MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 60412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021921	GAAC	2	8	183402	183409	50 %	0 %	25 %	25 %	529076646
3502	NC_021921	GTC	2	6	183432	183437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076646
3503	NC_021921	CGG	2	6	183486	183491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076646
3504	NC_021921	CGT	2	6	183515	183520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076646
3505	NC_021921	CGA	2	6	183521	183526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076646
3506	NC_021921	GTC	2	6	183585	183590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076646
3507	NC_021921	CGC	2	6	183600	183605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076646
3508	NC_021921	CGAG	2	8	183632	183639	25 %	0 %	50 %	25 %	529076646
3509	NC_021921	CCT	2	6	183650	183655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076646
3510	NC_021921	CCT	2	6	183692	183697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076646
3511	NC_021921	GGCG	2	8	183710	183717	0 %	0 %	75 %	25 %	529076646
3512	NC_021921	G	6	6	183740	183745	0 %	0 %	100 %	0 %	529076646
3513	NC_021921	TCGA	2	8	183874	183881	25 %	25 %	25 %	25 %	529076646
3514	NC_021921	CGC	2	6	183884	183889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076646
3515	NC_021921	AAG	2	6	183907	183912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076646
3516	NC_021921	CGA	2	6	183923	183928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076646
3517	NC_021921	TCG	2	6	183937	183942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076646
3518	NC_021921	GAC	2	6	183951	183956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076646
3519	NC_021921	CGC	2	6	184058	184063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076646
3520	NC_021921	GTC	2	6	184084	184089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076646
3521	NC_021921	CGT	2	6	184091	184096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076646
3522	NC_021921	GGGT	2	8	184321	184328	0 %	25 %	75 %	0 %	529076647
3523	NC_021921	ACC	2	6	184336	184341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076647
3524	NC_021921	TCG	2	6	184343	184348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076647
3525	NC_021921	TCG	3	9	184355	184363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076647
3526	NC_021921	GC	3	6	184364	184369	0 %	0 %	50 %	50 %	529076647
3527	NC_021921	GTC	2	6	184372	184377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076647
3528	NC_021921	CTCG	2	8	184386	184393	0 %	25 %	25 %	50 %	529076647
3529	NC_021921	CGT	2	6	184476	184481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076647
3530	NC_021921	CG	3	6	184607	184612	0 %	0 %	50 %	50 %	529076648
3531	NC_021921	CGA	2	6	184645	184650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076648
3532	NC_021921	CGGG	2	8	184659	184666	0 %	0 %	75 %	25 %	529076648
3533	NC_021921	CGA	2	6	184684	184689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076648
3534	NC_021921	CGA	2	6	184741	184746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076648
3535	NC_021921	GCC	2	6	184797	184802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076648
3536	NC_021921	TGAG	2	8	184810	184817	25 %	25 %	50 %	0 %	529076648
3537	NC_021921	GTCG	2	8	184864	184871	0 %	25 %	50 %	25 %	529076648
3538	NC_021921	CCGT	2	8	184873	184880	0 %	25 %	25 %	50 %	529076648
3539	NC_021921	CGA	2	6	184903	184908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076648
3540	NC_021921	CGG	2	6	184933	184938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076648
3541	NC_021921	AGC	2	6	184953	184958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076648
3542	NC_021921	C	6	6	184987	184992	0 %	0 %	0 %	100 %	529076648
3543	NC_021921	CGA	2	6	185050	185055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076648
3544	NC_021921	ACCG	2	8	185169	185176	25 %	0 %	25 %	50 %	529076649
3545	NC_021921	AGT	2	6	185217	185222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076649
3546	NC_021921	CGG	2	6	185340	185345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076649
3547	NC_021921	TCG	2	6	185375	185380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076649
3548	NC_021921	CTG	2	6	185494	185499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076649
3549	NC_021921	GTC	3	9	185500	185508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076649
3550	NC_021921	ACGG	2	8	185515	185522	25 %	0 %	50 %	25 %	529076649
3551	NC_021921	CGGC	2	8	185531	185538	0 %	0 %	50 %	50 %	529076649
3552	NC_021921	CGT	2	6	185558	185563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076649
3553	NC_021921	GAG	2	6	185677	185682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076649
3554	NC_021921	GAC	2	6	185698	185703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076649
3555	NC_021921	CTCG	2	8	185709	185716	0 %	25 %	25 %	50 %	529076649
3556	NC_021921	ATCG	2	8	185757	185764	25 %	25 %	25 %	25 %	529076649
3557	NC_021921	CAC	2	6	185787	185792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076649
3558	NC_021921	AAG	2	6	185801	185806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076649
3559	NC_021921	TC	3	6	185851	185856	0 %	50 %	0 %	50 %	529076649
3560	NC_021921	CCG	2	6	185864	185869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076649
3561	NC_021921	TCG	2	6	185910	185915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076649
3562	NC_021921	GCT	2	6	185974	185979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3563	NC_021921	TTC	2	6	185993	185998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076650
3564	NC_021921	TCG	2	6	186021	186026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3565	NC_021921	CGT	2	6	186034	186039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3566	NC_021921	GTT	2	6	186046	186051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529076650
3567	NC_021921	CGGC	2	8	186076	186083	0 %	0 %	50 %	50 %	529076650
3568	NC_021921	TCGC	2	8	186104	186111	0 %	25 %	25 %	50 %	529076650
3569	NC_021921	TCC	2	6	186126	186131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076650
3570	NC_021921	CGA	2	6	186174	186179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3571	NC_021921	CAGC	2	8	186222	186229	25 %	0 %	25 %	50 %	529076650
3572	NC_021921	GGT	2	6	186266	186271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076650
3573	NC_021921	TGG	2	6	186286	186291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076650
3574	NC_021921	CGT	2	6	186327	186332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3575	NC_021921	CTC	2	6	186368	186373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076650
3576	NC_021921	CGAT	2	8	186386	186393	25 %	25 %	25 %	25 %	529076650
3577	NC_021921	CGA	2	6	186406	186411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3578	NC_021921	TCGG	2	8	186428	186435	0 %	25 %	50 %	25 %	529076650
3579	NC_021921	CCT	2	6	186436	186441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076650
3580	NC_021921	GATCGC	2	12	186487	186498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3581	NC_021921	TCC	2	6	186576	186581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076650
3582	NC_021921	CTG	2	6	186587	186592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3583	NC_021921	TCA	2	6	186630	186635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076650
3584	NC_021921	CTT	2	6	186637	186642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076650
3585	NC_021921	CGG	4	12	186643	186654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076650
3586	NC_021921	ACG	2	6	186675	186680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3587	NC_021921	CG	3	6	186688	186693	0 %	0 %	50 %	50 %	529076650
3588	NC_021921	GC	4	8	186717	186724	0 %	0 %	50 %	50 %	529076650
3589	NC_021921	GCC	2	6	186776	186781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076650
3590	NC_021921	GCG	2	6	186782	186787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076650
3591	NC_021921	CGG	2	6	186849	186854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076650
3592	NC_021921	GAGT	2	8	186874	186881	25 %	25 %	50 %	0 %	529076650
3593	NC_021921	CGG	2	6	186883	186888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076650
3594	NC_021921	ACG	2	6	186894	186899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076650
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3597	NC_021921	ACGG	2	8	186941	186948	25 %	0 %	50 %	25 %	529076650
3598	NC_021921	TCG	2	6	187014	187019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3599	NC_021921	TCG	2	6	187071	187076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076650
3600	NC_021921	CGG	2	6	187195	187200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076650
3601	NC_021921	GCC	2	6	187255	187260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076651
3602	NC_021921	CGTGA	2	10	187288	187297	20 %	20 %	40 %	20 %	529076651
3603	NC_021921	CGA	2	6	187299	187304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076651
3604	NC_021921	CG	3	6	187352	187357	0 %	0 %	50 %	50 %	529076651
3605	NC_021921	CGA	2	6	187365	187370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076651
3606	NC_021921	TCG	2	6	187397	187402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076651
3607	NC_021921	CGA	2	6	187404	187409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076651
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3609	NC_021921	TCGAT	2	10	187478	187487	20 %	40 %	20 %	20 %	529076651
3610	NC_021921	CGA	2	6	187514	187519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076651
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3616	NC_021921	TCGC	2	8	187717	187724	0 %	25 %	25 %	50 %	529076652
3617	NC_021921	CGC	2	6	187739	187744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076652
3618	NC_021921	GCG	2	6	187750	187755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076652
3619	NC_021921	GAC	2	6	187791	187796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076652
3620	NC_021921	ATC	2	6	187875	187880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076652
3621	NC_021921	TCG	2	6	187930	187935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076652
3622	NC_021921	GCG	2	6	187945	187950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076652
3623	NC_021921	TCG	2	6	187963	187968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076652
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3625	NC_021921	CGC	2	6	188057	188062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076652
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3630	NC_021921	TCG	2	6	188248	188253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076652
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3633	NC_021921	AGATT	2	10	188459	188468	40 %	40 %	20 %	0 %	529076652
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3640	NC_021921	CGG	3	9	188695	188703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076652
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3648	NC_021921	TCG	2	6	189010	189015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076652
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3655	NC_021921	GA	3	6	189614	189619	50 %	0 %	50 %	0 %	529076653
3656	NC_021921	TCG	3	9	189658	189666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076654
3657	NC_021921	CTG	2	6	189672	189677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076654
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3662	NC_021921	CGGT	2	8	189958	189965	0 %	25 %	50 %	25 %	529076654
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3684	NC_021921	TCG	2	6	190662	190667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076654
3685	NC_021921	TCG	2	6	190696	190701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076654
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3719	NC_021921	CCGC	2	8	192399	192406	0 %	0 %	25 %	75 %	529076656
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3724	NC_021921	CGA	2	6	192736	192741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076657
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3727	NC_021921	CGTCG	2	10	192824	192833	0 %	20 %	40 %	40 %	529076657
3728	NC_021921	CGG	2	6	192865	192870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076657
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3730	NC_021921	CCGA	2	8	193179	193186	25 %	0 %	25 %	50 %	529076658
3731	NC_021921	AGCCG	2	10	193196	193205	20 %	0 %	40 %	40 %	529076658
3732	NC_021921	TC	3	6	193206	193211	0 %	50 %	0 %	50 %	529076658
3733	NC_021921	GA	3	6	193231	193236	50 %	0 %	50 %	0 %	529076658
3734	NC_021921	ACT	2	6	193255	193260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076658
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3737	NC_021921	CGC	2	6	193333	193338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076658
3738	NC_021921	ACCG	2	8	193340	193347	25 %	0 %	25 %	50 %	529076658
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3740	NC_021921	CGG	2	6	193413	193418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076658
3741	NC_021921	CGA	2	6	193424	193429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076658
3742	NC_021921	ACG	2	6	193453	193458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076658
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3839	NC_021921	AGGCG	2	10	197916	197925	20 %	0 %	60 %	20 %	529076660
3840	NC_021921	GATC	2	8	198085	198092	25 %	25 %	25 %	25 %	529076660
3841	NC_021921	TCGAGA	2	12	198096	198107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	529076660
3842	NC_021921	GGAC	2	8	198109	198116	25 %	0 %	50 %	25 %	529076660
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3846	NC_021921	ACG	3	9	198317	198325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076660
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3853	NC_021921	TCG	2	6	198498	198503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076660
3854	NC_021921	GAC	2	6	198590	198595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076660
3855	NC_021921	CGG	2	6	198607	198612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076660
3856	NC_021921	TCGCAG	2	12	198723	198734	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529076661
3857	NC_021921	G	6	6	198742	198747	0 %	0 %	100 %	0 %	529076661
3858	NC_021921	GAC	2	6	198757	198762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076661
3859	NC_021921	CGT	3	9	198811	198819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076661
3860	NC_021921	CCGA	2	8	198825	198832	25 %	0 %	25 %	50 %	529076661
3861	NC_021921	CGA	2	6	198876	198881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076661
3862	NC_021921	ACCG	2	8	198940	198947	25 %	0 %	25 %	50 %	529076661
3863	NC_021921	GCT	2	6	198952	198957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076661
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3889	NC_021921	TGAC	2	8	199996	200003	25 %	25 %	25 %	25 %	529076661
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3955	NC_021921	TCG	2	6	203742	203747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076665
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3967	NC_021921	GCGAT	2	10	204288	204297	20 %	20 %	40 %	20 %	529076666
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3974	NC_021921	GTC	2	6	204584	204589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076666
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3976	NC_021921	GCT	2	6	204694	204699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076666
3977	NC_021921	CA	3	6	204711	204716	50 %	0 %	0 %	50 %	529076666
3978	NC_021921	TTC	2	6	204719	204724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076666
3979	NC_021921	GC	3	6	204769	204774	0 %	0 %	50 %	50 %	529076666
3980	NC_021921	TCTCC	2	10	204850	204859	0 %	40 %	0 %	60 %	529076666
3981	NC_021921	GACT	2	8	204864	204871	25 %	25 %	25 %	25 %	529076666
3982	NC_021921	CGGAT	2	10	204933	204942	20 %	20 %	40 %	20 %	529076666
3983	NC_021921	GTC	2	6	204962	204967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076666
3984	NC_021921	TCG	2	6	204969	204974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076666
3985	NC_021921	ACG	2	6	204975	204980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076666
3986	NC_021921	CGCGAG	2	12	205010	205021	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529076666
3987	NC_021921	CGG	2	6	205030	205035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076666
3988	NC_021921	CCT	2	6	205059	205064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076666
3989	NC_021921	ACGG	2	8	205086	205093	25 %	0 %	50 %	25 %	529076666
3990	NC_021921	GAT	2	6	205165	205170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076667
3991	NC_021921	CTG	2	6	205190	205195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076667
3992	NC_021921	GGCG	2	8	205222	205229	0 %	0 %	75 %	25 %	529076667
3993	NC_021921	GC	3	6	205347	205352	0 %	0 %	50 %	50 %	529076667
3994	NC_021921	CGT	2	6	205377	205382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076667
3995	NC_021921	ACG	2	6	205442	205447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076667
3996	NC_021921	ATC	2	6	205499	205504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076667
3997	NC_021921	GAC	2	6	205528	205533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076667
3998	NC_021921	GCG	2	6	205583	205588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076667
3999	NC_021921	TGAG	2	8	205652	205659	25 %	25 %	50 %	0 %	529076667
4000	NC_021921	TCG	2	6	205772	205777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076668

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