MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_021521	CGC	2	6	1654345	1654350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060317
25502	NC_021521	GCCA	2	8	1654360	1654367	25 %	0 %	25 %	50 %	514060317
25503	NC_021521	AAG	2	6	1654466	1654471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060317
25504	NC_021521	CAT	2	6	1654510	1654515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060317
25505	NC_021521	A	6	6	1654575	1654580	100 %	0 %	0 %	0 %	514060317
25506	NC_021521	TTG	2	6	1654627	1654632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060317
25507	NC_021521	A	6	6	1654642	1654647	100 %	0 %	0 %	0 %	514060317
25508	NC_021521	ACG	2	6	1654687	1654692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060317
25509	NC_021521	AGT	3	9	1654697	1654705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060317
25510	NC_021521	CA	3	6	1655029	1655034	50 %	0 %	0 %	50 %	514060318
25511	NC_021521	ATC	2	6	1655040	1655045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060318
25512	NC_021521	CAG	2	6	1655102	1655107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060318
25513	NC_021521	GGT	3	9	1655122	1655130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060318
25514	NC_021521	A	6	6	1655163	1655168	100 %	0 %	0 %	0 %	514060318
25515	NC_021521	CTGT	2	8	1655189	1655196	0 %	50 %	25 %	25 %	514060318
25516	NC_021521	TCA	2	6	1655245	1655250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060318
25517	NC_021521	ATT	2	6	1655255	1655260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060318
25518	NC_021521	ACA	2	6	1655290	1655295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060318
25519	NC_021521	CAAT	2	8	1655322	1655329	50 %	25 %	0 %	25 %	514060318
25520	NC_021521	TTA	2	6	1655333	1655338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060318
25521	NC_021521	A	6	6	1655387	1655392	100 %	0 %	0 %	0 %	514060318
25522	NC_021521	T	6	6	1655546	1655551	0 %	100 %	0 %	0 %	514060318
25523	NC_021521	GAT	2	6	1655552	1655557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060318
25524	NC_021521	CCG	2	6	1655710	1655715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060318
25525	NC_021521	CAG	2	6	1655735	1655740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060318
25526	NC_021521	T	6	6	1655789	1655794	0 %	100 %	0 %	0 %	514060318
25527	NC_021521	GTT	2	6	1655836	1655841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060318
25528	NC_021521	TTTAAC	2	12	1656004	1656015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514060318
25529	NC_021521	CGG	2	6	1656036	1656041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060318
25530	NC_021521	CCAA	2	8	1656090	1656097	50 %	0 %	0 %	50 %	514060318
25531	NC_021521	T	6	6	1656115	1656120	0 %	100 %	0 %	0 %	514060318
25532	NC_021521	CAG	2	6	1656128	1656133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060318
25533	NC_021521	TAT	2	6	1656295	1656300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060318
25534	NC_021521	CTGAA	2	10	1656429	1656438	40 %	20 %	20 %	20 %	514060318
25535	NC_021521	GTG	2	6	1656452	1656457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060318
25536	NC_021521	GGC	2	6	1656485	1656490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060318
25537	NC_021521	ACC	2	6	1656494	1656499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060318
25538	NC_021521	GGC	2	6	1656509	1656514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060318
25539	NC_021521	GCTTC	2	10	1656575	1656584	0 %	40 %	20 %	40 %	514060318
25540	NC_021521	GCG	2	6	1656674	1656679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060318
25541	NC_021521	GGC	2	6	1656697	1656702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060318
25542	NC_021521	GAA	2	6	1656803	1656808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060318
25543	NC_021521	GT	3	6	1656881	1656886	0 %	50 %	50 %	0 %	514060318
25544	NC_021521	GCGA	2	8	1656922	1656929	25 %	0 %	50 %	25 %	514060318
25545	NC_021521	CTT	2	6	1656931	1656936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060318
25546	NC_021521	CAA	2	6	1656975	1656980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060318
25547	NC_021521	CAA	2	6	1656992	1656997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060318
25548	NC_021521	ATT	2	6	1657141	1657146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060318
25549	NC_021521	AAG	2	6	1657149	1657154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060318
25550	NC_021521	GAA	2	6	1657193	1657198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060318
25551	NC_021521	CCG	2	6	1657340	1657345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060318
25552	NC_021521	ATCA	2	8	1657357	1657364	50 %	25 %	0 %	25 %	514060318
25553	NC_021521	GAT	2	6	1657385	1657390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060318
25554	NC_021521	AAG	2	6	1657401	1657406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060318
25555	NC_021521	TAT	2	6	1657442	1657447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060318
25556	NC_021521	ATT	2	6	1657613	1657618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060318
25557	NC_021521	ATT	3	9	1657652	1657660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060318
25558	NC_021521	GAGC	2	8	1657661	1657668	25 %	0 %	50 %	25 %	514060318
25559	NC_021521	TTGGC	2	10	1657677	1657686	0 %	40 %	40 %	20 %	514060318
25560	NC_021521	CAC	2	6	1657724	1657729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060318
25561	NC_021521	CCA	2	6	1657757	1657762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060318
25562	NC_021521	AAG	2	6	1657965	1657970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060318
25563	NC_021521	TGA	2	6	1658044	1658049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060318
25564	NC_021521	AG	3	6	1658104	1658109	50 %	0 %	50 %	0 %	514060318
25565	NC_021521	TGA	2	6	1658110	1658115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060318
25566	NC_021521	A	6	6	1658231	1658236	100 %	0 %	0 %	0 %	514060318
25567	NC_021521	CGG	2	6	1658254	1658259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060318
25568	NC_021521	AACC	2	8	1658274	1658281	50 %	0 %	0 %	50 %	514060318
25569	NC_021521	AGA	2	6	1658389	1658394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060318
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25571	NC_021521	TTGA	2	8	1658417	1658424	25 %	50 %	25 %	0 %	514060318
25572	NC_021521	GCA	3	9	1658589	1658597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060319
25573	NC_021521	AGGA	2	8	1658696	1658703	50 %	0 %	50 %	0 %	514060319
25574	NC_021521	ATA	2	6	1658733	1658738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060319
25575	NC_021521	TGC	2	6	1658768	1658773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060319
25576	NC_021521	ATA	2	6	1658841	1658846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060319
25577	NC_021521	ATT	2	6	1658867	1658872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060319
25578	NC_021521	CAT	2	6	1658980	1658985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060319
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25580	NC_021521	CGTC	2	8	1659216	1659223	0 %	25 %	25 %	50 %	514060319
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25584	NC_021521	CATCTT	2	12	1659304	1659315	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	514060319
25585	NC_021521	A	7	7	1659317	1659323	100 %	0 %	0 %	0 %	514060319
25586	NC_021521	TTC	2	6	1659356	1659361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060319
25587	NC_021521	TTC	2	6	1659401	1659406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060319
25588	NC_021521	ATCA	2	8	1659416	1659423	50 %	25 %	0 %	25 %	514060319
25589	NC_021521	AT	3	6	1659867	1659872	50 %	50 %	0 %	0 %	514060320
25590	NC_021521	A	7	7	1659895	1659901	100 %	0 %	0 %	0 %	514060320
25591	NC_021521	AACG	2	8	1659961	1659968	50 %	0 %	25 %	25 %	514060320
25592	NC_021521	ACGCC	2	10	1659993	1660002	20 %	0 %	20 %	60 %	514060320
25593	NC_021521	CGA	2	6	1660065	1660070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060320
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25599	NC_021521	GTT	2	6	1662247	1662252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060322
25600	NC_021521	AAG	2	6	1662304	1662309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060322
25601	NC_021521	CGCA	2	8	1662555	1662562	25 %	0 %	25 %	50 %	514060322
25602	NC_021521	TAAT	2	8	1662623	1662630	50 %	50 %	0 %	0 %	514060322
25603	NC_021521	TGAA	2	8	1662710	1662717	50 %	25 %	25 %	0 %	514060322
25604	NC_021521	ACA	2	6	1662727	1662732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060322
25605	NC_021521	TAA	2	6	1662843	1662848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060322
25606	NC_021521	TTTA	2	8	1662888	1662895	25 %	75 %	0 %	0 %	514060322
25607	NC_021521	TAA	2	6	1662945	1662950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060322
25608	NC_021521	GCA	2	6	1662988	1662993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060322
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25611	NC_021521	TGTT	2	8	1663217	1663224	0 %	75 %	25 %	0 %	514060322
25612	NC_021521	TTGCA	2	10	1663260	1663269	20 %	40 %	20 %	20 %	514060322
25613	NC_021521	GCA	4	12	1663267	1663278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060322
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25615	NC_021521	ACC	2	6	1663392	1663397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060322
25616	NC_021521	GC	3	6	1663401	1663406	0 %	0 %	50 %	50 %	514060322
25617	NC_021521	TGAT	2	8	1663658	1663665	25 %	50 %	25 %	0 %	514060323
25618	NC_021521	GAA	2	6	1663693	1663698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060323
25619	NC_021521	ACC	2	6	1663761	1663766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060323
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25622	NC_021521	A	7	7	1664021	1664027	100 %	0 %	0 %	0 %	514060323
25623	NC_021521	TGTGG	2	10	1664062	1664071	0 %	40 %	60 %	0 %	514060323
25624	NC_021521	TG	3	6	1664092	1664097	0 %	50 %	50 %	0 %	514060323
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25642	NC_021521	AGGTG	2	10	1665641	1665650	20 %	20 %	60 %	0 %	514060325
25643	NC_021521	TG	3	6	1665667	1665672	0 %	50 %	50 %	0 %	514060325
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25731	NC_021521	GAAG	2	8	1670577	1670584	50 %	0 %	50 %	0 %	514060330
25732	NC_021521	GAC	2	6	1670602	1670607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060330
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25734	NC_021521	GAT	2	6	1670644	1670649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060330
25735	NC_021521	GAC	2	6	1670653	1670658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060330
25736	NC_021521	GAT	2	6	1670662	1670667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060330
25737	NC_021521	AGA	3	9	1670679	1670687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060330
25738	NC_021521	TGA	2	6	1670688	1670693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060330
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25741	NC_021521	TGC	3	9	1670867	1670875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060331
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25750	NC_021521	T	6	6	1671920	1671925	0 %	100 %	0 %	0 %	514060332
25751	NC_021521	TAAATT	2	12	1671941	1671952	50 %	50 %	0 %	0 %	514060332
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25753	NC_021521	CAGTAG	2	12	1671994	1672005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514060332
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25761	NC_021521	TGT	2	6	1672289	1672294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060332
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25764	NC_021521	TTGG	2	8	1672468	1672475	0 %	50 %	50 %	0 %	514060332
25765	NC_021521	ACA	2	6	1672524	1672529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060332
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25770	NC_021521	TAA	2	6	1672727	1672732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060332
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25850	NC_021521	CGT	2	6	1679062	1679067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060336
25851	NC_021521	TGC	2	6	1679087	1679092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060336
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