MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021521	GCA	2	6	1197878	1197883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059922
18502	NC_021521	T	6	6	1197886	1197891	0 %	100 %	0 %	0 %	514059922
18503	NC_021521	ATT	2	6	1197904	1197909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059922
18504	NC_021521	AGT	2	6	1197926	1197931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059922
18505	NC_021521	GAA	2	6	1197977	1197982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059922
18506	NC_021521	TG	3	6	1198118	1198123	0 %	50 %	50 %	0 %	514059922
18507	NC_021521	AATGA	2	10	1198190	1198199	60 %	20 %	20 %	0 %	514059922
18508	NC_021521	TTG	2	6	1198224	1198229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059922
18509	NC_021521	GTT	2	6	1198276	1198281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059922
18510	NC_021521	TGA	2	6	1198339	1198344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059922
18511	NC_021521	GTT	2	6	1198378	1198383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059922
18512	NC_021521	TGA	3	9	1198399	1198407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059922
18513	NC_021521	TGA	2	6	1198453	1198458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059922
18514	NC_021521	TC	3	6	1198473	1198478	0 %	50 %	0 %	50 %	514059922
18515	NC_021521	GAT	2	6	1198576	1198581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059922
18516	NC_021521	CAA	3	9	1198634	1198642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059922
18517	NC_021521	ACT	2	6	1198729	1198734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059922
18518	NC_021521	TGA	2	6	1198774	1198779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059922
18519	NC_021521	TTAGC	2	10	1198788	1198797	20 %	40 %	20 %	20 %	514059922
18520	NC_021521	GTT	2	6	1198813	1198818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059922
18521	NC_021521	AAG	2	6	1198821	1198826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059922
18522	NC_021521	TTC	2	6	1198927	1198932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059923
18523	NC_021521	CTG	2	6	1198956	1198961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059923
18524	NC_021521	ATT	2	6	1198970	1198975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059923
18525	NC_021521	TTA	2	6	1199018	1199023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059923
18526	NC_021521	ATT	2	6	1199039	1199044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059923
18527	NC_021521	TAT	2	6	1199053	1199058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059923
18528	NC_021521	TGGC	2	8	1199090	1199097	0 %	25 %	50 %	25 %	514059923
18529	NC_021521	T	6	6	1199135	1199140	0 %	100 %	0 %	0 %	514059923
18530	NC_021521	ACAGT	2	10	1199157	1199166	40 %	20 %	20 %	20 %	514059923
18531	NC_021521	TTC	2	6	1199202	1199207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059923
18532	NC_021521	TGC	2	6	1199221	1199226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059923
18533	NC_021521	TTG	2	6	1199238	1199243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059923
18534	NC_021521	ATT	2	6	1199306	1199311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059923
18535	NC_021521	TTA	2	6	1199330	1199335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059923
18536	NC_021521	CGT	2	6	1199350	1199355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059923
18537	NC_021521	TTA	2	6	1199375	1199380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059923
18538	NC_021521	GAA	2	6	1199465	1199470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059923
18539	NC_021521	TTA	2	6	1199499	1199504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059923
18540	NC_021521	TAT	2	6	1199592	1199597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059923
18541	NC_021521	CAAT	2	8	1199730	1199737	50 %	25 %	0 %	25 %	514059923
18542	NC_021521	ATG	2	6	1199768	1199773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059923
18543	NC_021521	TC	3	6	1199788	1199793	0 %	50 %	0 %	50 %	514059923
18544	NC_021521	ACT	2	6	1199815	1199820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059923
18545	NC_021521	TTA	2	6	1199930	1199935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059923
18546	NC_021521	TAA	2	6	1199944	1199949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059923
18547	NC_021521	TCT	2	6	1200127	1200132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059924
18548	NC_021521	ACT	2	6	1200194	1200199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059924
18549	NC_021521	GGCT	2	8	1200250	1200257	0 %	25 %	50 %	25 %	514059924
18550	NC_021521	CTG	2	6	1200261	1200266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059924
18551	NC_021521	TATT	2	8	1200273	1200280	25 %	75 %	0 %	0 %	514059924
18552	NC_021521	TTTA	2	8	1200451	1200458	25 %	75 %	0 %	0 %	514059924
18553	NC_021521	CGTG	2	8	1200482	1200489	0 %	25 %	50 %	25 %	514059924
18554	NC_021521	TGGAAT	2	12	1200529	1200540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059924
18555	NC_021521	ATTG	2	8	1200556	1200563	25 %	50 %	25 %	0 %	514059924
18556	NC_021521	CTT	2	6	1200630	1200635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059924
18557	NC_021521	GCT	2	6	1200665	1200670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059924
18558	NC_021521	ATC	2	6	1200734	1200739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059924
18559	NC_021521	TACC	2	8	1200789	1200796	25 %	25 %	0 %	50 %	514059924
18560	NC_021521	TTA	2	6	1200938	1200943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059924
18561	NC_021521	ACTT	2	8	1200979	1200986	25 %	50 %	0 %	25 %	514059924
18562	NC_021521	GCA	2	6	1201034	1201039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059924
18563	NC_021521	TA	3	6	1201041	1201046	50 %	50 %	0 %	0 %	514059924
18564	NC_021521	CAG	3	9	1201053	1201061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059924
18565	NC_021521	CTG	2	6	1201065	1201070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059924
18566	NC_021521	TGG	2	6	1201072	1201077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059924
18567	NC_021521	GTT	2	6	1201100	1201105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059924
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18569	NC_021521	TTA	2	6	1201118	1201123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059924
18570	NC_021521	TTC	2	6	1201130	1201135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059924
18571	NC_021521	TTA	2	6	1201196	1201201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059924
18572	NC_021521	TGA	2	6	1201231	1201236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059924
18573	NC_021521	TAT	2	6	1201306	1201311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059924
18574	NC_021521	GCTATT	2	12	1201385	1201396	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514059924
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18576	NC_021521	TGA	2	6	1201672	1201677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059925
18577	NC_021521	TCA	2	6	1201699	1201704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059925
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18582	NC_021521	ATC	2	6	1202049	1202054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059925
18583	NC_021521	TTTC	2	8	1202096	1202103	0 %	75 %	0 %	25 %	514059925
18584	NC_021521	ATG	2	6	1202106	1202111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059925
18585	NC_021521	CCATT	2	10	1202142	1202151	20 %	40 %	0 %	40 %	514059925
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18587	NC_021521	AGG	2	6	1202184	1202189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059925
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18589	NC_021521	TGT	2	6	1202316	1202321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059925
18590	NC_021521	CAT	3	9	1202435	1202443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059925
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18592	NC_021521	AAG	2	6	1202552	1202557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059925
18593	NC_021521	CAT	2	6	1202627	1202632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059925
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18598	NC_021521	AAAT	2	8	1202838	1202845	75 %	25 %	0 %	0 %	514059925
18599	NC_021521	AAT	2	6	1202850	1202855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059925
18600	NC_021521	AT	3	6	1202866	1202871	50 %	50 %	0 %	0 %	514059925
18601	NC_021521	TAAA	2	8	1203099	1203106	75 %	25 %	0 %	0 %	514059925
18602	NC_021521	AAT	2	6	1203119	1203124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059925
18603	NC_021521	GCT	2	6	1203169	1203174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059925
18604	NC_021521	AAG	2	6	1203266	1203271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059925
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18606	NC_021521	TTC	2	6	1203327	1203332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059925
18607	NC_021521	T	6	6	1203362	1203367	0 %	100 %	0 %	0 %	514059925
18608	NC_021521	T	6	6	1203374	1203379	0 %	100 %	0 %	0 %	514059925
18609	NC_021521	TTCT	2	8	1203533	1203540	0 %	75 %	0 %	25 %	514059926
18610	NC_021521	T	6	6	1203566	1203571	0 %	100 %	0 %	0 %	514059926
18611	NC_021521	ATC	2	6	1203599	1203604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059926
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18613	NC_021521	TTTC	2	8	1203640	1203647	0 %	75 %	0 %	25 %	514059926
18614	NC_021521	TTAA	2	8	1203732	1203739	50 %	50 %	0 %	0 %	514059926
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18735	NC_021521	CGC	2	6	1212245	1212250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059934
18736	NC_021521	CTG	2	6	1212269	1212274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059934
18737	NC_021521	T	6	6	1212295	1212300	0 %	100 %	0 %	0 %	514059934
18738	NC_021521	TAACGC	2	12	1212347	1212358	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514059934
18739	NC_021521	ATA	2	6	1212381	1212386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059934
18740	NC_021521	ACG	2	6	1212436	1212441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059934
18741	NC_021521	GAA	2	6	1212473	1212478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059934
18742	NC_021521	CA	3	6	1212569	1212574	50 %	0 %	0 %	50 %	514059934
18743	NC_021521	CAA	2	6	1212800	1212805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059934
18744	NC_021521	AAG	2	6	1212810	1212815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059934
18745	NC_021521	CAT	2	6	1212874	1212879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059934
18746	NC_021521	ATC	2	6	1212920	1212925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059934
18747	NC_021521	T	6	6	1212968	1212973	0 %	100 %	0 %	0 %	514059934
18748	NC_021521	TGA	2	6	1213005	1213010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059934
18749	NC_021521	ACC	2	6	1213062	1213067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059934
18750	NC_021521	GTA	2	6	1213095	1213100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059934
18751	NC_021521	TCA	2	6	1213159	1213164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059934
18752	NC_021521	T	6	6	1213181	1213186	0 %	100 %	0 %	0 %	514059934
18753	NC_021521	AAT	2	6	1213250	1213255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059934
18754	NC_021521	TCT	2	6	1213314	1213319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059934
18755	NC_021521	CATCG	2	10	1213370	1213379	20 %	20 %	20 %	40 %	514059934
18756	NC_021521	TCT	2	6	1213401	1213406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059934
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18760	NC_021521	CAA	2	6	1213538	1213543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059934
18761	NC_021521	CGCTCA	2	12	1213689	1213700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	514059934
18762	NC_021521	CCG	2	6	1213749	1213754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059934
18763	NC_021521	AAT	2	6	1213808	1213813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059934
18764	NC_021521	TATTG	2	10	1213861	1213870	20 %	60 %	20 %	0 %	514059935
18765	NC_021521	CGG	2	6	1213893	1213898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059935
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18802	NC_021521	CTT	2	6	1215931	1215936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059937
18803	NC_021521	CTT	2	6	1216021	1216026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059937
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18834	NC_021521	CACCGA	2	12	1217633	1217644	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	514059938
18835	NC_021521	T	6	6	1217766	1217771	0 %	100 %	0 %	0 %	514059939
18836	NC_021521	AAT	2	6	1217793	1217798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059939
18837	NC_021521	GCC	2	6	1217799	1217804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059939
18838	NC_021521	CTA	2	6	1217833	1217838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059939
18839	NC_021521	CCA	2	6	1218001	1218006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059939
18840	NC_021521	AATT	2	8	1218027	1218034	50 %	50 %	0 %	0 %	514059939
18841	NC_021521	ATTA	2	8	1218087	1218094	50 %	50 %	0 %	0 %	514059939
18842	NC_021521	T	7	7	1218191	1218197	0 %	100 %	0 %	0 %	514059939
18843	NC_021521	ATT	2	6	1218303	1218308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059939
18844	NC_021521	CCA	2	6	1218310	1218315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059939
18845	NC_021521	AAAC	2	8	1218394	1218401	75 %	0 %	0 %	25 %	514059939
18846	NC_021521	TCT	2	6	1218418	1218423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059939
18847	NC_021521	AAGC	2	8	1218443	1218450	50 %	0 %	25 %	25 %	514059939
18848	NC_021521	A	6	6	1218455	1218460	100 %	0 %	0 %	0 %	514059939
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18968	NC_021521	TAA	2	6	1226257	1226262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059946
18969	NC_021521	ACA	2	6	1226273	1226278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059946
18970	NC_021521	CTC	2	6	1226296	1226301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514059946
18971	NC_021521	GT	3	6	1226327	1226332	0 %	50 %	50 %	0 %	514059946
18972	NC_021521	AAG	2	6	1226466	1226471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059946
18973	NC_021521	ATA	2	6	1226570	1226575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059946
18974	NC_021521	CAA	2	6	1226638	1226643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059946
18975	NC_021521	TAAA	2	8	1226649	1226656	75 %	25 %	0 %	0 %	514059946
18976	NC_021521	T	6	6	1226691	1226696	0 %	100 %	0 %	0 %	514059946
18977	NC_021521	TCA	2	6	1226705	1226710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059946
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18980	NC_021521	AACC	2	8	1226873	1226880	50 %	0 %	0 %	50 %	514059946
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18982	NC_021521	ACT	2	6	1226998	1227003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059946
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18991	NC_021521	TCA	2	6	1227679	1227684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059947
18992	NC_021521	T	6	6	1227759	1227764	0 %	100 %	0 %	0 %	514059947
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18997	NC_021521	ACC	2	6	1228165	1228170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059947
18998	NC_021521	TAA	2	6	1228251	1228256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059947
18999	NC_021521	TG	3	6	1228278	1228283	0 %	50 %	50 %	0 %	514059947
19000	NC_021521	ATCA	2	8	1228335	1228342	50 %	25 %	0 %	25 %	514059947

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