MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_021521	AAT	2	6	1981594	1981599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060650
30502	NC_021521	TCT	2	6	1981613	1981618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060650
30503	NC_021521	AAT	2	6	1981626	1981631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060650
30504	NC_021521	ACC	2	6	1981688	1981693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060650
30505	NC_021521	AAT	2	6	1981768	1981773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060650
30506	NC_021521	T	6	6	1981826	1981831	0 %	100 %	0 %	0 %	514060651
30507	NC_021521	ACA	2	6	1981874	1981879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060651
30508	NC_021521	GATC	2	8	1981892	1981899	25 %	25 %	25 %	25 %	514060651
30509	NC_021521	ACT	2	6	1982055	1982060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060651
30510	NC_021521	TCAATA	2	12	1982110	1982121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514060651
30511	NC_021521	GCA	2	6	1982155	1982160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060651
30512	NC_021521	ATT	2	6	1982653	1982658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060652
30513	NC_021521	GC	3	6	1982685	1982690	0 %	0 %	50 %	50 %	514060652
30514	NC_021521	GATC	2	8	1982818	1982825	25 %	25 %	25 %	25 %	514060652
30515	NC_021521	CTC	2	6	1982916	1982921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060652
30516	NC_021521	ATT	2	6	1982991	1982996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060652
30517	NC_021521	CTGGG	2	10	1983013	1983022	0 %	20 %	60 %	20 %	514060652
30518	NC_021521	CGG	2	6	1983030	1983035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060652
30519	NC_021521	TCA	2	6	1983097	1983102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060652
30520	NC_021521	A	6	6	1983179	1983184	100 %	0 %	0 %	0 %	514060652
30521	NC_021521	AGCC	2	8	1983239	1983246	25 %	0 %	25 %	50 %	514060652
30522	NC_021521	TAT	2	6	1983280	1983285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060652
30523	NC_021521	GCTC	2	8	1983336	1983343	0 %	25 %	25 %	50 %	514060652
30524	NC_021521	GA	3	6	1983373	1983378	50 %	0 %	50 %	0 %	514060652
30525	NC_021521	AAG	2	6	1983441	1983446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060652
30526	NC_021521	CAGT	2	8	1983503	1983510	25 %	25 %	25 %	25 %	514060652
30527	NC_021521	A	6	6	1983577	1983582	100 %	0 %	0 %	0 %	514060652
30528	NC_021521	CAA	2	6	1983608	1983613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060652
30529	NC_021521	GTT	2	6	1983715	1983720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060652
30530	NC_021521	G	6	6	1983743	1983748	0 %	0 %	100 %	0 %	514060652
30531	NC_021521	ATA	2	6	1983763	1983768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060652
30532	NC_021521	CATT	2	8	1983820	1983827	25 %	50 %	0 %	25 %	514060653
30533	NC_021521	ATT	2	6	1983924	1983929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060653
30534	NC_021521	TCC	2	6	1983983	1983988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060653
30535	NC_021521	AAC	2	6	1984108	1984113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060653
30536	NC_021521	CTG	2	6	1984120	1984125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060653
30537	NC_021521	A	6	6	1984177	1984182	100 %	0 %	0 %	0 %	514060653
30538	NC_021521	CAA	2	6	1984215	1984220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060653
30539	NC_021521	AAAT	2	8	1984252	1984259	75 %	25 %	0 %	0 %	514060653
30540	NC_021521	TATT	2	8	1984294	1984301	25 %	75 %	0 %	0 %	514060653
30541	NC_021521	GGC	2	6	1984328	1984333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060653
30542	NC_021521	A	6	6	1984379	1984384	100 %	0 %	0 %	0 %	514060653
30543	NC_021521	AAG	2	6	1984423	1984428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060653
30544	NC_021521	ATT	2	6	1984431	1984436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060653
30545	NC_021521	GTT	3	9	1984557	1984565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060653
30546	NC_021521	GAT	2	6	1984566	1984571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060653
30547	NC_021521	A	6	6	1984615	1984620	100 %	0 %	0 %	0 %	514060653
30548	NC_021521	GTG	2	6	1984641	1984646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060653
30549	NC_021521	AAT	2	6	1984648	1984653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060653
30550	NC_021521	ACT	2	6	1984678	1984683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060654
30551	NC_021521	CAA	2	6	1984713	1984718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060654
30552	NC_021521	GCA	2	6	1984757	1984762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060654
30553	NC_021521	TG	3	6	1984777	1984782	0 %	50 %	50 %	0 %	514060654
30554	NC_021521	CT	3	6	1984943	1984948	0 %	50 %	0 %	50 %	514060654
30555	NC_021521	AT	3	6	1985140	1985145	50 %	50 %	0 %	0 %	514060654
30556	NC_021521	TTAT	2	8	1985219	1985226	25 %	75 %	0 %	0 %	514060654
30557	NC_021521	TGA	2	6	1985302	1985307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060654
30558	NC_021521	TAC	2	6	1985334	1985339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060654
30559	NC_021521	TTA	2	6	1985372	1985377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060654
30560	NC_021521	AGTG	2	8	1985395	1985402	25 %	25 %	50 %	0 %	514060654
30561	NC_021521	ATC	2	6	1985463	1985468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060654
30562	NC_021521	AAGGT	2	10	1985732	1985741	40 %	20 %	40 %	0 %	514060655
30563	NC_021521	TAT	2	6	1985792	1985797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060655
30564	NC_021521	TAA	2	6	1985838	1985843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060655
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30567	NC_021521	ATC	2	6	1985957	1985962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060655
30568	NC_021521	AGA	2	6	1985991	1985996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060655
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30570	NC_021521	AAC	3	9	1986062	1986070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060655
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30572	NC_021521	GTT	2	6	1986090	1986095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060655
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30574	NC_021521	TGT	2	6	1986229	1986234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060655
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30581	NC_021521	T	6	6	1987244	1987249	0 %	100 %	0 %	0 %	514060656
30582	NC_021521	TATT	2	8	1987269	1987276	25 %	75 %	0 %	0 %	514060656
30583	NC_021521	CTA	2	6	1987287	1987292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060656
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30586	NC_021521	GCA	2	6	1987379	1987384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060656
30587	NC_021521	CTGTTG	2	12	1987395	1987406	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	514060656
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30589	NC_021521	ATG	2	6	1987437	1987442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060656
30590	NC_021521	GTG	2	6	1987557	1987562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060656
30591	NC_021521	CTA	2	6	1987563	1987568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060656
30592	NC_021521	GGT	2	6	1987610	1987615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060656
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30598	NC_021521	ATC	2	6	1987793	1987798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060656
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30601	NC_021521	GCA	2	6	1987884	1987889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060656
30602	NC_021521	GTC	2	6	1988032	1988037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060656
30603	NC_021521	ATA	2	6	1988115	1988120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060656
30604	NC_021521	AC	3	6	1988131	1988136	50 %	0 %	0 %	50 %	514060656
30605	NC_021521	TGG	2	6	1988197	1988202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060656
30606	NC_021521	CAG	2	6	1988397	1988402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060656
30607	NC_021521	GA	3	6	1988475	1988480	50 %	0 %	50 %	0 %	514060656
30608	NC_021521	CAG	2	6	1988712	1988717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060656
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30610	NC_021521	CAG	2	6	1988802	1988807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060656
30611	NC_021521	ACT	2	6	1988885	1988890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060656
30612	NC_021521	CAG	2	6	1988895	1988900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060656
30613	NC_021521	AAT	2	6	1988936	1988941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060656
30614	NC_021521	CAA	2	6	1989018	1989023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060656
30615	NC_021521	AAG	2	6	1989204	1989209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060656
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30968	NC_021521	TAA	2	6	2011162	2011167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060684
30969	NC_021521	TTG	2	6	2011168	2011173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060684
30970	NC_021521	TTG	2	6	2011184	2011189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060684
30971	NC_021521	ATC	2	6	2011263	2011268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060684
30972	NC_021521	TTGCA	2	10	2011281	2011290	20 %	40 %	20 %	20 %	514060684
30973	NC_021521	ATA	2	6	2011317	2011322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060684
30974	NC_021521	TCA	2	6	2011399	2011404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060684
30975	NC_021521	TAA	2	6	2011422	2011427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060684
30976	NC_021521	CAG	2	6	2011433	2011438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060684
30977	NC_021521	TTA	2	6	2011477	2011482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060684
30978	NC_021521	TTAA	2	8	2011519	2011526	50 %	50 %	0 %	0 %	514060684
30979	NC_021521	CAA	2	6	2011558	2011563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060684
30980	NC_021521	CAA	2	6	2011589	2011594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060684
30981	NC_021521	ATG	2	6	2011608	2011613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060684
30982	NC_021521	AGG	2	6	2011632	2011637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514060684
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30988	NC_021521	A	6	6	2012196	2012201	100 %	0 %	0 %	0 %	514060685
30989	NC_021521	TCAA	2	8	2012227	2012234	50 %	25 %	0 %	25 %	514060685
30990	NC_021521	TTTA	2	8	2012303	2012310	25 %	75 %	0 %	0 %	514060685
30991	NC_021521	TGA	2	6	2012339	2012344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060685
30992	NC_021521	GTT	2	6	2012421	2012426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060685
30993	NC_021521	GCA	2	6	2012507	2012512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060685
30994	NC_021521	AAG	2	6	2012668	2012673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060685
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30996	NC_021521	TTA	2	6	2012733	2012738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060685
30997	NC_021521	CAGT	2	8	2012758	2012765	25 %	25 %	25 %	25 %	514060685
30998	NC_021521	AT	3	6	2012792	2012797	50 %	50 %	0 %	0 %	514060685
30999	NC_021521	TGG	2	6	2012840	2012845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060685
31000	NC_021521	ATTA	2	8	2012861	2012868	50 %	50 %	0 %	0 %	514060685

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