MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22001	NC_021521	GTGAC	2	10	1420347	1420356	20 %	20 %	40 %	20 %	514060121
22002	NC_021521	AGTT	2	8	1420388	1420395	25 %	50 %	25 %	0 %	514060121
22003	NC_021521	A	6	6	1420452	1420457	100 %	0 %	0 %	0 %	514060121
22004	NC_021521	CACG	2	8	1420523	1420530	25 %	0 %	25 %	50 %	514060121
22005	NC_021521	TAA	2	6	1420581	1420586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060121
22006	NC_021521	CAGTGA	2	12	1420646	1420657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514060121
22007	NC_021521	GCT	2	6	1420669	1420674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060121
22008	NC_021521	AAG	2	6	1420758	1420763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060121
22009	NC_021521	CAG	2	6	1420778	1420783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060121
22010	NC_021521	TGT	2	6	1420790	1420795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060121
22011	NC_021521	CAA	2	6	1420802	1420807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060121
22012	NC_021521	CTG	3	9	1420817	1420825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060121
22013	NC_021521	ATCA	2	8	1423015	1423022	50 %	25 %	0 %	25 %	514060122
22014	NC_021521	ATT	2	6	1423028	1423033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060122
22015	NC_021521	ATC	2	6	1423091	1423096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060122
22016	NC_021521	TAA	2	6	1423165	1423170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060122
22017	NC_021521	GCT	2	6	1423180	1423185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060122
22018	NC_021521	TAATT	2	10	1423214	1423223	40 %	60 %	0 %	0 %	514060122
22019	NC_021521	ATG	2	6	1423244	1423249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060122
22020	NC_021521	GTA	2	6	1423353	1423358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060122
22021	NC_021521	T	7	7	1423374	1423380	0 %	100 %	0 %	0 %	514060122
22022	NC_021521	CTC	2	6	1423405	1423410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060122
22023	NC_021521	CTT	2	6	1423894	1423899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060123
22024	NC_021521	CTG	2	6	1423927	1423932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060123
22025	NC_021521	CTT	2	6	1423942	1423947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060123
22026	NC_021521	CTG	3	9	1424017	1424025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060123
22027	NC_021521	TGC	2	6	1424120	1424125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060123
22028	NC_021521	GTC	2	6	1424231	1424236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060123
22029	NC_021521	CTA	2	6	1424239	1424244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060123
22030	NC_021521	AGT	2	6	1424356	1424361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060123
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22032	NC_021521	AGA	2	6	1424438	1424443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060123
22033	NC_021521	CTT	2	6	1424503	1424508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060123
22034	NC_021521	ACC	2	6	1424555	1424560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060123
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22036	NC_021521	CTT	2	6	1424644	1424649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060123
22037	NC_021521	GTT	2	6	1424699	1424704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060123
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22039	NC_021521	TGA	2	6	1424725	1424730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060123
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22044	NC_021521	GCT	3	9	1425078	1425086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060123
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22050	NC_021521	GGT	2	6	1425527	1425532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060124
22051	NC_021521	T	6	6	1425544	1425549	0 %	100 %	0 %	0 %	514060124
22052	NC_021521	AGT	2	6	1425680	1425685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060124
22053	NC_021521	TTTC	2	8	1425723	1425730	0 %	75 %	0 %	25 %	514060124
22054	NC_021521	AAT	2	6	1425817	1425822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060124
22055	NC_021521	AAGC	2	8	1425853	1425860	50 %	0 %	25 %	25 %	514060124
22056	NC_021521	TTGG	2	8	1425896	1425903	0 %	50 %	50 %	0 %	514060124
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22058	NC_021521	GCA	2	6	1426035	1426040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060124
22059	NC_021521	T	6	6	1426051	1426056	0 %	100 %	0 %	0 %	514060124
22060	NC_021521	CCAA	2	8	1426063	1426070	50 %	0 %	0 %	50 %	514060124
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22063	NC_021521	ACCA	2	8	1426183	1426190	50 %	0 %	0 %	50 %	514060124
22064	NC_021521	AAAGCG	2	12	1426237	1426248	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	514060124
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22088	NC_021521	A	6	6	1427677	1427682	100 %	0 %	0 %	0 %	514060126
22089	NC_021521	T	6	6	1427724	1427729	0 %	100 %	0 %	0 %	514060126
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22109	NC_021521	CA	3	6	1428863	1428868	50 %	0 %	0 %	50 %	514060126
22110	NC_021521	CGT	2	6	1428912	1428917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060126
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22115	NC_021521	TCA	2	6	1429042	1429047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060126
22116	NC_021521	TGA	2	6	1429093	1429098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060126
22117	NC_021521	CAA	2	6	1429110	1429115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060126
22118	NC_021521	GAAA	2	8	1429148	1429155	75 %	0 %	25 %	0 %	514060126
22119	NC_021521	TCA	2	6	1429160	1429165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060126
22120	NC_021521	CTCA	2	8	1429209	1429216	25 %	25 %	0 %	50 %	514060126
22121	NC_021521	CTG	2	6	1429308	1429313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060126
22122	NC_021521	TTC	2	6	1429326	1429331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060126
22123	NC_021521	AAAC	2	8	1429353	1429360	75 %	0 %	0 %	25 %	514060126
22124	NC_021521	TA	3	6	1429370	1429375	50 %	50 %	0 %	0 %	514060126
22125	NC_021521	AG	3	6	1429401	1429406	50 %	0 %	50 %	0 %	514060126
22126	NC_021521	C	7	7	1429425	1429431	0 %	0 %	0 %	100 %	514060126
22127	NC_021521	TAT	2	6	1429469	1429474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060126
22128	NC_021521	T	7	7	1429495	1429501	0 %	100 %	0 %	0 %	514060126
22129	NC_021521	A	6	6	1429518	1429523	100 %	0 %	0 %	0 %	514060126
22130	NC_021521	TCA	2	6	1429562	1429567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060126
22131	NC_021521	A	6	6	1429597	1429602	100 %	0 %	0 %	0 %	514060126
22132	NC_021521	AC	3	6	1429654	1429659	50 %	0 %	0 %	50 %	514060126
22133	NC_021521	TTG	2	6	1429866	1429871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060126
22134	NC_021521	ATC	2	6	1429890	1429895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060126
22135	NC_021521	GTT	2	6	1429910	1429915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060126
22136	NC_021521	TG	3	6	1429957	1429962	0 %	50 %	50 %	0 %	514060126
22137	NC_021521	ATCA	2	8	1430001	1430008	50 %	25 %	0 %	25 %	514060126
22138	NC_021521	ATT	2	6	1430026	1430031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060126
22139	NC_021521	ATTT	2	8	1430208	1430215	25 %	75 %	0 %	0 %	514060127
22140	NC_021521	ATG	2	6	1430282	1430287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060127
22141	NC_021521	CTA	2	6	1430469	1430474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060127
22142	NC_021521	ACT	2	6	1430477	1430482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060127
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22144	NC_021521	CCA	2	6	1430573	1430578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060127
22145	NC_021521	T	6	6	1430583	1430588	0 %	100 %	0 %	0 %	514060127
22146	NC_021521	GAT	2	6	1430664	1430669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060127
22147	NC_021521	GAT	2	6	1430691	1430696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060127
22148	NC_021521	TC	4	8	1430712	1430719	0 %	50 %	0 %	50 %	514060127
22149	NC_021521	GTG	2	6	1430783	1430788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060127
22150	NC_021521	TGAT	2	8	1430792	1430799	25 %	50 %	25 %	0 %	514060127
22151	NC_021521	TGA	3	9	1430847	1430855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060127
22152	NC_021521	GA	3	6	1430952	1430957	50 %	0 %	50 %	0 %	514060127
22153	NC_021521	A	6	6	1430986	1430991	100 %	0 %	0 %	0 %	514060127
22154	NC_021521	ACTT	2	8	1431010	1431017	25 %	50 %	0 %	25 %	514060127
22155	NC_021521	GAA	2	6	1431040	1431045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060127
22156	NC_021521	GAT	2	6	1431081	1431086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060127
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22159	NC_021521	ATT	2	6	1431202	1431207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060127
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22182	NC_021521	TTCA	2	8	1432635	1432642	25 %	50 %	0 %	25 %	514060128
22183	NC_021521	A	6	6	1432667	1432672	100 %	0 %	0 %	0 %	514060128
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22208	NC_021521	TCGG	2	8	1434951	1434958	0 %	25 %	50 %	25 %	514060132
22209	NC_021521	AT	3	6	1434983	1434988	50 %	50 %	0 %	0 %	514060132
22210	NC_021521	TCA	2	6	1435029	1435034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060132
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22215	NC_021521	TCA	2	6	1435619	1435624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060132
22216	NC_021521	GTAAG	2	10	1435753	1435762	40 %	20 %	40 %	0 %	514060132
22217	NC_021521	A	6	6	1435820	1435825	100 %	0 %	0 %	0 %	514060132
22218	NC_021521	GTT	2	6	1435845	1435850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060132
22219	NC_021521	TATC	2	8	1435851	1435858	25 %	50 %	0 %	25 %	514060132
22220	NC_021521	ATC	2	6	1435966	1435971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060133
22221	NC_021521	TCT	2	6	1436008	1436013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060133
22222	NC_021521	ATA	2	6	1436028	1436033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060133
22223	NC_021521	CTG	2	6	1436076	1436081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060133
22224	NC_021521	CAT	2	6	1436169	1436174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060133
22225	NC_021521	CAAT	2	8	1436348	1436355	50 %	25 %	0 %	25 %	514060134
22226	NC_021521	CAAA	2	8	1436364	1436371	75 %	0 %	0 %	25 %	514060134
22227	NC_021521	GAG	2	6	1436404	1436409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514060134
22228	NC_021521	TTAA	2	8	1436443	1436450	50 %	50 %	0 %	0 %	514060134
22229	NC_021521	TAT	2	6	1436460	1436465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060134
22230	NC_021521	ATTT	2	8	1436522	1436529	25 %	75 %	0 %	0 %	514060134
22231	NC_021521	ATG	2	6	1436540	1436545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060134
22232	NC_021521	TAAA	2	8	1436597	1436604	75 %	25 %	0 %	0 %	514060134
22233	NC_021521	GCAGA	2	10	1436627	1436636	40 %	0 %	40 %	20 %	514060134
22234	NC_021521	A	6	6	1436647	1436652	100 %	0 %	0 %	0 %	514060134
22235	NC_021521	TGA	2	6	1437170	1437175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060135
22236	NC_021521	GTG	2	6	1437212	1437217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060135
22237	NC_021521	TCA	2	6	1437228	1437233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060135
22238	NC_021521	TA	3	6	1437237	1437242	50 %	50 %	0 %	0 %	514060135
22239	NC_021521	T	7	7	1437318	1437324	0 %	100 %	0 %	0 %	514060135
22240	NC_021521	GTTC	2	8	1437332	1437339	0 %	50 %	25 %	25 %	514060135
22241	NC_021521	T	6	6	1437386	1437391	0 %	100 %	0 %	0 %	514060135
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22253	NC_021521	TAA	2	6	1438315	1438320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060135
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22342	NC_021521	TGCT	2	8	1442664	1442671	0 %	50 %	25 %	25 %	514060139
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22346	NC_021521	AAC	2	6	1442796	1442801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060139
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22351	NC_021521	CTTT	2	8	1442967	1442974	0 %	75 %	0 %	25 %	514060139
22352	NC_021521	T	6	6	1442983	1442988	0 %	100 %	0 %	0 %	514060139
22353	NC_021521	T	7	7	1443007	1443013	0 %	100 %	0 %	0 %	514060139
22354	NC_021521	T	6	6	1443019	1443024	0 %	100 %	0 %	0 %	514060139
22355	NC_021521	T	6	6	1443049	1443054	0 %	100 %	0 %	0 %	514060139
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22467	NC_021521	TCA	2	6	1448884	1448889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060144
22468	NC_021521	AAT	2	6	1448962	1448967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060144
22469	NC_021521	AG	3	6	1449282	1449287	50 %	0 %	50 %	0 %	514060145
22470	NC_021521	GCA	2	6	1449312	1449317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060145
22471	NC_021521	TCA	2	6	1449361	1449366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060145
22472	NC_021521	GAA	2	6	1449369	1449374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060145
22473	NC_021521	ATT	2	6	1449465	1449470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060145
22474	NC_021521	AAGG	2	8	1449513	1449520	50 %	0 %	50 %	0 %	514060145
22475	NC_021521	GTT	2	6	1449687	1449692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060145
22476	NC_021521	CTT	2	6	1449716	1449721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060145
22477	NC_021521	CCG	2	6	1449736	1449741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060145
22478	NC_021521	GCA	2	6	1449810	1449815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060145
22479	NC_021521	CGTG	2	8	1449833	1449840	0 %	25 %	50 %	25 %	514060145
22480	NC_021521	CAAT	2	8	1449876	1449883	50 %	25 %	0 %	25 %	514060145
22481	NC_021521	AGA	2	6	1449914	1449919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060145
22482	NC_021521	GAA	2	6	1449957	1449962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060145
22483	NC_021521	CCG	2	6	1449968	1449973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060145
22484	NC_021521	AAG	2	6	1450003	1450008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060145
22485	NC_021521	ATT	3	9	1450014	1450022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060145
22486	NC_021521	ACC	2	6	1450023	1450028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060145
22487	NC_021521	ATC	2	6	1450229	1450234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060145
22488	NC_021521	ATCAAT	2	12	1450299	1450310	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514060145
22489	NC_021521	GTA	2	6	1450320	1450325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060145
22490	NC_021521	CAC	2	6	1450372	1450377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060145
22491	NC_021521	CAA	2	6	1450401	1450406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060145
22492	NC_021521	GCA	2	6	1450413	1450418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060145
22493	NC_021521	A	6	6	1450431	1450436	100 %	0 %	0 %	0 %	514060145
22494	NC_021521	GAA	2	6	1450437	1450442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060145
22495	NC_021521	GCA	2	6	1450524	1450529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060145
22496	NC_021521	TC	3	6	1450556	1450561	0 %	50 %	0 %	50 %	514060145
22497	NC_021521	TAT	2	6	1450646	1450651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060145
22498	NC_021521	TAC	2	6	1450666	1450671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060145
22499	NC_021521	TC	3	6	1450675	1450680	0 %	50 %	0 %	50 %	514060145
22500	NC_021521	CTT	2	6	1450688	1450693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060145

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