MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 60412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021921	TCG	2	6	20251	20256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076479
502	NC_021921	GTC	3	9	20382	20390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076479
503	NC_021921	TGCG	2	8	20429	20436	0 %	25 %	50 %	25 %	529076479
504	NC_021921	TCA	2	6	20467	20472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076479
505	NC_021921	CGA	2	6	20516	20521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076479
506	NC_021921	GC	3	6	20533	20538	0 %	0 %	50 %	50 %	529076479
507	NC_021921	AC	3	6	20546	20551	50 %	0 %	0 %	50 %	529076479
508	NC_021921	CGG	2	6	20576	20581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076479
509	NC_021921	CTG	2	6	20589	20594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076479
510	NC_021921	GAC	2	6	20625	20630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076479
511	NC_021921	GAC	2	6	20643	20648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076479
512	NC_021921	GAG	2	6	20658	20663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076479
513	NC_021921	GAA	2	6	20805	20810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076479
514	NC_021921	CTA	2	6	20825	20830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076479
515	NC_021921	TCG	2	6	20884	20889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076479
516	NC_021921	GT	3	6	21039	21044	0 %	50 %	50 %	0 %	529076480
517	NC_021921	GTT	2	6	21107	21112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529076480
518	NC_021921	GCC	2	6	21212	21217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076480
519	NC_021921	CGA	2	6	21259	21264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076480
520	NC_021921	CGA	2	6	21286	21291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076480
521	NC_021921	GCC	2	6	21302	21307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076480
522	NC_021921	TAC	2	6	21311	21316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076480
523	NC_021921	CGA	2	6	21424	21429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076480
524	NC_021921	GAC	2	6	21439	21444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076480
525	NC_021921	GAC	2	6	21461	21466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076480
526	NC_021921	CGG	2	6	21514	21519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076480
527	NC_021921	CAGG	2	8	21544	21551	25 %	0 %	50 %	25 %	529076480
528	NC_021921	CGA	2	6	21577	21582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076480
529	NC_021921	ACG	2	6	21615	21620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076480
530	NC_021921	ATC	2	6	21632	21637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076480
531	NC_021921	GGT	2	6	21672	21677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076480
532	NC_021921	TCG	2	6	21714	21719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076480
533	NC_021921	GCC	2	6	21798	21803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076480
534	NC_021921	TCG	2	6	21807	21812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076480
535	NC_021921	GAAC	2	8	21829	21836	50 %	0 %	25 %	25 %	529076480
536	NC_021921	AC	3	6	21835	21840	50 %	0 %	0 %	50 %	529076480
537	NC_021921	GCT	2	6	21847	21852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076480
538	NC_021921	TGGG	2	8	21904	21911	0 %	25 %	75 %	0 %	529076480
539	NC_021921	CCT	2	6	21913	21918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076480
540	NC_021921	TTC	2	6	22591	22596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076481
541	NC_021921	CCG	3	9	22598	22606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076481
542	NC_021921	CGT	2	6	22620	22625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076481
543	NC_021921	CGT	2	6	22641	22646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076481
544	NC_021921	CCG	2	6	22655	22660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076481
545	NC_021921	GGT	2	6	22671	22676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076481
546	NC_021921	GTC	2	6	22681	22686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076481
547	NC_021921	TCG	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076481
548	NC_021921	GT	3	6	22768	22773	0 %	50 %	50 %	0 %	529076481
549	NC_021921	GAA	2	6	22777	22782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076481
550	NC_021921	CAT	2	6	22831	22836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076481
551	NC_021921	TCG	2	6	22944	22949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076481
552	NC_021921	GAA	2	6	22954	22959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076481
553	NC_021921	GGC	2	6	22974	22979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076481
554	NC_021921	CTC	2	6	22993	22998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076481
555	NC_021921	CCA	2	6	23049	23054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076481
556	NC_021921	ACC	2	6	23063	23068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076481
557	NC_021921	GCC	2	6	23090	23095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076481
558	NC_021921	CTTG	2	8	23109	23116	0 %	50 %	25 %	25 %	529076481
559	NC_021921	CCG	2	6	23317	23322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076482
560	NC_021921	ATC	2	6	23364	23369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076482
561	NC_021921	CGA	2	6	23372	23377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076482
562	NC_021921	TCA	2	6	23404	23409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076482
563	NC_021921	GAA	2	6	23436	23441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076482
564	NC_021921	GAG	3	9	23457	23465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076482
565	NC_021921	CGTC	2	8	23512	23519	0 %	25 %	25 %	50 %	529076482
566	NC_021921	CGT	2	6	23534	23539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076482
567	NC_021921	CGG	2	6	23591	23596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076482
568	NC_021921	CGA	2	6	23602	23607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076482
569	NC_021921	ACT	2	6	23644	23649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076482
570	NC_021921	TCG	2	6	23713	23718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076482
571	NC_021921	GCT	2	6	23726	23731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076482
572	NC_021921	GGT	2	6	23800	23805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076482
573	NC_021921	ATC	2	6	23838	23843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076482
574	NC_021921	GCG	2	6	23887	23892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076482
575	NC_021921	CGA	3	9	23909	23917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076482
576	NC_021921	CGC	2	6	23972	23977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076482
577	NC_021921	CGG	2	6	24022	24027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076482
578	NC_021921	TCG	3	9	24046	24054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076482
579	NC_021921	AGA	2	6	24077	24082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076482
580	NC_021921	ACG	2	6	24115	24120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076482
581	NC_021921	CGA	2	6	24128	24133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076482
582	NC_021921	CGT	2	6	24176	24181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076482
583	NC_021921	CGC	2	6	24182	24187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076482
584	NC_021921	CGA	2	6	24203	24208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076482
585	NC_021921	AC	3	6	24249	24254	50 %	0 %	0 %	50 %	529076482
586	NC_021921	CGA	2	6	24286	24291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076482
587	NC_021921	CGA	3	9	24296	24304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076482
588	NC_021921	GGC	3	9	24334	24342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076482
589	NC_021921	CGG	2	6	24368	24373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076482
590	NC_021921	ATC	2	6	24417	24422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076482
591	NC_021921	CTC	2	6	24459	24464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076482
592	NC_021921	CGCCA	2	10	24543	24552	20 %	0 %	20 %	60 %	529076483
593	NC_021921	GACGCC	2	12	24568	24579	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529076483
594	NC_021921	GA	3	6	24584	24589	50 %	0 %	50 %	0 %	529076483
595	NC_021921	GCA	2	6	24618	24623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076483
596	NC_021921	CGT	2	6	24705	24710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076483
597	NC_021921	TCT	2	6	24749	24754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076483
598	NC_021921	TACGTC	2	12	24817	24828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	529076483
599	NC_021921	CGA	2	6	24834	24839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076483
600	NC_021921	GCC	2	6	24853	24858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076483
601	NC_021921	CGG	3	9	24941	24949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076483
602	NC_021921	CG	3	6	24962	24967	0 %	0 %	50 %	50 %	529076483
603	NC_021921	CGA	2	6	25083	25088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076484
604	NC_021921	CGT	2	6	25147	25152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076484
605	NC_021921	GCG	2	6	25169	25174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076484
606	NC_021921	TCG	2	6	25232	25237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076484
607	NC_021921	CT	3	6	25241	25246	0 %	50 %	0 %	50 %	529076484
608	NC_021921	CGA	2	6	25275	25280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076484
609	NC_021921	CCTCA	2	10	25291	25300	20 %	20 %	0 %	60 %	529076484
610	NC_021921	GGA	2	6	25314	25319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076484
611	NC_021921	CGA	2	6	25326	25331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076484
612	NC_021921	GAC	2	6	25354	25359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076484
613	NC_021921	TGT	2	6	25379	25384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529076484
614	NC_021921	GTG	2	6	25423	25428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076484
615	NC_021921	TCG	3	9	25433	25441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076484
616	NC_021921	GAG	2	6	25498	25503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076484
617	NC_021921	TCG	2	6	25532	25537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076484
618	NC_021921	AC	3	6	25577	25582	50 %	0 %	0 %	50 %	529076484
619	NC_021921	GTC	2	6	25632	25637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076485
620	NC_021921	GT	3	6	25646	25651	0 %	50 %	50 %	0 %	529076485
621	NC_021921	CGGC	2	8	25656	25663	0 %	0 %	50 %	50 %	529076485
622	NC_021921	TG	3	6	25676	25681	0 %	50 %	50 %	0 %	529076485
623	NC_021921	TGC	2	6	25779	25784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076486
624	NC_021921	CGA	2	6	25834	25839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076486
625	NC_021921	CG	3	6	25849	25854	0 %	0 %	50 %	50 %	529076486
626	NC_021921	ACG	2	6	25863	25868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076486
627	NC_021921	ACG	2	6	25881	25886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076486
628	NC_021921	CGA	2	6	25987	25992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076486
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746	NC_021921	TCGACG	2	12	30302	30313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529076488
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750	NC_021921	CGC	2	6	30468	30473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076488
751	NC_021921	CTC	2	6	30555	30560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076488
752	NC_021921	CGA	2	6	30642	30647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076488
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999	NC_021921	GTCG	2	8	40117	40124	0 %	25 %	50 %	25 %	529076500
1000	NC_021921	CGC	2	6	40127	40132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076500

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