MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_021521	CAT	2	6	2137905	2137910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060788
33002	NC_021521	GTT	2	6	2137979	2137984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060788
33003	NC_021521	CCA	2	6	2138093	2138098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060788
33004	NC_021521	GCA	2	6	2138198	2138203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060788
33005	NC_021521	GTT	2	6	2138458	2138463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060789
33006	NC_021521	A	7	7	2138502	2138508	100 %	0 %	0 %	0 %	514060789
33007	NC_021521	T	6	6	2138557	2138562	0 %	100 %	0 %	0 %	514060789
33008	NC_021521	TTA	2	6	2138614	2138619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060790
33009	NC_021521	T	6	6	2138652	2138657	0 %	100 %	0 %	0 %	514060790
33010	NC_021521	CTT	2	6	2138719	2138724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060790
33011	NC_021521	TGGCT	2	10	2138731	2138740	0 %	40 %	40 %	20 %	514060790
33012	NC_021521	ATA	2	6	2138768	2138773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060790
33013	NC_021521	GAA	2	6	2138811	2138816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060790
33014	NC_021521	GCG	2	6	2138837	2138842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060790
33015	NC_021521	CCA	2	6	2138845	2138850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060790
33016	NC_021521	GTG	2	6	2138886	2138891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060790
33017	NC_021521	TGT	2	6	2138910	2138915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060790
33018	NC_021521	A	6	6	2138936	2138941	100 %	0 %	0 %	0 %	514060790
33019	NC_021521	ATT	2	6	2138966	2138971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060790
33020	NC_021521	CCA	2	6	2139130	2139135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060790
33021	NC_021521	CGC	2	6	2139145	2139150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060790
33022	NC_021521	T	6	6	2139152	2139157	0 %	100 %	0 %	0 %	514060790
33023	NC_021521	TGTT	2	8	2139215	2139222	0 %	75 %	25 %	0 %	514060790
33024	NC_021521	T	6	6	2139226	2139231	0 %	100 %	0 %	0 %	514060790
33025	NC_021521	TAA	2	6	2139307	2139312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060791
33026	NC_021521	TGA	2	6	2139407	2139412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060791
33027	NC_021521	ACGCA	2	10	2139516	2139525	40 %	0 %	20 %	40 %	514060791
33028	NC_021521	CTG	2	6	2139625	2139630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060791
33029	NC_021521	CCG	2	6	2139676	2139681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060791
33030	NC_021521	TGC	2	6	2139694	2139699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060791
33031	NC_021521	ACA	2	6	2139710	2139715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060791
33032	NC_021521	TTA	2	6	2139765	2139770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060791
33033	NC_021521	AC	3	6	2139782	2139787	50 %	0 %	0 %	50 %	514060791
33034	NC_021521	TGC	2	6	2139815	2139820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060791
33035	NC_021521	AAG	2	6	2139832	2139837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060791
33036	NC_021521	ACC	2	6	2139838	2139843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060791
33037	NC_021521	AAC	2	6	2139880	2139885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060791
33038	NC_021521	AAC	2	6	2139922	2139927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060791
33039	NC_021521	A	8	8	2139940	2139947	100 %	0 %	0 %	0 %	514060791
33040	NC_021521	CTGC	2	8	2139981	2139988	0 %	25 %	25 %	50 %	514060791
33041	NC_021521	CAAC	2	8	2140001	2140008	50 %	0 %	0 %	50 %	514060791
33042	NC_021521	AAT	2	6	2140264	2140269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060792
33043	NC_021521	ACA	2	6	2140294	2140299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060792
33044	NC_021521	AATA	2	8	2140479	2140486	75 %	25 %	0 %	0 %	514060792
33045	NC_021521	T	6	6	2140524	2140529	0 %	100 %	0 %	0 %	514060793
33046	NC_021521	CCA	2	6	2140596	2140601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060793
33047	NC_021521	GCTG	2	8	2140629	2140636	0 %	25 %	50 %	25 %	514060793
33048	NC_021521	CTA	2	6	2140650	2140655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060793
33049	NC_021521	ACC	2	6	2140744	2140749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060793
33050	NC_021521	AT	3	6	2140790	2140795	50 %	50 %	0 %	0 %	514060793
33051	NC_021521	TGA	2	6	2140900	2140905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060793
33052	NC_021521	TAAAAG	2	12	2140918	2140929	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514060793
33053	NC_021521	T	6	6	2140933	2140938	0 %	100 %	0 %	0 %	514060793
33054	NC_021521	TACCGC	2	12	2141132	2141143	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	514060794
33055	NC_021521	GAT	2	6	2141168	2141173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060794
33056	NC_021521	GAA	2	6	2141196	2141201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060794
33057	NC_021521	T	6	6	2141275	2141280	0 %	100 %	0 %	0 %	514060794
33058	NC_021521	ATG	2	6	2141322	2141327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060794
33059	NC_021521	CAG	2	6	2141331	2141336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060794
33060	NC_021521	GTG	2	6	2141347	2141352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060794
33061	NC_021521	AGCG	2	8	2141481	2141488	25 %	0 %	50 %	25 %	514060794
33062	NC_021521	GATC	2	8	2141489	2141496	25 %	25 %	25 %	25 %	514060794
33063	NC_021521	CCCGA	2	10	2141520	2141529	20 %	0 %	20 %	60 %	514060794
33064	NC_021521	CATT	2	8	2141559	2141566	25 %	50 %	0 %	25 %	514060794
33065	NC_021521	TGG	2	6	2141569	2141574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060794
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33068	NC_021521	ACTGA	2	10	2141808	2141817	40 %	20 %	20 %	20 %	514060794
33069	NC_021521	ACTG	2	8	2141844	2141851	25 %	25 %	25 %	25 %	514060794
33070	NC_021521	T	6	6	2141930	2141935	0 %	100 %	0 %	0 %	514060794
33071	NC_021521	TAA	2	6	2142282	2142287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060795
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33073	NC_021521	GAT	2	6	2142490	2142495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060795
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33090	NC_021521	CT	3	6	2143896	2143901	0 %	50 %	0 %	50 %	514060796
33091	NC_021521	GAA	2	6	2143935	2143940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060796
33092	NC_021521	A	6	6	2143973	2143978	100 %	0 %	0 %	0 %	514060796
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33100	NC_021521	GTG	2	6	2144418	2144423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060796
33101	NC_021521	AAT	2	6	2144460	2144465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060796
33102	NC_021521	TGA	2	6	2144576	2144581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060796
33103	NC_021521	CAA	2	6	2144616	2144621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060796
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33107	NC_021521	TC	3	6	2144834	2144839	0 %	50 %	0 %	50 %	514060796
33108	NC_021521	GCTT	2	8	2144869	2144876	0 %	50 %	25 %	25 %	514060796
33109	NC_021521	ATA	2	6	2144953	2144958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060796
33110	NC_021521	TGG	2	6	2144959	2144964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060796
33111	NC_021521	CAA	2	6	2144982	2144987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060796
33112	NC_021521	CGT	2	6	2145081	2145086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060796
33113	NC_021521	AG	3	6	2145224	2145229	50 %	0 %	50 %	0 %	514060796
33114	NC_021521	AG	3	6	2145233	2145238	50 %	0 %	50 %	0 %	514060796
33115	NC_021521	GTG	2	6	2145249	2145254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060796
33116	NC_021521	AAGC	2	8	2145313	2145320	50 %	0 %	25 %	25 %	514060796
33117	NC_021521	AAGGC	2	10	2145364	2145373	40 %	0 %	40 %	20 %	514060796
33118	NC_021521	CGA	2	6	2145398	2145403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060796
33119	NC_021521	A	6	6	2145408	2145413	100 %	0 %	0 %	0 %	514060796
33120	NC_021521	TGA	2	6	2145512	2145517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060796
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33222	NC_021521	AGT	2	6	2151352	2151357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060803
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33228	NC_021521	ATT	2	6	2151746	2151751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060803
33229	NC_021521	ATC	2	6	2151806	2151811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060803
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33232	NC_021521	TAT	2	6	2152090	2152095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060803
33233	NC_021521	TGAT	2	8	2152149	2152156	25 %	50 %	25 %	0 %	514060803
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33235	NC_021521	AC	3	6	2152494	2152499	50 %	0 %	0 %	50 %	514060803
33236	NC_021521	GT	3	6	2152503	2152508	0 %	50 %	50 %	0 %	514060803
33237	NC_021521	ACGC	2	8	2152515	2152522	25 %	0 %	25 %	50 %	514060803
33238	NC_021521	AACA	2	8	2152543	2152550	75 %	0 %	0 %	25 %	514060803
33239	NC_021521	TGA	3	9	2152638	2152646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060803
33240	NC_021521	GAT	2	6	2152709	2152714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060803
33241	NC_021521	AG	3	6	2152738	2152743	50 %	0 %	50 %	0 %	514060803
33242	NC_021521	T	6	6	2152747	2152752	0 %	100 %	0 %	0 %	514060803
33243	NC_021521	CAA	2	6	2152787	2152792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060803
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33247	NC_021521	A	6	6	2153069	2153074	100 %	0 %	0 %	0 %	514060803
33248	NC_021521	GGC	2	6	2153092	2153097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060803
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33250	NC_021521	GGT	2	6	2153230	2153235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060803
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33255	NC_021521	TGG	2	6	2153531	2153536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060803
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33263	NC_021521	TGA	2	6	2154052	2154057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060803
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33265	NC_021521	GTT	2	6	2154247	2154252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060803
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33270	NC_021521	GAA	2	6	2154476	2154481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060803
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33287	NC_021521	TGA	2	6	2155955	2155960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060804
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33290	NC_021521	GCG	2	6	2156118	2156123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060804
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33327	NC_021521	TAA	2	6	2158288	2158293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060806
33328	NC_021521	GCAGAA	2	12	2158433	2158444	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	514060806
33329	NC_021521	AATT	2	8	2158498	2158505	50 %	50 %	0 %	0 %	514060806
33330	NC_021521	TGC	2	6	2158549	2158554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060806
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33334	NC_021521	TGG	2	6	2158751	2158756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060807
33335	NC_021521	ATT	2	6	2158769	2158774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060807
33336	NC_021521	TAC	2	6	2158782	2158787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060807
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33338	NC_021521	TGG	2	6	2158865	2158870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060807
33339	NC_021521	AAG	2	6	2158896	2158901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060807
33340	NC_021521	CAA	2	6	2158904	2158909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060807
33341	NC_021521	TTGT	2	8	2159081	2159088	0 %	75 %	25 %	0 %	514060807
33342	NC_021521	CCG	2	6	2159288	2159293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060808
33343	NC_021521	TAC	2	6	2159308	2159313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060808
33344	NC_021521	CAT	2	6	2159407	2159412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060808
33345	NC_021521	CAA	2	6	2159489	2159494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060808
33346	NC_021521	GCC	2	6	2159495	2159500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060808
33347	NC_021521	TCA	2	6	2159505	2159510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060808
33348	NC_021521	TGG	2	6	2159572	2159577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060808
33349	NC_021521	GCT	2	6	2159594	2159599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060808
33350	NC_021521	ATA	2	6	2159684	2159689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060808
33351	NC_021521	CCA	2	6	2159690	2159695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060808
33352	NC_021521	CTG	2	6	2159706	2159711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060808
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33453	NC_021521	CAAG	2	8	2165562	2165569	50 %	0 %	25 %	25 %	514060814
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33462	NC_021521	TTC	2	6	2166469	2166474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060815
33463	NC_021521	ATC	2	6	2166599	2166604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
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33465	NC_021521	ATC	3	9	2166686	2166694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
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33467	NC_021521	CCA	2	6	2166774	2166779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060815
33468	NC_021521	CA	3	6	2166813	2166818	50 %	0 %	0 %	50 %	514060815
33469	NC_021521	TTTC	2	8	2166828	2166835	0 %	75 %	0 %	25 %	514060815
33470	NC_021521	GCA	2	6	2166870	2166875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060815
33471	NC_021521	TCA	2	6	2166944	2166949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
33472	NC_021521	GCC	2	6	2166961	2166966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060815
33473	NC_021521	CCA	2	6	2166975	2166980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060815
33474	NC_021521	AAT	2	6	2167057	2167062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060815
33475	NC_021521	TGC	2	6	2167093	2167098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060815
33476	NC_021521	ATC	2	6	2167169	2167174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
33477	NC_021521	CGG	2	6	2167196	2167201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060815
33478	NC_021521	TAA	2	6	2167202	2167207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060815
33479	NC_021521	TCT	2	6	2167208	2167213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060815
33480	NC_021521	TCA	2	6	2167235	2167240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
33481	NC_021521	TGT	2	6	2167256	2167261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060815
33482	NC_021521	TGCG	2	8	2167318	2167325	0 %	25 %	50 %	25 %	514060815
33483	NC_021521	T	6	6	2167348	2167353	0 %	100 %	0 %	0 %	514060815
33484	NC_021521	TCA	2	6	2167361	2167366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
33485	NC_021521	TAA	2	6	2167666	2167671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060816
33486	NC_021521	A	6	6	2167696	2167701	100 %	0 %	0 %	0 %	514060816
33487	NC_021521	TTG	2	6	2167755	2167760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060816
33488	NC_021521	CT	3	6	2167777	2167782	0 %	50 %	0 %	50 %	514060816
33489	NC_021521	CAAT	2	8	2167820	2167827	50 %	25 %	0 %	25 %	514060816
33490	NC_021521	TTA	2	6	2167991	2167996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060816
33491	NC_021521	GCT	2	6	2168018	2168023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060816
33492	NC_021521	ATCA	2	8	2168047	2168054	50 %	25 %	0 %	25 %	514060816
33493	NC_021521	CATAAT	2	12	2168055	2168066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514060816
33494	NC_021521	AAT	2	6	2168076	2168081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060816
33495	NC_021521	ATC	2	6	2168107	2168112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060816
33496	NC_021521	GATT	2	8	2168136	2168143	25 %	50 %	25 %	0 %	514060816
33497	NC_021521	CCAATC	2	12	2168312	2168323	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	514060816
33498	NC_021521	GAC	2	6	2168373	2168378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060816
33499	NC_021521	GTT	2	6	2168394	2168399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060816
33500	NC_021521	A	6	6	2168492	2168497	100 %	0 %	0 %	0 %	514060817

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