MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_021521	CCAT	2	8	2229229	2229236	25 %	25 %	0 %	50 %	514060878
34503	NC_021521	TTG	2	6	2229288	2229293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060878
34504	NC_021521	TAAA	2	8	2229294	2229301	75 %	25 %	0 %	0 %	514060878
34505	NC_021521	TAA	2	6	2229345	2229350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060878
34506	NC_021521	TTG	2	6	2229362	2229367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060878
34507	NC_021521	TTC	2	6	2229378	2229383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060878
34508	NC_021521	TAT	2	6	2229464	2229469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060878
34509	NC_021521	AAT	2	6	2229486	2229491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060878
34510	NC_021521	AATC	2	8	2229512	2229519	50 %	25 %	0 %	25 %	514060878
34511	NC_021521	ATAG	2	8	2229683	2229690	50 %	25 %	25 %	0 %	514060878
34512	NC_021521	TA	3	6	2229746	2229751	50 %	50 %	0 %	0 %	514060878
34513	NC_021521	TTG	2	6	2229789	2229794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060878
34514	NC_021521	ATG	2	6	2229817	2229822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060878
34515	NC_021521	CTTT	2	8	2229943	2229950	0 %	75 %	0 %	25 %	514060878
34516	NC_021521	ATC	2	6	2230003	2230008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060878
34517	NC_021521	T	6	6	2230104	2230109	0 %	100 %	0 %	0 %	514060878
34518	NC_021521	T	6	6	2230412	2230417	0 %	100 %	0 %	0 %	514060878
34519	NC_021521	TCC	2	6	2230421	2230426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060879
34520	NC_021521	TCT	2	6	2230452	2230457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060879
34521	NC_021521	TAT	2	6	2230486	2230491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060879
34522	NC_021521	T	6	6	2230491	2230496	0 %	100 %	0 %	0 %	514060879
34523	NC_021521	AATT	2	8	2230528	2230535	50 %	50 %	0 %	0 %	514060879
34524	NC_021521	TA	3	6	2230549	2230554	50 %	50 %	0 %	0 %	514060879
34525	NC_021521	A	6	6	2230554	2230559	100 %	0 %	0 %	0 %	514060879
34526	NC_021521	ATA	2	6	2230651	2230656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060879
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34530	NC_021521	TAA	2	6	2231061	2231066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060880
34531	NC_021521	AGAT	2	8	2231087	2231094	50 %	25 %	25 %	0 %	514060880
34532	NC_021521	GGT	2	6	2231100	2231105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060880
34533	NC_021521	TAG	2	6	2231135	2231140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060880
34534	NC_021521	ATA	2	6	2231191	2231196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060880
34535	NC_021521	TAA	2	6	2231235	2231240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060880
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34539	NC_021521	ACG	2	6	2231290	2231295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060880
34540	NC_021521	GTA	2	6	2231298	2231303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060880
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34543	NC_021521	TAG	2	6	2231343	2231348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060880
34544	NC_021521	TAA	2	6	2231355	2231360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060880
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34546	NC_021521	CAT	2	6	2231486	2231491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060880
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34549	NC_021521	T	6	6	2231757	2231762	0 %	100 %	0 %	0 %	514060880
34550	NC_021521	TGT	2	6	2231801	2231806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060881
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34552	NC_021521	TTGC	2	8	2231822	2231829	0 %	50 %	25 %	25 %	514060881
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34555	NC_021521	TGC	2	6	2231937	2231942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060881
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34559	NC_021521	TGG	2	6	2232063	2232068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060881
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34561	NC_021521	CTG	2	6	2232104	2232109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060881
34562	NC_021521	TAA	2	6	2232156	2232161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060881
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34564	NC_021521	TTTA	2	8	2232186	2232193	25 %	75 %	0 %	0 %	514060881
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34584	NC_021521	GTC	2	6	2233063	2233068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060882
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34589	NC_021521	CAT	2	6	2233257	2233262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060882
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34598	NC_021521	AT	3	6	2233975	2233980	50 %	50 %	0 %	0 %	514060883
34599	NC_021521	TCC	2	6	2233992	2233997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060883
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34601	NC_021521	TTC	2	6	2234034	2234039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060883
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34603	NC_021521	TAG	2	6	2234102	2234107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060883
34604	NC_021521	CTA	2	6	2234216	2234221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060883
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34606	NC_021521	A	6	6	2234297	2234302	100 %	0 %	0 %	0 %	514060883
34607	NC_021521	TA	3	6	2234411	2234416	50 %	50 %	0 %	0 %	514060883
34608	NC_021521	TGT	3	9	2234448	2234456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060883
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34611	NC_021521	TTG	2	6	2234578	2234583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060883
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34617	NC_021521	T	8	8	2234852	2234859	0 %	100 %	0 %	0 %	514060883
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34736	NC_021521	AAG	2	6	2241421	2241426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060890
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34740	NC_021521	GCA	2	6	2241675	2241680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060890
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34851	NC_021521	CAAC	2	8	2249146	2249153	50 %	0 %	0 %	50 %	514060898
34852	NC_021521	CCA	2	6	2249164	2249169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060898
34853	NC_021521	CAC	2	6	2249195	2249200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060898
34854	NC_021521	CCAA	2	8	2249214	2249221	50 %	0 %	0 %	50 %	514060898
34855	NC_021521	CGG	2	6	2249241	2249246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060898
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34862	NC_021521	TTA	2	6	2249624	2249629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060899
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34886	NC_021521	T	6	6	2251509	2251514	0 %	100 %	0 %	0 %	514060900
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34954	NC_021521	CCA	2	6	2255305	2255310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060902
34955	NC_021521	A	6	6	2255318	2255323	100 %	0 %	0 %	0 %	514060902
34956	NC_021521	CGA	2	6	2255330	2255335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060902
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34963	NC_021521	CAT	2	6	2255613	2255618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060903
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34965	NC_021521	CAA	2	6	2255657	2255662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060903
34966	NC_021521	GTA	2	6	2255675	2255680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060903
34967	NC_021521	GCAA	2	8	2255725	2255732	50 %	0 %	25 %	25 %	514060903
34968	NC_021521	ACGGC	2	10	2255762	2255771	20 %	0 %	40 %	40 %	514060903
34969	NC_021521	ATAA	2	8	2255821	2255828	75 %	25 %	0 %	0 %	514060903
34970	NC_021521	ATC	3	9	2255908	2255916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060903
34971	NC_021521	GTC	2	6	2256005	2256010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060903
34972	NC_021521	T	6	6	2256012	2256017	0 %	100 %	0 %	0 %	514060903
34973	NC_021521	TCA	2	6	2256031	2256036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060903
34974	NC_021521	TTGG	2	8	2256065	2256072	0 %	50 %	50 %	0 %	514060903
34975	NC_021521	CAG	2	6	2256083	2256088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060903
34976	NC_021521	CCA	2	6	2256120	2256125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060903
34977	NC_021521	GTA	2	6	2256192	2256197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060903
34978	NC_021521	GCC	2	6	2256235	2256240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060903
34979	NC_021521	CAA	2	6	2256348	2256353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060903
34980	NC_021521	TAG	2	6	2256480	2256485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060903
34981	NC_021521	TCA	2	6	2256494	2256499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060903
34982	NC_021521	AATAA	2	10	2256523	2256532	80 %	20 %	0 %	0 %	514060903
34983	NC_021521	CAA	2	6	2256610	2256615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060903
34984	NC_021521	GTAA	2	8	2256677	2256684	50 %	25 %	25 %	0 %	514060903
34985	NC_021521	T	6	6	2256693	2256698	0 %	100 %	0 %	0 %	514060903
34986	NC_021521	TTGG	2	8	2256789	2256796	0 %	50 %	50 %	0 %	514060904
34987	NC_021521	GCA	2	6	2256888	2256893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060904
34988	NC_021521	CAA	2	6	2256904	2256909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060904
34989	NC_021521	TCA	2	6	2257062	2257067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060904
34990	NC_021521	TTC	2	6	2257112	2257117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060904
34991	NC_021521	TTC	2	6	2257149	2257154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060904
34992	NC_021521	ACC	2	6	2257209	2257214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060904
34993	NC_021521	CCAA	2	8	2257218	2257225	50 %	0 %	0 %	50 %	514060904
34994	NC_021521	CATC	2	8	2257283	2257290	25 %	25 %	0 %	50 %	514060904
34995	NC_021521	TTC	2	6	2257295	2257300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060905
34996	NC_021521	AAT	2	6	2257320	2257325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060905
34997	NC_021521	TTTA	2	8	2257373	2257380	25 %	75 %	0 %	0 %	514060905
34998	NC_021521	CAC	2	6	2257382	2257387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060905
34999	NC_021521	TGT	2	6	2257401	2257406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060905
35000	NC_021521	ATCA	2	8	2257697	2257704	50 %	25 %	0 %	25 %	514060905

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