MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_021521	ACC	2	6	1822142	1822147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060494
28003	NC_021521	CTG	2	6	1822170	1822175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060494
28004	NC_021521	TTG	2	6	1822188	1822193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060494
28005	NC_021521	TGT	2	6	1822407	1822412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060494
28006	NC_021521	AAC	2	6	1822472	1822477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060494
28007	NC_021521	GTGAT	2	10	1822510	1822519	20 %	40 %	40 %	0 %	514060494
28008	NC_021521	CTT	3	9	1822594	1822602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060494
28009	NC_021521	TAC	2	6	1822684	1822689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060494
28010	NC_021521	T	6	6	1822928	1822933	0 %	100 %	0 %	0 %	514060495
28011	NC_021521	TGT	2	6	1822958	1822963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060495
28012	NC_021521	TTG	2	6	1823056	1823061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060496
28013	NC_021521	TTC	2	6	1823129	1823134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060496
28014	NC_021521	TCGT	2	8	1823178	1823185	0 %	50 %	25 %	25 %	514060496
28015	NC_021521	ACC	2	6	1823213	1823218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060496
28016	NC_021521	GAT	2	6	1823219	1823224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060496
28017	NC_021521	ACA	2	6	1823283	1823288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060496
28018	NC_021521	CCG	2	6	1823467	1823472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060496
28019	NC_021521	TC	3	6	1823519	1823524	0 %	50 %	0 %	50 %	514060496
28020	NC_021521	ACA	2	6	1823541	1823546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060497
28021	NC_021521	T	6	6	1823627	1823632	0 %	100 %	0 %	0 %	514060497
28022	NC_021521	T	6	6	1823840	1823845	0 %	100 %	0 %	0 %	514060497
28023	NC_021521	TAA	2	6	1823892	1823897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060497
28024	NC_021521	TGGC	2	8	1823912	1823919	0 %	25 %	50 %	25 %	514060497
28025	NC_021521	AAT	2	6	1823921	1823926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060497
28026	NC_021521	CCA	2	6	1824069	1824074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060497
28027	NC_021521	CGA	2	6	1824085	1824090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060497
28028	NC_021521	AAT	2	6	1824404	1824409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060497
28029	NC_021521	CAG	2	6	1824578	1824583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060498
28030	NC_021521	ATT	2	6	1824591	1824596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060498
28031	NC_021521	AG	3	6	1824603	1824608	50 %	0 %	50 %	0 %	514060498
28032	NC_021521	CAT	2	6	1824819	1824824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060499
28033	NC_021521	TGAAA	2	10	1824935	1824944	60 %	20 %	20 %	0 %	514060499
28034	NC_021521	AAT	2	6	1824996	1825001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060499
28035	NC_021521	TTG	2	6	1825072	1825077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060499
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28038	NC_021521	TTG	2	6	1825114	1825119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060499
28039	NC_021521	GAAC	2	8	1825121	1825128	50 %	0 %	25 %	25 %	514060499
28040	NC_021521	TCA	2	6	1825133	1825138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060499
28041	NC_021521	CAA	2	6	1825145	1825150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060499
28042	NC_021521	CGT	2	6	1826816	1826821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060500
28043	NC_021521	GCT	2	6	1826825	1826830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060500
28044	NC_021521	ATC	2	6	1826840	1826845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060500
28045	NC_021521	AAG	2	6	1826859	1826864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060500
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28047	NC_021521	GTT	2	6	1826909	1826914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060500
28048	NC_021521	AAG	2	6	1826924	1826929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060500
28049	NC_021521	TCG	2	6	1826935	1826940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060500
28050	NC_021521	GGTAA	2	10	1827179	1827188	40 %	20 %	40 %	0 %	514060501
28051	NC_021521	GTT	2	6	1827215	1827220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060501
28052	NC_021521	GAA	2	6	1827289	1827294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060501
28053	NC_021521	AAAC	2	8	1827339	1827346	75 %	0 %	0 %	25 %	514060501
28054	NC_021521	A	6	6	1827383	1827388	100 %	0 %	0 %	0 %	514060501
28055	NC_021521	TTC	2	6	1827395	1827400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060501
28056	NC_021521	TTAA	2	8	1827421	1827428	50 %	50 %	0 %	0 %	514060501
28057	NC_021521	TAC	2	6	1827460	1827465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060502
28058	NC_021521	AGT	2	6	1827474	1827479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060502
28059	NC_021521	ACT	2	6	1827503	1827508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060502
28060	NC_021521	TGGGTG	2	12	1827554	1827565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060502
28061	NC_021521	A	6	6	1827580	1827585	100 %	0 %	0 %	0 %	514060502
28062	NC_021521	GTG	2	6	1827716	1827721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060502
28063	NC_021521	GATT	2	8	1827746	1827753	25 %	50 %	25 %	0 %	514060502
28064	NC_021521	TGA	2	6	1827927	1827932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060502
28065	NC_021521	TTA	2	6	1827946	1827951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060502
28066	NC_021521	AGGT	2	8	1827981	1827988	25 %	25 %	50 %	0 %	514060502
28067	NC_021521	CAAT	2	8	1828002	1828009	50 %	25 %	0 %	25 %	514060503
28068	NC_021521	GAA	2	6	1828065	1828070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060503
28069	NC_021521	ATT	2	6	1828080	1828085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060503
28070	NC_021521	TTC	2	6	1828097	1828102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060503
28071	NC_021521	GCA	2	6	1828119	1828124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060503
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28073	NC_021521	GTC	2	6	1828195	1828200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060503
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28076	NC_021521	GTT	2	6	1828485	1828490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060504
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28080	NC_021521	TGC	2	6	1828676	1828681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060504
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28084	NC_021521	ATT	2	6	1829134	1829139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060505
28085	NC_021521	TAAAGG	2	12	1829214	1829225	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514060505
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28087	NC_021521	GAA	2	6	1829265	1829270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060505
28088	NC_021521	AAAGT	2	10	1829271	1829280	60 %	20 %	20 %	0 %	514060505
28089	NC_021521	CGT	2	6	1829316	1829321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060506
28090	NC_021521	GA	3	6	1829345	1829350	50 %	0 %	50 %	0 %	514060506
28091	NC_021521	AGC	3	9	1829435	1829443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060506
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28096	NC_021521	TAT	2	6	1829746	1829751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060507
28097	NC_021521	GTG	2	6	1829771	1829776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060507
28098	NC_021521	CAG	2	6	1829829	1829834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060507
28099	NC_021521	TCG	2	6	1829860	1829865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060507
28100	NC_021521	ACA	2	6	1829902	1829907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060507
28101	NC_021521	ATC	2	6	1829972	1829977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060507
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28103	NC_021521	GTT	2	6	1830065	1830070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060507
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28110	NC_021521	AT	3	6	1830322	1830327	50 %	50 %	0 %	0 %	514060508
28111	NC_021521	GGA	2	6	1830337	1830342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514060508
28112	NC_021521	ATA	2	6	1830343	1830348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060508
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28116	NC_021521	GGT	2	6	1830504	1830509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060509
28117	NC_021521	CGT	2	6	1830525	1830530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060509
28118	NC_021521	TGT	2	6	1830614	1830619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060509
28119	NC_021521	AGC	2	6	1830638	1830643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060509
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28121	NC_021521	GCT	2	6	1830747	1830752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060509
28122	NC_021521	GCT	2	6	1830759	1830764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060509
28123	NC_021521	GGT	2	6	1830765	1830770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060509
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28220	NC_021521	AGTT	2	8	1835196	1835203	25 %	50 %	25 %	0 %	514060516
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28225	NC_021521	TGG	2	6	1835603	1835608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060517
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28227	NC_021521	ACA	2	6	1835701	1835706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060518
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28229	NC_021521	CAA	2	6	1835755	1835760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060518
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28232	NC_021521	A	6	6	1835779	1835784	100 %	0 %	0 %	0 %	514060518
28233	NC_021521	AGGA	2	8	1835811	1835818	50 %	0 %	50 %	0 %	514060518
28234	NC_021521	ATA	2	6	1835909	1835914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060518
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28348	NC_021521	GTA	2	6	1843342	1843347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060531
28349	NC_021521	ATCA	2	8	1843480	1843487	50 %	25 %	0 %	25 %	514060531
28350	NC_021521	CAC	2	6	1843595	1843600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060532
28351	NC_021521	CTTTT	2	10	1843601	1843610	0 %	80 %	0 %	20 %	514060532
28352	NC_021521	TTC	2	6	1843645	1843650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060532
28353	NC_021521	CGC	2	6	1843757	1843762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060532
28354	NC_021521	CCT	2	6	1843788	1843793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060533
28355	NC_021521	TCA	2	6	1843832	1843837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060533
28356	NC_021521	CATT	2	8	1843844	1843851	25 %	50 %	0 %	25 %	514060533
28357	NC_021521	CAC	2	6	1843867	1843872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060533
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28361	NC_021521	TTAA	2	8	1844066	1844073	50 %	50 %	0 %	0 %	514060533
28362	NC_021521	CCAA	2	8	1844087	1844094	50 %	0 %	0 %	50 %	514060533
28363	NC_021521	CGAG	2	8	1844143	1844150	25 %	0 %	50 %	25 %	514060533
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28365	NC_021521	GTT	2	6	1844245	1844250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060533
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28367	NC_021521	ATTT	2	8	1844604	1844611	25 %	75 %	0 %	0 %	514060533
28368	NC_021521	CTC	2	6	1844777	1844782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060534
28369	NC_021521	CT	3	6	1844827	1844832	0 %	50 %	0 %	50 %	514060534
28370	NC_021521	TGT	2	6	1844896	1844901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060534
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28375	NC_021521	T	7	7	1845170	1845176	0 %	100 %	0 %	0 %	514060534
28376	NC_021521	CAT	2	6	1845177	1845182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060534
28377	NC_021521	T	6	6	1845216	1845221	0 %	100 %	0 %	0 %	514060535
28378	NC_021521	CTC	2	6	1845228	1845233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060535
28379	NC_021521	CT	3	6	1845235	1845240	0 %	50 %	0 %	50 %	514060535
28380	NC_021521	TTA	2	6	1845302	1845307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060535
28381	NC_021521	TAA	2	6	1845332	1845337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060535
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28403	NC_021521	GT	3	6	1846125	1846130	0 %	50 %	50 %	0 %	514060535
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28412	NC_021521	T	6	6	1846710	1846715	0 %	100 %	0 %	0 %	514060535
28413	NC_021521	CAAC	2	8	1846730	1846737	50 %	0 %	0 %	50 %	514060535
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28425	NC_021521	T	6	6	1847196	1847201	0 %	100 %	0 %	0 %	514060536
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28433	NC_021521	GAAAT	2	10	1847716	1847725	60 %	20 %	20 %	0 %	514060537
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28435	NC_021521	CTAC	2	8	1847840	1847847	25 %	25 %	0 %	50 %	514060537
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28438	NC_021521	TCA	2	6	1848102	1848107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060537
28439	NC_021521	CCA	2	6	1848115	1848120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060537
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28441	NC_021521	AAGA	2	8	1848156	1848163	75 %	0 %	25 %	0 %	514060537
28442	NC_021521	ACA	2	6	1848259	1848264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060537
28443	NC_021521	AAG	2	6	1848265	1848270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060537
28444	NC_021521	CAG	2	6	1848292	1848297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060537
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28448	NC_021521	A	6	6	1848502	1848507	100 %	0 %	0 %	0 %	514060538
28449	NC_021521	CAC	2	6	1848520	1848525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060538
28450	NC_021521	T	6	6	1848542	1848547	0 %	100 %	0 %	0 %	514060538
28451	NC_021521	T	7	7	1848557	1848563	0 %	100 %	0 %	0 %	514060538
28452	NC_021521	CTTT	2	8	1848564	1848571	0 %	75 %	0 %	25 %	514060538
28453	NC_021521	TTCGT	2	10	1848631	1848640	0 %	60 %	20 %	20 %	514060539
28454	NC_021521	GGCA	2	8	1848740	1848747	25 %	0 %	50 %	25 %	514060539
28455	NC_021521	T	6	6	1848802	1848807	0 %	100 %	0 %	0 %	514060539
28456	NC_021521	TCG	2	6	1848876	1848881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060539
28457	NC_021521	A	6	6	1848889	1848894	100 %	0 %	0 %	0 %	514060539
28458	NC_021521	GAT	2	6	1848913	1848918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060539
28459	NC_021521	A	7	7	1848960	1848966	100 %	0 %	0 %	0 %	514060539
28460	NC_021521	TGAT	2	8	1849013	1849020	25 %	50 %	25 %	0 %	514060539
28461	NC_021521	CAG	2	6	1849093	1849098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060540
28462	NC_021521	CAT	2	6	1849147	1849152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060540
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28464	NC_021521	ATT	2	6	1849208	1849213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060540
28465	NC_021521	ACGA	2	8	1849226	1849233	50 %	0 %	25 %	25 %	514060540
28466	NC_021521	CAA	2	6	1849261	1849266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060540
28467	NC_021521	ACC	2	6	1849382	1849387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060540
28468	NC_021521	AAT	2	6	1849390	1849395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060540
28469	NC_021521	ACC	2	6	1849421	1849426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060540
28470	NC_021521	GA	3	6	1849481	1849486	50 %	0 %	50 %	0 %	514060540
28471	NC_021521	AGC	2	6	1849496	1849501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060540
28472	NC_021521	GCC	2	6	1849611	1849616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060540
28473	NC_021521	ATTTT	2	10	1849641	1849650	20 %	80 %	0 %	0 %	514060540
28474	NC_021521	T	6	6	1849647	1849652	0 %	100 %	0 %	0 %	514060540
28475	NC_021521	CAC	2	6	1849705	1849710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060540
28476	NC_021521	CTG	2	6	1849861	1849866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060540
28477	NC_021521	TTG	2	6	1849929	1849934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060540
28478	NC_021521	CTATTA	2	12	1849935	1849946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514060540
28479	NC_021521	TTTG	2	8	1850089	1850096	0 %	75 %	25 %	0 %	514060540
28480	NC_021521	TTG	2	6	1850278	1850283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060540
28481	NC_021521	GCA	2	6	1850381	1850386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060541
28482	NC_021521	CAG	2	6	1850433	1850438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060541
28483	NC_021521	TTTCAC	2	12	1850440	1850451	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	514060541
28484	NC_021521	ACC	2	6	1850452	1850457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060541
28485	NC_021521	TGCTG	2	10	1850474	1850483	0 %	40 %	40 %	20 %	514060541
28486	NC_021521	GCT	2	6	1850511	1850516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060541
28487	NC_021521	ACC	2	6	1850548	1850553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060541
28488	NC_021521	ACT	2	6	1850554	1850559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060541
28489	NC_021521	GCT	2	6	1850566	1850571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060541
28490	NC_021521	GTT	2	6	1850618	1850623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060541
28491	NC_021521	CAC	2	6	1850628	1850633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060541
28492	NC_021521	TGA	2	6	1850650	1850655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060541
28493	NC_021521	ACC	2	6	1850689	1850694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060541
28494	NC_021521	TTG	2	6	1850738	1850743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060541
28495	NC_021521	T	6	6	1850753	1850758	0 %	100 %	0 %	0 %	514060541
28496	NC_021521	TCA	2	6	1850777	1850782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060541
28497	NC_021521	TTC	2	6	1850854	1850859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060541
28498	NC_021521	GAA	2	6	1850899	1850904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060541
28499	NC_021521	TTAC	2	8	1850957	1850964	25 %	50 %	0 %	25 %	514060541
28500	NC_021521	TTG	2	6	1851024	1851029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060541

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