MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 60412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021921	CTG	2	6	205823	205828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076668
4002	NC_021921	GA	4	8	205865	205872	50 %	0 %	50 %	0 %	529076668
4003	NC_021921	TCG	2	6	205887	205892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076668
4004	NC_021921	CGC	2	6	205918	205923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076668
4005	NC_021921	CGG	2	6	205977	205982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076668
4006	NC_021921	GTC	2	6	205985	205990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076668
4007	NC_021921	GGC	2	6	206026	206031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076668
4008	NC_021921	CTC	2	6	206036	206041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076668
4009	NC_021921	TCGG	2	8	206049	206056	0 %	25 %	50 %	25 %	529076668
4010	NC_021921	CTC	2	6	206066	206071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076668
4011	NC_021921	CGT	2	6	206101	206106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076668
4012	NC_021921	CGATC	2	10	206149	206158	20 %	20 %	20 %	40 %	529076668
4013	NC_021921	TCG	2	6	206184	206189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076668
4014	NC_021921	CCG	2	6	206193	206198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076668
4015	NC_021921	ACT	2	6	206256	206261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076668
4016	NC_021921	TCG	2	6	206262	206267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076668
4017	NC_021921	CGA	2	6	206281	206286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076668
4018	NC_021921	CGCC	2	8	206341	206348	0 %	0 %	25 %	75 %	529076668
4019	NC_021921	GCG	2	6	206489	206494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076668
4020	NC_021921	GAC	2	6	206659	206664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076668
4021	NC_021921	TC	3	6	206670	206675	0 %	50 %	0 %	50 %	529076668
4022	NC_021921	TCGCG	2	10	206700	206709	0 %	20 %	40 %	40 %	529076668
4023	NC_021921	GCGG	2	8	206724	206731	0 %	0 %	75 %	25 %	529076668
4024	NC_021921	TC	3	6	206923	206928	0 %	50 %	0 %	50 %	529076668
4025	NC_021921	CGG	2	6	206949	206954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076668
4026	NC_021921	GAC	2	6	206986	206991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076668
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4028	NC_021921	GTT	2	6	207004	207009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529076668
4029	NC_021921	CGG	2	6	207021	207026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076668
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4031	NC_021921	CGG	2	6	207144	207149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076668
4032	NC_021921	GC	3	6	207183	207188	0 %	0 %	50 %	50 %	529076668
4033	NC_021921	GAG	2	6	207212	207217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076668
4034	NC_021921	ACGGCG	2	12	207282	207293	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529076668
4035	NC_021921	CGT	2	6	207313	207318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076668
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4039	NC_021921	ACG	2	6	207438	207443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076668
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4041	NC_021921	CGC	2	6	207616	207621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076668
4042	NC_021921	CCGAA	2	10	207628	207637	40 %	0 %	20 %	40 %	529076668
4043	NC_021921	GCCG	2	8	207662	207669	0 %	0 %	50 %	50 %	529076668
4044	NC_021921	GTTC	2	8	207691	207698	0 %	50 %	25 %	25 %	529076669
4045	NC_021921	TCG	2	6	207707	207712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076669
4046	NC_021921	TCG	2	6	207758	207763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076669
4047	NC_021921	CGC	2	6	207785	207790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076669
4048	NC_021921	ACGT	2	8	207802	207809	25 %	25 %	25 %	25 %	529076669
4049	NC_021921	CT	3	6	207863	207868	0 %	50 %	0 %	50 %	529076669
4050	NC_021921	GTC	2	6	207886	207891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076669
4051	NC_021921	CGT	2	6	207927	207932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076669
4052	NC_021921	CGT	2	6	207956	207961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076669
4053	NC_021921	CGGG	2	8	208002	208009	0 %	0 %	75 %	25 %	529076669
4054	NC_021921	TCC	2	6	208013	208018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076669
4055	NC_021921	GCC	2	6	208060	208065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076669
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4057	NC_021921	GCC	2	6	208114	208119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076669
4058	NC_021921	CTG	2	6	208141	208146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076669
4059	NC_021921	GAG	2	6	208156	208161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076669
4060	NC_021921	GCG	2	6	208185	208190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076669
4061	NC_021921	TACT	2	8	208198	208205	25 %	50 %	0 %	25 %	529076669
4062	NC_021921	TCGC	2	8	208254	208261	0 %	25 %	25 %	50 %	529076669
4063	NC_021921	CG	3	6	208283	208288	0 %	0 %	50 %	50 %	529076669
4064	NC_021921	CGCTCG	2	12	208361	208372	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529076669
4065	NC_021921	ACG	2	6	208439	208444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076669
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4070	NC_021921	GCT	2	6	208566	208571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076669
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4072	NC_021921	GTG	2	6	208649	208654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076669
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4074	NC_021921	ACGT	2	8	208711	208718	25 %	25 %	25 %	25 %	529076669
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4081	NC_021921	GC	3	6	209001	209006	0 %	0 %	50 %	50 %	529076669
4082	NC_021921	CGA	2	6	209031	209036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076669
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4091	NC_021921	CGT	2	6	209355	209360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076669
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4093	NC_021921	GCTG	2	8	209490	209497	0 %	25 %	50 %	25 %	529076670
4094	NC_021921	GAG	2	6	209569	209574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076670
4095	NC_021921	CG	3	6	209575	209580	0 %	0 %	50 %	50 %	529076670
4096	NC_021921	TCGGT	2	10	209582	209591	0 %	40 %	40 %	20 %	529076670
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4105	NC_021921	GGT	3	9	209874	209882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076670
4106	NC_021921	GGC	2	6	209893	209898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076671
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4108	NC_021921	CTG	2	6	209943	209948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076671
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4112	NC_021921	CGA	2	6	210086	210091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076671
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4115	NC_021921	GGCAC	2	10	210241	210250	20 %	0 %	40 %	40 %	529076671
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4119	NC_021921	CGC	2	6	210403	210408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076671
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4121	NC_021921	TCG	2	6	210514	210519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076671
4122	NC_021921	CGTCG	2	10	210527	210536	0 %	20 %	40 %	40 %	529076671
4123	NC_021921	CGG	2	6	210627	210632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076671
4124	NC_021921	CGA	2	6	210655	210660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076671
4125	NC_021921	CGT	2	6	210677	210682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076671
4126	NC_021921	GCT	2	6	210795	210800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076671
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4128	NC_021921	GAC	2	6	210893	210898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076672
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4130	NC_021921	GACCG	2	10	210927	210936	20 %	0 %	40 %	40 %	529076672
4131	NC_021921	GAC	2	6	210947	210952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076672
4132	NC_021921	TCG	2	6	210978	210983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076672
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4140	NC_021921	CAG	2	6	211322	211327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076672
4141	NC_021921	TCGA	2	8	211361	211368	25 %	25 %	25 %	25 %	529076672
4142	NC_021921	GCG	2	6	211388	211393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076672
4143	NC_021921	ATCG	2	8	211394	211401	25 %	25 %	25 %	25 %	529076672
4144	NC_021921	GA	3	6	211497	211502	50 %	0 %	50 %	0 %	529076672
4145	NC_021921	CGGC	2	8	211578	211585	0 %	0 %	50 %	50 %	529076672
4146	NC_021921	CG	3	6	211618	211623	0 %	0 %	50 %	50 %	529076672
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4151	NC_021921	CGA	2	6	211834	211839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076672
4152	NC_021921	ACG	2	6	211854	211859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076672
4153	NC_021921	CGA	2	6	211888	211893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076672
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4157	NC_021921	CGT	2	6	212097	212102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076672
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4159	NC_021921	GC	3	6	212185	212190	0 %	0 %	50 %	50 %	529076672
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4230	NC_021921	GC	3	6	215389	215394	0 %	0 %	50 %	50 %	529076674
4231	NC_021921	TCGA	2	8	215422	215429	25 %	25 %	25 %	25 %	529076674
4232	NC_021921	CGA	2	6	215606	215611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076674
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4234	NC_021921	GAC	2	6	215671	215676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076674
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4237	NC_021921	GTGTG	2	10	215898	215907	0 %	40 %	60 %	0 %	529076675
4238	NC_021921	GCC	2	6	215914	215919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076675
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4240	NC_021921	AAG	2	6	216056	216061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076675
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4242	NC_021921	GAA	2	6	216145	216150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076675
4243	NC_021921	AGTCG	2	10	216180	216189	20 %	20 %	40 %	20 %	529076675
4244	NC_021921	GTA	2	6	216286	216291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076675
4245	NC_021921	CGA	2	6	216312	216317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076675
4246	NC_021921	CGATCG	2	12	216324	216335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529076675
4247	NC_021921	GAC	2	6	216453	216458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076675
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4249	NC_021921	GCC	2	6	216610	216615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076676
4250	NC_021921	GTC	2	6	216646	216651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076676
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4252	NC_021921	GAC	2	6	216819	216824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076677
4253	NC_021921	GGT	2	6	216849	216854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076677
4254	NC_021921	GTC	2	6	216871	216876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076677
4255	NC_021921	CGACGC	2	12	216900	216911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529076677
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4257	NC_021921	CGA	2	6	216966	216971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076677
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4261	NC_021921	ACG	2	6	217129	217134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076677
4262	NC_021921	CG	3	6	217160	217165	0 %	0 %	50 %	50 %	529076677
4263	NC_021921	GTG	2	6	217178	217183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076677
4264	NC_021921	GAC	2	6	217221	217226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076677
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4270	NC_021921	ACG	2	6	217390	217395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076677
4271	NC_021921	TCGACG	2	12	217460	217471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529076677
4272	NC_021921	GC	3	6	217597	217602	0 %	0 %	50 %	50 %	529076677
4273	NC_021921	TCG	2	6	217610	217615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076677
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4275	NC_021921	CCG	2	6	217679	217684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076677
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4348	NC_021921	GAC	2	6	220753	220758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076679
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4350	NC_021921	CGG	2	6	220983	220988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076679
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4352	NC_021921	TGT	2	6	221206	221211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529076680
4353	NC_021921	GC	3	6	221284	221289	0 %	0 %	50 %	50 %	529076680
4354	NC_021921	GAAC	2	8	221305	221312	50 %	0 %	25 %	25 %	529076680
4355	NC_021921	GAG	2	6	221359	221364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076681
4356	NC_021921	GAA	2	6	221427	221432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076681
4357	NC_021921	TC	3	6	221451	221456	0 %	50 %	0 %	50 %	529076681
4358	NC_021921	CGA	2	6	221502	221507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076681
4359	NC_021921	GGGC	2	8	221527	221534	0 %	0 %	75 %	25 %	529076681
4360	NC_021921	CGA	2	6	221540	221545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076681
4361	NC_021921	AGC	2	6	221681	221686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076682
4362	NC_021921	CGT	2	6	221703	221708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076682
4363	NC_021921	CG	3	6	221734	221739	0 %	0 %	50 %	50 %	529076682
4364	NC_021921	ACG	2	6	221811	221816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076682
4365	NC_021921	TCG	2	6	221837	221842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076682
4366	NC_021921	CG	4	8	221849	221856	0 %	0 %	50 %	50 %	529076682
4367	NC_021921	GTC	2	6	221863	221868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076682
4368	NC_021921	CTT	2	6	221955	221960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076682
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4370	NC_021921	TCGAT	2	10	222244	222253	20 %	40 %	20 %	20 %	529076683
4371	NC_021921	TCG	2	6	222292	222297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076683
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4373	NC_021921	CAG	2	6	222314	222319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076683
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4375	NC_021921	CGCA	2	8	222348	222355	25 %	0 %	25 %	50 %	529076683
4376	NC_021921	GGC	2	6	222360	222365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076683
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4388	NC_021921	TCTCGC	2	12	222761	222772	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	529076683
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4394	NC_021921	TCG	2	6	222979	222984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076683
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4421	NC_021921	GTC	2	6	223839	223844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076683
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4425	NC_021921	TCC	2	6	224152	224157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076683
4426	NC_021921	GGCG	2	8	224249	224256	0 %	0 %	75 %	25 %	529076683
4427	NC_021921	CGT	2	6	224309	224314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076683
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4432	NC_021921	CGGGC	2	10	224586	224595	0 %	0 %	60 %	40 %	529076685
4433	NC_021921	TCG	2	6	224608	224613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076685
4434	NC_021921	ACG	2	6	224707	224712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076685
4435	NC_021921	GGT	2	6	224754	224759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076685
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4445	NC_021921	CGG	2	6	225154	225159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076685
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4447	NC_021921	CGGA	2	8	225363	225370	25 %	0 %	50 %	25 %	529076685
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4450	NC_021921	CGACG	2	10	225452	225461	20 %	0 %	40 %	40 %	529076685
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4457	NC_021921	GC	3	6	225656	225661	0 %	0 %	50 %	50 %	529076685
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4462	NC_021921	AAC	2	6	225922	225927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529076685
4463	NC_021921	ACG	2	6	225948	225953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076685
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4467	NC_021921	TCG	2	6	226029	226034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076686
4468	NC_021921	CG	3	6	226042	226047	0 %	0 %	50 %	50 %	529076686
4469	NC_021921	AGG	2	6	226083	226088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076686
4470	NC_021921	CGA	2	6	226101	226106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076686
4471	NC_021921	CGA	2	6	226108	226113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076686
4472	NC_021921	TCGACG	2	12	226164	226175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529076686
4473	NC_021921	CGTTC	2	10	226332	226341	0 %	40 %	20 %	40 %	529076687
4474	NC_021921	CTT	2	6	226349	226354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076687
4475	NC_021921	TCG	3	9	226374	226382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076687
4476	NC_021921	GATC	2	8	226441	226448	25 %	25 %	25 %	25 %	529076687
4477	NC_021921	GC	3	6	226455	226460	0 %	0 %	50 %	50 %	529076687
4478	NC_021921	TGA	2	6	226504	226509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076687
4479	NC_021921	GA	3	6	226538	226543	50 %	0 %	50 %	0 %	529076687
4480	NC_021921	TCG	3	9	226587	226595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076687
4481	NC_021921	CGA	2	6	226645	226650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076687
4482	NC_021921	GGA	2	6	226651	226656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076687
4483	NC_021921	ATGGT	2	10	227052	227061	20 %	40 %	40 %	0 %	529076689
4484	NC_021921	CGA	2	6	227080	227085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076689
4485	NC_021921	GACA	2	8	227088	227095	50 %	0 %	25 %	25 %	529076689
4486	NC_021921	CGA	2	6	227158	227163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076689
4487	NC_021921	CGAC	2	8	227193	227200	25 %	0 %	25 %	50 %	529076689
4488	NC_021921	GAC	3	9	227285	227293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076689
4489	NC_021921	AC	3	6	227292	227297	50 %	0 %	0 %	50 %	529076689
4490	NC_021921	GA	3	6	227318	227323	50 %	0 %	50 %	0 %	529076689
4491	NC_021921	CGA	2	6	227338	227343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076689
4492	NC_021921	CGA	2	6	227347	227352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076689
4493	NC_021921	TTCG	2	8	227371	227378	0 %	50 %	25 %	25 %	529076689
4494	NC_021921	TCC	2	6	227379	227384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076689
4495	NC_021921	CGG	2	6	227386	227391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076689
4496	NC_021921	GAGC	2	8	227400	227407	25 %	0 %	50 %	25 %	529076689
4497	NC_021921	TCC	2	6	227409	227414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076689
4498	NC_021921	CGAGC	2	10	227438	227447	20 %	0 %	40 %	40 %	529076689
4499	NC_021921	CGC	2	6	227496	227501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076689
4500	NC_021921	CTG	2	6	227528	227533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076689

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