MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 30317

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022130	CAT	2	6	849549	849554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531364
16002	NC_022130	CAC	2	6	849574	849579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531364
16003	NC_022130	AGGT	2	8	849632	849639	25 %	25 %	50 %	0 %	532531364
16004	NC_022130	A	6	6	849649	849654	100 %	0 %	0 %	0 %	532531364
16005	NC_022130	GCT	2	6	849661	849666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531364
16006	NC_022130	ATTG	2	8	849787	849794	25 %	50 %	25 %	0 %	532531364
16007	NC_022130	ACC	2	6	849875	849880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531364
16008	NC_022130	TTG	2	6	849943	849948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531364
16009	NC_022130	T	6	6	850071	850076	0 %	100 %	0 %	0 %	532531364
16010	NC_022130	A	6	6	850111	850116	100 %	0 %	0 %	0 %	532531364
16011	NC_022130	A	6	6	850133	850138	100 %	0 %	0 %	0 %	532531364
16012	NC_022130	CGCCT	2	10	850273	850282	0 %	20 %	20 %	60 %	532531364
16013	NC_022130	TTGT	2	8	850366	850373	0 %	75 %	25 %	0 %	532531364
16014	NC_022130	TCA	2	6	850374	850379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531364
16015	NC_022130	T	7	7	850406	850412	0 %	100 %	0 %	0 %	532531364
16016	NC_022130	GGTT	2	8	850418	850425	0 %	50 %	50 %	0 %	532531364
16017	NC_022130	TTG	2	6	850436	850441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531364
16018	NC_022130	TCT	2	6	850446	850451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531364
16019	NC_022130	GAA	2	6	850494	850499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531364
16020	NC_022130	T	6	6	850612	850617	0 %	100 %	0 %	0 %	532531364
16021	NC_022130	CAAG	2	8	850618	850625	50 %	0 %	25 %	25 %	532531364
16022	NC_022130	AG	3	6	850637	850642	50 %	0 %	50 %	0 %	532531365
16023	NC_022130	T	6	6	850700	850705	0 %	100 %	0 %	0 %	532531365
16024	NC_022130	GCTC	3	12	850726	850737	0 %	25 %	25 %	50 %	532531365
16025	NC_022130	CTT	2	6	850774	850779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531365
16026	NC_022130	GTTT	2	8	850783	850790	0 %	75 %	25 %	0 %	532531365
16027	NC_022130	TAT	2	6	850801	850806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531365
16028	NC_022130	CT	3	6	850812	850817	0 %	50 %	0 %	50 %	532531365
16029	NC_022130	CCA	2	6	850909	850914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531365
16030	NC_022130	TCTAA	2	10	850956	850965	40 %	40 %	0 %	20 %	532531365
16031	NC_022130	TGC	2	6	851055	851060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531365
16032	NC_022130	C	6	6	851065	851070	0 %	0 %	0 %	100 %	532531365
16033	NC_022130	T	6	6	851127	851132	0 %	100 %	0 %	0 %	532531365
16034	NC_022130	ACC	2	6	851135	851140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531365
16035	NC_022130	ACAA	2	8	851325	851332	75 %	0 %	0 %	25 %	532531366
16036	NC_022130	AACC	2	8	851344	851351	50 %	0 %	0 %	50 %	532531366
16037	NC_022130	GAA	2	6	851405	851410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531366
16038	NC_022130	T	6	6	851451	851456	0 %	100 %	0 %	0 %	532531366
16039	NC_022130	TCA	2	6	851469	851474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531366
16040	NC_022130	TAA	2	6	851490	851495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531366
16041	NC_022130	ACTG	2	8	851540	851547	25 %	25 %	25 %	25 %	532531366
16042	NC_022130	CTA	2	6	851635	851640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531366
16043	NC_022130	GTT	2	6	851791	851796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531367
16044	NC_022130	TTTC	2	8	851824	851831	0 %	75 %	0 %	25 %	532531367
16045	NC_022130	TTTC	2	8	851860	851867	0 %	75 %	0 %	25 %	532531367
16046	NC_022130	A	6	6	852013	852018	100 %	0 %	0 %	0 %	532531367
16047	NC_022130	CTTT	2	8	852079	852086	0 %	75 %	0 %	25 %	532531367
16048	NC_022130	A	6	6	852142	852147	100 %	0 %	0 %	0 %	532531367
16049	NC_022130	TCA	2	6	852196	852201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531367
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16051	NC_022130	AATG	2	8	852351	852358	50 %	25 %	25 %	0 %	532531368
16052	NC_022130	TG	3	6	852383	852388	0 %	50 %	50 %	0 %	532531368
16053	NC_022130	CAT	2	6	852389	852394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531368
16054	NC_022130	TCT	2	6	852418	852423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531368
16055	NC_022130	AC	3	6	852473	852478	50 %	0 %	0 %	50 %	532531368
16056	NC_022130	CAA	2	6	852521	852526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532531368
16057	NC_022130	T	6	6	852600	852605	0 %	100 %	0 %	0 %	532531368
16058	NC_022130	ATA	2	6	852606	852611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531368
16059	NC_022130	TTG	2	6	852654	852659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531368
16060	NC_022130	A	6	6	852694	852699	100 %	0 %	0 %	0 %	532531368
16061	NC_022130	GC	3	6	852724	852729	0 %	0 %	50 %	50 %	532531368
16062	NC_022130	T	6	6	852732	852737	0 %	100 %	0 %	0 %	532531368
16063	NC_022130	ATA	2	6	852762	852767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531368
16064	NC_022130	T	6	6	852792	852797	0 %	100 %	0 %	0 %	532531368
16065	NC_022130	T	7	7	852800	852806	0 %	100 %	0 %	0 %	532531368
16066	NC_022130	AGA	2	6	852825	852830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531368
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16068	NC_022130	TCC	2	6	853024	853029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532531368
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16070	NC_022130	GCAAT	2	10	853153	853162	40 %	20 %	20 %	20 %	532531368
16071	NC_022130	T	6	6	853172	853177	0 %	100 %	0 %	0 %	532531368
16072	NC_022130	GGT	2	6	853183	853188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531368
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16074	NC_022130	AAAC	2	8	853247	853254	75 %	0 %	0 %	25 %	532531368
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16077	NC_022130	TTC	2	6	853334	853339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531369
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16079	NC_022130	TTTTCT	2	12	853371	853382	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532531369
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16082	NC_022130	T	8	8	853474	853481	0 %	100 %	0 %	0 %	532531369
16083	NC_022130	TTG	2	6	853508	853513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531369
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16089	NC_022130	TTC	2	6	853839	853844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531370
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16091	NC_022130	TAT	2	6	853925	853930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531370
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16093	NC_022130	CATC	2	8	854296	854303	25 %	25 %	0 %	50 %	532531371
16094	NC_022130	TGA	2	6	854387	854392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531371
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16096	NC_022130	AGCG	2	8	854471	854478	25 %	0 %	50 %	25 %	532531371
16097	NC_022130	CGT	2	6	854482	854487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531371
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16099	NC_022130	ATTCC	2	10	854579	854588	20 %	40 %	0 %	40 %	532531371
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16106	NC_022130	ATTG	2	8	854863	854870	25 %	50 %	25 %	0 %	532531371
16107	NC_022130	GCC	2	6	855219	855224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532531371
16108	NC_022130	GAAA	2	8	855263	855270	75 %	0 %	25 %	0 %	532531371
16109	NC_022130	ATTCA	2	10	855281	855290	40 %	40 %	0 %	20 %	532531371
16110	NC_022130	GGA	2	6	855313	855318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532531371
16111	NC_022130	TTCA	2	8	855368	855375	25 %	50 %	0 %	25 %	532531371
16112	NC_022130	GAA	2	6	855489	855494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531371
16113	NC_022130	CGC	2	6	855509	855514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532531371
16114	NC_022130	TTA	2	6	855663	855668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531371
16115	NC_022130	CACC	2	8	855689	855696	25 %	0 %	0 %	75 %	532531371
16116	NC_022130	CAC	2	6	855701	855706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531371
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16118	NC_022130	A	6	6	855803	855808	100 %	0 %	0 %	0 %	532531371
16119	NC_022130	GTC	2	6	855879	855884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531371
16120	NC_022130	GA	3	6	855973	855978	50 %	0 %	50 %	0 %	532531371
16121	NC_022130	AAG	2	6	855991	855996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531371
16122	NC_022130	GTA	2	6	856017	856022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531371
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16373	NC_022130	GAA	2	6	870433	870438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531384
16374	NC_022130	A	6	6	870454	870459	100 %	0 %	0 %	0 %	532531384
16375	NC_022130	A	6	6	870529	870534	100 %	0 %	0 %	0 %	532531384
16376	NC_022130	ATGC	2	8	870546	870553	25 %	25 %	25 %	25 %	532531384
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16499	NC_022130	ATCGCC	2	12	877889	877900	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532531389
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