630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000907	TTA	2	6	18657	18662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000907	AT	3	6	19339	19344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000907	A	6	6	19349	19354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000907	TC	3	6	19369	19374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_000907	AAT	2	6	20856	20861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000907	TAAA	2	8	20866	20873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000907	A	7	7	20977	20983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000907	TTAAA	2	10	21139	21148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000907	AT	3	6	21179	21184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000907	ACT	2	6	21194	21199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_000907	CTA	2	6	21204	21209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_000907	A	6	6	21235	21240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000907	TGT	3	9	23989	23997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000907	A	7	7	24072	24078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000907	TGC	2	6	24079	24084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_000907	AAAT	2	8	24110	24117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000907	CTT	3	9	26643	26651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_000907	TTCC	2	8	26949	26956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_000907	TGA	2	6	26963	26968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000907	A	6	6	27998	28003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000907	GAA	2	6	28004	28009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000907	AACAT	2	10	28010	28019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_000907	TAG	2	6	28031	28036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000907	TAT	2	6	28045	28050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000907	AAT	2	6	28139	28144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000907	GCAA	2	8	28200	28207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_000907	TAAA	2	8	29212	29219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000907	TTTC	2	8	30174	30181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_000907	ATAAA	2	10	30188	30197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000907	GT	3	6	31412	31417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000907	TTCT	2	8	32313	32320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_000907	AAGA	2	8	32323	32330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000907	A	6	6	32330	32335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000907	T	6	6	35919	35924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000907	A	6	6	36320	36325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000907	ATT	2	6	36366	36371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000907	GTT	2	6	38078	38083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000907	T	6	6	38082	38087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000907	A	6	6	38107	38112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000907	T	6	6	38129	38134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000907	A	6	6	40024	40029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000907	T	7	7	40047	40053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000907	T	6	6	40070	40075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000907	CAAA	2	8	40109	40116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_000907	T	6	6	41253	41258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000907	CAA	2	6	41263	41268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_000907	GA	3	6	42828	42833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000907	CT	4	8	42837	42844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_000907	T	6	6	42844	42849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000907	TAT	2	6	44495	44500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000907	A	6	6	46260	46265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000907	ATCA	2	8	46301	46308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_000907	ATAA	2	8	46988	46995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000907	TCT	2	6	47000	47005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_000907	A	6	6	47026	47031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000907	AATT	2	8	47049	47056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000907	TCA	2	6	47057	47062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_000907	ATC	3	9	47076	47084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_000907	ATC	2	6	47094	47099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_000907	TAC	2	6	47133	47138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_000907	ATCA	2	8	47143	47150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_000907	GGA	2	6	47152	47157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000907	CCT	2	6	47209	47214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_000907	TCC	2	6	47232	47237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_000907	TAT	2	6	47926	47931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_000907	AAG	2	6	47940	47945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_000907	A	6	6	48285	48290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_000907	AAAT	2	8	48326	48333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_000907	TAA	2	6	50805	50810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_000907	ATA	2	6	52070	52075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_000907	TTA	2	6	52621	52626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_000907	TATGA	2	10	54723	54732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_000907	A	6	6	54799	54804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_000907	TAA	2	6	55587	55592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_000907	A	6	6	56810	56815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_000907	ATT	2	6	56817	56822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_000907	AAAT	2	8	65657	65664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_000907	ACAA	2	8	65690	65697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_000907	TTCA	2	8	68414	68421	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
186	NC_000907	TTC	2	6	72105	72110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_000907	TA	3	6	80507	80512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_000907	T	6	6	82674	82679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_000907	TCT	2	6	82750	82755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_000907	TGCG	2	8	105347	105354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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283	NC_000907	A	6	6	108021	108026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_000907	GTT	2	6	108491	108496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_000907	A	6	6	108598	108603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_000907	CTT	2	6	128299	128304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_000907	C	6	6	128334	128339	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
437	NC_000907	CTG	2	6	128358	128363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_000907	GCC	2	6	128672	128677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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450	NC_000907	AT	3	6	128865	128870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_000907	AAGAT	2	10	128980	128989	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_000907	GTT	2	6	129073	129078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_000907	CGT	2	6	129175	129180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_000907	TAA	2	6	129204	129209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_000907	TA	3	6	129317	129322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_000907	TTC	2	6	129415	129420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_000907	TAT	2	6	129453	129458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_000907	A	6	6	129462	129467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_000907	AAT	2	6	129873	129878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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