MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 36026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_021521	TCA	2	6	1135370	1135375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059865
17502	NC_021521	TCA	2	6	1135489	1135494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059865
17503	NC_021521	CAG	2	6	1135514	1135519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059865
17504	NC_021521	GTC	2	6	1135554	1135559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059865
17505	NC_021521	CAC	2	6	1135619	1135624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059865
17506	NC_021521	CTT	2	6	1135730	1135735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059865
17507	NC_021521	AAT	2	6	1135953	1135958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059865
17508	NC_021521	ACTT	2	8	1135968	1135975	25 %	50 %	0 %	25 %	514059865
17509	NC_021521	T	7	7	1135974	1135980	0 %	100 %	0 %	0 %	514059865
17510	NC_021521	CTT	2	6	1136003	1136008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059865
17511	NC_021521	TTA	2	6	1136032	1136037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059865
17512	NC_021521	GTG	2	6	1136193	1136198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059865
17513	NC_021521	CGG	2	6	1136224	1136229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059865
17514	NC_021521	ATCAAT	2	12	1136274	1136285	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514059865
17515	NC_021521	CTTT	2	8	1136324	1136331	0 %	75 %	0 %	25 %	514059865
17516	NC_021521	TAA	2	6	1136385	1136390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059865
17517	NC_021521	TAA	2	6	1136418	1136423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059865
17518	NC_021521	CAA	2	6	1136626	1136631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059866
17519	NC_021521	AAT	2	6	1136655	1136660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059866
17520	NC_021521	CACT	2	8	1136734	1136741	25 %	25 %	0 %	50 %	514059866
17521	NC_021521	ATC	2	6	1136762	1136767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059866
17522	NC_021521	CTT	2	6	1136782	1136787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059866
17523	NC_021521	AT	3	6	1136793	1136798	50 %	50 %	0 %	0 %	514059866
17524	NC_021521	A	6	6	1136811	1136816	100 %	0 %	0 %	0 %	514059866
17525	NC_021521	CAA	2	6	1137301	1137306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059867
17526	NC_021521	T	6	6	1137320	1137325	0 %	100 %	0 %	0 %	514059867
17527	NC_021521	TA	3	6	1137331	1137336	50 %	50 %	0 %	0 %	514059867
17528	NC_021521	TCA	2	6	1137353	1137358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059867
17529	NC_021521	TCT	2	6	1137362	1137367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059867
17530	NC_021521	GGTTAA	2	12	1137369	1137380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059867
17531	NC_021521	TAA	2	6	1137481	1137486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059867
17532	NC_021521	GACAA	2	10	1137511	1137520	60 %	0 %	20 %	20 %	514059867
17533	NC_021521	TGC	2	6	1137544	1137549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059867
17534	NC_021521	A	6	6	1137609	1137614	100 %	0 %	0 %	0 %	514059867
17535	NC_021521	CAA	2	6	1137639	1137644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059867
17536	NC_021521	AG	4	8	1137645	1137652	50 %	0 %	50 %	0 %	514059867
17537	NC_021521	TCA	2	6	1137722	1137727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059867
17538	NC_021521	AGTGA	2	10	1137767	1137776	40 %	20 %	40 %	0 %	514059867
17539	NC_021521	GTT	2	6	1137786	1137791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059867
17540	NC_021521	T	6	6	1137804	1137809	0 %	100 %	0 %	0 %	514059867
17541	NC_021521	ACT	2	6	1137841	1137846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059867
17542	NC_021521	TCA	2	6	1137854	1137859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059867
17543	NC_021521	GTT	2	6	1137909	1137914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059867
17544	NC_021521	CTT	2	6	1137981	1137986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059867
17545	NC_021521	CTT	2	6	1138005	1138010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059867
17546	NC_021521	GTTGC	2	10	1138110	1138119	0 %	40 %	40 %	20 %	514059867
17547	NC_021521	CTG	2	6	1138158	1138163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059867
17548	NC_021521	T	7	7	1138328	1138334	0 %	100 %	0 %	0 %	514059867
17549	NC_021521	TTC	2	6	1140705	1140710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059868
17550	NC_021521	TCT	2	6	1140751	1140756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059868
17551	NC_021521	ATC	2	6	1140765	1140770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059868
17552	NC_021521	TCG	2	6	1140907	1140912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059868
17553	NC_021521	CTT	2	6	1140974	1140979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059868
17554	NC_021521	CAGC	2	8	1140990	1140997	25 %	0 %	25 %	50 %	514059868
17555	NC_021521	TCA	2	6	1141028	1141033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059868
17556	NC_021521	AG	3	6	1141075	1141080	50 %	0 %	50 %	0 %	514059868
17557	NC_021521	TAA	2	6	1141095	1141100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059868
17558	NC_021521	CAT	2	6	1141226	1141231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059868
17559	NC_021521	TTC	2	6	1141255	1141260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059868
17560	NC_021521	GTT	2	6	1141268	1141273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059868
17561	NC_021521	T	6	6	1141311	1141316	0 %	100 %	0 %	0 %	514059868
17562	NC_021521	AAT	2	6	1141333	1141338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059868
17563	NC_021521	TCT	2	6	1141342	1141347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059868
17564	NC_021521	CTG	2	6	1141368	1141373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059868
17565	NC_021521	GAC	2	6	1141414	1141419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059868
17566	NC_021521	TTG	2	6	1141443	1141448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059868
17567	NC_021521	TTTG	2	8	1141462	1141469	0 %	75 %	25 %	0 %	514059868
17568	NC_021521	ACT	2	6	1141491	1141496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059868
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17570	NC_021521	CAA	2	6	1142032	1142037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059869
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17583	NC_021521	AAT	2	6	1143136	1143141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059870
17584	NC_021521	ATT	2	6	1143153	1143158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059870
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17586	NC_021521	ATG	2	6	1143253	1143258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059870
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17588	NC_021521	CTT	2	6	1143440	1143445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059870
17589	NC_021521	ACT	2	6	1143450	1143455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059870
17590	NC_021521	CTT	2	6	1143483	1143488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059870
17591	NC_021521	GTC	2	6	1143492	1143497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059870
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17599	NC_021521	AAT	2	6	1143971	1143976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059871
17600	NC_021521	GCTTG	2	10	1143999	1144008	0 %	40 %	40 %	20 %	514059871
17601	NC_021521	CAG	2	6	1144011	1144016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059871
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17604	NC_021521	AGGC	2	8	1144137	1144144	25 %	0 %	50 %	25 %	514059871
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17850	NC_021521	CAT	2	6	1158735	1158740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059884
17851	NC_021521	CCG	2	6	1158783	1158788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059884
17852	NC_021521	TGA	2	6	1158883	1158888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059884
17853	NC_021521	TGA	2	6	1158914	1158919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059884
17854	NC_021521	ATC	2	6	1158953	1158958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059884
17855	NC_021521	TTC	2	6	1159051	1159056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059884
17856	NC_021521	CTT	2	6	1159062	1159067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059884
17857	NC_021521	GTTG	2	8	1159069	1159076	0 %	50 %	50 %	0 %	514059884
17858	NC_021521	TAAA	2	8	1159125	1159132	75 %	25 %	0 %	0 %	514059884
17859	NC_021521	CTT	2	6	1159179	1159184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059884
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17862	NC_021521	TTGCA	2	10	1159867	1159876	20 %	40 %	20 %	20 %	514059884
17863	NC_021521	GCCA	2	8	1159931	1159938	25 %	0 %	25 %	50 %	514059884
17864	NC_021521	TG	3	6	1160036	1160041	0 %	50 %	50 %	0 %	514059884
17865	NC_021521	CTG	2	6	1160067	1160072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059884
17866	NC_021521	TCAT	2	8	1160096	1160103	25 %	50 %	0 %	25 %	514059884
17867	NC_021521	TGT	2	6	1160165	1160170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059884
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17870	NC_021521	ATA	2	6	1160528	1160533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059884
17871	NC_021521	CTGCA	2	10	1160605	1160614	20 %	20 %	20 %	40 %	514059884
17872	NC_021521	CAT	2	6	1160628	1160633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059884
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17875	NC_021521	CGG	2	6	1160728	1160733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059884
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17879	NC_021521	TTG	2	6	1160967	1160972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059884
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17961	NC_021521	GTT	2	6	1166719	1166724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059893
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17965	NC_021521	CG	3	6	1166912	1166917	0 %	0 %	50 %	50 %	514059893
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17967	NC_021521	TAC	2	6	1166995	1167000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059893
17968	NC_021521	TCA	2	6	1167018	1167023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059893
17969	NC_021521	CAT	2	6	1167083	1167088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059893
17970	NC_021521	TGC	2	6	1167188	1167193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059893
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17972	NC_021521	TGT	2	6	1167218	1167223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059893
17973	NC_021521	GCT	2	6	1167243	1167248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059893
17974	NC_021521	AAT	2	6	1167251	1167256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059893
17975	NC_021521	GCA	2	6	1167297	1167302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059893
17976	NC_021521	ATC	2	6	1167386	1167391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059893
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17980	NC_021521	GCA	2	6	1167525	1167530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059893
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17999	NC_021521	AAC	2	6	1168591	1168596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059894
18000	NC_021521	AAGC	2	8	1168636	1168643	50 %	0 %	25 %	25 %	514059894

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