MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_021521	ACCA	2	8	2168509	2168516	50 %	0 %	0 %	50 %	514060817
33502	NC_021521	CTAC	2	8	2168645	2168652	25 %	25 %	0 %	50 %	514060817
33503	NC_021521	GA	3	6	2168664	2168669	50 %	0 %	50 %	0 %	514060817
33504	NC_021521	ATC	2	6	2168689	2168694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
33505	NC_021521	GTTT	2	8	2168715	2168722	0 %	75 %	25 %	0 %	514060817
33506	NC_021521	AGG	2	6	2168785	2168790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514060817
33507	NC_021521	TCA	2	6	2168849	2168854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
33508	NC_021521	GCC	2	6	2168948	2168953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060817
33509	NC_021521	TCA	2	6	2168981	2168986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
33510	NC_021521	CAA	2	6	2169106	2169111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060817
33511	NC_021521	TAA	2	6	2169127	2169132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060817
33512	NC_021521	TAT	2	6	2169150	2169155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060817
33513	NC_021521	CCA	2	6	2169236	2169241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060817
33514	NC_021521	ACA	2	6	2169242	2169247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060817
33515	NC_021521	CTT	2	6	2169258	2169263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060817
33516	NC_021521	ATT	3	9	2169268	2169276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060817
33517	NC_021521	CAT	2	6	2169298	2169303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
33518	NC_021521	TGCT	2	8	2169322	2169329	0 %	50 %	25 %	25 %	514060817
33519	NC_021521	CTA	2	6	2169438	2169443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
33520	NC_021521	TCA	2	6	2169458	2169463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
33521	NC_021521	T	6	6	2169486	2169491	0 %	100 %	0 %	0 %	514060817
33522	NC_021521	CTG	2	6	2169492	2169497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060817
33523	NC_021521	TGA	2	6	2169536	2169541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060817
33524	NC_021521	CAT	2	6	2169579	2169584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
33525	NC_021521	CCA	2	6	2169645	2169650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060817
33526	NC_021521	ATA	2	6	2169653	2169658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060817
33527	NC_021521	CTTTTT	2	12	2169664	2169675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	514060817
33528	NC_021521	CCG	2	6	2169722	2169727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060817
33529	NC_021521	AACGAT	2	12	2169730	2169741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514060817
33530	NC_021521	T	6	6	2170094	2170099	0 %	100 %	0 %	0 %	514060818
33531	NC_021521	G	6	6	2170121	2170126	0 %	0 %	100 %	0 %	514060818
33532	NC_021521	TGG	2	6	2170233	2170238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060818
33533	NC_021521	GGT	2	6	2170248	2170253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060818
33534	NC_021521	TCA	2	6	2170298	2170303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060818
33535	NC_021521	TAA	2	6	2170307	2170312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060818
33536	NC_021521	TTG	2	6	2170330	2170335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060818
33537	NC_021521	T	6	6	2170344	2170349	0 %	100 %	0 %	0 %	514060818
33538	NC_021521	CTT	2	6	2170362	2170367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060818
33539	NC_021521	A	6	6	2170398	2170403	100 %	0 %	0 %	0 %	514060818
33540	NC_021521	TAA	2	6	2170444	2170449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060818
33541	NC_021521	TA	3	6	2170465	2170470	50 %	50 %	0 %	0 %	514060818
33542	NC_021521	TGG	2	6	2170518	2170523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060818
33543	NC_021521	T	6	6	2170577	2170582	0 %	100 %	0 %	0 %	514060818
33544	NC_021521	CAA	2	6	2170666	2170671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060818
33545	NC_021521	CCA	2	6	2170676	2170681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060818
33546	NC_021521	T	7	7	2170705	2170711	0 %	100 %	0 %	0 %	514060818
33547	NC_021521	CCA	2	6	2170752	2170757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060818
33548	NC_021521	GAA	2	6	2170804	2170809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060818
33549	NC_021521	T	6	6	2170933	2170938	0 %	100 %	0 %	0 %	514060819
33550	NC_021521	TGCCG	2	10	2170969	2170978	0 %	20 %	40 %	40 %	514060819
33551	NC_021521	TCA	2	6	2170987	2170992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060819
33552	NC_021521	CAC	2	6	2171070	2171075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060819
33553	NC_021521	A	6	6	2171133	2171138	100 %	0 %	0 %	0 %	514060819
33554	NC_021521	AC	3	6	2171147	2171152	50 %	0 %	0 %	50 %	514060819
33555	NC_021521	A	6	6	2171182	2171187	100 %	0 %	0 %	0 %	514060819
33556	NC_021521	CAT	2	6	2171210	2171215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060819
33557	NC_021521	ATG	2	6	2171307	2171312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060819
33558	NC_021521	ATA	2	6	2171353	2171358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060819
33559	NC_021521	AACGC	2	10	2171483	2171492	40 %	0 %	20 %	40 %	514060819
33560	NC_021521	TAA	2	6	2171528	2171533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060819
33561	NC_021521	T	6	6	2171537	2171542	0 %	100 %	0 %	0 %	514060819
33562	NC_021521	GAT	2	6	2171609	2171614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060819
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33564	NC_021521	AATC	2	8	2171856	2171863	50 %	25 %	0 %	25 %	514060820
33565	NC_021521	GGT	2	6	2171884	2171889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060820
33566	NC_021521	AAT	2	6	2171997	2172002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060820
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33568	NC_021521	AAAGGC	2	12	2172177	2172188	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	514060820
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33570	NC_021521	GTC	2	6	2172208	2172213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060820
33571	NC_021521	AAT	2	6	2172225	2172230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060820
33572	NC_021521	ATT	2	6	2172351	2172356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060820
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33574	NC_021521	TAAA	2	8	2172428	2172435	75 %	25 %	0 %	0 %	514060820
33575	NC_021521	ATT	2	6	2172530	2172535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060821
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33577	NC_021521	CCA	2	6	2172554	2172559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060821
33578	NC_021521	ATT	2	6	2172612	2172617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060821
33579	NC_021521	CAC	2	6	2172618	2172623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060821
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33582	NC_021521	CCCAG	2	10	2172769	2172778	20 %	0 %	20 %	60 %	514060821
33583	NC_021521	T	7	7	2172912	2172918	0 %	100 %	0 %	0 %	514060821
33584	NC_021521	TTTA	2	8	2172930	2172937	25 %	75 %	0 %	0 %	514060821
33585	NC_021521	TAA	2	6	2172978	2172983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060821
33586	NC_021521	TAA	3	9	2173017	2173025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060821
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33588	NC_021521	CCG	2	6	2173094	2173099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060821
33589	NC_021521	CA	3	6	2173223	2173228	50 %	0 %	0 %	50 %	514060822
33590	NC_021521	CAA	2	6	2173238	2173243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060822
33591	NC_021521	ACGCC	2	10	2173252	2173261	20 %	0 %	20 %	60 %	514060822
33592	NC_021521	ATA	2	6	2173277	2173282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060822
33593	NC_021521	AAAT	2	8	2173290	2173297	75 %	25 %	0 %	0 %	514060822
33594	NC_021521	CAA	2	6	2173298	2173303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060822
33595	NC_021521	CAT	2	6	2173388	2173393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060822
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33599	NC_021521	CCG	2	6	2173572	2173577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060822
33600	NC_021521	GAC	2	6	2173677	2173682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060822
33601	NC_021521	TGA	2	6	2173707	2173712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060822
33602	NC_021521	CCGT	2	8	2173722	2173729	0 %	25 %	25 %	50 %	514060822
33603	NC_021521	TAA	2	6	2173784	2173789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060822
33604	NC_021521	AGG	2	6	2173796	2173801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514060822
33605	NC_021521	CAA	3	9	2173835	2173843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060822
33606	NC_021521	TAAA	2	8	2173867	2173874	75 %	25 %	0 %	0 %	514060822
33607	NC_021521	CAA	2	6	2173910	2173915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060822
33608	NC_021521	CAATCA	2	12	2173930	2173941	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	514060822
33609	NC_021521	ACC	2	6	2174064	2174069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060822
33610	NC_021521	GCCAA	2	10	2174070	2174079	40 %	0 %	20 %	40 %	514060822
33611	NC_021521	TGAA	2	8	2174094	2174101	50 %	25 %	25 %	0 %	514060822
33612	NC_021521	A	7	7	2174114	2174120	100 %	0 %	0 %	0 %	514060822
33613	NC_021521	CAAC	2	8	2174131	2174138	50 %	0 %	0 %	50 %	514060822
33614	NC_021521	GTT	2	6	2174186	2174191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060822
33615	NC_021521	G	6	6	2174203	2174208	0 %	0 %	100 %	0 %	514060822
33616	NC_021521	CGT	2	6	2174315	2174320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060823
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33618	NC_021521	CAA	2	6	2174389	2174394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060823
33619	NC_021521	CTT	2	6	2174413	2174418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060823
33620	NC_021521	CCA	2	6	2174466	2174471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060823
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33720	NC_021521	AAG	2	6	2180580	2180585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060829
33721	NC_021521	TGAA	2	8	2180727	2180734	50 %	25 %	25 %	0 %	514060829
33722	NC_021521	TCG	2	6	2180913	2180918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060830
33723	NC_021521	CT	3	6	2180951	2180956	0 %	50 %	0 %	50 %	514060830
33724	NC_021521	CCAT	2	8	2181003	2181010	25 %	25 %	0 %	50 %	514060830
33725	NC_021521	TCA	2	6	2181013	2181018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060830
33726	NC_021521	TCGA	2	8	2181111	2181118	25 %	25 %	25 %	25 %	514060830
33727	NC_021521	TCG	2	6	2181166	2181171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060830
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33730	NC_021521	T	7	7	2181233	2181239	0 %	100 %	0 %	0 %	514060830
33731	NC_021521	GCG	2	6	2181259	2181264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060830
33732	NC_021521	GAA	2	6	2181354	2181359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060830
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33734	NC_021521	AAC	3	9	2182364	2182372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060831
33735	NC_021521	A	6	6	2182428	2182433	100 %	0 %	0 %	0 %	514060831
33736	NC_021521	TC	3	6	2182453	2182458	0 %	50 %	0 %	50 %	514060831
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33738	NC_021521	GT	3	6	2182528	2182533	0 %	50 %	50 %	0 %	514060832
33739	NC_021521	TAT	2	6	2182545	2182550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060832
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33741	NC_021521	GTC	2	6	2182627	2182632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060832
33742	NC_021521	ATT	2	6	2182727	2182732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060832
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33748	NC_021521	CGG	2	6	2183100	2183105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060832
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33773	NC_021521	T	7	7	2184640	2184646	0 %	100 %	0 %	0 %	514060834
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33835	NC_021521	AAT	2	6	2188147	2188152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060835
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33842	NC_021521	TTC	2	6	2188675	2188680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060835
33843	NC_021521	T	6	6	2188713	2188718	0 %	100 %	0 %	0 %	514060835
33844	NC_021521	CAT	2	6	2188878	2188883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060835
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33847	NC_021521	TTTGG	2	10	2189125	2189134	0 %	60 %	40 %	0 %	514060835
33848	NC_021521	GTT	2	6	2189157	2189162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060835
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33851	NC_021521	AAT	2	6	2189368	2189373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060835
33852	NC_021521	T	6	6	2189383	2189388	0 %	100 %	0 %	0 %	514060835
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33953	NC_021521	GCTTGG	2	12	2195535	2195546	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	514060844
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