MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 60412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021921	CGGC	2	8	40141	40148	0 %	0 %	50 %	50 %	529076500
1002	NC_021921	CGG	2	6	40168	40173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076500
1003	NC_021921	AGA	2	6	40222	40227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076500
1004	NC_021921	AAG	2	6	40284	40289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076500
1005	NC_021921	CGA	2	6	40319	40324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1006	NC_021921	CT	3	6	40373	40378	0 %	50 %	0 %	50 %	529076500
1007	NC_021921	TC	3	6	40381	40386	0 %	50 %	0 %	50 %	529076500
1008	NC_021921	TCG	2	6	40410	40415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1009	NC_021921	CCG	2	6	40428	40433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076500
1010	NC_021921	CGT	2	6	40483	40488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1011	NC_021921	GAC	2	6	40490	40495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1012	NC_021921	CGA	2	6	40507	40512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1013	NC_021921	CGT	2	6	40520	40525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1014	NC_021921	TGCTT	2	10	40627	40636	0 %	60 %	20 %	20 %	529076501
1015	NC_021921	CAG	2	6	40725	40730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1016	NC_021921	GGC	2	6	40734	40739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076501
1017	NC_021921	CGC	2	6	40746	40751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076501
1018	NC_021921	GCG	2	6	40753	40758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076501
1019	NC_021921	GGCGT	2	10	40821	40830	0 %	20 %	60 %	20 %	529076501
1020	NC_021921	TCG	2	6	40880	40885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1021	NC_021921	CGGC	2	8	40889	40896	0 %	0 %	50 %	50 %	529076501
1022	NC_021921	GAC	2	6	40920	40925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1023	NC_021921	GGCG	2	8	41009	41016	0 %	0 %	75 %	25 %	529076501
1024	NC_021921	AGG	2	6	41065	41070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076501
1025	NC_021921	TCG	2	6	41074	41079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1026	NC_021921	CG	3	6	41195	41200	0 %	0 %	50 %	50 %	529076501
1027	NC_021921	TCT	2	6	41237	41242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076501
1028	NC_021921	TCG	2	6	41300	41305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1029	NC_021921	CAT	2	6	41322	41327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076501
1030	NC_021921	TCG	3	9	41330	41338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1031	NC_021921	GC	3	6	41383	41388	0 %	0 %	50 %	50 %	529076501
1032	NC_021921	GATC	2	8	41402	41409	25 %	25 %	25 %	25 %	529076501
1033	NC_021921	TCC	2	6	41413	41418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076501
1034	NC_021921	CGA	3	9	41420	41428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1035	NC_021921	TC	3	6	41450	41455	0 %	50 %	0 %	50 %	529076501
1036	NC_021921	CCA	2	6	41482	41487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076501
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1039	NC_021921	TC	3	6	41531	41536	0 %	50 %	0 %	50 %	529076501
1040	NC_021921	TTCG	2	8	41542	41549	0 %	50 %	25 %	25 %	529076501
1041	NC_021921	GGT	2	6	41565	41570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076501
1042	NC_021921	CGA	2	6	41772	41777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076502
1043	NC_021921	GCGAGC	2	12	41822	41833	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529076502
1044	NC_021921	CCTCG	2	10	41859	41868	0 %	20 %	20 %	60 %	529076502
1045	NC_021921	CGA	2	6	41880	41885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076502
1046	NC_021921	CGA	2	6	41934	41939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076502
1047	NC_021921	TTC	2	6	42001	42006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076502
1048	NC_021921	CGA	2	6	42052	42057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1049	NC_021921	CGA	2	6	42164	42169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1050	NC_021921	C	6	6	42177	42182	0 %	0 %	0 %	100 %	529076503
1051	NC_021921	ACG	2	6	42184	42189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1052	NC_021921	CGA	2	6	42223	42228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1053	NC_021921	GAC	2	6	42266	42271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1054	NC_021921	CCGA	2	8	42294	42301	25 %	0 %	25 %	50 %	529076503
1055	NC_021921	CGC	2	6	42308	42313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1056	NC_021921	CGG	2	6	42329	42334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076503
1057	NC_021921	GCC	2	6	42354	42359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1058	NC_021921	CGC	2	6	42362	42367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1059	NC_021921	TCGGT	2	10	42408	42417	0 %	40 %	40 %	20 %	529076503
1060	NC_021921	CT	3	6	42500	42505	0 %	50 %	0 %	50 %	529076503
1061	NC_021921	GCA	2	6	42543	42548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1062	NC_021921	ACT	2	6	42551	42556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076503
1063	NC_021921	ATC	2	6	42561	42566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076503
1064	NC_021921	GCC	2	6	42567	42572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1065	NC_021921	ACG	2	6	42583	42588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1066	NC_021921	ACG	2	6	42591	42596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1067	NC_021921	GAG	2	6	42609	42614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076503
1068	NC_021921	CGG	2	6	42617	42622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076503
1069	NC_021921	CGC	2	6	42662	42667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1070	NC_021921	TCG	2	6	42736	42741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1071	NC_021921	CGA	2	6	42761	42766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1072	NC_021921	CTA	2	6	42833	42838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076503
1073	NC_021921	CG	3	6	42872	42877	0 %	0 %	50 %	50 %	529076503
1074	NC_021921	GAG	2	6	42930	42935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076503
1075	NC_021921	GAG	2	6	42951	42956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076503
1076	NC_021921	GAG	2	6	42966	42971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076503
1077	NC_021921	CGGC	2	8	43009	43016	0 %	0 %	50 %	50 %	529076503
1078	NC_021921	TAC	2	6	43029	43034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076503
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1081	NC_021921	CGA	2	6	43114	43119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1082	NC_021921	CCG	2	6	43128	43133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1083	NC_021921	GCG	2	6	43141	43146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076503
1084	NC_021921	ACG	2	6	43191	43196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1085	NC_021921	CGGT	2	8	43261	43268	0 %	25 %	50 %	25 %	529076503
1086	NC_021921	CCG	2	6	43459	43464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076504
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1089	NC_021921	GAG	2	6	43544	43549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076504
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1091	NC_021921	GGAGTC	2	12	43663	43674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	529076504
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1093	NC_021921	TTGGAG	2	12	43900	43911	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	529076504
1094	NC_021921	CGA	2	6	43954	43959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076504
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1096	NC_021921	TCC	2	6	44113	44118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076505
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1099	NC_021921	GC	3	6	44285	44290	0 %	0 %	50 %	50 %	529076505
1100	NC_021921	CTC	2	6	44409	44414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076505
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1103	NC_021921	CCG	2	6	44497	44502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076505
1104	NC_021921	GAC	2	6	44505	44510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076505
1105	NC_021921	GGC	2	6	44532	44537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076505
1106	NC_021921	CGA	2	6	44585	44590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076505
1107	NC_021921	GAC	2	6	44676	44681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076505
1108	NC_021921	CCT	2	6	44705	44710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076505
1109	NC_021921	CGCT	2	8	44731	44738	0 %	25 %	25 %	50 %	529076505
1110	NC_021921	ACG	3	9	44746	44754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076505
1111	NC_021921	GAA	2	6	44766	44771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076505
1112	NC_021921	AGG	2	6	44867	44872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076505
1113	NC_021921	GAGC	2	8	44893	44900	25 %	0 %	50 %	25 %	529076505
1114	NC_021921	GAACGG	2	12	45009	45020	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	529076505
1115	NC_021921	GTC	2	6	45060	45065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076505
1116	NC_021921	AGGT	2	8	45160	45167	25 %	25 %	50 %	0 %	529076505
1117	NC_021921	GACG	2	8	45183	45190	25 %	0 %	50 %	25 %	529076505
1118	NC_021921	TGAG	2	8	45324	45331	25 %	25 %	50 %	0 %	529076506
1119	NC_021921	GC	3	6	45375	45380	0 %	0 %	50 %	50 %	529076506
1120	NC_021921	TCG	2	6	45427	45432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076506
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1122	NC_021921	CGT	2	6	45559	45564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076506
1123	NC_021921	ACG	2	6	45603	45608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076506
1124	NC_021921	CGT	2	6	45792	45797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076507
1125	NC_021921	CGA	2	6	45798	45803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076507
1126	NC_021921	TCC	2	6	45848	45853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076507
1127	NC_021921	CGC	2	6	45879	45884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076507
1128	NC_021921	GAG	2	6	45892	45897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076507
1129	NC_021921	CGAA	2	8	45907	45914	50 %	0 %	25 %	25 %	529076507
1130	NC_021921	GTC	2	6	45922	45927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076507
1131	NC_021921	TGGC	2	8	45985	45992	0 %	25 %	50 %	25 %	529076508
1132	NC_021921	CACT	2	8	46051	46058	25 %	25 %	0 %	50 %	529076508
1133	NC_021921	TCGG	2	8	46090	46097	0 %	25 %	50 %	25 %	529076508
1134	NC_021921	CGA	2	6	46099	46104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076508
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1137	NC_021921	TCG	2	6	46198	46203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076508
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1141	NC_021921	TCG	2	6	46321	46326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076508
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1145	NC_021921	TCA	2	6	46489	46494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076508
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1148	NC_021921	ACG	2	6	46603	46608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076508
1149	NC_021921	CGA	2	6	46616	46621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076508
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1151	NC_021921	TCG	2	6	46642	46647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076508
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1154	NC_021921	CGA	2	6	46760	46765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076508
1155	NC_021921	CGG	2	6	46802	46807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076508
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1158	NC_021921	TCCG	2	8	47562	47569	0 %	25 %	25 %	50 %	529076509
1159	NC_021921	TCA	2	6	47575	47580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076509
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1162	NC_021921	CGG	2	6	47632	47637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076509
1163	NC_021921	TTC	2	6	47657	47662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076509
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1182	NC_021921	CGA	2	6	48493	48498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076511
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1231	NC_021921	GTC	2	6	52049	52054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076514
1232	NC_021921	TCG	2	6	52172	52177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076514
1233	NC_021921	GTC	2	6	52237	52242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076514
1234	NC_021921	ACCGT	2	10	52243	52252	20 %	20 %	20 %	40 %	529076514
1235	NC_021921	CG	3	6	52258	52263	0 %	0 %	50 %	50 %	529076514
1236	NC_021921	CGTCA	2	10	52273	52282	20 %	20 %	20 %	40 %	529076514
1237	NC_021921	GTTC	2	8	52311	52318	0 %	50 %	25 %	25 %	529076514
1238	NC_021921	TCCTT	2	10	52343	52352	0 %	60 %	0 %	40 %	529076514
1239	NC_021921	CCA	2	6	52366	52371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076514
1240	NC_021921	GA	3	6	52411	52416	50 %	0 %	50 %	0 %	529076514
1241	NC_021921	TC	3	6	52434	52439	0 %	50 %	0 %	50 %	529076514
1242	NC_021921	GAG	2	6	52504	52509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076514
1243	NC_021921	CGTCAC	2	12	52596	52607	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	529076514
1244	NC_021921	GACA	2	8	52612	52619	50 %	0 %	25 %	25 %	529076514
1245	NC_021921	CTG	2	6	52621	52626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076514
1246	NC_021921	GCCG	2	8	52628	52635	0 %	0 %	50 %	50 %	529076514
1247	NC_021921	GCC	2	6	52674	52679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076514
1248	NC_021921	ACC	2	6	52723	52728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076514
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1252	NC_021921	GACT	2	8	52823	52830	25 %	25 %	25 %	25 %	529076514
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1493	NC_021921	CA	3	6	67323	67328	50 %	0 %	0 %	50 %	529076523
1494	NC_021921	TCG	2	6	67393	67398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076523
1495	NC_021921	GAG	2	6	67434	67439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076523
1496	NC_021921	CCGG	2	8	67619	67626	0 %	0 %	50 %	50 %	529076523
1497	NC_021921	ACT	2	6	67686	67691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076523
1498	NC_021921	GTC	2	6	67988	67993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076524
1499	NC_021921	CGT	3	9	68098	68106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076524
1500	NC_021921	TCG	2	6	68163	68168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076524

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