MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021521	TCA	2	6	1168722	1168727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059894
18002	NC_021521	GAA	2	6	1169092	1169097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059895
18003	NC_021521	ATA	2	6	1169185	1169190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059895
18004	NC_021521	ATC	2	6	1169226	1169231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059895
18005	NC_021521	TCAG	2	8	1169234	1169241	25 %	25 %	25 %	25 %	514059895
18006	NC_021521	TGA	2	6	1169243	1169248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059895
18007	NC_021521	TCTA	2	8	1169256	1169263	25 %	50 %	0 %	25 %	514059895
18008	NC_021521	GAT	2	6	1169445	1169450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059895
18009	NC_021521	TGA	2	6	1169494	1169499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059895
18010	NC_021521	GAT	2	6	1169525	1169530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059895
18011	NC_021521	TTG	2	6	1169532	1169537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059895
18012	NC_021521	GCG	2	6	1169568	1169573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059895
18013	NC_021521	TTTA	2	8	1169574	1169581	25 %	75 %	0 %	0 %	514059895
18014	NC_021521	GTG	2	6	1169647	1169652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059895
18015	NC_021521	GCTT	2	8	1169695	1169702	0 %	50 %	25 %	25 %	514059895
18016	NC_021521	CAT	2	6	1169723	1169728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059895
18017	NC_021521	AT	3	6	1169744	1169749	50 %	50 %	0 %	0 %	514059895
18018	NC_021521	CTTCC	2	10	1170044	1170053	0 %	40 %	0 %	60 %	514059896
18019	NC_021521	TTGG	2	8	1170141	1170148	0 %	50 %	50 %	0 %	514059896
18020	NC_021521	TAGA	2	8	1170196	1170203	50 %	25 %	25 %	0 %	514059896
18021	NC_021521	ATAA	2	8	1170213	1170220	75 %	25 %	0 %	0 %	514059896
18022	NC_021521	TAA	2	6	1170250	1170255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059896
18023	NC_021521	T	6	6	1170437	1170442	0 %	100 %	0 %	0 %	514059896
18024	NC_021521	ATC	2	6	1170489	1170494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059896
18025	NC_021521	T	6	6	1170575	1170580	0 %	100 %	0 %	0 %	514059896
18026	NC_021521	CT	3	6	1170675	1170680	0 %	50 %	0 %	50 %	514059896
18027	NC_021521	ATT	2	6	1170965	1170970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059896
18028	NC_021521	T	7	7	1171016	1171022	0 %	100 %	0 %	0 %	514059896
18029	NC_021521	T	6	6	1171031	1171036	0 %	100 %	0 %	0 %	514059896
18030	NC_021521	A	6	6	1171160	1171165	100 %	0 %	0 %	0 %	514059897
18031	NC_021521	TCAAAT	2	12	1171176	1171187	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514059897
18032	NC_021521	GAA	2	6	1171534	1171539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059897
18033	NC_021521	TTA	2	6	1171540	1171545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059897
18034	NC_021521	CCAA	2	8	1171570	1171577	50 %	0 %	0 %	50 %	514059897
18035	NC_021521	TGGCT	2	10	1171640	1171649	0 %	40 %	40 %	20 %	514059897
18036	NC_021521	A	6	6	1171661	1171666	100 %	0 %	0 %	0 %	514059897
18037	NC_021521	TA	3	6	1171739	1171744	50 %	50 %	0 %	0 %	514059897
18038	NC_021521	TTA	2	6	1171834	1171839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059897
18039	NC_021521	TAA	3	9	1171891	1171899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059897
18040	NC_021521	ATA	2	6	1171974	1171979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059898
18041	NC_021521	T	6	6	1172014	1172019	0 %	100 %	0 %	0 %	514059898
18042	NC_021521	TTA	2	6	1172021	1172026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059898
18043	NC_021521	CAA	2	6	1172055	1172060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059898
18044	NC_021521	AAC	2	6	1172065	1172070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059898
18045	NC_021521	TGA	2	6	1172108	1172113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059898
18046	NC_021521	AGT	2	6	1172154	1172159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059898
18047	NC_021521	ACA	2	6	1172246	1172251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059898
18048	NC_021521	ACC	2	6	1172257	1172262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059898
18049	NC_021521	TCTT	2	8	1172324	1172331	0 %	75 %	0 %	25 %	514059898
18050	NC_021521	TCA	2	6	1172354	1172359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059898
18051	NC_021521	CTG	2	6	1172370	1172375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059898
18052	NC_021521	TAG	2	6	1172442	1172447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059898
18053	NC_021521	TTA	2	6	1172468	1172473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059898
18054	NC_021521	GTATAG	2	12	1172528	1172539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059898
18055	NC_021521	AGA	2	6	1172554	1172559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059898
18056	NC_021521	T	6	6	1172581	1172586	0 %	100 %	0 %	0 %	514059898
18057	NC_021521	TGT	2	6	1172592	1172597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059898
18058	NC_021521	CCA	2	6	1172615	1172620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059898
18059	NC_021521	GCC	2	6	1172710	1172715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059898
18060	NC_021521	TGT	2	6	1172737	1172742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059898
18061	NC_021521	C	6	6	1172748	1172753	0 %	0 %	0 %	100 %	514059898
18062	NC_021521	CAT	2	6	1172760	1172765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059898
18063	NC_021521	ATT	2	6	1172860	1172865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059898
18064	NC_021521	ACC	2	6	1172881	1172886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059898
18065	NC_021521	TTC	2	6	1172920	1172925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059898
18066	NC_021521	AGA	2	6	1172930	1172935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059898
18067	NC_021521	GCTGAT	2	12	1172990	1173001	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	514059898
18068	NC_021521	CTA	2	6	1173027	1173032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059898
18069	NC_021521	T	7	7	1173036	1173042	0 %	100 %	0 %	0 %	514059898
18070	NC_021521	A	6	6	1173489	1173494	100 %	0 %	0 %	0 %	514059899
18071	NC_021521	TCTA	2	8	1173563	1173570	25 %	50 %	0 %	25 %	514059899
18072	NC_021521	ATG	2	6	1173705	1173710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059899
18073	NC_021521	A	6	6	1173717	1173722	100 %	0 %	0 %	0 %	514059899
18074	NC_021521	TC	3	6	1173762	1173767	0 %	50 %	0 %	50 %	514059899
18075	NC_021521	TGAA	2	8	1173846	1173853	50 %	25 %	25 %	0 %	514059899
18076	NC_021521	ATTACC	2	12	1173879	1173890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059899
18077	NC_021521	GAA	2	6	1173965	1173970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059899
18078	NC_021521	GAC	3	9	1174177	1174185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059900
18079	NC_021521	T	6	6	1174205	1174210	0 %	100 %	0 %	0 %	514059900
18080	NC_021521	ACG	2	6	1174220	1174225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059900
18081	NC_021521	GCA	2	6	1174248	1174253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059900
18082	NC_021521	TCG	2	6	1174275	1174280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059900
18083	NC_021521	ACC	3	9	1174337	1174345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059900
18084	NC_021521	ACGA	2	8	1174403	1174410	50 %	0 %	25 %	25 %	514059900
18085	NC_021521	GCG	2	6	1174514	1174519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059900
18086	NC_021521	TGC	2	6	1174541	1174546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059900
18087	NC_021521	GTT	2	6	1174588	1174593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059901
18088	NC_021521	TGC	2	6	1174595	1174600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059901
18089	NC_021521	GAC	2	6	1174708	1174713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059901
18090	NC_021521	T	6	6	1174793	1174798	0 %	100 %	0 %	0 %	514059901
18091	NC_021521	GAT	2	6	1174832	1174837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059901
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18094	NC_021521	ATT	2	6	1175323	1175328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059902
18095	NC_021521	GCA	2	6	1175329	1175334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059902
18096	NC_021521	TTG	2	6	1175339	1175344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059902
18097	NC_021521	TAT	2	6	1175349	1175354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059902
18098	NC_021521	TGT	3	9	1175361	1175369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059902
18099	NC_021521	CAA	2	6	1175375	1175380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059902
18100	NC_021521	A	6	6	1175392	1175397	100 %	0 %	0 %	0 %	514059902
18101	NC_021521	A	6	6	1175434	1175439	100 %	0 %	0 %	0 %	514059902
18102	NC_021521	TTGC	2	8	1175491	1175498	0 %	50 %	25 %	25 %	514059902
18103	NC_021521	ATT	2	6	1175556	1175561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059902
18104	NC_021521	ATT	2	6	1175645	1175650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059902
18105	NC_021521	CTC	2	6	1175658	1175663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514059902
18106	NC_021521	TTTA	2	8	1175870	1175877	25 %	75 %	0 %	0 %	514059903
18107	NC_021521	ACAA	2	8	1175930	1175937	75 %	0 %	0 %	25 %	514059903
18108	NC_021521	GTG	2	6	1175983	1175988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059903
18109	NC_021521	GAT	2	6	1175991	1175996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059903
18110	NC_021521	GAT	2	6	1176021	1176026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059903
18111	NC_021521	TAA	2	6	1176173	1176178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059903
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18113	NC_021521	TAA	2	6	1176260	1176265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059903
18114	NC_021521	TTG	2	6	1176316	1176321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059903
18115	NC_021521	GGAT	2	8	1176399	1176406	25 %	25 %	50 %	0 %	514059903
18116	NC_021521	AATT	2	8	1176445	1176452	50 %	50 %	0 %	0 %	514059903
18117	NC_021521	A	7	7	1176465	1176471	100 %	0 %	0 %	0 %	514059903
18118	NC_021521	A	6	6	1176519	1176524	100 %	0 %	0 %	0 %	514059903
18119	NC_021521	T	6	6	1176566	1176571	0 %	100 %	0 %	0 %	514059903
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18142	NC_021521	TGA	2	6	1178440	1178445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059905
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18220	NC_021521	TTTC	2	8	1183206	1183213	0 %	75 %	0 %	25 %	514059908
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18229	NC_021521	GTTTT	2	10	1183712	1183721	0 %	80 %	20 %	0 %	514059908
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18231	NC_021521	AAGA	2	8	1183784	1183791	75 %	0 %	25 %	0 %	514059908
18232	NC_021521	TCA	2	6	1183793	1183798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059908
18233	NC_021521	T	7	7	1183817	1183823	0 %	100 %	0 %	0 %	514059908
18234	NC_021521	CACG	2	8	1183833	1183840	25 %	0 %	25 %	50 %	514059908
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18237	NC_021521	CAC	2	6	1184058	1184063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059909
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18332	NC_021521	AGT	2	6	1190247	1190252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059916
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18335	NC_021521	GACA	17	68	1190286	1190353	50 %	0 %	25 %	25 %	514059916
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18342	NC_021521	GAC	2	6	1190694	1190699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059917
18343	NC_021521	AAG	2	6	1190708	1190713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059917
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18345	NC_021521	AGA	2	6	1190745	1190750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059917
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18347	NC_021521	AAC	2	6	1190795	1190800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059917
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18349	NC_021521	AGA	3	9	1190847	1190855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059917
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18469	NC_021521	AGT	2	6	1195730	1195735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059920
18470	NC_021521	AAT	2	6	1195736	1195741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059920
18471	NC_021521	GT	3	6	1195770	1195775	0 %	50 %	50 %	0 %	514059920
18472	NC_021521	AAC	2	6	1195776	1195781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059920
18473	NC_021521	TCGCCT	2	12	1195797	1195808	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	514059920
18474	NC_021521	TTG	2	6	1195950	1195955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059920
18475	NC_021521	ATCAAT	2	12	1195967	1195978	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514059920
18476	NC_021521	GTC	2	6	1196030	1196035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059920
18477	NC_021521	CGTGC	2	10	1196096	1196105	0 %	20 %	40 %	40 %	514059920
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18480	NC_021521	GCC	2	6	1196322	1196327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059920
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18488	NC_021521	GCA	2	6	1196703	1196708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059920
18489	NC_021521	GAT	2	6	1196731	1196736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059920
18490	NC_021521	CAT	2	6	1196758	1196763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059920
18491	NC_021521	TC	3	6	1197296	1197301	0 %	50 %	0 %	50 %	514059921
18492	NC_021521	TTA	2	6	1197346	1197351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059921
18493	NC_021521	CGGT	2	8	1197368	1197375	0 %	25 %	50 %	25 %	514059921
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18495	NC_021521	T	6	6	1197475	1197480	0 %	100 %	0 %	0 %	514059921
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18499	NC_021521	ATA	2	6	1197650	1197655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059921
18500	NC_021521	AAT	2	6	1197707	1197712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059921

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